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Methodenartikel

Die Mettl3/Nrf2-Achse unterdrückt das Fortschreiten der Parkinson-Krankheit durch Hemmung der NLRP3-induzierten Pyroptose in Serotonin-Neuronen

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DOI:

10.3791/69124

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7. November 2025

 ,  , 
1Department of Neurosurgery, Feicheng People's Hospital, 2Department of Neurology, Yantai Yantaishan Hospital

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Hier stellen wir ein Protokoll vor, um zu untersuchen, wie Mettl3 Nrf2 über m6A-Modifikation reguliert und dadurch die mikrogliale Pyroptose unterdrückt und Serotonin-Neuronen in Parkinson-Modellen schützt, mit Anwendungen in der epitranskriptomischen Neuroinflammationsforschung.

Zusammenfassung

Die genauen Mechanismen, die der Pathogenese der Parkinson-Krankheit (PD) zugrunde liegen, sind nach wie vor unvollständig verstanden, insbesondere im Hinblick auf die Rolle der Mikrogliaentzündung und des Überlebens der Serotonin-Neuronen. Dieses Protokoll beschreibt einen umfassenden Rahmen zur Aufklärung, wie Methyltransferase-like 3 (Mettl3) den nuklearen Faktor Erythroid 2-verwandten Faktor 2 (Nrf2) durch N6-Methyladenosin (m6A)-Modifikation moduliert, wodurch die mikrogliale Pyroptose abgeschwächt und Serotonin-Neuronen sowohl in vitro - als auch in vivo-PD-Modellen erhalten bleiben. Das Hauptziel ist es, Forschern reproduzierbare Methoden zur Verfügung zu stellen, um die epitranskriptomische Regulation neuroinflammatorischer Signalwege zu entschlüsseln, beginnend mit der Lipopolysaccharid (LPS)-induzierten Mikrogliaaktivierung in BV2-Zellen zur Simulation von Entzündungskaskaden, gefolgt von der quantitativen PCR mit methylierter RNA-Immunpräzipitation (MeRIP-qPCR) für die m6A-Analyse. In vivo beschreiben wir die Etablierung eines MPTP-induzierten PD-Mausmodells, ergänzt durch die stereotaktische Verabreichung von Adeno-assoziierten Virus-Serotyp 9 (AAV9)-Vektoren für eine gezielte Nrf2-Modulation im Striatum. Die Verhaltensbewertungen umfassen die Platzierung der Vordergliedmaßen, die Beschleunigung des Rotarods und Freifeldtests zur Quantifizierung motorischer Defizite, während molekulare Assays Western Blotting für Pyroptose-Marker (z. B. NLRP3, gespaltene Caspase-1), Enzyme-linked Immunosorbent Assay (ELISA) für Zytokine und Dihydroethidium (DHE)-Färbung für den Nachweis reaktiver Sauerstoffspezies (ROS) in Serotonin-Neuronen umfassen. Fortschrittliche Mikroskopietechniken, wie z. B. die Immunhistochemie für Iba1 und TPH2, ermöglichen die Visualisierung der Mikrogliadynamik und der serotonergen Integrität. Die Ergebnisse belegen, dass ein Mettl3-Mangel die Nrf2-Herunterregulation, die NLRP3-Inflammasom-Hyperaktivierung, den pyroptotischen Zelltod und die daraus resultierende Degeneration der Serotonin-Neuronen verschlimmert. Diese Methode bietet nicht nur ein robustes experimentelles Gerüst für die Untersuchung der m6A-vermittelten Neuroprotektion, sondern zeigt auch potenzielle therapeutische Wege zur Milderung des Fortschreitens der Parkinson-Krankheit durch gezielte Modulation der Mettl3/Nrf2-Achse in neurodegenerativen Kontexten auf.

Einleitung

Die Parkinson-Krankheit (PD) ist die zweithäufigste neurodegenerative Erkrankung bei älteren Menschen, von der etwa 2-3 % der Menschen im Alter von 65 Jahren und älter betroffen sind, was sowohl für die Familien als auch für die Gesellschaft eine erhebliche Belastung darstellt1. Obwohl die genauen Mechanismen hinter Parkinson noch teilweise verstanden sind, deuten immer mehr Beweise auf einen Zusammenhang zwischen der Entwicklung von Parkinson und Herausforderungen bei der neuronalen Übertragung hin, zusammen mit Neuroinflammation, die von Mikrogliazellen angetrieben wird, was ein häufiges Merkmal ist, das bei alternden Gehirnen und verschiedenen neurodegenerativen Erkrankungen, einschließlich PD 2,3,4,5, beobachtet wird . Mikroglia dienen als angeborene Immunzellen im Zentralnervensystem (ZNS) und sind für die Aufrechterhaltung der Homöostase des Gehirns von entscheidender Bedeutung6. Eine anhaltende Überaktivierung dieser Mikroglia kann jedoch chronische neuroinflammatorische Reaktionen auslösen, die letztendlich zum Fortschreiten der neurodegenerativen Erkrankung beitragen.

Sowohl zentrale als auch periphere Entzündungsprozesse beeinflussen die Pathologie der PD 7,8 signifikant. Die Aktivierung von Mikrogliazellen löst Entzündungsreaktionen aus, die sich auf das neuronale Überleben auswirken9, wobei neue Erkenntnisse darauf hindeuten, dass sie durch Ubiquitin-Ligasen vorbereitet werden10. Unter den verschiedenen Entzündungswegen leistet die Aktivierung des NOD-, LRR- und Pyrindomänen-haltigen Proteins 3 (NLRP3) einen Hauptbeitrag zur Entzündungsregulation der Mikroglia11. Die Aktivierung führt zur NLRP3-Expression und anschließenden Assemblierung des Inflammasom-Komplexes, der aus dem Adapterprotein der Caspase-Aktivierungs- und Rekrutierungsdomäne (CARD) und Pro-Caspase-1 besteht, was in der Proteinspaltung und der Freisetzung von Zytokinengipfelt 12. Bei Parkinson-Patienten und verschiedenen Tiermodellen der Krankheit wurde eine erhöhte NLRP3-Aktivierung beobachtet, die zum neuronalen Tod führte. Insbesondere die Hemmung von NLRP3 hat in Mausmodellen eine schützende Wirkung gegen die Parkinson-Pathologie gezeigt, was die entscheidende Rolle des NLRP3-Inflammasoms beim Auftreten der Parkinson-Krankheit unterstreicht13,14.

