Abbildung 1 bietet einen Überblick über die experimentellen Schritte der FRET-Lebendzellbildgebung zur Überwachung der Akt-Phosphorylierung in einzelnen HepG2-Zellen.
1. Plasmidaufnahme, -vermehrung und -reinigung
HINWEIS: In diesem Abschnitt werden die wesentlichen Schritte für die Erfassung, Amplifikation und Reinigung des Plasmids beschrieben, die für die Einzelzell-FRET-Analyse erforderlich sind.
- Verwenden Sie das Plasmid pEevee-iAkt-NES-YPet (Abbildung 2A).
HINWEIS: Das Plasmid wurde freundlicherweise von Prof. Kazuhiro Aoki vom National Institute for Basic Biology (NIBB), Japan, zur Verfügung gestellt.Plasmidkarten für die FRET-Biosensoren, die für die Akt-Überwachung verwendet werden, und ihre jeweiligen Steuerungen sind in Abbildung 2 dargestellt. Der pEevee-iAkt-NES-ECFP (Spender; Abbildung 2B) und pEevee-iAkt-NES-Ypet (Akzeptor; Abbildung 2C) Plasmide werden als Kalibrierungskontrollen bei FRET-Experimenten verwendet9.
HINWEIS: Abbildung 3 zeigt die Zusammensetzung und den Mechanismus des intramolekularen FRET-Biosensors.
- Um das Plasmid zu vermehren, führen Sie eine bakterielle Transformation mit chemisch kompetenten E. coli-Zellen durch (siehe Materialtabelle). Die transformierten Zellen werden auf Luria-Bertani (LB)-Agar mit 100 μg/ml Ampicillin aufgetragen und über Nacht bei 37 °C inkubiert. Am nächsten Tag wählen Sie eine Ampicillin-resistente Kolonie aus und kultivieren Sie sie in LB-Bouillon, die mit 100 μg/ml Ampicillin zur Plasmidamplifikation ergänzt wurde.
- Um die Plasmid-DNA aufzureinigen, verwenden Sie ein kommerziell erhältliches Plasmid-DNA-Aufreinigungskit (siehe Materialtabelle), um eine hohe Reinheit und Ausbeute zu erzielen. Beurteilen Sie die DNA-Qualität durch Messung der Absorptionsverhältnisse (A260/A280 und A260/A230) mit einem Spektralphotometer (siehe Materialtabelle). Verhältnisse zwischen 1,8-2,0 und 2,0-2,2 gelten als optimal. Überprüfen Sie die Integrität des Plasmids durch Agarose-Gelelektrophorese, um sicherzustellen, dass es für die Transfektion geeignet ist.
2. Ablauf der Zellkultur
HINWEIS: Führen Sie alle Zellkulturverfahren in einer Laminar-Flow-Haube durch, um eine sterile Umgebung zu gewährleisten und eine Kontamination zu vermeiden. Der Arbeitsablauf der HepG2-Zellkultur ist in Abbildung 4 dargestellt. Das komplette Medium für HepG2-Zellen besteht aus Minimum Essential Medium (MEM), 10 % fötalem Rinderserum (FBS), 1 % nicht-essentiellen Aminosäuren (NEAA), 1 mM Natriumpyruvat, 2 mM L-Glutamin-Ergänzung, 100 U/mL Penicillin-Streptomycin und 2,5 μg/ml Antibiotika-Antimykotika-Lösung (siehe Materialtabelle, Tabelle 1).
- Tauen Sie gefrorene HepG2-Zellen schnell auf, indem Sie das Fläschchen in einen 37 °C Thermomixer oder ein Wasserbad stellen, bis es vollständig aufgetaut ist.
- Übertragen Sie die aufgetauten Zellen in ein konisches 15-ml-Röhrchen mit 10 mL vollständigem Wachstumsmedium (siehe Materialtabelle).
HINWEIS: Erwärmen Sie das gesamte Wachstumsmedium vor der Verwendung auf 37 °C, um einen Temperaturschock für die Zellen zu minimieren.
- Zentrifugieren Sie das Röhrchen bei 200 x g für 5 min, um die Zellen zu pelletieren.
