Dieser Artikel beschreibt die Verwendung von konfokaler Mikroskopie und ImageJ zur Beurteilung der mitochondrialen Spaltungs-/Fusionsdynamik mittels Dendra2-Photoswitching-Fluoreszenz.
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Methodenartikel
Dieser Artikel beschreibt die Verwendung von konfokaler Mikroskopie und ImageJ zur Beurteilung der mitochondrialen Spaltungs-/Fusionsdynamik mittels Dendra2-Photoswitching-Fluoreszenz.
Mitochondrien sind vor allem für ihre Rolle bei der ATP-Synthese bekannt und dienen als wichtige Regulatoren des Zellstoffwechsels. Die mitochondriale Dynamik umfasst die intrazelluläre und interzelluläre Bewegung der Mitochondrien sowie die Prozesse der Spaltung/Fusion. Diese Ereignisse sind von grundlegender Bedeutung für die Aufrechterhaltung der mitochondrialen Funktion, indem sie die zelluläre Homöostase, Morphologie, Bioenergetik, Qualitätskontrolle und Stressreaktionen aufrechterhalten. Auf der anderen Seite wirkt sich eine Dysregulation der mitochondrialen Dynamik auf die zelluläre Morphologie und Funktion aus. Eine präzise Messung von Spaltungs-/Fusionsereignissen in Mitochondrien kann ein Hinweis auf die Zellgesundheit sein. Aktuelle Methoden zur Messung der Mitochondriendynamik verwenden fortschrittliche Bildgebung wie hochauflösende Mikroskopie, Fluoreszenztechniken (Fluorescence Recovery After Photobleaching (FRAP)) für die Konnektivität und optogenetische Werkzeuge für die raumzeitliche Kontrolle. Bei der quantitativen Analyse werden Berechnungswerkzeuge verwendet, um Parameter wie Länge, Anzahl und Verzweigung zu messen, die das Gleichgewicht zwischen Spaltung und Fusion anzeigen. Diese Methoden erfordern jedoch Fähigkeiten und ausgefeilte Instrumente. In diesem Artikel beschreiben wir die Verwendung der konfokalen Mikroskopie in Kombination mit frei verwendbaren Werkzeugen in ImageJ (Fidschi) zur Untersuchung von Spaltungs-/Fusionsereignissen unter Verwendung der Photo-Switching-Eigenschaft des Dendra2-Proteins, das an mitochondriales Cytochrom c gebunden ist.
Mitochondrien sind ein dynamisches Organell, das eine wichtige Rolle bei der Energieproduktion, dem Zelltod und der Signaltransduktion spielt1. Die mitochondriale Morphologie bezieht sich auf die Größe und Form der mitochondrialen Kompartimente, die sehr gut auf intrazelluläre und extrazelluläre Bedingungen reagieren und für die Aufrechterhaltung der Zellgesundheit entscheidend sind2. Die Morphologie der Mitochondrien kann wichtige Erkenntnisse über ihre Funktion liefern, jedoch können Veränderungen in der mitochondrialen Form den Zellstoffwechsel und die allgemeine Gesundheit beeinträchtigen3. Störungen der mitochondrialen Morphologie sind mit verschiedenen Krankheiten verbunden, darunter neurodegenerative Erkrankungen, Krebs und Stoffwechselerkrankungen4. Die mitochondriale Morphologie wird dynamisch durch Fusions- und Spaltungs-/Fusionsereignisse reguliert, die für die Aufrechterhaltung der zellulären Homöostase und die Reaktion auf verschiedene metabolische Anforderungen entscheidend sind 5,6.
