Die genauen Mechanismen, die der Pathogenese der Parkinson-Krankheit (PD) zugrunde liegen, sind nach wie vor unvollständig verstanden, insbesondere im Hinblick auf die Rolle der Mikrogliaentzündung und des Überlebens der Serotonin-Neuronen. Dieses Protokoll beschreibt einen umfassenden Rahmen zur Aufklärung, wie Methyltransferase-like 3 (Mettl3) den nuklearen Faktor Erythroid 2-verwandten Faktor 2 (Nrf2) durch N6-Methyladenosin (m6A)-Modifikation moduliert, wodurch die mikrogliale Pyroptose abgeschwächt und Serotonin-Neuronen sowohl in vitro - als auch in vivo-PD-Modellen erhalten bleiben. Das Hauptziel ist es, Forschern reproduzierbare Methoden zur Verfügung zu stellen, um die epitranskriptomische Regulation neuroinflammatorischer Signalwege zu entschlüsseln, beginnend mit der Lipopolysaccharid (LPS)-induzierten Mikrogliaaktivierung in BV2-Zellen zur Simulation von Entzündungskaskaden, gefolgt von der quantitativen PCR mit methylierter RNA-Immunpräzipitation (MeRIP-qPCR) für die m6A-Analyse. In vivo beschreiben wir die Etablierung eines MPTP-induzierten PD-Mausmodells, ergänzt durch die stereotaktische Verabreichung von Adeno-assoziierten Virus-Serotyp 9 (AAV9)-Vektoren für eine gezielte Nrf2-Modulation im Striatum. Die Verhaltensbewertungen umfassen die Platzierung der Vordergliedmaßen, die Beschleunigung des Rotarods und Freifeldtests zur Quantifizierung motorischer Defizite, während molekulare Assays Western Blotting für Pyroptose-Marker (z. B. NLRP3, gespaltene Caspase-1), Enzyme-linked Immunosorbent Assay (ELISA) für Zytokine und Dihydroethidium (DHE)-Färbung für den Nachweis reaktiver Sauerstoffspezies (ROS) in Serotonin-Neuronen umfassen. Fortschrittliche Mikroskopietechniken, wie z. B. die Immunhistochemie für Iba1 und TPH2, ermöglichen die Visualisierung der Mikrogliadynamik und der serotonergen Integrität. Die Ergebnisse belegen, dass ein Mettl3-Mangel die Nrf2-Herunterregulation, die NLRP3-Inflammasom-Hyperaktivierung, den pyroptotischen Zelltod und die daraus resultierende Degeneration der Serotonin-Neuronen verschlimmert. Diese Methode bietet nicht nur ein robustes experimentelles Gerüst für die Untersuchung der m6A-vermittelten Neuroprotektion, sondern zeigt auch potenzielle therapeutische Wege zur Milderung des Fortschreitens der Parkinson-Krankheit durch gezielte Modulation der Mettl3/Nrf2-Achse in neurodegenerativen Kontexten auf.