- Saugen Sie den Überstand vorsichtig mit einer Pipettenspitze mit breiter Bohrung an, um eine Störung des Zellpellets zu vermeiden.
- Resuspendieren Sie das Pellet in 10 mL frischem Vollwachstumsmedium.
- Die Zellsuspension wird in einen 75 cm² großen Gewebekulturkolben überführt.
- Der Kolben wird bei 37 °C in einer befeuchteten Atmosphäre mit 5 % CO2 inkubiert.
HINWEIS: Beobachten Sie die Zellen in den nächsten 24-48 Stunden, um die Anheftung zu bestätigen und die Erholung zu beurteilen. Stören Sie die Zellen mindestens 4 Stunden lang nicht, um eine korrekte Anheftung zu gewährleisten, bevor Sie das Medium wechseln. Vermeiden Sie es, den Inkubator in den ersten 4 Stunden häufig zu öffnen, da dies die Zelladhäsion stören kann. Befolgen Sie die institutionellen Biosicherheitsprotokolle und verwenden Sie geeignete persönliche Schutzausrüstung (PSA), um während aller Zellkulturverfahren eine sichere Arbeitsumgebung zu gewährleisten. Subkultur von HepG2-Zellen, wenn sie eine Konfluenz von 70 % bis 80 % erreichen, um optimale Wachstumsbedingungen aufrechtzuerhalten und eine Überfüllung zu verhindern, die sich auf die Lebensfähigkeit und das Wachstumspotenzial der Zellen auswirken kann.
- Für die Subkultivierung aspirieren Sie das Medium und spülen die Zellen einmal mit 5 ml phosphatgepufferter Kochsalzlösung (PBS).
- Fügen Sie 1 ml 0,25 % Trypsin hinzu, um die Zellmonoschicht zu bedecken (siehe Materialtabelle).
HINWEIS: Stellen Sie sicher, dass das Trypsin für eine optimale Aktivität auf 37 °C vorgewärmt ist. Übertrypsinisieren Sie die Zellen nicht, da dies die Lebensfähigkeit beeinträchtigen kann. Überwachen Sie die Zellen unter einem Mikroskop, um die Ablösung zu bestätigen.
- Bei 37 °C ca. 5 min inkubieren.
- Wenn sich die Zellen lösen, fügen Sie 2 ml vollständiges Medium hinzu, um das Trypsin zu neutralisieren, und sammeln Sie die Zellen durch Pipettieren.
- Pipettieren Sie die Zellsuspension vorsichtig, um die Klumpen aufzubrechen und eine Einzelzellsuspension zu erhalten.
- Geben Sie 3 ml vollständiges Medium in jeden neuen Kolben und übertragen Sie die Zellen dann in einem Teilungsverhältnis von 1:2 auf jeden Kolben.
HINWEIS: Für frühe Passagen teilen Sie die Zellen in einer Verdünnung von 1:2. Nach den Passagen 4-5 können je nach Bedarf Verdünnungen von 1:4 oder 1:5 durchgeführt werden.
- Inkubieren Sie die Zellen bei 37 °C in einer befeuchteten Atmosphäre mit 5 % CO2.
HINWEIS: Überprüfen Sie die Zellen nach 24 Stunden, um die Anheftung zu bestätigen und die Wiederherstellung zu beurteilen.
- Für die Routinekultur wechseln Sie das Nährmedium alle 2-3 Tage oder früher, wenn sich der pH-Indikator von rosa zu gelb ändert, was auf eine Versauerung hinweist.
HINWEIS: Lassen Sie das Medium nicht zu sauer werden, da dies die Zellen schädigen kann.
- Überprüfen Sie die Zellmorphologie regelmäßig unter dem Mikroskop, um die Zellgesundheit zu gewährleisten.
HINWEIS: Für die kurzfristige Lagerung hepG2-Zellen bei -80 °C einfrieren; Für die Langzeitlagerung in flüssigem Stickstoff lagern. Die Zusammensetzung des in diesem Versuch verwendeten Gefriermediums ist in Tabelle 2 dargestellt.
3. Beschichten von Bildgebungsschalen mit Poly-L-Lysin
- Verwenden Sie 1 ml einer 0,1 mg/ml-Poly-L-Lysin-Lösung pro Bildgebungsschale, um die gesamte Oberfläche zu bedecken (siehe Materialtabelle).