Die mitochondriale Dynamik hilft der Organelle, auf unterschiedliche Stressoren und Stoffwechselanforderungen zu reagieren7. Es beinhaltet eine kontinuierliche Spaltung/Fusion und Bewegung von Mitochondrien innerhalb von Zellen oder zwischen Zellen. Mitochondrien passen sich durch Veränderungen der Morphologie durch Spaltungs-/Fusionsereignisse an den zellulären Energiebedarfan 8. Diese Prozesse bestimmen die mitochondriale Form und beeinflussen mitochondriale Funktionen wie Energieabgabe, Produktion reaktiver Sauerstoffspezies (ROS) und mitochondriale Qualitätskontrolle 7,9,10. Darüber hinaus sind mitochondriale Spaltung/Fusion ausgleichende Mechanismen, die ein funktionsfähiges mitochondriales Netzwerk aufrechterhalten11. Die Fusion ermöglicht den Austausch von mitochondrialen Inhalten, wodurch die Komplementation und Pufferung gegen lokale Schäden gefördert wird, während die Spaltung die Segregation und Entfernung geschädigter Mitochondrien durch Mitophagie ermöglicht 7,12. Darüber hinaus hilft die Spaltung, beschädigte Bestandteile der Mitochondrien zu trennen, die dann durch Mitophagie, einen selektiven Autophagieprozess, entfernt werden13. Die Fusion hingegen ermöglicht die Komplementierung des mitochondrialen Inhalts, wobei alle beschädigten Bestandteile verdünntwerden 14. Die Hauptakteure bei der mitochondrialen Spaltung/Fusion sind Mitofusine (MFN1/2), die für die Fusion der äußeren mitochondrialen Membranessentiell sind 15,16, (OPA1): Diese Dynamin-ähnliche GTPase ist für die Fusion der inneren mitochondrialen Membran verantwortlich16. Bei den Spaltproteinen handelt es sich um das Dynamin-verwandte Protein 1 (Drp1), das Pro-Spaltungsprotein13,17. Mitochondriales Spaltungsprotein 1 (Fis1), Mitochondrialer Spaltfaktor (Mff) und Mitochondrialer Spaltregulator1 wie (MTFR1L). Verschiedene Techniken, wie z. B. die superauflösende EM, wurden verwendet, um die mitochondriale Ultrastrukturzu untersuchen 18. Die Einzelmolekül-Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (smFISH) in Kombination mit STED- und MINFLUX-Superauflösungsmikroskopie (Nanoskopie) wurde verwendet, um einzelne mitochondriale mRNA und assoziierte Proteine sichtbar zu machen18. Einzelmolekül-Lokalisierungsmikroskopie (SMLM) verfolgt Veränderungen des Membranabstands19. Die superauflösende Mikroskopie der stochastischen optischen Rekonstruktionsmikroskopie (STORM) ermöglicht die Untersuchung mitochondrialer innerer Membrankomplexe20. Der Einsatz dieser fortschrittlichen Geräte ist jedoch nicht leicht zugänglich. Die konfokale Mikroskopie ist zugänglich und erfordert weniger Fachwissen. Darüber hinaus hat die Entwicklung von mitochondrialen zielgerichteten fluoreszierenden Proteinen die Untersuchung der mitochondrialen Dynamik in lebenden Zellen erheblich vorangetrieben21, da wir photoaktivierbares grün fluoreszierendes Protein (GFP) verwenden, um die mitochondriale Fusion sichtbar zu machen und zu quantifizieren22.
Um die mitochondriale Spaltung und Fusion zu untersuchen, werden die Zellen gestresst oder Medikamenten wie Cisplatin ausgesetzt, das an die DNA bindet und DNA-Schäden hervorruft, die in einer mitochondrienvermittelten Apoptose gipfeln23. In dieser Studie haben wir photoschaltbare, markierte Dendra2-Mitochondrien von photoaktivierbaren Mitochondrienmäusen verwendet, um die Spaltungs- und Fusionsereignisse in mit Cisplatin behandelten Nierenröhrenzellen zu untersuchen, da sie reich an Mitochondrien sind und eine hohe Regenerationsfähigkeit aufweisen. Dieses Protokoll kann jedoch in jedem Zelltyp verwendet werden, der photoschaltbare markierte Dendra2-Mitochondrien aufweist (Abbildung 1A-C).
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Alle Tierarbeiten wurden in Übereinstimmung mit den Protokollen durchgeführt, die vom Temple University Institutional Animal Care and Use Committee der Temple University (Animal Protocol-5183) genehmigt wurden. Die Pham-Mäuse, deren Mitochondrien das Dendra2-Protein exprimieren, wurden gekauft.
1. Vorbereitung des Zellkulturmediums
2. Induktion von Stress mit Cisplatin
3. Bildgebung
4. Bildanalyse
HINWEIS: Da Mitochondrien mit dem Dendra2-Protein markiert sind, führt eine irreversible Konformationsänderung des Dendra2-Proteins nach dem Photobleaching zu einer Erhöhung der roten Fluoreszenz, die durch den 561-nm-Laser nachgewiesen wird. Wenn die roten Mitochondrien mit den ungebleichten grünen Mitochondrien verschmelzen, ergibt die Kombination eine gelbe Farbe. Unter Ausnutzung dieses Phänomens können die dynamischen Spaltungs-/Fusionsereignisse gemessen werden.
