| 0,3 % Triton-X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | Lösung zur Blockierung des Puffers |
|---|
| 1 % BSA | Sigma-Aldrich | A4503 | Lösung zur Blockierung des Puffers |
|---|
| 1 % Human BD Fc Block | BD Biosciences | 564220 | Fc Block zur Blockierung des Puffers |
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| erforderlich 150 W LED-Lampe | Amazon | B07VH3CVSF LED-Lichtquelle | für die Photobestrahlung des Gewebes |
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| 1x PBS | Gibco | 10010-023 | Lösung zum Blockieren von Puffer- und Waschschritten |
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| 20 Gallonen Vorratsbehälter | Amazon | B001B1C4G0 | Behälter für den Photobestrahlungsprozess |
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| 40 W RGBW Flut LED-Lampe | Amazon | B08QFPJSMD RGB-Lichtquelle | für die Photobestrahlung von Geweben |
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| Ag85B | Abcam | ab43019/NA | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
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| Alpha-glatte Muskulatur Aktin DyLight 755 | Novus Biologicals | NBP2-345221R/NA | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
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| Avidin/Biotin Blocking Kit | Abcam | ab64212 | Avidin- und Biotin-Blockierungslösung |
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| BD Cytofix/Cytoperm | BD Biosciences | 554714 | Fixierungslösung |
|---|
| BOND Entwachsungslösung | Leica Biosystems | NC0221076 | Entparaffinierungslösung |
|---|
| BOND Epitop-Rückhollösung 1 | Leica Biosystems | NC0235529 | Citrat-basierte pH-6-Epitop-Rückgewinnungslösung ( ER1) |
|---|
| BOND Epitop-Entnahmelösung 2 | Leica Biosystems | NC0235530 | EDTA-basierte pH-9-Epitop-Rückgewinnungslösung (ER2) |
|---|
| BOND Research Detection System | Leica Biosystems | NC0396648 | Automatisiertes Forschungsfärbereagenz |
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| BOND RX Research Stainer | Leica Biosystems | NA | Automatisierte Forschungsfärbeplattform |
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| BOND Wash Solution | Leica Biosystems | NC0221077 | Waschpuffer |
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| CD15 | BD Biosciences | 347420/AB_400298 | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
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| CD20 eFluor 660 | Thermo Fisher Scientific | 50-0202-82/AB_11150959 | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
|---|
| CD4 Alexa Fluor 488 | R& D | Systems FAB8165G/AB_2728839 | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
|---|
| CD45 Phycoerythrin (PE) | Novus Biologicals | NBP2-34528PE/NA | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
|---|
| CD68 iFluor 594 | Caprico Biotechnologies | 1064135/AB_2892745 | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
|---|
| Esel Anti-Ziegen-IgG Alexa Fluor Plus 488 | Thermo Fisher Scientific | A32814/AB_2762838 | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
|---|
| Esel Anti-Maus IgG Alexa Fluor Plus AF647 | Thermo Fisher Scientific | A32787/ AB_2762830 | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
|---|
| Esel Anti-Maus IgM Alexa Fluor 488 | Jackson ImmunoResearch | 715-545-020/AB_2340844 | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
|---|
| Esel Anti-Kaninchen IgG Alexa Fluor Plus AF555 | Thermo Fisher Scientific | A32794/AB_2762834 | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
|---|
| EasyDip Färbesystem | Newcomer Supply | 5300KIT | Objektträger-Färbesystem |
|---|