Die Serotonin-Signalübertragung (5-HT) ist ein bedeutender Mechanismus der neuronalen Regulation und beeinflusst zahlreiche Verhaltensweisen und physiologische Funktionen durch Wechselwirkungen mit mindestens 14 postsynaptischen Rezeptor-Subtypen15,16, einschließlich der Rolle in der ZNS-Pathologie, wie in umfassenden Übersichtenbeschrieben 17. Der umfangreiche neuromodulatorische Einfluss des 5-HT-Systems wird von etwa 26.000 Neuronen im Nagetiergehirn gesteuert18. Während in der umfangreichen Literatur Parkinson überwiegend mit dem Verlust dopaminerger Neuronen in Verbindung gebracht wird, ist die Beziehung zwischen 5-HT-Neuronen und Parkinson weniger gründlich untersucht.

Die N6-Methyladenosin (m6A)-Modifikation, die häufigste mRNA-Modifikation in eukaryotischen Zellen, ist der Schlüssel zur Regulierung des Spleißens, der Stabilität und des Exports von mRNA und beeinflusst dadurch verschiedene zelluläre Aktivitäten19. Die m6A-Spiegel werden durch Methyltransferasen und Demethylasen moduliert. Erhöhte m6A-Modifikationen im Gehirn wurden mit der neurologischen Entwicklung in Verbindung gebracht, wobei seine Dysregulation eng mit neurodegenerativen Erkrankungen verbunden ist20,21, einschließlich einer veränderten METTL3-Expression in Alzheimer-Modellen22. Zum Beispiel wurde die Akkumulation von Methyltransferase-ähnlichem 3 (METTL3) in der unlöslichen Fraktion des postmortalen Hirngewebes von Alzheimer-Patienten positiv mit dem Gehalt an unlöslichem Tau-Protein23 korreliert. Darüber hinaus kann eine signifikante Abnahme der m6A-Spiegel im Striatum zu einer erheblichen Abnahme der Dopamin-Neurotransmitterspiegel führen24. Bemerkenswert ist, dass zwölf m6A-verwandte Einzelnukleotid-Polymorphismen signifikante Assoziationen mit der Parkinson-Anfälligkeit gezeigthaben 25. Dieses Protokoll etabliert umfassende Methoden zur Untersuchung, wie METTL3-vermittelte m6A-Modifikationen die mikrogliale Pyroptose über die Nrf2/NLRP3-Achse regulieren und letztendlich das Überleben von Serotonin-Neuronen in Parkinson-Modellen beeinflussen. Das akute MPTP in vivo Modell und das LPS in vitro Modell wurden aufgrund ihrer robusten Induktion neuroinflammatorischer Reaktionen ausgewählt, obwohl chronische Paradigmen zukünftige Studien ergänzen könnten, wie unten diskutiert.

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Protokoll

Alle Tierversuche wurden unter Genehmigung des Institutional Animal Care and Use Committee des Feicheng People's Hospital (Zulassungsnummer IACUC-2024-118) durchgeführt und in strikter Übereinstimmung mit institutionellen Richtlinien und etablierten ethischen Grundsätzen für Labortierversuche durchgeführt. Die Studienprotokolle gewährleisteten eine humane Pflege und Behandlung aller Tiere, wobei der Schwerpunkt auf der Minimierung von Leiden und Leiden lag, während sowohl die institutionellen Standards als auch die ANARRIVE-Richtlinien für verantwortungsvolle Tierversuchspraktiken eingehalten wurden.