HINWEIS: Passen Sie die Poly-L-Lysin-Konzentration basierend auf den spezifischen Anforderungen des Zelltyps an.
- Schütteln Sie die Schale vorsichtig, um eine gleichmäßige Beschichtung der Kulturoberfläche zu erzielen.
HINWEIS: Stellen Sie während des gesamten Prozesses sterile Bedingungen sicher, um eine Kontamination zu vermeiden.
- Inkubieren Sie die Gerichte über Nacht bei Raumtemperatur (RT).
- Überschüssige Poly-L-Lysin-Lösung durch Pipettieren aus den Schalen aspirieren.
- Spülen Sie die Oberfläche dreimal mit PBS ab und ruhen Sie jedes Mal 5 Minuten lang (siehe Materialtabelle). Entfernen Sie das ungebundene Poly-L-Lysin vollständig aus der Bildgebungsschale, um eine Hemmung des Zellwachstums zu verhindern. Spülen Sie die Platten vorsichtig ab, um ein Abkratzen oder Beschädigen des Glasbodens zu vermeiden.
- Trocknen Sie die beschichteten Bildgebungsschalen mindestens 3 h lang bei 37 °C an der Luft.
- Verwenden Sie die beschichteten Bildgebungsschalen sofort oder lagern Sie sie bis zu 2 Wochen bei 4 °C.
4. Transfektion von HepG2-Zellen
HINWEIS: Die HepG2-Transfektionsmethode ist in Abbildung 5 dargestellt.
- Satieren Sie HepG2-Zellen 24-48 Stunden vor der Transfektion in vorbeschichteten Bildgebungsschalen, um sicherzustellen, dass sie eine Konfluenz von 70 % bis 90 % erreichen.
- Tauen Sie das Transfektionsreagenz und das Plasmid, das für den FRET-Biosensor kodiert, auf Eis auf. Gründlich vortexen und vor Gebrauch eine kurze Drehung (z.B. 5.000 x g für 5 s) durchführen (siehe Materialtabelle).
HINWEIS: Stellen Sie sicher, dass das Transfektionsreagenz und das Plasmid vor der Verwendung vollständig aufgetaut sind.
ACHTUNG: Vermeiden Sie wiederholte Gefrier-Auftau-Zyklen, da dies die Wirksamkeit des Transfektionsreagenzes verringern kann.
- Geben Sie 8 μg Plasmid, das für den FRET-Biosensor mit dem Reaktionspuffer kodiert, bis zu einem Endvolumen von 100 μl. Mischen Sie gut, indem Sie 5 s lang bei hoher Geschwindigkeit (ca. 3.000-5.000 x g) vortexen.
HINWEIS: Geben Sie immer ein Plasmid in den Puffer, bevor Sie das Transfektionsreagenz auf Polymerbasis hinzufügen. Mindestens 50 μl der Lösung müssen aus dem Reaktionspuffer bestehen (siehe Materialtabelle).
- 2,4 μl des Transfektionspolymers werden in das Röhrchen mit der verdünnten Plasmid-DNA gegeben. Gut mischen, indem 15 s bei hoher Geschwindigkeit (ca. 3.000-5.000 × g) vortexen.
HINWEIS: Verwenden Sie immer 0,3 μl des Transfektionspolymers pro 1 μg DNA.
ACHTUNG: Stellen Sie sicher, dass das Transfektionspolymer gründlich mit der Plasmid-DNA vermischt wird, um einheitliche Nanopartikelkomplexe zu bilden.
- Inkubieren Sie die Mischung aus Biosensor und Polymer 15 Minuten lang bei 37 °C, damit sich Nanopartikelkomplexe bilden können.
HINWEIS: Vermeiden Sie es, das Transfektionspolymer länger als 30 Minuten in Lösung zu halten, da dies die Transfektionseffizienz verringern kann.
VORSICHT: Überwachen Sie die Inkubationszeit sorgfältig, um eine Überinkubation zu vermeiden, die zu einer verminderten Transfektionseffizienz führen kann.
