Die Fluoreszenzmikroskopie (FM) kann verwendet werden, um die Lokalisierung und Verteilung des Zielproteins zu erhalten. Der Kontext, der das Zielprotein umgibt, geht jedoch verloren, was für eine gründliche Untersuchung des Zielproteins entscheidend ist. Die Elektronenmikroskopie (EM) hat die höchste Bildauflösung und liefert mehrere subzelluläre Details. Dennoch fehlt es EM an einer Zielkennzeichnung. Durch die genaue Zusammenführung des von FM aufgenommenen Fluoreszenzbildes mit dem von EM aufgenommenen Graubild kann die korrelative Licht- und Elektronenmikroskopie (CLEM) die von diesen beiden Bildgebungsmodi erhaltenen Informationen kombinieren 1,2,3,4.
CLEM ist ein Kompromiss zwischen Fluoreszenz und der Ultrastruktur1. Aufgrund der Einschränkungen der derzeitigen fluoreszierenden Proteine und der traditionellen EM-Probenvorbereitungsverfahren, insbesondere der Verwendung von Osmisäure (OsO 4) und hydrophoben Harzen wie Epon, beeinträchtigt die Ultrastruktur immer die Fluoreszenz5. OsO4 ist ein unverzichtbares Reagenz in der EM-Probenvorbereitung, das zur Verbesserung des Kontrasts von EM-Bildern eingesetzt wird. Im Vergleich zu anderen Einbettungsharzen ist Epon in Bezug auf die Ultrastrukturkonservierung und die Trenneigenschaftenüberlegen 5. Allerdings können keine fluoreszierenden Proteine das Fluoreszenzsignal nach der Behandlung von OsO4 und Epon-Einbettung6 speichern. Um die Einschränkungen fluoreszierender Proteine zu überwinden, wurde ein Pre-Embedding-CLEM entwickelt, bei dem die FM-Bildgebung vor der EM-Probenvorbereitung durchgeführt wird6. Der Nachteil der Voreinbettung von CLEM ist jedoch die ungenaue Registrierung zwischen den FM- und EM-Bildern5.
Im Gegensatz dazu führt die CLEM-Methode nach dem Einbetten die FM-Bildgebung nach der EM-Probenvorbereitung durch, deren Registrierungsgenauigkeit 6-7 nm erreichen kann 5,6. Um die Fluoreszenz fluoreszierender Proteine zu erhalten, wurden sehr niedrige Konzentrationen von OsO4 (0,001%)3 oder die Hochdruck-Gefrier- (HPF) und Gefriersubstitutions- (FS) EM-Präparationsmethoden 4,7 auf Kosten der beeinträchtigten Ultrastruktur oder des Kontrasts des EM-Bildes verwendet. Die Entwicklung von mEos4b fördert den Fortschritt von CLEM nach der Einbettung erheblich, obwohl Glycidylmethacrylat als Einbettharzverwendet wird 5. Mit der Entwicklung von mEosEM, dasdie OsO4-Färbung und Epon-Einbettung überleben kann, wurde zum ersten Mal eine superauflösende EPON-Post-Embedding-CLEM erreicht, bei der die Fluoreszenz und die Ultrastruktur gleichzeitig erhaltenbleiben 6. Nach mEosEM wurden mehrere fluoreszierende Proteine entwickelt, die dieOsO4-Färbung und die Epon-Einbettung überleben können 8,9,10,11. Dies fördert die Entwicklung von CLEM erheblich.
Es gibt drei Schlüsselaspekte für Epon nach der Einbettung von CLEM. Das erste ist das fluoreszierende Protein, das das Fluoreszenzsignal nach der EM-Probenvorbereitung aufrechterhalten soll. Nach unserer Erfahrung ist mScarlet anderen fluoreszierenden Proteinen überlegen. Die zweite ist, wie man dieselbe Zelle findet, die durch FM-Bildgebung in der EM-Bildgebung abgebildet wurde. Um dieses Problem zu lösen, verbessern wir das Verfahren für diesen Schritt, so dass man die Zielzelle leicht finden kann. Die letzte ist die Methode zum Ausrichten des FM-Bildes am EM-Bild. Hier beschreiben wir die Registrierung zwischen den FM- und EM-Bildern. In diesem Protokoll exprimieren wir mScarlet in VGLUT2-Neuronen und zeigen, dass mScarlet sekundäre Lysosomen mit Hilfe von Epon nach der Einbettung von CLEM angreifen kann. Wir bieten Schritt-für-Schritt-Details für Epon nach der Einbettung von CLEM, ohne die Fluoreszenz und die Ultrastruktur zu beeinträchtigen.