Der vorliegende Bericht beschreibt das Verfahren zur Durchführung von Maus-in-vivo-PET-Bildgebung mit den BCAM-Formen und zur Analyse der Daten mit dem automatisierten SaaS-Tool. Es werden Schritt-für-Schritt-Anleitungen zur Mausvorbereitung, zur Bildaufnahme und zur Datenverarbeitung bereitgestellt. Dieser Automatisierungsworkflow lieferte auch Daten, die mit der manuellen Analyse konsistent waren. Im Folgenden werden einige wichtige technische Überlegungen hervorgehoben.
Obwohl ein Tumor nicht zu den Organen gehört, die durch das OPM definiert werden, ist ein kritischer Schritt in diesem Protokoll die korrekte Implantation von subkutanen Tumoren, um letztendlich eine optimale Ausrichtung aller Mausorgane in der Körperhöhle und BCAM zu gewährleisten. Das OPM kann nur dann genaue Daten liefern, wenn die Wirbelsäule einer Maus relativ gerade ist und die inneren Organe neutral positioniert sind. Zu große oder falsch platzierte Tumore könnten die Haltung der Maus beeinträchtigen und in ihre Körperhöhle drücken, wodurch sich die inneren Organe verschieben. Diese Verschiebung wiederum wird die resultierende quantitative Analyse des OPM-Algorithmus verzerren. Andere haben über die Auswirkungen einer ungeraden Wirbelsäule auf die Ausrichtung innerer Organe unter Verwendung verschiedener Bildgebungsmodalitäten und Segmentierungsalgorithmen berichtet13,14. Daher ist es von entscheidender Bedeutung, die Schablone zu verwenden, um die Tumorimplantation zu steuern und das Tumorwachstum genau zu überwachen, um sicherzustellen, dass die Tumore sowohl richtig positioniert als auch im idealen Größenbereich sind.
Ein weiterer Bereich, in dem eine Abweichung möglich ist, ist die Auswahl eines BCAM in der richtigen Größe. BCAMs werden in 2-g-Integralen mit einem Bereich von 18-26 g erstellt. Da Mäuse mit unterschiedlicher Körperzusammensetzung (z. B. mehr Muskeln versus mehr Fett) jedoch das gleiche Körpergewicht, aber unterschiedliche Körpergrößen haben können, ist es wichtig, den am besten geeigneten BCAM zu wählen und dabei ihr Körpergewicht als allgemeine Referenz zu verwenden. Steigen Sie durch Versuch und Irrtum auf oder ab, und denken Sie daran, dass die richtige Ausrichtung entscheidend ist. Die Wahl eines zu großen BCAM führt dazu, dass die inneren Organe der Maus näher an den Boden des Bettes "sinken", was sich insbesondere auf die Genauigkeit der Analyse der dorsalen Organe wie Nieren und Wirbelsäule auswirkt. Im Gegensatz dazu könnte das Platzieren einer zu kleinen Maus in einem BCAM auf ihre Körperhöhlen drücken, die Organpositionierung verzerren und möglicherweise Schwierigkeiten beim Atmen verursachen. Die Verwendung von Klebeband, um sicherzustellen, dass die Gliedmaßen auf Pfotenplattformen befestigt sind, hilft bei der Einrichtung und Positionierung.
