Wirkstoffe und Wirkungsziele der Xiaoyao-Pillen
Durch die Suche in der TCMSP-Datenbank und das Screening nach den Kriterien der oralen Bioverfügbarkeit (OB) ≥ 30% und der arzneimittelähnlichen Eigenschaften (DL) ≥ 0,18 wurden 125 Wirkstoffe in Xiaoyao-Pillen gefunden. Die Zutaten 6, 4, 9, 13, 2, 6, 83 und 2 stammten von White Paeonia lactiflora, Atractylodes macrocephala, Menthae herba, Chaihu, Angelica sinensis, Poria cocos, Süßholz und Ingwer. Einige der Wirkstoffe sind in Tabelle 1 aufgeführt. Darüber hinaus wurden insgesamt 879 Ziele mit wirksamen Wirkstoffen aus der TCMSP-Datenbank gewonnen, und 232 Ziele blieben nach ID-Konvertierung und Löschung doppelter Werte übrig.
Netzwerkanalyse der TCM - Wirkstoff - Schnittpunkt - Krankheit
Mehrere Datenbanken wurden unter dem Stichwort Osteoporose nach Genen durchsucht, die mit der Krankheit in Verbindung stehen. In der GeneCards-Datenbank wurden 1692 Gene nach dem Relevanz-Score ≥1 gefiltert. Insgesamt wurden 35 Gene in der OMIM-Datenbank erfasst. Es gab 3, 33 bzw. 386 Gene in den Datenbanken PharmGkb, TTD und DrugBank. Anschließend wurde die Schnittmenge der Ergebnisse dieser fünf Datenbanken für die weitere Analyse verwendet (Abbildung 1A). Eines der Gene, das in vier Datenbanken vertreten war, war CALCR. Insgesamt wurden 102 sich überschneidende Gene erhalten, nachdem die krankheitsbezogenen Gene kombiniert und die Schnittmenge mit dem Wirkstoffziel genommen wurden (Abbildung 1B). Basierend auf den Wechselwirkungen zwischen den Krankheitszielen und den Wirkstoffen des Medikaments wurde mit der Cytoscape-Software ein TCM-Wirkstoff-überschneidendes Ziel-Krankheitsnetzwerk konstruiert. Als Ergebnis wurden Beziehungen zwischen den Komponenten des Medikaments und der polymorphen Regulation von krankheitsbezogenen Genscans erhalten (Abbildung 2A).
In der String-Datenbank wurden Proteininteraktionen an der Schnittstelle von Krankheitsgenen und Wirkstoffzielen analysiert, um ihre Interaktionsnetzwerkdiagramme zu erhalten (Abbildung 2B), und diese wurden dann auf die zentralsten Proteine gescreent (Abbildung 2C-D). Die Ergebnisse zeigten die stärksten Wechselwirkungen zwischen FOS, ESR1, MAPK3, TP53, MAPK1 und STAT3 unter den Krankheitsgenen und Wirkstoffzielen (Abbildung 2E).
GO-Funktion und Analyse der KEGG-Signalanreicherung
Die GO-Anreicherungsanalyse ergab insgesamt 2177 Einträge, darunter 1990 Einträge zu biologischen Prozessen (BP), 58 Einträgen zu Zellkomponenten (CC) und 129 Einträgen zu molekularen Funktionen (MF). Bei BP konzentrierten sich die Gene hauptsächlich auf die Reaktion auf den Nährstoffgehalt, die Reaktion auf oxidativen Stress und die zelluläre Reaktion auf oxidativen Stress. MF konzentrierte sich auf die Bindung von DNA-bindenden Transkriptionsfaktoren, die RNA-Polymerase II-spezifische DNA-bindende Transkriptionsfaktor-Bindung, die Kernrezeptoraktivität, die ligandenaktivierte Transkriptionsfaktoraktivität und die Zytokinaktivität (Abbildung 3A-B).
In der Analyse der Anreicherung des KEGG-Signalwegs wurden insgesamt 168 verwandte Signalwege erhalten, wobei die signifikantesten der AGE-RAGE-Signalweg, der IL-17-Signalweg, der TNF-Signalweg, der HIF-1-Signalweg und die Th17-Zelldifferenzierung waren (Abbildung 3C-D). Es wird vermutet, dass Xiaoyao-Pillen auf verschiedene Weise therapeutische Wirkungen auf PMOM ausüben können. Entzündungen sind stark mit Osteoporose assoziiert und können durch die Menopause beschleunigt werden, und IL-17 ist ein wichtiger Entzündungsfaktor7. Daher ist der nächste Plan zu untersuchen, ob Xiaoyao-Pillen Osteoporose aus einer entzündlichen Perspektive in Bezug auf IL-17 behandeln könnten.