| Fluoromount-G | Thermo Fisher Scientific | 00-4958-02 | Eindeckmedium |
|---|
| Hoechst | Biotium | 40046 | Kernfärbemittel für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
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| Imaris File Converter x64 10.2.0 | Imaris Oxford Instruments | | Kostenloser Dateikonverter |
|---|
| ImarisViewer Software x64 10.2.0 | Imaris Oxford Instruments | | Kostenlose Bildbearbeitungssoftware |
|---|
| ImmEdge Pen | Vector Laboratories | H-4000 | Hydrophober Barrierestift |
|---|
| Lithiumborhydrid (1 Gramm) | STREM Chemicals | 93-0397 | Chemikalie zur Farbstoffinaktivierung, kaufen Sie kleine Aliquots dieser Chemikalie (1 Gramm) |
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| Lumican Biotin | R& D Systems | BAF2846 | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
|---|
| Micro Cover Gläser | VWR | 48393-241 | Glas-Objektträgerabdeckungen |
|---|
| Pan-Cytokeratin Alexa Fluor 750 | Novus Biologicals | NBP2-33200AF750/AB_2868569 | Antikörper für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
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| PELCO BioWave Pro Mikrowellensystem | Ted Pella Inc | 36500-230 | Wissenschaftliche Mikrowelle ohne Erwärmung |
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| PELCO SteadyTemp Pro | Ted Pella Inc | 50062 | Vollautomatische Temperaturregelung für wissenschaftliche |
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| Mikrowellen SimpleITK | Open-Source-Software | | Registrierungs- und Kanalverarbeitungssoftware |
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| Streptavidin Alexa Fluor 594 | Thermo Fisher Scientific | S11227 | Markierungsreagenz für die IBEX-Bildgebung. Siehe Tabelle 1. |
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| Weitfeldmikroskop | Leica Microsystems | NA | Leica Microsystems THUNDER Imager mit LED8-Lichtquelle und LAS X Software (3.7.1.21655). Für die Fluoreszenzbildgebung wurde ein spezieller Quad-Band-Filter mit externem Filterrad (PN: 11536075) mit zwei zusätzlichen Einzelbandfiltern (PN: 8118215) verwendet, um sieben Farbkanäle pro Durchgang abzubilden. Die Filteranregungs-, dichroitischen und Emissionslinien sind (1) Quad-Band-Würfel: dichroitisch bei 391/32, 479/33, 554/24, 638/31, keine Anregungs- oder Emissionsfilter; (2) Außenfilterrad Position 1: 434/32, Position 2: 520/40, Position 3: 585/20, Position 4: 720/60, Position 5: Durchlauf; (3) Einzelband 1– 585/22 Anregung, 594 dichroitisch, 625/30 Emission; (4) Single-Band 2– 635/20 Anregung, 647 dichroitische, 667/30 Emission. |
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| Zeiss Optical Lens Cleaner | Amazon | B00GPVQVCO | Mikroskop Objektivreiniger |
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| Antikörper | | | |
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| Ag85B | Abcam | ab43019 | Polyklonales Kaninchen IgG, Zyklus 1 |
|---|
| Alpha-glatte Muskelmasse Aktin DyLight 755 | Novus Biologicals | NBP2-345221R | 1A4/asm-1, Zyklus 1 |
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| CD4 Alexa Fluor 488 | R&;D Systeme | FAB8165G | Polyklonales Ziegen-IgG, Zyklus 1 |
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| CD8 Alexa Fluor 647 | BioLegend | 372906 | C8/144B, Zyklus 1 |
|---|
| CD68 iFluor 594 | Caprico Biotechnologies | 1064135 | KP1, Zyklus 1 |
|---|
| Esel Anti-Ziegen-IgG Alexa Fluor Plus 488 | Thermo Fisher Scientific | A32814 | Polyklonaler Esel, Zyklus 1 |
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| Esel Anti-Maus-IgG Alexa Fluor Plus AF647 | Thermo Fisher Scientific | A32787 | Polyklonaler Esel, Zyklus 1 |
