Synaptische Verbindungen ermöglichen den Austausch und die Verarbeitung von Informationen zwischen Neuronen. Die postsynaptische Stelle der exzitatorischen Synapsen wird häufig an dendritischen Dornen gebildet. Dendritische Dornen sind Strukturen, die in der Forschung rund um synaptische Plastizität, Neuroentwicklung sowie neurologische und psychiatrische Störungen von großem Interesse sind. Dendritische Stacheln durchlaufen im Laufe ihres Lebens strukturelle Veränderungen, wobei sich Eigenschaften wie die Gesamtanzahl der Wirbelsäule, die Größe der dendritischen Wirbelsäule und der morphologisch definierte Subtyp als Reaktion auf verschiedene Prozesse verändern. Die Abgrenzung der molekularen Mechanismen, die diese strukturellen Veränderungen der dendritischen Dornen regulieren, beruht auf morphologischen Messungen. Dies erfordert eine genaue und reproduzierbare Analyse der dendritischen Wirbelsäule, um experimentelle Beweise zu liefern. Die vorliegende Studie skizziert ein detailliertes Protokoll zur Quantifizierung und Klassifizierung der dendritischen Wirbelsäule mit Neurolucida 360 (automatische dreidimensionale Neuronenrekonstruktionssoftware). Dieses Protokoll ermöglicht die Bestimmung wichtiger Eigenschaften der dendritischen Wirbelsäule wie die Gesamtdichte der Wirbelsäule, das Volumen des Wirbelsäulenkopfes und die Klassifizierung in Wirbelsäulensubtypen und ermöglicht so eine effektive Analyse der strukturellen Phänotypen der dendritischen Wirbelsäule.