- Drehen Sie das Röhrchen 5 s lang bei 5.000 x g herunter, um den Inhalt am Boden zu sammeln, und geben Sie dann die gesamten 100 μl der Nanopartikel-Komplexlösung tropfenweise in das Zellkulturmedium. Den Teller zum Mischen vorsichtig hin und her wiegen.
HINWEIS: Stellen Sie sicher, dass die Nanopartikel-Komplexlösung tropfenweise hinzugefügt wird, um sie gleichmäßig auf dem Zellkulturmedium zu verteilen.
ACHTUNG: Vermeiden Sie starkes Schaukeln, da dies zu Zellverdrängungen oder zu einer ungleichmäßigen Verteilung der Komplexe führen kann.
- Inkubieren Sie die Platte bei 37 °C für 4 h bis über Nacht.
HINWEIS: Die Inkubationszeit kann je nach experimentellem Bedarf angepasst werden, aber 4 h sind in der Regel ausreichend für eine effiziente Transfektion.
ACHTUNG: Vermeiden Sie eine längere Inkubation (>16 h), da dies die Lebensfähigkeit der Zellen verringern kann.
- Entfernen Sie die Nanopartikelkomplexe durch Aspiration aus den Zellen, ersetzen Sie sie durch 2 mL frisches vollständiges Wachstumsmedium und stellen Sie die Platte bis zum Zeitpunkt der Analyse wieder in den 37 °C-Inkubator. Die maximale Expression erreicht typischerweise 48 h nach der Transfektion.
- Analysieren Sie die Zellen unter Fluoreszenzmikroskopie.
HINWEIS: Stellen Sie sicher, dass das Mikroskop für die Fluoreszenzbildgebung richtig kalibriert ist, um genaue Ergebnisse zu erhalten.
VORSICHT: Minimieren Sie die Exposition der Zellen gegenüber intensivem Licht während der Bildgebung, um Phototoxizität zu vermeiden.
5. Hunger von HepG2-Zellen
HINWEIS: Nach Abschluss des Transfektionsschritts werden die Zellen vor der Insulinstimulation und der FRET-Bildgebung mit Serum ausgehungert. Dies minimiert die Aktivierung des Akt-Signalwegs aufgrund des im FBS vorhandenen Insulins und gewährleistet ein konsistentes Ausgangsniveau der Akt-Aktivität. Die Zusammensetzung des in diesem Versuch verwendeten Hungermediums ist in (Tabelle 3) beschrieben. BSA kommt in Pulverform. Um eine 0,1%ige (w/v) Lösung herzustellen, rekonstituieren Sie 0,1 g BSA in 3 ml DMEM und mischen Sie gründlich. Sterilisieren Sie die Lösung mit einem 0,45-μm-Filter und stellen Sie das Endvolumen durch Zugabe von DMEM auf 100 mL ein.
- Entfernen Sie das Kulturmedium und spülen Sie die Bildgebungsschalen zweimal für jeweils 5 min mit 1x PBS aus.
HINWEIS: Die beiden PBS-Waschungen helfen, Restserum und Insulin oder Wachstumsfaktoren, die das Experiment beeinträchtigen könnten, vollständig zu entfernen.
- Geben Sie 2 ml Hungermedium in die Bildgebungsschalen (siehe Materialtabelle). Geben Sie das Medium vorsichtig um den Rand der Schale herum, um zu vermeiden, dass sich die Zellen vom Glasboden lösen. Inkubieren Sie bei 37 °C für 4 h.
HINWEIS: Die 4-stündige Inkubation ist optimal für die Synchronisierung des Zellstoffwechsels; Die Dauer kann jedoch je nach experimentellem Bedarf verlängert werden.
6. FRET-Lebendzell-Imaging für HepG2-Zellen
HINWEIS: Dieser Abschnitt enthält Anweisungen für die FRET-Lebendzellbildgebung zur Überwachung der räumlich-zeitlichen Dynamik der Akt-Phosphorylierung in einzelnen HepG2-Zellen. Es ist wichtig, den Mikroskopaufbau, die Handhabungsverfahren und die Bildgebungsbedingungen für lebende HepG2-Zellen zu optimieren, wie unten beschrieben. Der Mikroskopaufbau ist entscheidend für die Optimierung der Bildgebungsbedingungen für die FRET-Bildgebung. Befolgen Sie die Einrichtung der PC/konfokalen Laser-Scanning-Mikroskopie (CLSM) schrittweise gemäß den Anweisungen des Herstellers, um einen stabilen Betrieb zu gewährleisten. Die angepasste CLSM-Konfiguration für die FRET-Bildgebung ist in Abbildung 6 dargestellt.
