Kultur von PC12-Zellen
Die PC12-Zelllinie wurde in einem Wachstumsmedium des Roswell Park Memorial Institute 1640 (RPMI-1640) vermehrt, das 10 % fötales Rinderserum (FBS) und 1 % Penicillin/Streptomycin enthielt, wobei die Behandlung routinemäßig unter Standardkulturbedingungen (37 °C, 5 % CO2 -befeuchtete Atmosphäre) durchgeführt wurde. Für experimentelle Verfahren wurden adhärente Zellen auf Kulturgefäße plattiert und proliferieren gelassen, bis nahezu konfluente Monoschichten (ca. 90 % Oberflächenbedeckung) erreicht wurden. Die zelluläre Dissoziation wurde durch eine enzymatische Behandlung mit 0,25%iger Trypsin-EDTA-Lösung erreicht, gefolgt von drei aufeinanderfolgenden Subkulturzyklen, um die Stabilität der Population zu gewährleisten. Die prozessierten Zellen wurden anschließend für nachgelagerte experimentelle Anwendungen und analytische Bewertungen bereitgestellt.
Assays zur Zellviabilität
Die Lebensfähigkeit der Zellen wurde bewertet, um die Zytotoxizität von Hemin und Locostatin auf PC12-Zellen gemäß den Anweisungen des Herstellers des Assay-Kits zu bewerten. PC12-Zellen wurden gleichmäßig in 96-Well-Platten ausgesät und 24 Stunden lang mit Hemin oder Locostatin kultiviert. Nach dem Waschen mit phosphatgepufferter Kochsalzlösung (PBS) wurden die Zellen 90 Minuten lang bei 37 °C in RPMI-1640-Medium mit 10%iger Tetrazoliumsalzlösung inkubiert. Die Werte der optischen Dichte (OD) wurden dann bei 450 nm mit einem Mikroplatten-Reader gemessen.
Quantitative reverse Transkriptase-Polymerase-Kettenreaktion (RT-qPCR)
Die Gesamt-RNA wurde aus PC12-Zellen mit dem RNA-Extraktionsreagenz extrahiert. Zunächst wurde die Probe im Extraktionsreagenz homogenisiert, um eine gründliche Lyse zu gewährleisten. Chloroform wurde der Mischung zugesetzt, kräftig geschüttelt und zentrifugiert, um die Phasen zu trennen (12.000 × g, 15 min, 4 °C). Die wässrige Phase, die die RNA enthielt, wurde gesammelt, und die RNA wurde durch Zugabe von Isopropanol (wässrige Phase: iPrOH = 1:1) ausgefällt und bei Raumtemperatur inkubiert. Die RNA wurde zentrifugiert, um sie zu pelletieren (12.000 × g, 10 min, 4 °C), 1 ml 70 % Ethanol wurde hinzugefügt, um Verunreinigungen zu entfernen, und schließlich wurde das RNA-Pellet in RNase-freiem Wasser zur Lagerung bei -80 °C aufgelöst. Komplementäre DNA (cDNA)-Templates wurden durch reverse Transkription mit dem RT Master Mix erzeugt. Die resultierenden Templates wurden dann im Verhältnis 1:5 verdünnt und einer quantitativen Real-Time-PCR auf einem Real-Time-PCR-Instrument unterzogen. Jede Probe wurde in dreifacher Ausfertigung amplifiziert, und die relative Menge des PCR-Produkts wurde gemittelt. Die verwendeten Primer sind in Tabelle 1 aufgeführt, wobei β-Aktin als Haushaltsgen dient. Die relative mRNA-Konzentration wurde mit der Formel E = 2-ΔΔCt bestimmt, und der Wert des kritischen Schwellenzyklus (CT) wurde für jede Reaktion aufgezeichnet.
Intrazelluläre Assays für reaktive Sauerstoffspezies (ROS) und Lipidhydroperoxid (LPO)
Die ROS- und LPO-Spiegel wurden mittels Durchflusszytometrie gemessen. PC12-Zellen wurden 24 h lang mit Hemin (80 μM), Locostatin (5 μM) und ML385 (5 μM) behandelt und 3x mit PBS im Geschirr gewaschen. Die Zellen wurden dann bei 37 °C mit 5 % CO2 für 40 min in Gegenwart von 2',7'-Dichlordihydrofluoresceindiacetat (DCFH-DA), einer ROS-Sonde, und BODIPY 581/591 C11, einer LPO-Sonde, inkubiert. Nach PBS-Waschungen zur Entfernung überschüssiger Sonden wurde die Fluoreszenzintensität mittels Durchflusszytometrie gemessen. Eine konsistente Gating-Strategie wurde auf alle Proben angewendet: Zuerst wurden die Zellen auf FSC-A vs. SSC-A gegated, um Trümmer auszuschließen, dann wurden einzelne Zellen durch FSC-A- vs. FSC-H-Gating ausgewählt. Ungefärbte Zellen und Zellen, die nur mit Hämin behandelt wurden, wurden als Negativ- und Positivkontrollen verwendet, um die Fluoreszenzkompensation und die Gates zu etablieren. Die Daten wurden mit der verknüpften Software analysiert.