1. Zellkultur und Mikroglia-Aktivierungsmodell

  1. Vorbereitung und Wartung der BV2-Zellen
    1. Tauen Sie gefrorene BV2-Mikrogliazellbestände in einem 37 °C warmen Wasserbad für 2 Minuten schnell auf und sorgen Sie für ein sanftes Schwenken, um einen Temperaturschock zu vermeiden.
    2. Zentrifugieren Sie die aufgetaute Zellsuspension bei 300 × g für 5 min bei Raumtemperatur (RT), um das Kryoprotektivum zu entfernen.
    3. Verwerfen Sie den Überstand und resuspendieren Sie das Zellpellet in 10 ml vollständigem DMEM-Medium mit hohem Glukosegehalt, das mit 10 % FBS, 1 % Penicillin-Streptomycin und 2 mM L-Glutamin ergänzt wird.
    4. Führen Sie eine Bewertung der Zellviabilität mit der Trypanblau-Ausschlussmethode durch (mischen Sie 10 μl Zellsuspension mit 10 μl 0,4 % Trypanblau, Zählung mit einem Hämozytometer) und stellen Sie eine Viabilität von >95 % sicher, bevor Sie fortfahren.
    5. Plattenzellen in T75-Kulturkolben mit einer Dichte von 1 × 106 Zellen pro Kolben und in einem befeuchteten Zellkultur-Inkubator bei 37 °C mit 5 % CO2 halten.
    6. Passagezellen alle 48 h bei Erreichen einer Konfluenz von 80-85 % unter Verwendung von Standard-Trypsinisierungsverfahren.
      HINWEIS Halten Sie die Durchgangsnummern (Passagen 3-8) konstant, um reproduzierbare Entzündungsreaktionen zu gewährleisten. Alle Zellkulturexperimente wurden unabhängig voneinander mindestens dreimal wiederholt, mit drei technischen Replikaten pro Bedingung, um die Variabilität zu minimieren.
  2. LPS-induzierte Aktivierung von Mikroglia
    1. BV2-Zellen in 6-Well-Platten mit 2 × 105 Zellen pro Well in 2 ml vollständigem Medium 24 h vor der Behandlung säen.
    2. Bereiten Sie LPS-Stammlösung mit 1 mg/ml in sterilem PBS vor, sterilisieren Sie sie durch einen 0,22-μm-Filter und lagern Sie sie in Einmal-Aliquoten bei -20 °C.
    3. Validieren Sie die LPS-Aktivität mit einem Limulus-Amöbozytenlysat-Assay (LAL), um die Endotoxinkonzentration vor jedem Experiment zu bestätigen26.
    4. Verdünnen Sie LPS-Material unmittelbar vor der Verwendung auf eine Arbeitskonzentration von 1 μg/ml in serumfreiem DMEM.
    5. Entfernen Sie das Kulturmedium aus den Vertiefungen und waschen Sie die Zellen zweimal mit sterilem PBS.
    6. Geben Sie 2 ml LPS-haltiges Medium (1 μg/ml Endkonzentration) in die Behandlungsvertiefungen und serumfreies DMEM in die Kontrollvertiefungen.
    7. Inkubieren Sie die Zellen 24 h lang bei 37 °C mit 5 % CO2 zur Entzündungsaktivierung.
    8. Eingeschlossen sind positive Kontrollvertiefungen, die mit 100 ng/ml Tumornekrosefaktor (TNF)-α behandelt wurden, und negative Kontrollvertiefungen mit reinem Vehikel (PBS), um die Entzündungsreaktion zu validieren.
      HINWEIS: Bereiten Sie für jedes Experiment frische LPS-Lösung vor, um eine gleichbleibende Bioaktivität zu gewährleisten. Wenn die Entzündungsreaktion schwach ist (z. B. <2-facher Anstieg des Zytokins), überprüfen Sie die Stabilität des Reagenzes oder verlängern Sie die Inkubation auf 48 Stunden.
  3. Mettl3 Überexpression und Knockdown
    1. Entwicklung und Synthese von siRNA-Sequenzen (Small Interfering RNA), die auf Mettl3 und verschlüsselte Kontrollsequenzen abzielen, unter Verwendung von Standard-Oligonukleotid-Syntheseprotokollen. Wählen Sie Zielsequenzen aus der kodierenden Region der Mettl3-mRNA (GenBank-Zugang: NM_019721) mit einer Nukleotidlänge von 19-21 aus, um einen GC-Gehalt von 40-60 %27 zu gewährleisten.
    2. Validieren Sie siRNA-Sequenzen mit der BLAST-Analyse, um die Spezifität zu bestätigen und Off-Target-Effekte zu vermeiden (stellen Sie eine <70%ige Homologie mit Nicht-Zielgenen sicher).
    3. Präparation von Überexpressionsvektoren, die Mettl3-cDNA in voller Länge enthalten, die in den pcDNA3.1-Vektor kloniert wurde, unter Verwendung der Restriktionsstellen EcoRI und XhoI.
    4. Transfizieren Sie Zellen bei 70-80% Konfluenz mit einem kationischen Lipidtransfektionsreagenz:
      1. Mischen Sie 2 μl kationisches Lipidtransfektionsreagenz mit 50 pmol siRNA oder 2 μg Plasmid-DNA in 100 μl Opti-MEM-Medium.
      2. Die Mischung 15 min bei RT inkubieren.
      3. Geben Sie den Transfektionskomplex tropfenweise in die Zellen und inkubieren Sie ihn 4-6 Stunden lang, bevor Sie zu frischem Vollmedium wechseln.
    5. Inkubieren Sie transfizierte Zellen 48 Stunden lang vor der LPS-Behandlung, um adäquate Veränderungen der Proteinexpression zu ermöglichen.
    6. Bestätigen Sie die Transfektionseffizienz durch Fluoreszenz-Reporter-Co-Transfektion (100 ng pEGFP-C1 pro Well) mit dem Ziel einer Effizienz von >70 % durch Fluoreszenzmikroskopie, bevor Sie fortfahren.