- Schalten Sie den Fernschalter ein, um das Mikroskop, den Computer, den Scanner, den Laserstart, den Piezotisch und die Epifluoreszenz-LED-Lichtquelle mit Strom zu versorgen. Stellen Sie vor dem Einschalten sicher, dass alle Komponenten ordnungsgemäß angeschlossen sind, um mögliche Schäden zu vermeiden.
- Drehen Sie den Schlüssel beim Laserstart auf die ON-Position und drücken Sie die Tasten, um beide für FRET erforderlichen Laser (457 nm und 514 nm Laserlinien) zu aktivieren.
HINWEIS: Stellen Sie sicher, dass die richtigen Filter und Einstellungen für eine optimale FRET-Abbildung vorhanden sind. Die Auswahl der Laserlinie sollte auf den Anregungs- und Emissionsprofilen des Biosensors basieren.
- Schalten Sie die Steckdosenleiste ein, um den Computer und den Monitor, die an das Mikroskop angeschlossen sind, mit Strom zu versorgen.
HINWEIS: Stellen Sie vor dem Einschalten sicher, dass alle Anschlüsse fest sind, um Schäden am Gerät zu vermeiden.
- Melden Sie sich bei Windows an und starten Sie die Mikroskopie-Software.
- Klicken Sie auf A1 für Aufnahme, um die Bildgebungseinrichtung zu starten. Wählen Sie die geeigneten optischen Konfigurationen basierend auf den Anforderungen des FRET-Experiments.
- Passen Sie die Laserleistung und die Detektorempfindlichkeit nach Bedarf an, um optimale Bildgebungsbedingungen zu erzielen. Setzen Sie den Inkubator für den Mikroskoptisch vorsichtig ein und befestigen Sie ihn mit Schrauben.
HINWEIS: Ziehen Sie die Schrauben nicht zu fest an, um Schäden am Inkubator oder am Mikroskoptisch zu vermeiden.
- Füllen Sie das innere Wasserbad mit sterilem doppelt destilliertem Wasser (ddH2O). Installieren Sie die obere Heizung sicher und schalten Sie die Stromversorgung für die Bühnenheizung, die Badheizung und die Linsenheizung ein (Abbildung 7A).
HINWEIS: Nicht überfüllen, um ein Verschütten in das System zu vermeiden. Stellen Sie sicher, dass alle Heizungen ordnungsgemäß funktionieren, um konstante Temperaturbedingungen für die Bildgebung von Lebendzellen aufrechtzuerhalten.
- Verwenden Sie die 40-fach Öl-Immersionslinse für die Bildgebung (siehe Materialtabelle).
HINWEIS: Die technischen Spezifikationen finden Sie auf der Website des Herstellers.
- Wischen Sie die Objektivlinse mit Linsenpapier ab, das mit 95 % Ethanol angefeuchtet ist. Geben Sie ein kleines Tröpfchen Immersionsöl auf die Objektivlinse (Abbildung 7B). Stellen Sie die Bildgebungsschale mit den HepG2-Zellen auf den Mikroskoptisch und befestigen Sie sie mit der Halterung (Abbildung 7C).
HINWEIS: Stellen Sie sicher, dass die Bildgebungsschüssel richtig ausgerichtet und gesichert ist, um Bewegungen während der Bildgebung zu vermeiden. Vermeiden Sie Druck auf die Linse, um Schäden sowohl an der Linse als auch am Glasboden der Schale zu vermeiden.
- Schließen Sie die Kammer und inkubieren Sie die Zellen in der Lebendzellkammer für 1-2 Stunden, damit sie sich äquilibrieren können (Abbildung 7D).
- Halten Sie während der Zeitrafferbildgebung in bestimmten Intervallen eine Pause ein, entfernen Sie das Medium vorsichtig (Abbildung 7E) und fügen Sie dann 1 ml frisch zubereitetes Medium mit der angegebenen Insulinkonzentration hinzu (Abbildung 7F, Materialtabelle).