Proteinextraktion und Western Blot
Vollständige Proteinextraktion
Der Überstand der behandelten PC12-Zellen wurde verworfen, gefolgt von drei Waschgängen mit eiskaltem PBS. Die Zellen wurden mit Trypsin geerntet und 5 Minuten lang bei 200 × g zentrifugiert. Nach Entfernung des Überstands wurde das Zellpellet in einem kalten Radio-Immunpräzipitationsassay (RIPA)-Lysepuffer homogenisiert, der 10 % Proteaseinhibitor und 10 % Phosphataseinhibitor enthielt. Nach einer 30-minütigen Inkubation auf Eis wurde das Lysat bei 12.000 × g für 15 min bei 4 °C zentrifugiert. Der klare Überstand wurde mit Loading Buffer (4:1) gemischt und 5 min lang auf 95 °C erhitzt, um die Proteine zu denaturieren. Die Proteinproben wurden für die spätere Verwendung bei -80 °C gelagert.
Western-Blot-Analyse
Die Proteine wurden mittels SDS-PAGE unter Verwendung eines Stapelgels und eines Auflösungsgels getrennt, wobei die Proben in die Vertiefungen geladen wurden. Die Elektrophorese wurde bei 80 V für das Stapelgel und 120 V für das auflösende Gel durchgeführt. Die Proteine wurden mit einem Transfersystem bei einem konstanten Strom von 300 mA für 1-2 h auf eine Polyvinylidenfluorid (PVDF)-Membran (1 min lang in Methanol voraktiviert) übertragen. Die Membran wurde mit 5 % Magermilch in TBST für 2 h bei Raumtemperatur verstopft, um eine unspezifische Bindung zu verhindern. Nach drei Waschgängen mit TBST (jeweils 10 Minuten) wurde die Membran über Nacht bei 4 °C inkubiert, wobei die folgenden Primärantikörper in TBST verdünnt wurden: Kaninchen-Anti-ACSL4 (1:1.000), Kaninchen-Anti-GPX4 (1:1.000), Kaninchen-Anti-HO-1 (1:2.000), Kaninchen-Anti-NRF2 (1:1.000), Kaninchen-Anti-RKIP (1:1.500) und Maus-Anti-β-Aktin (1:5.000). Die Membran wurde 3 x 10 min mit TBST gewaschen und 2 h bei Raumtemperatur mit HRP-konjugierten Sekundärantikörpern inkubiert: HRP-markiertes Goat Anti-Mouse IgG (1:1.000), HRP-markiertes Goat Anti-Rabbit IgG (1:1.000). Nach weiteren TBST-Waschungen für 3 x 5 min wurden die Proteinsignale mit einem ECL Western Blot Kit visualisiert und mit der ImageJ Software quantifiziert.
Immunfluoreszenz-Färbung
Die Zellen wurden auf Deckgläser ausgesät, die zuvor in Kulturplatten gelegt wurden, und ließen sie anhaften. Nach experimentellen Behandlungen wurde der Überstand verworfen und die Zellen wurden 3x mit PBS gewaschen. Die Zellen wurden 15 Minuten lang bei Raumtemperatur mit 4 % Paraformaldehyd (PFA) fixiert, gefolgt von drei PBS-Wäschen. Anschließend wurden die Zellen 10 min lang bei Raumtemperatur mit 0,1% Triton X-100 permeabilisiert und 3x mit PBS gewaschen. Die unspezifische Bindung wurde durch 30-minütige Inkubation mit 3% Rinderserumalbumin (BSA) bei Raumtemperatur blockiert. Primäre Antikörper wurden über Nacht bei 4 °C appliziert: Kaninchen anti-HO-1 (1:500), Kaninchen anti-NRF2 (1:500). Nach drei PBS-Waschungen am nächsten Tag wurden die Zellen 1 h lang bei Raumtemperatur im Dunkeln mit fluoreszierenden Sekundärantikörpern inkubiert: Alexa Fluor 488-markiertes Goat Anti-Rabbit IgG (1:500). Nach den letzten Waschungen wurden die Proben mit Einbettmedium eingefasst, das 4',6-Diamidino-2'-phenylindol (DAPI) für die nukleare Gegenfärbung enthielt. Die Bilder wurden mit einem konfokalen Laser-Scanning-Mikroskop aufgenommen.
Statistische Analyse
Die Messdaten wurden als Mittelwert ± Standardabweichung (S.D.) ausgedrückt. Für die Analyse wurden quantitative Daten entnommen, die die Ergebnisse von drei unabhängigen Replikat-Assays darstellen. Für Vergleiche zwischen zwei Gruppen wurde ein t-Test angewendet, während für Vergleiche zwischen mehreren Gruppen eine Einweg-Varianzanalyse (ANOVA) verwendet wurde, gefolgt von Tukeys Post-hoc-Test für Mehrfachvergleiche. Ein p-Wert < 0,05 wurde als statistisch signifikant angesehen.