Obwohl dieser berichtete Workflow eine standardisierte und automatisierte PET-Bildanalyse ermöglicht, ist es erwähnenswert, dass das aktuelle OPM auf dem immunkompetenten Mausstamm C57BL/6 und gesunden Mäusen basiert. Andere Stämme und Gesundheitszustände von Mäusen können unterschiedliche anatomische Merkmale aufweisen, die eine zusätzliche Anpassung, Optimierung und Validierung des Algorithmus erfordern. Zum Beispiel haben immundefiziente Stämme wie NSG oder NCG eine kleinere Milz. In ähnlicher Weise können Mäuse, die orthotope Tumorimplantate tragen, je nach Krankheitsstatus unterschiedliche Größen, Formen und Positionen der inneren Organe aufweisen. Eine weitere Einschränkung dieses Workflows ist der Gesamtdurchsatz während der Aufnahmephase eines Experiments. Das liegt vor allem an der zusätzlichen Zeit, die benötigt wird, um eine Maus im BCAM richtig einzurichten. Schulung und Übung könnten die Effizienz des Bedieners bei der richtigen Platzierung steigern. Das Hinzufügen einer zweiten Dockingstation kann auch den Gesamtdurchsatz erhöhen, wobei eine Dockingstation für die BCAM-Einrichtung und die andere für das Entfernen einer Maus in einen Wiederherstellungskäfig dienen kann. Trotz des erhöhten Zeitaufwands, der für die Einrichtung von BCAM vor dem Scannen erforderlich ist, zahlt sich die Zeitinvestition aus, indem Zeit bei der Datenanalyse gespart wird. In der vorliegenden Studie dauerte es beispielsweise weniger als 10 Minuten, bis das OPM zehn Bilder (mit 4 ROIs) analysiert hatte, während es für einen sehr erfahrenen Analysten 3-4 Stunden dauerte, um denselben Satz von Bildern und ROIs manuell zu segmentieren und zu analysieren. Ein unerfahrener Analyst würde noch mehr Zeit für die manuelle Analyse benötigen. Die SaaS-Plattform ermöglicht die Analyse von PET-Scans in großen Chargen, wobei eine vollständige In-vivo-Biodistributionsanalyse innerhalb von Minuten nach dem Hochladen der Daten abgeschlossen werden kann. Dies ist eine äußerst hilfreiche Funktion, wenn große Datenmengen aus mehreren Gruppen und/oder über mehrere Zeitpunkte hinweg verarbeitet werden, wie im Folgenden erläutert wird.
Die manuelle Segmentierung von Organen für ein einzelnes Subjekt kann zeitaufwändig sein und erfordert in der Regel eine erhebliche Vorabschulung des Bedieners. Selbst bei angemessener Schulung sind manuelle Analysen unweigerlich mit Schwankungen zwischen den Bedienern konfrontiert, die die quantitativen Ergebnisse verzerren können15,16. Im Gegensatz dazu können durch automatisierte Segmentierung und Datenanalyse die gesamte Bioverteilung eines Radiotracers genau und effizient bestimmt und Variabilitäten eliminiert werden, die auf menschliche Vorgänge zurückzuführen sind. Solche Vorteile der Automatisierung wurden sowohl in der klinischen Bildanalyse als auch im präklinischen Bereich gesehen. Zum Beispiel zeigten Sluis et al., dass ein einziger Scan 4 Stunden benötigte, um die interessierenden Organe zu segmentieren, verglichen mit 30 Minuten mit KI-Cloud-basierten Methoden17. Eine weitere Studie von Nazari et al. berichtete ebenfalls, dass die algorithmusbasierte Analyse von Leber und Nieren im Vergleich zu zwei menschlichen Medizinphysikern genaue Ergebnisse mit einer Genauigkeit von 7,0 % zeigte18. Die Daten in Abbildung 4 zeigten auch deutlich die Zuverlässigkeit des SaaS-basierten Arbeitsablaufs für die PET-Bildgebungsanalyse und dass die automatisierte Analyse im Vergleich zur manuellen Analyse konsistente Ergebnisse lieferte.
Zusammenfassend veranschaulicht dieser Artikel den Arbeitsablauf bei der Verwendung von BCAM-Formen, um eine standardisierte präklinische PET/CT-Bilderfassung sowie eine SaaS-fähige automatisierte PET-Datenanalyse zu ermöglichen. Es wird gezeigt, dass diese Plattformtechnologie relativ einfach einzusetzen ist und die Qualität der durch die Automatisierung generierten Daten mit der manuellen Analyse übereinstimmt, aber erhebliche Zeitersparnisse bietet. Daher kann dieser Workflow Forschern Hunderte von Stunden an Zeit bei der Datenanalyse einsparen und dazu beitragen, die Variabilität zwischen den Bedienern zu standardisieren und zu reduzieren. Dieses Verfahren kann bei der Entwicklung einer Vielzahl von Wirkstoffen über Modalitäten und Indikationen hinweg helfen. Insbesondere können großmolekulare Modalitäten wie therapeutische Antikörper, bispezifische Antikörper-Immunzell-Engager, Antikörper-Wirkstoff-Konjugate und sogar Nanopartikel leicht mit Radiometallen (z. B. Zr-89, Cu-64) markiert werden, um eine PET-Bildgebungs-vermittelte Biodistributionsbewertung zu ermöglichen19,20. In ähnlicher Weise kann diese Plattformtechnologie dazu beitragen, die Dosimetrie neuartiger Radiotherapeutika bei Mäusen zu bestimmen21. Die Anwendung dieses Verfahrens wird einen großen Mehrwert für die Arzneimittelentwicklung darstellen.