Strukturelle Veränderungen im Knochengewebe vor und nach der Entnahme von Eierstockgewebe
Die HE-Färbung zeigte, dass in den Femuren von Shammäusen die Trabekel eng angeordnet waren, mit guter Kontinuität, kleinen Lücken zwischen den Trabekeln, seltenen Frakturen und normaler Größe der Knochenmarkhöhle. Im Vergleich zur Sham-Gruppe waren die Femure der OVX-Gruppe spärlich angeordnet, mit schweren Frakturen der Trabekel, gestörter Kontinuität und einer deutlich vergrößerten Knochenmarkhöhle, die typische osteoporotische Veränderungen aufwies (Abbildung 4A).
Mikro-CT-Vergleich zwischen den Gruppen
Die Femure von Mäusen in der OVX-Gruppe zeigten ein unvollständiges Trabekelwerk, eine teilweise leere Knochenmarkhöhle und eine Ausdünnung der Knochenrinde im Vergleich zu denen von Mäusen in der Sham-Gruppe. Die Sham-Gruppe von Mäusen zeigte eine Fülle von Trabekeln, eine gute Kontinuität und eine Verengung der Knochenmarkhöhle in ihren Femuren (Abbildung 4B).
Verhaltenseffekte von Xiaoyao-Pillen auf Mäuse
Während des Studienzeitraums hatten mit Ausnahme der OVX-Gruppe alle Mäuse in den anderen Gruppen bessere Lebensgewohnheiten, eine normale Haarfarbe, eine hohe Mobilität und eine gute Gesundheit. Der Urin und der Kot jeder Maus normalisierten sich innerhalb von 1 Woche nach der Behandlung mit Xiaoyao-Pillen wieder. Es gab keine Bisse, Wundinfektionen, Magen-Darm-Obstruktion, Nahtablösung, Hautnekrose des Schnitts oder Tod einer der Mäuse. Die Mäuse in der OVX-Gruppe waren anfällig für Haarausfall, Verdunkelung der Haarfarbe, eingeschränkte Mobilität, längere Reflexe, erhöhte Ausscheidung und vermindertes Fressen und Trinken.
HE-Färbung pathologischer Schnitte von Mäusen nach medikamentöser Intervention
In der Sham-Gruppe war das Oberschenkelgewebe dicht, retikulär und regelmäßig angeordnet. Die Größe und Kontinuität der Knochenmarkhöhle war normal und der Abstand zwischen den angrenzenden Knochentrabekeln war relativ klein. Im Vergleich zur Sham-Gruppe zeigten die Femurrinde und der spongiöse Knochen in der OVX-Gruppe offensichtliche Defekte, verminderte Trabekel, vergrößerte Lücken, unterbrochene Kontinuität, Ausdünnung der Struktur, Erweiterung der Markhöhle und Ausdünnung der Knochenrinde. Im Vergleich zur OVX-Gruppe schienen die Femurtrabekel der Mäuse in den medikamentös behandelten Gruppen (niedrige und hohe Dosen) strukturell intakt zu sein, mit reduzierten Abständen, erhöhter Konnektivität, verengten Knochenmarkhöhlen und dichteren Strukturen (Abbildung 5A).
Detektion von Bildgebungsindizes bei Mäusen nach medikamentöser Intervention
Im Vergleich zur Sham-Gruppe wiesen die Femure der Mäuse in der OVX-Gruppe spärliche und gebrochene Knochentrabekel und eine ausgedünnte Knochenrinde auf. Im Vergleich zur OVX-Gruppe wiesen die Mäuse in der Gruppe der hochdosierten Xiaoyao-Pillen weniger frakturierte Knochentrabekel, eine wiederhergestellte Retikulation und ein signifikantes Maß an teilweiser Verkleinerung der Knochenmarkhöhle auf. Die Mäuse, die mit niedrig dosierten Xiaoyao-Pillen behandelt wurden, hatten jedoch immer noch frakturierte Knochentrabekel, obwohl es zu einer Zunahme der Knochentrabekel und einer Verkleinerung der Knochenmarkhöhle kam. Die trabekuläre Struktur der Knochentrabekel der scheinoperierten Gruppe zeigte mehr Kontinuität und Vollständigkeit (Abbildung 5B).