2. Entwicklung von Tiermodellen und Versuchsplanung

  1. Vorbereitung und Randomisierung von Tieren
    1. Gewinnung von C57BL/6J-Mäusen aus dem Vital River Laboratory, die ein gleichmäßiges Verhältnis von Männchen zu Weibchen gewährleisten, im Alter von 8 Wochen und mit einem Gewicht von 19-26 g.
    2. Haltungstiere unter spezifischen pathogenfreien Bedingungen (LSF) mit 12:12 h Hell-Dunkel-Zyklus, kontrollierter Temperatur (22 ± 2 °C) und Luftfeuchtigkeit (50-60 %).
    3. Gönnen Sie sich eine 7-tägige Akklimatisierungsphase mit ad libitum Zugang zu Standardfutter und Wasser.
    4. Durchführung von grundlegenden Verhaltensbewertungen während der Akklimatisierung: Durchführung umfassender Verhaltensbewertungen, einschließlich eines Platzierungstests der Vordergliedmaßen (10 Versuche pro Seite), einer beschleunigten Rotarod-Bewertung (4-40 U/min über 5 Minuten) und einer Analyse der lokomotorischen Aktivität im offenen Feld (10-minütige Sitzungen in einem 50-cm-× 50-cm-× 50-cm-Gerät)28,29,30.
    5. Ordnen Sie die Tiere nach dem Zufallsprinzip Versuchsgruppen zu (n = 6 pro Gruppe) unter Verwendung computergestützter Randomisierung zu, um Verzerrungen zu minimieren: Schein, Modell, Modell+Nrf2-KD, Modell+oe-Nrf2.
    6. Implementieren Sie ein verblindetes Versuchsdesign, bei dem die Ermittler, die Verhaltensbewertungen durchführen, die Gruppenaufgaben nicht kennen.
  2. 1-Methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridin (MPTP)-induziertes Parkinson-Modell
    1. Bereiten Sie eine MPTP-Lösung mit 30 mg/kg in steriler Kochsalzlösung unmittelbar vor der Injektion vor, indem Sie 15 mg MPTP-Hydrochlorid in 5 ml steriler Kochsalzlösung auflösen und das Volumen basierend auf dem Tiergewicht anpassen.
      ACHTUNG: MPTP ist hochgradig neurotoxisch. Führen Sie einen chemischen Abzug mit geeigneter persönlicher Schutzausrüstung ein, einschließlich Doppelhandschuhen und einem Laborkittel.
    2. Verabreichen Sie MPTP über intraperitoneale Injektion in einer Dosis von 30 mg/kg Körpergewicht (Injektionsvolumen 10 ml/kg) an drei aufeinanderfolgenden Tagen zur gleichen Zeit jeden Tag (09:00 ± 30 Minuten).
    3. Bei Tieren der Scheingruppe wird das gleiche Volumen an steriler Kochsalzlösung nach einem identischen Injektionsschema injiziert.
    4. Überwachen Sie die Tiere während des MPTP-Verabreichungszeitraums täglich auf Anzeichen von Stress, Gewichtsverlust (>15 % als Endpunkt) oder Nebenwirkungen mit standardisierten Bewertungsbögen.
    5. Halten Sie die Tiere 8 Tage lang nach der letzten Injektion, um die Entwicklung einer Neurodegeneration zu ermöglichen.
      HINWEIS: Die Tiere können während dieser Zeit bei kontinuierlicher Überwachung normal untergebracht werden.
  3. Stereotaktische Virusinjektion
    1. Bereiten Sie AAV9-Virusvektoren durch dreifache Transfektion HEK293T Zellen mit Polyethylenimin (PEI; 1:3 DNA:PEI-Verhältnis) vor, ernten Sie 72 Stunden nach der Transfektion, reinigen Sie sie mit Iodixanol-Gradienten-Ultrazentrifugation (177.000 × g für 2 Stunden) und konzentrieren Sie mit Zentrifugalfiltergeräten, um 1 × 1012 Genomkopien/ml zu erreichen.
    2. Validierung des Virustiters mittels quantitativer Polymerase-Kettenreaktion (PCR) unter Verwendung von Primern, die auf die ITR-Regionen abzielen, um sicherzustellen, dass die Titer mit der Standardkurvenanalyse 1 × 10¹² Genomkopien/ml erreichen.
    3. Validieren Sie den Virustiter mit SYBR Green-basierter quantitativer PCR mit ITR-spezifischen Primern, führen Sie serielle Verdünnungen bekannter Standards durch und berechnen Sie Genomkopien mithilfe der Standardkurvenanalyse. Bestätigen Sie das Fehlen einer replikationskompetenten Viruskontamination mit p24 ELISA.
    4. Betäuben Sie Mäuse mit Isofluran (3 % Induktion, 1,5-2 % Erhaltung), das mit einem Sauerstofffluss von 0,8-1,0 l/min durch einen Nasenkegel verabreicht wird, und überwachen Sie die Atemfrequenz (60-100 Atemzüge/min) und den Zehenquetschreflex während des gesamten Eingriffs. Befestigen Sie die Maus im stereotaktischen Rahmen und tragen Sie eine Augensalbe auf, um ein Austrocknen der Hornhaut zu verhindern.
    5. Befestigen Sie die Maus im stereotaktischen Rahmen und tragen Sie eine Augensalbe auf, um ein Austrocknen der Hornhaut zu verhindern.
    6. Machen Sie mit einer sterilen Skalpellklinge einen 1,5 cm langen Schnitt in der Mittellinie der Kopfhaut und identifizieren Sie den Bregma-Orientierungspunkt anhand stereotaktischer Koordinaten mit einer Genauigkeit von 0,1 mm.
    7. Berechnen Sie die Injektionskoordinaten für das Striatum: anterior-posterior -0,5 mm, medial-lateral ±2,0 mm, dorsal-ventral -3,0 mm vom Bregma.
    8. Durchführung von Pilotinjektionen mit fluoreszierendem Tracer (z. B. grün fluoreszierendes Protein [GFP]), um die Zielgenauigkeit zu validieren und eine >80%ige Kolokalisierung mit Mikrogliamarkern (Iba1) durch Immunhistochemie vor experimentellen Injektionen zu bestätigen.
    9. Senken Sie die Injektionsnadel (33 G) auf die Zieltiefe mit einer Geschwindigkeit von 1 mm/min und injizieren Sie 2 μl Virussuspension bei 0,2 μl/min mit einer Mikrospritzenpumpe mit einer automatischen Steuerung. Senken Sie die Injektionsnadel auf die Zieltiefe ab und injizieren Sie 2 μl Virussuspension mit einer Geschwindigkeit von 0,2 μl/min mit einer Mikrospritzenpumpe.
    10. Halten Sie die Nadelposition 5 Minuten nach der Injektion aufrecht, um einen Rückfluss zu verhindern.
    11. Ziehen Sie die Nadel langsam mit einer Geschwindigkeit von 0,5 mm/min zurück, schließen Sie den Schnitt mit 4-0-Seidennähten in einem unterbrochenen Muster und ermöglichen Sie die Genesung von der Narkose auf einem beheizten Aufwachpad.
    12. Verabreichen Sie eine postoperative Analgesie (Carprofen 5 mg/kg subkutan einmal täglich für 3 Tage) und überwachen Sie die Genesung für 24 Stunden mit detaillierten Beobachtungsblättern.

