Bei dieser Methode werden fachspezifische Simulationen durchgeführt, um mögliche thermische und mechanische Effekte, die sich aus der TUS-Anwendung auf das Gehirn ergeben, vorherzusagen und zu bewerten. Die Datensätze zwischen den Teilnehmern müssen getrennt und sorgfältig dokumentiert werden, da die Verwendung eines falschen Scans oder einer falschen Datei zu ungenauen Simulationen führt. Wenn zahlreiche Teilnehmerscans gesammelt werden und die Planung gemeinsam durchgeführt wird, ist es wichtig, auf eine korrekte Beschriftung von Bildern und Ordnern zu achten und beim Sortieren und Speichern von Dateien vorsichtig vorzugehen.
Um Simulationen genau durchführen zu können, muss der Schädel korrekt modelliert werden, um ein fachspezifisches Verständnis der akustischen und geometrischen Eigenschaften zu erlangen. BabelBrain erfordert daher die Durchführung eines CT- oder ZTE-Scans; Wenn keines von beiden verfügbar ist, kann BabelBrain eine vereinfachte Maske des Schädelknochens verwenden, die mit dem Charm-Tool erhalten wurde. CT-Scans liefern die genauesten Informationen über die Schädeleigenschaften, um vorherzusagen, wie sich der Ultraschall im Gehirn ausbreiten wird, sobald er den Schädel berührt. Dies wird durch die Verwendung voxelisierter Informationen des Schädelknochens erreicht, obwohl die Schätzung des Knochenvolumens aufgrund seiner heterogenen Natur immer noch schwer vorherzusagen ist51. In jüngerer Zeit wurden jedoch ultrakurze TE-MRT-Sequenzen, wie z. B. der ZTE-Scan, verwendet, um die akustischen Eigenschaften des Schädels zu bestimmen und TUS-Simulationen durchzuführen. Die Auflösung und der Kontrast der Knochenpixel sind in einem ZTE-Bild nicht so hoch wie in einer CT. Im Vergleich zu vereinfachten Masken, die nur aus der T1-w- und T2-w-MRT abgeleitet wurden, bieten ZTE-Bilder jedoch immer noch eine verbesserte Abschätzung der Erwärmung, wobei TUS-Simulationen52 ähnliche Vorhersagen wie CT-Scans53 enthalten. Durch die Verwendung von ZTE-Scans in Simulationen entfallen unnötige Strahlenbelastung und zusätzlicher Zeitaufwand für die Erstellung von Röntgen-CT-Bildern, da ZTE-Sequenzen zur ursprünglichen MRT-Scansitzung hinzugefügt werden können. ZTE-Protokolle sind jedoch kein Standardprodukt der meisten MRT-Scanner, und zusätzliche Forschung ist erforderlich, um die ZTE-basierte Nachbearbeitung für die Verwendung in der TUS-Modellierung zu verbessern. Wenn weder CT- noch ZTE-Bilder verfügbar sind, erstellt das mit BabelBrain verwendete Charm-Tool eine vereinfachte Maske aus T1- und T2-w-Bildern, um die Schädeleigenschaften vorherzusagen. Ein Vergleich von Simulationen, die mit einer CT und einer vereinfachten Maske durchgeführt wurden, ergab minimale Unterschiede in der Lenkung (1,00 mm ± 1,3 mm) und der mechanischen Repositionierung (x-Richtung 0,2 mm ± 0,4 mm; y-Richtung 0,1 mm ± 0,5 mm), die erforderlich war, um das Ziel zu erreichen, jedoch leicht unterschiedliche Intensitätsverteilung (Fokuslänge 6 % ± 8 %; Fokusbreite 2,7 % ± 2 %; Fokusvolumen 10,4 % ± 16 %; Spitzendruck -0,5 % ± 15 % für vereinfachte Maske relativ zur CT)36. Dies zeigt, dass die CT genauere Simulationen liefert; Wenn jedoch kein CT- oder ZTE-Scan verwendet werden kann, ist die vereinfachte Maske ausreichend, um Simulationen für TUS-Experimente am Menschen durchzuführen.
