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S. aureus ist ein weit verbreiteter grampositiver bedingter Erreger, der die Nasenschleimhaut gesunder Personen besiedelt 1,2. Wenn die Immunität des Wirts beeinträchtigt ist, kann dies zu lokalen Hautinfektionen, einer tiefen Gewebeinvasion oder systemischen Erkrankungen (z. B. Lungenentzündung, Endokarditis, Osteomyelitis und Bakteriämie) führen3. Methicillin, ein halbsynthetisches Penicillin, wurde 1959 klinisch bei S. aureus-Infektionen eingesetzt, und zwei Jahre später trat MRSA in Großbritannien auf und breitete sich schnell in europäischen Ländern wie Dänemark, Frankreich und der Schweiz aus4. Eine MRSA-Resistenz gegen β-Lactam-Antibiotika erschwert nicht nur das klinische Management, sondern erhöht auch das Infektionsrisiko erheblich5. Mehrere Faktoren - darunter unkontrollierbare Besiedlung/Ausbreitung, hohe Präventionskosten und übermäßiger Einsatz von Antibiotika - haben zusammen die MRSA-Infektionsraten in die Höhe getrieben6. Aufgrund der schnellen Übertragung und der komplexen Resistenzmechanismen sind MRSA-Infektionen mit hohen Sterblichkeitsraten verbunden, mit fast 150.000 gemeldeten Fällen und >7.000 Todesfällen pro Jahr in den EU-Ländern7. Laut CHINET-Überwachungsdaten sind die MRSA-Infektionsraten in China in den letzten fünf Jahren über 30 % geblieben8. Das hohe Risiko nosokomialer Kreuzinfektionen verschärft die Belastung der öffentlichen Gesundheit weiter und belastet die Gesundheitssysteme 9,10. Daher ist die Entwicklung effizienter und präziser MRSA-Schnellnachweistechnologien klinisch dringend erforderlich, um eine frühzeitige Diagnose und eine personalisierte Therapie zu erreichen, die Mortalität zu senken und Übertragungsketten zu unterbrechen.
Die aktuellen Nachweistechnologien für S.aureus und MRSA erstrecken sich über mehrere Bereiche, darunter phänotypische Nachweise, genomische Nachweise, transkriptomische Nachweise, proteomische Nachweise, Massenspektrometrie-Technologie und bioinformatikbasierte Analysen11.
Phänotypische Nachweismethoden, wie z. B. die Scheibendiffusionsmethode (KB-Methode) und die Methode der minimalen Hemmkonzentration (MHK-Methode), werden vom Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) und dem Europäischen Komitee für antimikrobielle Empfindlichkeitstests (EUCAST) als "Goldstandards" empfohlen. Diese Methoden haben den Vorteil, dass keine speziellen Instrumente erforderlich sind, da sie häufig für die Überwachung des Resistenzspektrums und epidemiologische Untersuchungen eingesetzt werden. Ihre Nachteile sind jedoch auch offensichtlich: Lange Kulturperioden (über 24 h) und die Ergebnisse der KB-Methode für einige neue Antibiotika erfordern eine Validierung durch MHK-Werte, wobei die Ergebnisse für Breakpoint-Stämme anfällig für humane Faktoren sind12,13.
Unter den Nachweismethoden auf genomischer Ebene zeichnet sich die konventionelle PCR durch eine hohe Sensitivität und eine hohe Spezifität aus, die eine vorläufige Beurteilung der Resistenz ermöglichen und die experimentelle Zeit bei geringen Kosten und hoher Effizienz verkürzen. Seine Grenzen liegen jedoch darin, dass nur bekannte Resistenzgene nachgewiesen werden können und auf spezialisierte Instrumente zurückgegriffenwerden kann 14. Der Mechanismus der mikrobiellen Resistenz ist hochkomplex, so dass es von entscheidender Bedeutung ist, technische Methoden zu entwickeln, die unbekannte resistente Phänotypen abdecken und eine schnelle Identifizierung ermöglichen können. Die aufstrebende GoPhAST-R-Technologie (Combined genotypic and phenotypic AST through RNA detection) bestimmt Resistenzphänotypen durch den Nachweis von mRNA-Expressionsniveaus, ermöglicht den gleichzeitigen Nachweis verschiedener resistenzbezogener Gene über mehrere Krankheitserreger hinweg, verkürzt die experimentelle Durchlaufzeit und erreicht in Kombination mit maschinellem Lernen eine Genauigkeit von 94-99 %15.