|---|
| Esel Anti-Kaninchen IgG Alexa Fluor Plus AF555 | Thermo Fisher Scientific | A32794 | Polyklonaler Esel, Zyklus 1 |
|---|
| Hoechst | Biotium | 40046 | Nukleare Markierung, Zyklus 1 |
|---|
| CD15 | BD Biosciences | 347420 | MMA, Zyklus 2 |
|---|
| CD20 eFluor 660 | Thermo Fisher Scientific | 50-0202-82 | L26, Zyklus 2 |
|---|
| CD45 Phycoerythrin (PE) | Novus Biologicals | NBP2-34528PE | 2B11 + PD7/26, Zyklus 2 |
|---|
| Esel Anti-Maus IgM Alexa Fluor 488 | Jackson ImmunoResearch | 715-545-020 | Polyklonaler Esel, Zyklus 2 |
|---|
| Lumican Biotin | R& D Systems | BAF2846 | Polyklonales Ziegen-IgG, Zyklus 2 |
|---|
| Pan-Cytokeratin Alexa Fluor 750 | Novus Biologicals | NBP2-33200AF750 | AE-1/AE-3, Zyklus 2 |
|---|
| Streptavidin Alexa Fluor 594 | Thermo Fisher Scientific | S11227 | N/A, Zyklus 2 |
|---|
| Hoechst | Biotium | 40046 | Zyklus 2 |
|---|
| Solutions | | | |
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| Blocking Buffer (Cycle 1) | | | |
|---|
| Triton-X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | 0,3 Vol.-% |
|---|
| BSA | Sigma-Aldrich | A4503 | 1 Vol.-% |
|---|
| Human BD Fc Block | BD Biosciences | 564220 | 1 Vol.-% |
|---|
| 1x PBS | Gibco | 10010-023 | 97,7 Vol.-% |
|---|
| Primärantikörper-Färbelösung #1 (Zyklus 1)Blocking-Puffer | | | |
|---|
| (Zyklus 1) | Siehe oben | | Nach Zugabe von Antikörpern auf Volumen auffüllen |
|---|
| Hoechst | Biotium | 40046 | 1:5000 |
|---|
| CD8 AF647 | BioLegend | 372906 | 1:10 |
|---|
| Primary Antibody Staining Solution #2 (Zyklus 1) | | | |
|---|
| Blocking Buffer (Zyklus 1) | Siehe oben | | Nach Zugabe von CD4 |
|---|
| nbsp; AF488 | R& D Systems | FAB8165G | 1:10 |
|---|
| Ag85B | Abcam | ab43019/NA | 1:100 |
|---|
| Sekundärantikörper-Färbelösung #1 (Zyklus 1) | | | |
|---|
| Blocking Buffer (Zyklus 1) | Siehe oben | | Nach Zugabe von Antikörpern auf Volumen auffüllen |
|---|
| Donkey Anti-Goat AF Plus 488 | Thermo Fisher Scientific | A32814/AB_2762838 | 1:100 |
|---|
| Donkey Anti-Rabbit AF Plus 555 | Thermo Fisher Scientific | A32794/AB_2762834 | 1:100 |
|---|
| Donkey Anti-Mouse AF Plus 647 | Thermo Fisher Scientific | A32787/AB_2762830 | 1:50< |
|---|
| strong>Primary Antibody Staining Solution #3 (Zyklus 1) | | | |
|---|
| Blocking Buffer (Zyklus 1) | Siehe oben | | Nach Zugabe auf Volumen auffüllen Antikörper |
|---|
| CD68 iF594 | Caprico Biotechnologies | 1064135 | 1:10 |
|---|
| a-SMA DL755 | Novus Biologicals | NBP2-345221R/NA | 1:30 |
|---|
| BSA-freier Blockierungspuffer (Zyklus 2) | | | |
|---|
| Triton-X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | 0,3 Vol.-% |
|---|
| BD Fc Block | BD Biosciences | 564220 | 1 Vol.-% |
|---|
| 1x PBS | Gibco | 10010-023 | 98,7 Vol.-% |
|---|
| Primäre Antikörper-Färbelösung #4 (Zyklus 2)BSA-freier | | | |
|---|
| Blockierungspuffer (Zyklus 2) | Siehe oben | | Nach Zugabe von Antikörpern auf Volumen |
|---|
| auffüllen CD15 | BD Biosciences | 347420 | 1:30 |
|---|
| Lumican Biotin | R& D Systems | BAF2846 | 1:100 |
|---|
| CD45 PE | Novus Biologicals | NBP2-34528PE | 1:20 |
|---|
| CD20 eFluor 660 | Thermo Fisher Scientific | 50-0202-82 | 1:10 |
|---|
| Pan-Cytokeratin AF750 | Novus Biologicals | NBP2-33200AF750 | 1:10 |
|---|
| Sekundärantikörper-Färbelösung #2 (Zyklus 2) | | | |
|---|
| BSA-freier Blockierungspuffer (Zyklus 2) | Siehe oben | | Nach Zugabe von Antikörpern auf Volumen auffüllen |
|---|
| Esel Anti-Maus IgM AF488 | Jackson ImmunoResearch | 715-545-020/AB_2340844 | 1:100 |
|---|
| Strepavidin AF594 | Thermo Fisher Scientific | S11227 | 1:200 |
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