Immunhistochemische Ergebnisse von Geweben in den Gruppen nach medikamentöser Intervention
Act1 und IL-6 sind Schlüsselproteine im IL-17-Signalweg, und ALP und COL-1 sind osteogene Gene. Die Expression von ALP-, COL-1-, IL-6-, IL-17- und Act1-Proteinen führt zur Bildung von hellbraunen oder gelben Granulaten auf dem Knochengewebe. Die immunhistochemischen Ergebnisse zeigten, dass die mittleren optischen Dichtewerte von ALP und COL-1 in der Wirkstoffgruppe höher waren als die in der OVX-Gruppe nach Behandlung mit Xiaoyao-Pillen, und der Unterschied war statistisch signifikant (p < 0,05). Die mittleren optischen Dichtewerte von IL-17, Act1 und IL-6 in der Wirkstoffgruppe waren niedriger als die in der OVX-Gruppe, und der Unterschied war statistisch signifikant (p < 0,05; Abbildung 6). Xiaoyao-Pillen kehrten den durch die Ovariektomie verursachten Rückgang von ALP und COL-1 um, während sie die Expression mehrerer Schlüsselproteine IL-17, IL-6 und Act1 im IL-17-Signalweg verringerten, was darauf hindeutet, dass das Medikament seine therapeutische Wirkung über diesen Signalweg ausüben kann.

Abbildung 1: Netzwerkanalyse der Schnittstelle von Wirkstoffen der chinesischen Kräutermedizin und krankheitsbezogenen Genen. (A) Die Überschneidung von krankheitsbezogenen Genen, die aus den Datenbanken GeneCards, OMIM, PharmGkb, TTD und DrugBank stammen. Diese werden durch blaue, rote, grüne, gelbe und braune Farben mit den Genen 1692, 35, 3, 33 bzw. 386 dargestellt. Die Schnittmenge besteht aus den krankheitsassoziierten Genen in den fünf Datenbanken, und der überlappende Teil gibt die Anzahl der sich überschneidenden Gene in jeder Datenbank an. (B) Die Überschneidung der Wirkstoffziele (wobei die blaue Farbe diesen Datensatz kennzeichnet, d. h. die Menge der medikamentenwirkenden Zielgene, die in der TCMSP-Datenbank nach der ID-Transformation und der Entfernung von Duplikaten gesammelt wurden) und krankheitsbezogene Gene (wobei die rote Farbe diesen Datensatz anzeigt, der alle Gene aus den fünf oben genannten Datenbanken enthält) wird angezeigt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: Interaktion von Wirkstoffen der TCM mit krankheitsbezogenen genregulatorischen Netzwerken und Kernproteinen. (A) Das regulatorische Netzwerk von Wirkstoffen und krankheitsbezogenen Genen in der TCM zeigt die genregulatorischen Beziehungen, die jedem Wirkstoff in den Xiaoyao-Pillen entsprechen, wobei jeder Inhaltsstoff mit dem Gen verknüpft ist, das er reguliert. (B) Die Ergebnisse der Protein-Protein-Interaktionsanalyse von sich überschneidenden Genen in STRING (die Netzwerkknoten repräsentieren Proteine, Kanten repräsentieren Protein-Protein-Assoziationen und multiple Verknüpfungen weisen auf multiple Wechselwirkungen zwischen zwei Proteinen hin). (C-E) Die mit String erhaltenen Proteininteraktionen wurden mehrfach gescreent. (C) Das Proteininteraktionsnetzwerk wurde nach dem ersten Screening erhalten, und der hervorgehobene Teil ist sein Kernteil. (D) Das Ergebnis des zweiten Screenings und der hervorgehobene Teil ist der Kernteil. (E) Das zentralste Protein-Interaktionsnetzwerk im Protein-Interaktionsnetzwerk. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 3: GO- und KEGG-Anreicherungsanalyse. (A-B) Die Ergebnisse der GO-Anreicherungsanalyse sich überschneidender Gene sind in 3 Einträge unterteilt: Biologischer Prozess (BP), Zelluläre Komponente (CC) und Molekulare Funktion (MF), und jeder Eintrag zeigt nur die Top 10 der am stärksten angereicherten Gene. (C-D) Die Ergebnisse der KEGG-Anreicherungsanalyse der sich überschneidenden Gene (zeigen die Top 30 der am stärksten angereicherten Gene). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 4: Etablierung und Evaluierung des ovariektomierten Mausmodells. (A) Vergleich der metaphysären Knochenmorphologie zwischen der scheinoperierten und der ovariektomierten Gruppe (10x). In der OVX-Gruppe waren die Trabekelfrakturen schwerwiegend, die Kontinuität war gestört und die Knochenmarkhöhle war signifikant vergrößert, während in der Scheingruppe die Trabekelfrakturen selten waren und die Knochenmarkhöhle normal groß war. (B) Mikro-CT-Scans des Femurs in der scheinoperierten und der ovariektomierten Gruppe. In der OVX-Gruppe war das Trabekelwerk unvollständig und die Knochenmarkhöhle teilweise leer. In der Sham-Gruppe waren die Trabekel reichlich vorhanden und kontinuierlich, und die Knochenmarkhöhle war eng. