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Hier werden zwei einfache, aber effektive Protokolle zur Isolierung von Immunzellen aus dem Gehirn und dem Schädelknochenmark vorgestellt. Diese Protokolle können zuverlässig eine große Menge lebensfähiger Immunzellen liefern, die für verschiedene nachgelagerte Anwendungen, insbesondere für die Durchflusszytometrie, geeignet sein können.
Um die Neuroinflammation bei verschiedenen Erkrankungen des Gehirns zu untersuchen, wurden viele Protokolle für Immunzellpräparate aus dem Gehirn etabliert und in verschiedenen Labors verwendet 15,16,17. Die gängigen Ansätze beinhalten die enzymbasierte Zelldissoziation mit anschließender Gradiententrennung. In der Regel wird bei diesen Protokollen das Hirngewebe zerkleinert und dann in einer Enzymaufschlusslösung, die sowohl Kollagenase als auch DNase enthält, 30-60 Minuten lang bei 37 °C unter leichtem Schütteln inkubiert. Nach dem Verdau werden die Zellen mit einer mechanischen Methode wie Pipettieren oder Dounce-Homogenisierung weiter dissoziationiert. Nach dem Passieren eines Zellsiebs (z. B. 70 μm Sieb) werden die Zellen einer Gradientenzentrifugation unterzogen (oft 30%/70% Dichtegradientenlösung), um Myelin, rote Blutkörperchen und Ablagerungen zu entfernen und Leukozyten anzureichern. Dieser Ansatz erfordert jedoch eine verlängerte enzymatische Inkubation bei 37 °C, die das Transkriptom und Proteom von Immunzellen des Gehirns erheblich verändern kann. Tatsächlich deutete eine systematische Untersuchung darauf hin, dass der enzymatische Ansatz tiefgreifende Veränderungen im Transkriptom und Proteotyp spezifischer Gehirnzellen einführt18. Dies könnte bei nachfolgenden transkriptomischen Analysen wie scRNA-seq zu Artefakten führen. Im Gegensatz dazu verwendet das hier berichtete Protokoll während des gesamten Verfahrens einen mechanischen Dissoziationsansatz bei kalten Temperaturen, wodurch der Zellstoffwechsel unterdrückt wird. Dies gewährleistet eine bessere Erhaltung des transkriptionellen und proteomischen Zustands und minimiert potenzielle Artefakte. Während der Protokollentwicklung stellten wir fest, dass die Verwendung eines großen Dounce-Homogenisators zur Homogenisierung von Hirngewebe entscheidend ist, um höhere Zellzahlen bei geringerem Zelltod zu erreichen. Es ist wahrscheinlich, dass während der Dounce-Homogenisierung das massive Vorhandensein von extrazellulären Matrizen, Zelltrümmern und zytoplasmatischen Bestandteilen für die Zellen toxisch ist. Die Verwendung einer übermäßigen Menge an Puffer hilft, diese giftigen Substanzen zu verdünnen und so ihre schädlichen Auswirkungen zu mildern, was zu einer besseren Lebensfähigkeit der Zellen führt. Die durchflusszytometrischen Daten bestätigten eine Lebensfähigkeitsrate von etwa 85 % der mit diesem Protokoll hergestellten Immunzellen. Darüber hinaus ist bemerkenswert, dass die Zentrifugation mit nur einer 30%igen Dichtegradientenlösung die Immunzellen des Gehirns effektiv anreichert und Myelin entfernt. Dadurch können auch die Kosten für die Zellvorbereitung gesenkt werden.
Studien an Immunzellen im Schädelknochenmark sind noch begrenzt. Eine Methode, die häufig verwendet wird, um Zellen aus dem Schädelschädel der Maus zu isolieren, besteht darin, den Schädel in kleine Stücke zu schneiden und die Stücke dann mechanisch mit einem Stößel6 zu zerkleinern. Im aktuellen Protokoll wird eine kurze Zentrifugation verwendet. Diese Methode basiert auf einem veröffentlichten Protokoll zur Präparation von Knochenmark aus Femuren und Tibias19. Bei diesen langen Knochen muss man nur ein Ende des Knochens abschneiden, um durch Zentrifugation Knochenmark zu gewinnen. Für den Schädel wird dieser Schritt modifiziert, indem er in mehrere kleine Stücke geschnitten wird, um die Markhöhle zu öffnen. Es wird empfohlen, ein einheitliches Muster für den Schnitt des Schädels zu verwenden, um reproduzierbare Zellzahlen zu erhalten. Um die Gewinnung von Knochenmarkzellen zu maximieren, können die Schädelstücke außerdem 2-3 Zentrifugationsrunden unterzogen werden, wobei zwischen den einzelnen Zentrifugationen gemischt wird.
Beide Protokolle haben Einschränkungen. Erstens kann die Verwendung einer 30%igen Dichtegradientenlösungszentrifugation die verbleibenden roten Blutkörperchen im Gehirn nicht effektiv entfernen, was aufgrund einer unvollständigen Perfusion auftreten kann. Wenn die Myelinstruktur unter bestimmten Bedingungen moduliert wird, ist eine 30%ige Dichtegradientenlösung möglicherweise keine optimale Konzentration für ihre Entfernung. In diesem Fall muss eine andere Arbeitskonzentration der Dichtegradientenlösung festgelegt werden. Zweitens, obwohl die durchflusszytometrische Analyse eine gute Zellviabilität der Immunzellen des Gehirns unter Verwendung des beschriebenen Protokolls anzeigt, muss sie noch für andere Anwendungen evaluiert werden, wie z. B. die transkriptomische Analyse, bei der Actinomycin D verwendet werden kann. Drittens wird der Schädeldach zur Aufbereitung des Schädelknochenmarks verwendet. Zu beachten ist allerdings, dass Immunzellen in vielen anderen Teilen des Schädels existieren. Schließlich beherbergen die Hirnhäute, insbesondere die Dura mater, verschiedene Immunzellen und spielen eine Rolle bei der Homöostase und Dysfunktion des Gehirns20. Für die Immunanalyse der Hirnhäute kann ein an anderer Stelle veröffentlichtes Protokoll übernommen werden 17,21,22,23.
Zusammenfassend werden zwei robuste Protokolle für die Isolierung von Immunzellen sowohl aus dem Gehirn als auch aus dem Schädel der Maus beschrieben. Es wird erwartet, dass diese Protokolle nützlich sind, um eine große Menge hochwertiger Zellen zu erhalten, die für verschiedene Downstream-Anwendungen geeignet sind.