3. Molekularbiologische Techniken und Validierung

  1. RNA-Extraktion und Qualitätskontrolle
    1. Entnahme von Zellen oder striatalen Hirngewebeproben unmittelbar nach experimentellen Endpunkten durch humane Einschläferung der Tiere durch CO2 -Inhalation, gefolgt von einer Gebärmutterhalsluxation; Gewebe auf Eis präparieren, fein hacken und enzymatisch mit 0,25 % Trypsin für 10 min bei 37 °C dissoziieren, wenn Zellen entnommen werden.
    2. Extraktion der Gesamt-RNA unter Verwendung des TRIzol-Reagenzes (1 ml pro 1 10,6 Zellen oder 100 mg Gewebe) mit mechanischer Homogenisierung (20-25 Hübe in einem Dounce-Homogenisator) und Chloroform-Phasentrennung (0,2 ml Chloroform pro 1 ml TRIzol).
    3. Beurteilung der RNA-Qualität mittels Spektrophotometrie (A260/A280 Verhältnis 1,8-2,0) und Gelelektrophorese (1 % Agarose) zur Bestätigung der ribosomalen 28S- und 18S-Banden.
    4. Quantifizieren Sie die RNA-Konzentration mit einem Spektralphotometer.
    5. Lagern Sie RNA-Proben bis zur Analyse bei -80 °C in nukleasefreiem Wasser bei -80 °C unter Zugabe eines RNase-Inhibitors (40 Einheiten/μl).
  2. Kernzytoplasmatische Fraktionierung
    1. Zellen ernten (mindestens 2 × 106 ) und zweimal mit eiskaltem PBS waschen (5 mL pro Waschgang, 5 min Zentrifugation bei 300 × g).
    2. Verwenden Sie ein kommerzielles Zellfraktionierungskit mit dem folgenden Protokoll.
      1. Resuspendieren Sie das Zellpellet in 200 μl zytoplasmatischem Extraktionspuffer mit Proteaseinhibitoren.
      2. 10 min auf Eis inkubieren und alle 3 min vortexen.
      3. Bei 16.000 × g für 5 min bei 4 °C zentrifugieren und Überstand (zytoplasmatische Fraktion) auffangen.
      4. Waschen Sie das Pellet zweimal mit zytoplasmatischem Extraktionspuffer.
      5. Das Pellet wird in 100 μl Kernextraktionspuffer resuspendiert.
      6. 40 min auf Eis inkubieren und alle 10 min vortexen.
      7. Bei 16.000 × g für 10 min bei 4 °C zentrifugieren und den Überstand (Kernfraktion) auffangen
    3. Validieren Sie die Fraktionierungseffizienz durch Analyse der Verteilung von nuklearen Markern (U6) und zytoplasmatischen Markern (GAPDH) mittels Western Blot.
    4. Extrahieren Sie RNA getrennt aus nuklearen und zytoplasmatischen Fraktionen.
    5. Analysieren Sie die Nrf2-mRNA-Spiegel in jeder Fraktion mittels RT-qPCR mit fraktionsspezifischen Referenzgenen.
  3. Quantitative real-time PCR (RT-qPCR)
    1. Synthetisieren Sie cDNA aus 1 μg Gesamt-RNA mit einem Reagenzkit für reverse Transkription mit zufälligen Primern.
    2. Führen Sie die qPCR mit dem Premix Ex Taq II-Kit mit genspezifischen Primern auf einem Echtzeit-PCR-System durch.
    3. Validieren Sie die Primerspezifität mithilfe der Schmelzkurvenanalyse und bestätigen Sie ein einzelnes Amplikon durch Gelelektrophorese.
    4. Es sind die folgenden Temperaturwechselbedingungen zu verwenden: anfängliche Denaturierung bei 95 °C für 10 Minuten, gefolgt von 40 Zyklen bei 95 °C für 15 s, 60 °C für 30 s und 72 °C für 30 s.
    5. Berechnen Sie die relativen mRNA-Expressionsniveaus mit der 2-ΔΔCt-Methode mit β-Aktin als interner Referenz.
    6. Integrieren Sie No-Template-Kontrollen und validieren Sie die Stabilität von Referenzgenen unter experimentellen Bedingungen mithilfe der geNorm-Analyse (Stabilitätswert M < 0,5).
      HINWEIS: Reproduzierbarkeitswerte: Intra-Assay-Variationskoeffizient (CV) <10 % über drei unabhängige Läufe.
  4. MeRIP-qPCR für die Analyse von m6A-Modifikationen
    1. Die Gesamt-RNA (mindestens 20 μg) extrahieren und mit einem RNA-Fragmentierungsreagenz (10 mM ZnCl2, 10 mM Tris-HCl, pH 7,0) bei 70 °C für 5 min auf 100-200 Nukleotide fragmentieren.
    2. Durchführung der Immunpräzipitation mit m6A-spezifischem Antikörper (2 μg pro 20 μg RNA) über Nacht bei 4 °C mit Rotation (10 U/min) in Immunpräzipitationspuffer (50 mM Tris-HCl, pH 7,4, 750 mM NaCl, 0,5 % NP-40).
    3. Validierung der Antikörperspezifität mit bekannten m6A-modifizierten und unmodifizierten RNA-Kontrollen.
    4. Immunpräzipitierte Komplexe fünfmal mit Waschpuffer waschen.
    5. Eluierte gebundene RNA und reverse transkribieren mit zufälligen Primern.
    6. Reverse transkribiert eluierte RNA mit zufälligen Primern und führt qPCR-Analysen mit Nrf2-spezifischen Primern durch, die potenzielle m6A-Stellen abdecken.
    7. Führen Sie eine qPCR-Analyse mit Nrf2-spezifischen Primern durch und berechnen Sie die Anreicherung relativ zur Eingangs-RNA.
      HINWEIS: Wenn die Erkennung inkonsistent ist, optimieren Sie die Fragmentierungszeit (4-6 Minuten), um die Reproduzierbarkeit zu verbessern. quantitativer Benchmark: Signal-Rausch-Verhältnis >15:1 im Vergleich zu IgG-Kontrollen.

