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Schriftliche Beschreibung der positiven und negativen Ergebnisse (einschließlich Positiv-/Negativplatten- und Tupferkontrollen)
Negativkontrolltupfer sind in den Überwachungsabstrich einbezogen, um eine mögliche Prionenkontamination zu überwachen, die während des Abstrichs, der Extraktion und des Konzentrationsprozesses eingebracht werden könnte. Die erste RT-QuIC-Platte, die für eine bestimmte monatliche Überwachung durchgeführt wird, sollte die Positiv- und Negativ-Abstrichkontrollen enthalten. Erfolgreiche Negativkontrollen überschreiten die positive Fluoreszenzschwelle nicht (Abbildung 6A). Dieses Ergebnis würde darauf hindeuten, dass während der experimentellen Verfahren keine Kontamination eingebracht wurde. Erfolgreiche Positivkontroll-Tupferextrakte zeigten eine positive Aussaat in allen Replikatvertiefungen für eine gegebene Probe (Positivkontrollabstriche waren mit dem hirnhomogenat des hamsteradaptierten transmissiblen Nerzenzephalopathiestamms Hyper (HY TME) kontaminiert. Die Einbeziehung einer Positivkontrollverdünnungsreihe ermöglicht die Bestimmung der Sensitivität der Prionendetektion für ein gegebenes Experiment (Abbildung 6A).
Bei der Untersuchung von Oberflächentupfer-Extraktproben können Oberflächen, die keine Aussaat über der vorgegebenen positiven Fluoreszenzschwelle aufweisen, als Prionen-negativ angesehen werden (Abbildung 6B). Umgekehrt zeigen Prionen-kontaminierte Oberflächentupferextrakte Seeding-Fähigkeiten oberhalb der positiven Fluoreszenzschwelle, obwohl das Maxpoint-Verhältnis (MPR) und die Zeit bis zur Fluoreszenz im Vergleich zur enthaltenen Positivplattenkontrolle variieren können (Abbildung 6B). Die Fähigkeit der Methode, eine angemessene Desinfektion zu beurteilen, wird durch die mit Bleiche behandelten Prionenkontaminierten Oberflächen unterstrichen, die RT-QuIC nun nicht mehr aussäen können (Abbildung 6B).
Wichtig ist, dass unser Labor zwar eine positive Probe als eine Probe definiert, die die eingestellte positive Fluoreszenzschwelle in mindestens der Hälfte der Replikatvertiefungen überschreitet, es jedoch notwendig ist, dass jedes Labor seine eigenen Standards festlegt. Die Rate der Amyloidbildung (RAF) und die Zeit bis zur Fluoreszenz können ebenfalls verwendet werden, um laborspezifische Schwellenwerte für die Positivität festzulegen.
Wir haben Ergebnisse von Oberflächenartefakten beobachtet, die die positive Fluoreszenzschwelle überschreiten, jedoch mit veränderten kinetischen Kurven und nach einer ungewöhnlich langen Zeit bis zur Fluoreszenz im Vergleich zu positiven Kontrollproben (Abbildung 6C). Diese Ergebnisse sollten mit Vorsicht interpretiert werden, da sie durch das Vorhandensein von Staub oder Chemikalienrückständen auf einer Oberfläche verursacht werden können. Diese Ergebnisse unterstreichen die Notwendigkeit einer allgemeinen Laborsauberkeit sowie Kriterien zur Unterscheidung zwischen True-Positive- und False-Positive-Seeding.
Die Entsorgung von festen und flüssigen Abfällen mit biologischer gefährlicher Gefahr sollte gemäß den aktuellen Richtlinien für die Entsorgung biologischer Gefahrstoffe einer bestimmten Institution erfolgen. Zu den gängigen Prionen-Desinfektionstechniken gehören die Behandlung mit Natriumhydroxid, Natriumhypochlorit (Bleichmittel) oder das Autoklavieren bei 134 °C für 18 min 43,44,45,46.

Abbildung 1: Schematische Übersicht des Swipe-Tests des Prionen-Sicherheitslabors. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 2: Beispiel für ein Layout der Abstrichstelle. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 3: Das Probenversuchsdesign für Tupferkontrollen umfasste einen Swipe-Test des Prionensicherheitslabors. (A) Probenlayout für negative und positive Tupferextraktkontrollen. (B) Negative und positive Tupferextraktkontrollen sollten mit 50 μl H2O resuspendiert werden. Eine 10-fache Verdünnung des resuspendierten Tupferextrakts sollte durch Verdünnung in eine Gewebeverdünnungslösung erzeugt werden. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 4: Probenversuchsdesign für Oberflächentupferextrakte aus dem Swipe-Test des Prionensicherheitslabors. (A) Probenlayout für Oberflächentupferextrakte. (B) Oberflächentupfer-Extraktproben sollten mit 20 μl Gewebeverdünnungslösung resuspendiert werden. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 5: Monatlicher Swipe-Test des Prionensicherheitslabors. Flussdiagramm, das zur Interpretation der Ergebnisse und zur Bestimmung der angemessenen Reaktion verwendet wird. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 6: Repräsentatives Oberflächenabstrich-Experiment. (A) Oberflächentupfer-Kontrollplatte mit Negativ-Tupfer-Extrakt-Kontrollen in dreifacher Ausführung (DPBS, nicht infiziertes Hamstergehirn-Homogenat 10-4 und 10-10) und positiven Tupfer-Extrakt-Kontrollen in dreifacher Ausführung (HY-Gehirn-Homogenat 10-3). (B) Repräsentative Tupferextrakte für Tisch-, Glas- und Edelstahloberflächen, die vor der Kontamination, nach der Kontamination mit HY 10-3 und nach der Bleichbehandlung kontaminierter Oberflächen abgetupft wurden. (C) Vergleich des nicht infizierten Gehirnhomogenats 10-4, des HY-Gehirnhomogenats 10-3 und des mit einem feinen Staubfilm überzogenen Tupferextrakts aus dem Labortisch. Zu den Negativplattenkontrollen für die Panels A und B gehören ein Blindpräparat (Gewebeverdünnungslösung) und ein nicht infiziertes Hamsterhirnhomogenat 10-4. Panel B umfasst die Zugabe von nicht infiziertem Gehirnhomogenat 10-4 und die Positivplattenkontrolle von HY-Gehirnhomogenat 10-3. Eine positive Fluoreszenzschwelle (dargestellt durch eine rote gestrichelte Linie) wurde mit 2 bestimmt. Das angegebene Maxpoint-Verhältnis (MPR) ist die maximale Fluoreszenz geteilt durch den anfänglichen Fluoreszenzwert, der vom Plattenleser erhalten wurde. Jeder Punkt stellt eine technische Vertiefungsreplik für einen bestimmten Probentyp dar. Der Mittelwert und die Standardabweichung werden dargestellt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Tabelle 1: Monatliches Dokumentationsformular für den Probenabstrich vor Ort. Bitte klicken Sie hier, um diese Tabelle herunterzuladen.
Ergänzende Abbildung 1: Layoutvorlage für die Abstrichstelle. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Ergänzende Abbildung 2: Monatliches Dokumentationsformular für die Abstrichstelle. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.