Dieses Protokoll bietet ein umfassendes und unkompliziertes Template-Protokoll zur Beurteilung der mitochondrialen Funktion in permeabilisierten Skelettmuskelfasern sowohl für Human- als auch für Mausproben. Die Verwendung von permeabilisierten Fasern anstelle von isolierten Mitochondrien hat mehrere Vorteile. Ein wesentlicher Vorteil besteht darin, dass für die Verwendung von permeabilisierten Fasern kleine Mengen an Gewebe (2-5 mg) erforderlich sind, wodurch diese Methode sowohl für menschliche Muskelbiopsieproben als auch für Mausmuskeln geeignet ist. Ein weiterer Vorteil gegenüber isolierten Mitochondrien besteht darin, dass die zelluläre Architektur intakt bleibt, wodurch die Erhaltung der strukturellen und funktionellen Wechselwirkungen zwischen Mitochondrien und zellulären Komponenten gewährleistetwird 12,21,22,23.
Die Verwendung von Pyruvat, Malat und Glutamat in unserem aeroben glykolytischen Protokoll bietet eine umfassende, breit angelegte Bewertung der NADH-Versorgung von Komplex I 24,25,26,27,28. Während dieser umfassende Ansatz eine Bewertung der Komplex-I-Aktivität unter ganzheitlichen und physiologisch relevanten Stoffwechselbedingungen ermöglicht, kann die Verwendung von Pyruvat-Malat oder Glutamat-Malat ein geeigneterer experimenteller Ansatz sein. Zum Beispiel kann die Verwendung von Glutamat-Malat Unterschiede in der mitochondrialen Funktion im Zusammenhang mit dem Aminosäurekatabolismus herauskitzeln29. Wir ermutigen die Forscher, sorgfältig zu überlegen, welchen Ansatz sie für ihr spezifisches Forschungsmodell verwenden sollten.
Während sich dieses Protokoll auf die Verwendung von Substraten zur Beurteilung der mitochondrialen Aktivität konzentriert, kann die Verwendung spezifischer Inhibitoren erforderlich sein, um experimentelle Ziele zu erreichen. Zum Beispiel kann Rotenon verwendet werden, um Komplex I 12,21,30 zu hemmen, Oligomycin zur Hemmung von Komplex V (ATP-Synthase)12,21 und Antimycin A zur Blockierung von Komplex III12,21 zur Beurteilung der nicht-mitochondrialen Atmung. Das oben bereitgestellte Protokoll kann leicht angepasst werden, um die Verwendung spezifischer Inhibitoren einzubeziehen. Bemerkenswert ist, dass ein Vorbehalt in Bezug auf die Verwendung von Inhibitoren darin besteht, dass diese Verbindungen klebrig sind und eine umfangreiche Reinigung erfordern, um sie aus der Instrumentenkammer zu entfernen. Wir stellen fest, dass die Verwendung einer Lösung von 10% BSA für 60 min für die Entfernung von Restinhibitoren ausreichend ist.
Die LEAK-Atmung bezieht sich auf die Sauerstoffverbrauchsrate, die unabhängig von der ATP-Synthese ist. Diese Rate stellt den Rückfluss von Protonen in die mitochondriale Matrix dar, der über die innere Mitochondrienmembran hinweg erfolgt. Es gibt drei anerkannte Methoden, um den Sauerstoffverbrauch unabhängig von der ATP-Synthese (LEAK) zu bewerten. Die erste, LEAK(n), misst den Sauerstoffverbrauch in Gegenwart von Substraten, jedoch ohne Zusatz von Adenylaten (ADP oder ATP)31,32,33. Dieser LEAK-Zustand stellt die intrinsische Undichtigkeit der Mitochondrienmembran dar. Die zweite Methode, LEAK(t), wird in Gegenwart von ATP34 gemessen, und die dritte, LEAK(o), wird in Gegenwart des ATP-Synthase-Inhibitors Oligomycin 35,36,37 gemessen. Dieses Protokoll verwendet LEAK(n) für diese Bewertung, aber je nach experimentellen Zielen und Modellen können andere Methoden zur Messung des LEAK-Sauerstoffflusses geeignet sein.
Für diesen Assay wird MiR05 sowohl mit Kreatin (3 mg/ml) als auch mit Blebbistatin (10 μM) ergänzt. Der mitochondriale ADP-Transport wird durch die Kreatinkinase (CK) erleichtert, und Kreatin wird der Atmungslösung zugesetzt, um die CK-Aktivität zu sättigen38,39. Muskelfasern können sich spontan zusammenziehen und sind auch empfindlich gegenüber ADP-induzierter Kontraktion. Um die mitochondriale Atmungsaktivität ohne den Einfluss der Kontraktion zu beurteilen, wurde Blebbistatin zugesetzt, um die kontraktile Aktivität der Fasernzu hemmen 38. Darüber hinaus deuten Studien an der menschlichen Muskulatur darauf hin, dass die Atmungskapazität durch die Biopsiemethode (Mikrobiopsie versus Bergstrom-Nadel) beeinflusst werden kann und dass dieser Unterschied auf Unterschiede in der erhaltenen Faserlänge zurückzuführen sein kann40,41. Kürzere Fasern können während der Zubereitung anfälliger für Beschädigungen sein, und die Verwendung von Blebbistatin hilft, die Funktion zu erhalten. Es kann bestimmte Bedingungen geben, unter denen die Faserentspannung nicht mit den Forschungszielen vereinbar ist, und in diesem Fall kann Blebbistatin aus der MiR05-Lösung ausgeschlossen werden.