4. Proteinanalyse und -validierung

  1. Proteinextraktion und -quantifizierung
    1. Lyse von Zellen (1 × 106 Zellen) oder Homogenisierung von Gewebeproben (100 mg striatales Gewebe) in 200 μl Puffer des Radioimmunpräzipitationsassays (RIPA), der Proteaseinhibitoren (1 mM Phenylmethylsulfonylfluorid (PMSF), 1 μg/ml Leupeptin, 1 μg/ml Pepstatin A) und Phosphatase-Inhibitoren (1 mM Natriumorthovanadat, 5 mM Natriumfluorid) enthält.
    2. Inkubieren Sie die Lysate 30 Minuten lang auf Eis mit periodischem Vortexen (alle 10 Minuten für 10 s).
    3. Zentrifugieren Sie 15 Minuten lang bei 12.000 × g bei 4 °C, um Zelltrümmer zu entfernen und Überstände aufzufangen.
    4. Quantifizieren Sie die Proteinkonzentration unter Verwendung eines Bicinchoninsäure-Assays (BCA) mit Rinderserumalbuminstandards (0, 25, 125, 250, 500, 750, 1000, 1500, 2000 μg/ml) in dreifacher Ausführung.
    5. Validieren Sie die Proteinintegrität durch Analyse des Housekeeping-Proteingehalts (GAPDH, erwartete MW: 36 kDa) in allen Proben mittels Western Blot.
  2. Western-Blot-Analyse
    1. Bereiten Sie Proteinproben mit gleicher Beladung (30-50 μg) in Natriumdodecylsulfat-Polyacrylamid-Gelelektrophorese (SDS-PAGE)-Beladungspuffer vor (Endkonzentrationen: 62,5 mM Tris-HCl, pH 6,8, 2 % SDS, 10 % Glycerin, 5 % β-Mercaptoethanol, 0,003 % Bromphenolblau) und denaturieren Sie sie 5 Minuten lang bei 95 °C.
    2. Trennen Sie Proteine durch SDS-PAGE unter Verwendung von 10%igen Polyacrylamid-Gelen, die 30 Minuten lang bei 80 V und 90 Minuten lang bei 120 V in Tris-Glycin-SDS-Puffer laufen.
    3. Übertragen Sie Proteine auf Polyvinylidenfluorid (PVDF)-Membranen unter Verwendung eines halbtrockenen Transfersystems (400 mA für 90 min) in Transferpuffer (25 mM Tris, 192 mM Glycin, 20 % Methanol).
    4. Bestätigen Sie die Transfereffizienz durch reversible Proteinfärbung (Ponceau S: 0,1 % in 5 % Essigsäure für 5 Minuten), bevor Sie mit der Antikörperinkubation fortfahren.
    5. Blockmembranen mit 5 % fettfreier Milch in TBST (TBS + 0,1 % Tween-20) für 1 h bei RT unter sanftem Rühren.
    6. Inkubieren Sie mit Primärantikörpern, die über Nacht bei 4 °C bei 4 °C in einem Blockierungspuffer verdünnt sind, und zwar unter leichtem Rühren.
    7. Die Membranen dreimal mit TBST waschen (je 10 min) und mit HRP-konjugierten Sekundärantikörpern (1:5000 Verdünnung) für 1 h bei RT inkubieren.
    8. Erkennen Sie Proteinbanden mit erhöhter Chemilumineszenz und quantifizieren Sie mit Densitometrie.
    9. Normalisierung der Zielproteinexpression bis zur Beladungskontrolle (GAPDH) und Validierung der Antikörperspezifität mit geeigneten Kontrollen (Peptidblockierung für primäre Antikörper, reine Sekundärkontrollen).

5. Verhaltensbewertung und Funktionsanalyse

  1. Platzierungstest der Vordergliedmaßen
    1. Lassen Sie die Maus vor der Bewertung 30 Minuten lang an die Testumgebung (ruhiger Raum, 22 °C, schwache Beleuchtung) gewöhnen.
    2. Fassen Sie die Maus vorsichtig an der Rückenhaut und hängen Sie alle vier Gliedmaßen etwa 0,5 cm über der Tischkante, während Sie sicherstellen, dass die Maus die Tischoberfläche nicht sehen kann.
    3. Bürsten Sie Vibrissen auf jeder Seite gegen die Tischkante, um den Setzreflex auszulösen und die erfolgreiche Platzierung der Vordergliedmaßen innerhalb von 2 s zu protokollieren.
    4. Führen Sie 10 Versuche pro Seite mit einem Abstand von 30 Sekunden zwischen den Versuchen durch, abwechselnd auf der linken und rechten Seite.
    5. Führen Sie Tests bei gleichbleibenden Lichtverhältnissen (50-100 Lux) und Tageszeit (13:00-17:00 Uhr) durch, um zirkadiane Einflüsse zu minimieren.
    6. Berechnen Sie die Erfolgsquote als Prozentsatz der erfolgreichen Platzierungen: (erfolgreiche Platzierungen/Gesamtzahl der Versuche) × 100.
  2. Beschleunigung des Rotarod-Tests
    1. Stellen Sie das Rotarod-Gerät auf eine Anfangsdrehzahl von 4 U/min mit einer linearen Beschleunigung auf 40 U/min über eine Dauer von 5 Minuten ein.
    2. Trainieren Sie die Mäuse an 3 aufeinanderfolgenden Tagen (3 Versuche pro Tag, 15-Minuten-Intervalle), bevor Sie testen, um Lerneffekte zu minimieren.
    3. Standardisieren Sie die Testbedingungen, einschließlich RT (22 ± 2 °C), Beleuchtung (100 Lux) und Hintergrundgeräuschpegel (<50 dB).
    4. Platzieren Sie die Maus mit dem Gesicht nach vorne auf den rotierenden Stab und starten Sie sofort das Beschleunigungsprotokoll.
    5. Zeichnen Sie die Latenz bis zum Sturz (Zeit vom Start bis zum Sturz der Maus oder zum Abschluss des 5-minütigen Versuchs) für jeden Versuch auf, wobei 5 Mal pro Tier mit 15-minütigen Ruheintervallen getestet wird.
    6. Berechnen Sie die durchschnittliche Latenz aus den drei längsten Versuchen, um die Variabilität aufgrund von Motivationsfaktoren zu minimieren.
  3. Offener Feldtest
    1. Verwenden Sie ein Freigeländegerät (50 cm × 50 cm × 50 cm durchsichtige Acrylbox) mit einem Videoverfolgungssystem, das 1 m über der Arena positioniert ist.
    2. Reinigen Sie das Gerät zwischen den Tieren mit 70 % Ethanol (sprühen und wischen, 5 Minuten an der Luft trocknen), um Geruchsreize zu beseitigen.
    3. Platzieren Sie die Maus in der Mitte des Geräts und zeichnen Sie die Aktivität 10 Minuten lang bei gleichbleibender Beleuchtung (200 Lux) mit Videoaufnahme mit 30 Bildern pro Sekunde auf.
    4. Analysieren Sie mehrere Parameter mit automatisierter Tracking-Software:
      Gesamte zurückgelegte Strecke (cm)
      Zeit der Mittelzone (definiert als 10 cm von den Wänden, angegeben in s)
      Bewegungsgeschwindigkeit (cm/s)
      Zeit, die in Peripherie- und Zentrumszonen verbracht wird
  4. Definieren Sie die zentrale Zone als 10 cm von den Wänden entfernt und quantifizieren Sie die in der Mitte verbrachte Zeit und die zurückgelegte Strecke im Vergleich zu den peripheren Zonen.