HINWEIS: Bereiten Sie eine 1 mg/ml-Insulinstammlösung vor, indem Sie 1 mg Insulin in 1 ml 10 mM Essigsäure auflösen. Die Lösung wird durch einen sterilen 0,2-μm-Spritzenvorsatzfilter filtriert und die Aliquote bei -20 °C gelagert.
- Starten Sie das ND-Erfassungsfenster über das Menü Datei der Mikroskopiesoftware.
HINWEIS: Die Einrichtung der ND-Erfassung ist in (Abbildung 8) dargestellt.
- Wählen Sie die Registerkarte Zeit , um das Intervall, die Dauer und die gewünschten Schleifen für das Zeitraffer-Imaging festzulegen. Klicken Sie anschließend auf die Registerkarte XY und drücken Sie die Schaltfläche + Hinzufügen , um einzelne HepG2-Zellen für die Bildgebung einzubeziehen.
- Wenn Sie mehrere Zellen hinzufügen möchten, suchen Sie geeignete Zellen, scannen Sie, optimieren Sie den Fokus und sperren Sie die Point Spread Function (PSF). Wiederholen Sie diesen Schritt für jede neue Zelle, die für die Bildgebung hinzugefügt wird. Scannen Sie mehrere Zellen an verschiedenen Stellen innerhalb der Bildgebungsschalen, um verschiedene Zielzellen für den Einschluss zu identifizieren.
- Klicken Sie auf das rote X-Symbol , um die Auswahl von Zellen aufzuheben. Aktivieren Sie das Kontrollkästchen "Z", um die Z-Position einzustellen. Nachdem Sie alle Parameter ausgewählt haben, geben Sie den Namen des Experiments in das Feld "Dateiname" ein.
- Klicken Sie auf Durchsuchen , um den Zielordner auszuwählen, und aktivieren Sie dann das Kontrollkästchen In Datei speichern. Klicken Sie auf die Registerkarte Jetzt ausführen , um die ND-Erfassung zu starten. Das ND-Aufnahmefenster zeigt den Fortschritt der Zeitraffer-Bildgebung in Echtzeit an, einschließlich der verstrichenen und verbleibenden Zeit.
- Zeichnen Sie Ausgangswerte bis zu 30 Minuten lang auf, ohne die Zellen mit Insulin zu stimulieren.
- Lokalisieren Sie geeignete Zellen, zoomen Sie hinein/heraus, um eine einzelne Zelle in den Fokus zu bringen, und wählen Sie Zellen mit hoher Fluoreszenzintensität aus. Fügen Sie die Zellen nacheinander hinzu, bis zu einem Maximum von 6 Zellen.
HINWEIS: Begrenzen Sie die Anzahl der Zellen, um Verzögerungen bei der Bildaufnahme und das Einfrieren des Fensters während der Bildgebung zu vermeiden.
- Legen Sie die Zeit und die Bildfrequenz für die Zeitrafferaufnahme fest. Starten Sie das Zeitraffer-Imaging.
HINWEIS: Stellen Sie sicher, dass alle Parameter, einschließlich Belichtungszeit und Laserleistung, optimiert sind, bevor Sie mit der Bildgebung beginnen.
- Pausieren Sie die Bildgebung in regelmäßigen Abständen, nehmen Sie das Medium vorsichtig aus der Glasbodenschale und fügen Sie 1 ml Medium hinzu, das mit der entsprechenden Insulinkonzentration versetzt ist.
- Setzen Sie die Bildaufnahme fort. Wiederholen Sie Schritt 6.20 bei Bedarf.
- Klicken Sie am Ende des Experiments auf die Registerkarte Fertig stellen, um es zu schließen. Sichern und speichern Sie aufgenommene Bilder sicher für die Analyse.
7. Datenanalyse
- Korrigieren Sie die vorverarbeiteten Zeitraffer-FRET-Bildgebungsdaten von Kontrollproben auf spektrales Übersprechen und CFP-Autofluoreszenz, was zu korrigierten FRET-Werten und präziser FRET-Effizienz führt. Verwenden Sie Bildgebungssoftware für die Erfassung, Verarbeitung und Analyse von FRET-Bildern gemäß den Protokollen, die in früheren Studien beschrieben wurden 27,28,29,30 (Abbildung 9).