Die Permeabilisierung der Skelettmuskelfasern mit Saponin erzeugt Poren in der Plasmamembran und ermöglicht es Substraten und Inhibitoren, ungehindert in die Zelle einzudringen. Saponin hat eine hohe Affinität zu Cholesterin, das reich und reichlich in zellulären Plasmamembranen vorhanden ist, während die Mitochondrienmembranen cholesterinarm sind42,43. Es wird erwartet, dass die Saponinbehandlung, die in diesem Protokoll zur Faservorbereitung verwendet wird, die Integrität der mitochondrialen Membran bewahrt. Eine Schädigung der Mitochondrien kann auch durch Scherkräfte entstehen, die sich aus der mechanischen Trennung des Gewebes in Fasern ergeben. Wir schlagen vor, dass die Trennung des Gewebes in Faserbündel schnell und mit minimalem Aufwand durchgeführt wird. Um mögliche mitochondriale Schäden zu beurteilen, haben wir die Titration von Cytochrom C in das Atmungsprotokoll aufgenommen. Cytochrom C kann keine intakte äußere Mitochondrienmembran12 passieren, daher deutet jede Erhöhung desO2-Flusses nach Zugabe von Cytochrom C darauf hin, dass während des Probenvorbereitungsprozesses eine Schädigung der äußeren Mitochondrienmembran aufgetreten ist. In einer unserer jüngsten Studien fanden wir heraus, dass derO2-Fluss nach Zugabe von Cytochrom C um 8%15 anstieg, was bestätigt, dass die in diesem Protokoll vorgeschlagene Saponinkonsum keine mitochondrialen Schäden hervorruft. Wir schlagen vor, dass jede Probe, die nach Zugabe von Cytochrom C einen Anstieg desO2-Flusses um mehr als 15 % zeigt, von der Analyse ausgeschlossen werdensollte 44. Dieser Schritt dient ausschließlich der Qualitätskontrolle und nicht der Bewertung der Aktivität des Komplexes IV.
Während sich die hochauflösende Respirometrie durch hochempfindliche und zuverlässige Messungen des Sauerstoffverbrauchs auszeichnet, besteht eine bemerkenswerte Einschränkung der Instrumente darin, dass nur zwei Proben gleichzeitig pro Instrument gemessen werden können. Dies erfordert eine sorgfältige Abwägung bei der Konzeption von Studien mit Kohorten mit mehreren Stichproben. Auch wenn die Versuchung groß sein mag, im Laufe des Tages Messungen an verschiedenen Probensätzen durchzuführen, raten wir den Forschern dringend, den Einfluss des zirkadianen Rhythmus auf den Stoffwechsel zu berücksichtigen. Untersuchungen an menschlichen und Nagetier-Skelettmuskeln haben einen Einfluss der biologischen Uhr auf die Mitochondrienfunktion gezeigt 45,46. Daher empfehlen wir, Messungen über mehrere Tage zur gleichen Tageszeit durchzuführen, um diese zirkadianen Schwankungen zu berücksichtigen.
Um reproduzierbare und robuste Respirometrie-Messungen zu gewährleisten, muss das Respirometer regelmäßig gereinigt, gewartet und kalibriert werden. Die Luftkalibrierung, wie im Protokoll beschrieben, sollte täglich durchgeführt werden. Wir empfehlen den Benutzern, auch eine vollständige monatliche Kalibrierung (sowohl Luft als auch Null) der polarographischen Sauerstoffsensoren durchzuführen. Weitere Informationen zu dieser Kalibriermethode und Anweisungen zur routinemäßigen Gerätewartung finden Sie in der Dokumentation und auf der Website des Herstellers.
Die hochauflösende Respirometrie ist nach wie vor der Goldstandard für die Messung der mitochondrialen Atmung. Die in diesem Protokoll beschriebene Methode ermöglicht eine robuste Beurteilung der mitochondrialen Kapazität sowohl in der Skelettmuskulatur von Nagetieren als auch beim Menschen. Dieses Protokoll wurde auf Studien angewendet, in denen die mitochondriale Funktion im Zusammenhang mit genetischen Mausmodellen15,16 im Zusammenhang mit chronischen Nierenerkrankungen19 nach Verabreichung von Nahrungsergänzungsmitteln14,20 und Bewegung17,18 untersucht wurde.