Die Kartierung von Methoden der akustischen Eigenschaften bleibt ein notwendiges Forschungsgebiet, da die Vorhersage der Schallgeschwindigkeit und der Dämpfung aus CT- und MRT-Bildern noch ein besseres Verständnis und einen optimierten Arbeitsablauf erfordert. Daher bleibt ein Vorbehalt der möglichen Abweichung der thermischen oder mechanischen Effekte von dem, was in der Simulation vorhergesagt wird, bestehen. Die Modellierung akustischer Effekte in BabelBrain erfolgt unter Verwendung einer Open-Source-Bibliothek BabelViscoFDTD54,55, die es ermöglicht, sowohl die lineare Kompressions- als auch die Scherwellenübertragung zu modellieren. Dieses Modell wurde im Vergleich zu mehreren anderen Modellen in Bezug auf Position, Größe und Größe des Fokusses validiert, die sich um weniger als 10 % im Fokusdruck und weniger als 1 mm in der Fokuspositionierung unterscheiden56. Akustische Simulationen sind daher in Übereinstimmung mit anderen Simulationsmodellen. Thermische Vorhersagen sind schwieriger und wurden nicht experimentell validiert, da die MR-Thermometrie nicht im Schädel durchgeführt werden kann und die Temperaturänderungen voraussichtlich sehr gering sind, was eine Quelle der Unsicherheit darstellt. Die in BabelBrain verwendete thermische Modellierung ist zwischen den Arbeiten konsistent und löst die Biowärmeübertragungsgleichung (BHTE), um die Erwärmung des Schädels durch Modellierung der thermischen Diffusion, der Perfusionseffekte und der akustischen Leistung zu simulieren36,51. Schätzungen des thermischen Anstiegs aus Modellen der Dämpfung und Absorption werden verwendet, um die Auswirkungen im Schädel mit TUS auf der Grundlage anderer veröffentlichter Literaturvorherzusagen 57 und dienen als bisher beste Alternative zur Simulation der Schädelerwärmung. Wie in den beschriebenen Verfahren zu sehen ist, spezifiziert der Benutzer die Dauer des Ultraschalls, die Abwesenheit nach dem Ultraschall, den Tastverhältnis und die gewünschte räumliche Spitzenpuls-Durchschnittsintensität unter Gehirnbedingungen, wobei die Sicherheitsparameter als Funktion der Parameterauswahl berechnet werden. Der Benutzer muss daher alle anzuwendenden Parameter überprüfen, um sicherzustellen, dass sie den Sicherheitsanforderungen entsprechen. Verschiedene Neuronavigationssysteme, die verwendet werden, um den Schallkopf über dem interessierenden Bereich zu positionieren, haben ebenfalls einen Zielregistrierungsfehler von etwa 3 mm 38,58,59. Abhängig von der verwendeten Frequenz und der Größe des Ziels kann der Brennfleck jedoch auch bei einem Fehler von 3 mm immer noch groß genug sein, um das Ziel abzudecken. Obwohl dies eine Einschränkung sein mag, bietet es aufgrund der Invasivität stereotaktischer Lokalisierungsmethoden immer noch einen größeren Vorteil gegenüber alternativen Navigationssystemen.
BabelBrain vereinfacht die Planungsschritte, die für die Durchführung von TUS-Experimenten am Menschen erforderlich sind, da es effizient und einfach zu bedienen ist und das bisher einzige Open-Source-zugängliche Planungstool ist. Dies ermöglicht Transparenz bei experimentellen Methoden in der veröffentlichten Literatur, da die verwendeten Skripte offen zugänglich sind. Die beschriebene Methode führt die Schritte der Datenaufbereitung und Bildverarbeitung durch, so dass keine benutzerdefinierten Skripte oder eine externe Zusammenarbeit zur Durchführung von Simulationen erforderlich sind. Damit wird ein großes Hindernis für Experimentatoren beseitigt, da sie Planungen und Simulationen direkt durchführen können und mehr Laboratorien erfolgreiche TUS-Experimente durchführen können. Neben der prospektiven Planung von Experimenten bietet diese Methode auch potenzielle Anwendungen bei der Planung der Kavitations-vermittelten FUS-Therapie36, wie z. B. der Öffnung der Blut-Hirn-Schranke59. Insgesamt bietet diese Methode einen effektiven, optimierten Ansatz für die Planung und Durchführung von TUS-Experimenten am Menschen und die Entwicklung von TUS für den Einsatz im klinischen Umfeld.