8. Berechnungen des FRET-Wirkungsgrads
- Um die FRET-Effizienz zu bestimmen, nehmen Sie sieben Bilder auf: Zelle (IDA(D), IDD(D), IDA(A), IAA(A), IDD, IAA und IDA). Berechnen Sie den FRET-Wirkungsgrad mit der folgenden Formel:

wobeiFRET Corrected aus der Gleichung erhalten wird:

wobei d und a definiert sind als:


Hier stellen IDA, IDD und IAA Bilder von Zellen dar, die mit dem Biosensor transfiziert wurden. IDA(D) und IDD(D)) SIND REINE SPENDER-KONTROLLBILDER, UND IDA(A) und IAA(A) sind reine Akzeptor-Kontrollbilder.
9. Bilderfassung
- IDA : Das Bild wird durch Donoranregung (434 nm) mit Akzeptoremission (530 nm) erhalten.
- IDD : Das Bild wird durch Donoranregung (434 nm) mit Donoremission (477 nm) erhalten.
- IAA : Das Bild wird durch Akzeptoranregung (517 nm) mit Akzeptoremission (530 nm) erhalten.
- IDA(D) und IDA(A) : Erfassen Sie das Bild mit der gleichen Anregung und Emission wie IDA, jedoch von Zellen, die nur den Donor bzw. den Akzeptor exprimieren.
- IDD(D) : Erfassen Sie das Bild unter den gleichen Bedingungen wie IDD für die Nur-Spender-Kontrolle.
- IAA(A) : Ruft das Bild unter den gleichen Bedingungen wie IAA ab, ist jedoch spezifisch für das Nur-Akzeptor-Steuerelement.
10. Korrektur des Hintergrunds
- Öffnen Sie die Bildanalysesoftware auf dem Computer. Rufen Sie in der oberen Menüleiste das Menü Datei auf. Wählen Sie Öffnen oder Datei öffnen aus den Dropdown-Optionen aus.
- Navigieren Sie zu dem Verzeichnis, das die Zeitraffer-Bilddaten enthält. Suchen Sie das Zeitrafferbild, das analysiert werden muss (z. B. im nd2-Format).
- Wählen Sie die Datei aus und klicken Sie auf Öffnen oder OK , um sie zur Anzeige und Analyse in die Software zu laden. Definieren Sie einen Interessenbereich (ROI) innerhalb der Zelle (oder verwenden Sie die gesamte Zelle als ROI) und notieren Sie den Grauwert jedes Pixels innerhalb dieses Bereichs.
- Wählen Sie einen zellenfreien Bereich als Hintergrund und berechnen Sie dessen durchschnittlichen Grauwert. Erstellen Sie das korrigierte Bild, indem Sie diesen Hintergrunddurchschnitt vom Grauwert jedes Pixels innerhalb der Zellen-ROI subtrahieren.
11. Eliminierung des Durchblutens (Übersprechen) des Fret-Bleed-Throughs (Übersprechen)
HINWEIS: Die spektrale Überlappung zwischen der Donoremission und der Akzeptoranregung ist in Abbildung 3B dargestellt, die für den FRET-Wirkungsgrad und den Energieübertragungsprozess entscheidend ist. Das Durchscheinen in der FRET-Bildgebung im Zeitraffer ist eine große Herausforderung, die sich aus der spektralen Überlappung von Donor- und Akzeptorfluorophoren ergibt, was zu ungenauen Messungen führt. Das Übersprechen ist inhärent, da sich die Spektren sowohl der Donor- als auch der Akzeptorfluorophore bis zu einem gewissen Grad überlappen (Abbildung 3C, D). Dieses Problem wird durch Faktoren wie hohe Fluorophorkonzentrationen und unsachgemäße Filterkonfigurationen noch verschärft. Die Berücksichtigung des Durchblutens ist entscheidend für die Gewährleistung der Zuverlässigkeit von FRET-Messungen.
- In einer früheren Studie finden Sie eine Methode zur Abschwächung von Durchblutungseffekten9.
12. Quantifizierung und statistische Analyse
- Führen Sie statistische Analysen mit statistischer Analysesoftware durch.