6. Erweiterte Mikroskopie und Bildgebung

  1. DHE-Färbung für den ROS-Nachweis
    1. Bereiten Sie unmittelbar vor Gebrauch frische Dihydroethidium (DHE)-Lösung mit 10 μM in PBS vor (vor Licht schützen).
    2. Führen Sie eine Co-Immunfluoreszenz-Färbung durch, bei der DHE mit Tryptophan-Hydroxylase-2 (TPH2)-Antikörpern (1:500 Verdünnung) kombiniert werden, um Serotonin-Neuronen spezifisch zu identifizieren.
      HINWEIS: Dieser Dual-Labeling-Ansatz ermöglicht die Unterscheidung der ROS-Produktion in TPH2-positiven neuronalen Zellkörpern von oxidativem Stress in umgebenden Gliazellen, basierend auf dem Prinzip, dass DHE bei der Oxidation durch Superoxid membranundurchlässige fluoreszierende Produkte bildet, die in der Ursprungszelle lokalisiert bleiben.
    3. Inkubieren Sie Gewebeschnitte (20 μm Dicke) mit DHE-Lösung für 30 min bei 37 °C bei Dunkelheit in einer befeuchteten Kammer.
    4. Enthalten sind Negativkontrollen (kein DHE) und Positivkontrollen (100 μM H2O2 -Behandlung für 30 Minuten), um die Spezifität des ROS-Nachweises zu validieren.
    5. Waschen Sie die Abschnitte dreimal mit PBS und montieren Sie sie mit lichtbeständigem Eindeckmedium.
    6. Bild mittels Fluoreszenzmikroskopie (DHE: 518 nm Anregung/605 nm Emission, TPH2: 488 nm Anregung/525 nm Emission) mit konsistenten Belichtungseinstellungen (200 ms) über alle Proben; Die bildgebenden Systeme wurden wöchentlich mit Standard-Fluoreszenzperlen kalibriert (Signal-Rausch-Verhältnis > 20:1).
    7. Quantifizieren Sie die Fluoreszenzintensität in TPH2-positiven Zellen nur mit der ImageJ-Software mit standardisierten Analyseprotokollen (Schwellenwert: 50-255, Partikelgröße: 10-∞ Pixel2). Festlegung von ROI-Grenzen basierend auf der TPH2-Immunreaktivität, um die Messung von oxidativem Stress speziell in serotonergen Neuronen sicherzustellen und gleichzeitig Signale von benachbarten Mikroglia, Astrozyten oder anderen Zelltypen auszuschließen. Analysieren Sie für jedes Tier mindestens 50 TPH2-positive Neuronen in mehreren Gewebeschnitten.
  2. Immunhistochemie
    1. Gewebeschnitte in 4% Paraformaldehyd in PBS für 24 h bei 4 °C unter leichtem Rühren fixieren.
    2. Dehydrieren Sie durch eine abgestufte Ethanolreihe (70 %, 80 %, 90 %, 95 %, 100 % × jeweils 2,1 h) und betten Sie sie mit einem automatisierten Prozessor in Paraffin ein.
    3. Schneiden Sie 5-μm-Schnitte mit einem Mikrotom und montieren Sie sie auf geladene Objektträger, wobei 3-4 Schnitte pro Objektträger sichergestellt werden.
    4. Abschnitte mit Xylol entparaffinisieren (2 × 10 min) und durch gradiertes Ethanol zu Wasser rehydrieren.
    5. Führen Sie die Antigen-Entnahme mit Citratpuffer (10 mM Natriumcitrat, pH 6,0) in einer Mikrowelle durch (750 W für 10 Minuten mit 2-minütigen Kühlintervallen).
    6. Validierung der Antikörperspezifität unter Verwendung geeigneter Negativkontrollen (keine primären Antikörper) und Positivkontrollgewebe (Gehirnschnitte, von denen bekannt ist, dass sie Zielproteine exprimieren).
    7. Blockieren Sie die endogene Peroxidaseaktivität mit 3% Wasserstoffperoxid in Methanol für 10 min bei RT.
    8. Bringen Sie die Primärantikörper über Nacht bei 4 °C in einer befeuchteten Kammer an.
    9. Nachweis mit HRP-konjugierten Sekundärantikörpern (1:500 Verdünnung, 1 h bei RT) und DAB-Chromogen (inkubieren, bis sich eine braune Farbe entwickelt, typischerweise 2-5 min).
    10. Mit Hämatoxylin (30 s) gegenfärben, dehydrieren, klären und mit permanentem Eindeckmedium einbetten.
    11. Quantifizierung positiver Zellen mit stereologischen Methoden mit systematischer Zufallsstichprobe (jeder 5. Schnitt, 3 Zählbilder pro Schnitt, 40× Vergrößerung).

7. Statistische Analyse und Datenvalidierung

  1. Statistisches Design und Analyse
    1. Führen Sie eine Power-Analyse durch, um geeignete Stichprobengrößen für die Erkennung biologisch bedeutsamer Unterschiede (Effektstärke ≥ 0,8, Power ≥ 0,80, α = 0,05) mit der G*Power 3.1.9.7-Software zu bestimmen.
    2. Validieren Sie die Datennormalität mit dem Shapiro-Wilk-Test und beurteilen Sie die Homogenität der Varianz mit dem Levene-Test vor der parametrischen Analyse.
    3. Analysieren Sie Daten mit einer Statistiksoftware mit geeigneten statistischen Tests auf der Grundlage des Versuchsdesigns und der Datenverteilung.
    4. Wenden Sie die unidirektionale Varianzanalyse (ANOVA) für Einzelfaktorvergleiche und die bidirektionale ANOVA für faktorielle Designs (z. B. Behandlungs- × Zeitinteraktionen) an.
    5. Verwenden Sie den Post-hoc-Test nach Tukey für Mehrfachvergleiche, wenn die ANOVA Signifikanz zeigt (p < 0,05), und wenden Sie gegebenenfalls die Bonferroni-Korrektur an.
    6. Legen Sie den Schwellenwert für die statistische Signifikanz für alle Analysen auf p < 0,05 fest, mit zusätzlicher Notation für p < 0,01 und p < 0,001.
    7. Geben Sie Effektgrößen (Cohens d oder η2) und 95 %-Konfidenzintervalle zusammen mit p-Werten an, um eine umfassende statistische Interpretation zu erhalten.
    8. Präsentieren Sie die Daten als Mittelwert ± SEM aus mindestens drei unabhängigen Experimenten, wobei einzelne Datenpunkte angezeigt werden, wenn n ≤ 10.
      HINWEIS: Alle Zellkulturexperimente sollten unabhängig voneinander mindestens dreimal wiederholt werden, wobei jedes Experiment geeignete Kontrollen und mehrere technische Replikate umfasst, und die beobachtete Variabilität (z. B. CV <15 % für Verhaltensdaten) wurde durch Verblindung und standardisiertes Timing minimiert.