Unter den Nachweismethoden auf proteomischer Ebene basiert die PBP2a-Latexagglutinationsmethode auf der Antigen-Antikörper-spezifischen Bindung, mit einfacher Bedienung und schnellen Ergebnissen, mit hoher Spezifität und Sensitivität für MRSA. Es kann jedoch nicht zwischen verschiedenen Spezies von Staphylokokken unterscheiden, und die Nachweisempfindlichkeit kommerzieller Kits hat etwas abgenommen, so dass nach der Induktion mit Oxacillin8 ein erneuter Test erforderlich ist.
MALDI-TOF MS-basierte Nachweismethoden, wie z. B. die DOT-MGA-Methode (DNA Oligonucleotide Tag-Microarray Detection of Genomic Amplification), erreichen eine optimale analytische Leistung nach 6-8 Stunden Inkubation mit einer Nachweisrate von bis zu 96,4 %, und sowohl die Sensitivität als auch die Spezifität liegen bei 100 %. Aber die Kosten sind hoch, und die begrenzten Positionen auf der Zielplatte machen es schwierig, gleichzeitig Hunderte von Proben zu detektieren16,17.
Unter den bioinformatischen Analysetechnologien, die mit Omics-Daten zur Vorhersage von Resistenzen kombiniert werden, sticht die Ganzgenomsequenzierungstechnologie durch ihre hohe Auflösung und ihre umfassenden Möglichkeiten zur Informationsanalyse hervor. In Kombination mit Datenbanken zur Analyse von Resistenzgenen wie Resfinder kann analysiert werden, ob Stämme spezifische Resistenzgene tragen, das Resistenzpotenzial vorhersagen, Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs) und resistenzassoziierte Genmutanten nachweisen und gleichzeitig die Speicherung und Reanalyse von Gesamtgenomdaten unterstützen18. Diese Methode erfordert jedoch die Bedienung durch Fachleute mit bioinformatischem Hintergrund, wird selten in täglichen Tests eingesetzt und wird häufig für die epidemiologische Analyse oder die molekulare Überwachung von Krankheitserregern eingesetzt19.
Die oben genannten Methoden sind entweder kostenintensiv, zeitaufwändig oder befinden sich noch in der Forschungs- und Entwicklungsphase. Klinisch besteht ein dringender Bedarf an einer Lösung, die "Unmittelbarkeit" und "Genauigkeit" in Einklang bringt - eine neuartige Multiplex-Fluoreszenz-PCR-Technologie füllt diese Lücke, indem sie gleichzeitig nuc/mecA-Gene in einem einzigen Röhrchen amplifiziert und den Nachweiszyklus auf 1 h verkürzt. Es überbrückt präzise die Zeitfensterlücke im traditionellen Prozess des "Notfall-Screenings - Resistenztypisierung" und bietet ein zeiteffizienteres molekulares Diagnosewerkzeug für die Prävention und Kontrolle nosokomialer Infektionen. Dieser spezifische PCR-Assay wird hauptsächlich für den Nachweis von Atemwegsproben verwendet, wobei Sputumproben ein typisches Beispiel sind. Es weist eine Sensitivität von 500 Kopien/ml und eine hohe Spezifität auf, während es von antibakteriellen Wirkstoffen nicht beeinflusst wird. Aufgrund dieser günstigen Leistungsmerkmale hat dieser PCR-Assay einen erheblichen Anwendungswert für die Diagnose von Atemwegsinfektionen und die Überwachung von nosokomialen Infektionen, die durch MRSA verursacht werden.