5. Analysieren von Fusionsereignissen
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Primäre tubuläre Epithelzellen wurden durch enzymatischen Verdau aus der Mausniere isoliert und in DMF-12 kultiviert, ergänzt mit 5 % FBS, 1 % Penicillin-Streptomycin bei 37 °C unter 5 % CO2. Bei Erreichen einer Konfluenz von 80 % wurden die Zellen trypsinisiert (0,25 % Trypsin-EDTA) und mit einer Dichte von 5 × 104 Zellen pro Vertiefung in Kulturplatten mit Glasboden ausgesät, die mit Kollagen vorbeschichtet waren.
Das Kulturmedium enthi...
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Mitochondriale Spaltung/Fusion sind entscheidende dynamische Prozesse, die die mitochondriale Homöostase und die zelluläre Lebensfähigkeit aufrechterhalten26. Eine korrekte Beurteilung dieser Prozesse erfordert fortschrittliche bildgebende Verfahren zur Visualisierung und Quantifizierung der mitochondrialen Morphologie, Dynamik und Funktion27,28. Verschiedene Techniken wurden zur Messung der mitochondriale...
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Die Autoren erklären, dass sie nichts offenzulegen haben.
Diese Arbeit wurde durch Forschungsstipendien des National Institute of Health mit der Fördernummer 5R01DK135470-03, des ISAC-NIH-Stipendiums 5U24DK128851-03 und des Postdoktorandenstipendiums der American Heart Association unterstützt.
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| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| Zellkultur | |||
| DMEM/F12 | Basalmedium | (Gibco/Katze. Nr.11320033 ) | Proximale tubuläre Zellkultur |
| Fetal Bovine Serum (FBS) | 5–10 % Supplementierung | (Biowest/Cat. Nr.S181B) | Kulturmittelanreicherung |
| Penicillin-Streptomycin | 100X | (Gibco/Katze. Nr.15140122) | Antibiotikaschutz |
| Kollagen IV | Beschichtung | (Sigma-C5533-5M) | Ibidi-Plattenbeschichtung |
| Trypsin-EDTA | 0,25 % Lösung | (Gibco/Katze. Nr.25200056) | Zellablösung |
| Phosphatgepufferte Kochsalzlösung (PBS) | (Gibco/Katze. Nr.10010023 ) | Zellreinigung | |
| Behandlungen | |||
| Cisplatin | 2 & Mikro; M Arbeitsschwerpunkt | (Selleck Chemicals/Cat. Nr.S1166) | Spannungseinduktion |
| Dimethylsulfoxid (DMSO) | Fahrzeugsteuerung  | (Fisher Scientific/Cat. Nr.D1391) | Cisplatin-Lösungsmittelkontrolle |
| Imaging | |||
| Phenolrotfreies Medium | Live Imaging | (Gibco/Katze. Nr.21041025) | Reduzierte Hintergrundfluoreszenz |
| Molekularbiologie | |||
| TRIzol® | RNA-Extraktion | (Gibco/Katze. Nr.15596018) | Totale RNA-Isolation |
| SYBR Green Master Mix | qPCR-Chemie | (Thermowissenschaftlich/Katzen. Nr.K0221) | Genexpression der Mitochondriendynamik (DNM1L, FIS1, MFN1, MFN2, OPA1) |
| Fluoreszierende Werkzeuge | |||
| Dendra2 | Mitochondrienmatrix-Tag | Jacson Laboratory(PhAMentfernt) | Foto-umschaltbarer Reporter (405nm-Umwandlung, 488/561nm-Bildgebung) |
| Mikroskope | |||
| Konfokalmikroskop | Leica DMi8 | Lebendzellbildgebung und FRAP | 405nm/488nm/561nm Laser |
| Bild J | https://imagej.net/software/fiji/downloads | ||
| RGB Profiler Plugin | https://imagej.net/ij/plugins/rgb-profiler.html. | Analyse von Fusionsereignissen (Rot/Grün-Signal-Überlappung) |
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