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Ergebnisse

Das Protokoll zeigt erfolgreich, dass die Mettl3-Expression in LPS-behandelten Mikrogliazellen abnimmt (Abbildung 1), was sowohl durch eine Verringerung des mRNA- als auch des Proteinspiegels im Vergleich zu Kontrollgruppen belegt wird (Abbildung 1B, C). Die ELISA-Analyse bestätigt eine erfolgreiche LPS-vermittelte Entzündungsaktivierung durch erhöhte IL-6- und TNF-α-Spiegel in Kulturüberständen (Abbildung 1...

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Diskussion

Es gibt mehrere kritische Schritte, die sorgfältige Aufmerksamkeit erfordern, um reproduzierbare Ergebnisse zu gewährleisten. Der Zeitpunkt der LPS-Aktivierung ist entscheidend - Entzündungsreaktionen erreichen 24 Stunden nach der Behandlung ihren Höhepunkt, und wir empfehlen dringend, für jedes Experiment frische LPS-Lösung vorzubereiten, da gelagerte Lösungen an Bioaktivität verlieren können19,20. Für die MeRIP-qPCR-Analyse ist...

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Offenlegungen

Die Autoren erklären, dass keine konkurrierenden finanziellen Interessen oder Interessenkonflikte im Zusammenhang mit dieser Arbeit stehen. Kein Autor hat eine finanzielle Beziehung zu Unternehmen, deren Produkte in diesem Artikel erwähnt werden.

Danksagungen

Die Autoren danken dem technischen Personal des Feicheng People's Hospital und des Yantai Yantaishan Hospital für ihre Unterstützung bei experimentellen Verfahren und der Tierpflege.

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
AAV9-VirusvektorenVector Core AnlageGewohnheitMit Nrf2-Konstrukten
Beschleunigung von RotarodUgo Basile47600Für Verhaltenstests
Anti-GAPDH-AntikörperZell-Signaltechnik5174Primärer Antikörper, 1:5000
Anti-GSDMD-AntikörperAbcamab219800Primärer Antikörper, 1:1000
Anti-Iba1-AntikörperWako019-19741Primärer Antikörper, 1:500
Anti-NLRP3-AntikörperAdipoGenAG-20B-0014Primärer Antikörper, 1:1000
Anti-Nrf2-AntikörperAbcamab62352Primärer Antikörper, 1:1000
Anti-SLC6A4-AntikörperNovus BiologicalsNBP1-85726Primärer Antikörper, 1:500
Anti-TPH2-AntikörperMilliporeMAB847Primärer Antikörper, 1:500
BCA-Protein-Assay-KitDurchbohren23225Zur Proteinquantifizierung
BV2-MikroglialzellenShengen BiologieSG-BV2Maus-Mikroglialzelllinie
C57BL/6J-MäuseVital River Labor2138 Wochen alt, 19-26 g
Zellfraktionierungs-KitZell-Signaltechnik9038Nuklear-zytoplasmatische Trennung
Vollständiges hochglukosehaltiges DMEMGibco11965092Zellkulturmedium
DAB-ChromogenVektorlaboreSK-4100Für die Immunhistochemie
ZahnbohrerFeine wissenschaftliche Werkzeuge18000-17Für das Bohren von Bohrlöchern
DHE (Dihydroethidium)Molekulare SondenD11347ROS-Erkennung
ELISA Kit (IL-1β)R& D-SystemeMLB00CMaus IL-1β Erkennung
ELISA-Kit (IL-18)R& D-Systeme7625Maus-IL-18-Erkennung
ELISA-Kit (IL-6)R& D-SystemeM6000BMaus-IL-6-Erkennung
ELISA-Kit (TNF-α)R& D-SystemeMTA00BMaus TNF-Α Erkennung
Fetales RinderserumGibco16000044Zellkulturpräparat
HRP-konjugierter sekundärer AntikörperJackson ImmunoResearch111-035-003Anti-Kaninchen, 1:10000
IsofluraneRWD Life ScienceR510-22Anästhetikum
LAL-Assay-KitLonza50-647ULPS-Aktivitätsvalidierung
Lipofektamin-TransfektionsreagenzInvitrogen11668019Für Zelltransfektion
LPS (Lipopolysaccharid)Sigma-AldrichL2630Von E. coli, 1 mg/mL Aktie
m6A-AntikörperSynaptische Systeme202003Für MeRIP, 1:200
MikrospritzenpumpeHarvard-Apparat70-3007Für stereotaktische Injektion
MPTPSigma-AldrichM0896Neurotoxin, 30 mg/kg
FreifeldgeräteJEDER-LABYRINTHGewohnheit50 cm und akut; 50 cm und akut; 50 cm
ParaformaldehydSigma-AldrichP61484 % in PBS
pcDNA3.1-VektorInvitrogenV79020Expressionsvektor
Penicillin-StreptomycinGibco15140122Antibiotische Lösung
Premix Ex Taq II KitTakaraRR820AFür qPCR
PrimeScript RT KitTakaraRR037AUmgekehrte Transkription
PVDF-MembranMilliporeIPVH00010Für Western Blot
RIPA-PufferZell-Signaltechnik9806Proteinextraktion
siRNA (Mettl3)RiboBioGewohnheitValidierung der Zielsequenz
Stereotaktischer RahmenRWD Life Science68001Für Gehirnchirurgie
TRIzol-ReagenzInvitrogen15596026RNA-Extraktion
Trypan blauSigma-AldrichT8154Zellviabilitätsfärbung

Referenzen

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