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 5: HE- und Mikro-CT-Assay nach Behandlung mit den Xiaoyao-Pillen. (A) HE-Färbung (10x) von Femurschnitten von Mäusen in jeder Gruppe nach der Behandlung mit Xiaoyao-Pillen. In der OVX-Gruppe waren die Knochentrabekel verkleinert, die Kontinuität unterbrochen, die Struktur spärlich und die Knochenmarkhöhle vergrößert. In der Sham-Gruppe wiesen die Knochentrabekel eine gute Kontinuität auf, das Oberschenkelgewebe war strukturell dicht und die Knochenmarkhöhle war normal. Im Vergleich zur OVX-Gruppe erschienen die Knochentrabekel in der Wirkstoffgruppe strukturell intakt, mit erhöhter Konnektivität, einer reduzierten Knochenmarkhöhle und einer dichteren Struktur als in der Modellgruppe. (B) Vergleich der Mikro-CT von Oberschenkelknochen von Mäusen in jeder Gruppe nach Behandlung mit Xiaoyao-Pillen. Die Knochentrabekel in den Femuren der Mäuse der ovariektomierten Gruppe waren spärlich und gebrochen, während die Sham-Gruppe kontinuierlichere und intaktere Trabekel aufwies. Im Vergleich zur ovariektomierten Gruppe hatten Mäuse in der hochdosierten medikamentös behandelten Gruppe weniger gebrochene Knochentrabekel, eine wiederhergestellte retikuläre Struktur und eine teilweise reduzierte Knochenmarkhöhle, während die Tiere in der niedrig dosierten Wirkstoffgruppe mehr Knochentrabekel und eine reduzierte Knochenmarkhöhle aufwiesen, aber die gebrochenen Knochentrabekel blieben. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 6: Immunhistochemie zum Nachweis der Wirkung von Xiaoyao-Pillen auf den IL-17-Signalweg und die Expression osteogener Markergenproteine in osteoporotischen Mäusen (40x). Positive Reaktionen auf das Vorhandensein von ALP-, COL-1-, IL-6- sowie IL-17- und Act1-Proteinen äußerten sich durch das Auftreten von hellbraunen oder gelben Granulaten auf dem Knochengewebe. Die Expression von ALP und COL-1 in der Wirkstoffgruppe war höher als in der OVX-Gruppe (p < 0,05). Die Expression von IL-17, Act1 und IL-6 in der Wirkstoffgruppe war niedriger als in der OVX-Gruppe (p < 0,05). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
| Name der Traditionellen Chinesischen Medizin | Molekulare ID | Name des Moleküls |
| Weiße Paeonia lactiflora | MOL001918 | Paeoniflorgenon |
| Weiße Paeonia lactiflora | MOL000211 | Mairin |
| Atractylodes macrocephala | MOL000022 | 14-Acetyl-12-senecioyl-2E,8Z,10E-atractylentriol |
| Atractylodes macrocephala | MOL000049 | 3β-Acetoxyatractylon |
| Menthae Herba | MOL000471 | Aloe-Emodin |
| Menthae Herba | MOL005190 | Eriodictyol |
| Chai Hu | MOL000354 | Isorhamnetin |
| Chai Hu | MOL013187 | Würfel |
| Angelica sinensis | MOL000449 | Stigmasterol |
| Angelica sinensis | MOL000358 | Beta-Sitosterol |
| Poria Kokosnüsse | MOL000282 | ergosta-7,22E-dien-3beta-ol |
| Poria Kokosnüsse | MOL000283 | Ergosterolperoxid |
| Lakritze | MOL002311 | Glycyrol |
| Lakritze | MOL004990 | 7,2',4'-trihydroxy - 5-methoxy-3-arylcoumarin |
| Frischer Ingwer | MOL006129 | 6-Methylgingdiacetat2 |
| Frischer Ingwer | MOL001771 | poriferast-5-de-3beta-ol |
Tabelle 1: Wirkstoffe in ausgewählten chinesischen Arzneimitteln. Die erste Spalte listet die Namen der traditionellen chinesischen Medizin auf, die zweite Spalte ist die ID des Wirkstoffs der chinesischen Medizin und die dritte Spalte ist der Name des Wirkstoffs der chinesischen Medizin.
Ergänzende Codierungsdatei 1: Fusionscode für den Kräuternamen, die Zutat und die Ziel-ID. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Codierungsdatei 2: Umwandlung der Wirkstoffziel-ID. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Codierungsdatei 3: Dateien für die Netzwerkanalyse. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Kodierungsdatei 4: Umwandlung von Symbol-zu-Gen-ID. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Codierungsdatei 5: GO-Anreicherungsanalyse. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Kodierungsdatei 6: KEGG-Anreicherungsanalyse. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.