Transkriptomische Analyse von gesunden Personen und Patienten mit Präeklampsie
Für die Genexpressionsunterschiede zwischen der normalen (Normal) Gruppe und PE-Patienten wurde die differentielle Expression mittels des R-Pakets limma in den zusammengeführten Datensätzen analysiert. Insgesamt wurden 89 DEGs identifiziert (p < 0,05 und |log2FC| > 0,5), darunter 69 hochregulierte Gene und 20 herunterregulierte Gene für GSE75010 (Abbildung 1A). Es gibt 2.097 differentiell exprimierte Gene, davon 1.121 hochregulierte und 976 herunterregulierte Gene (Abbildung 1B). Für den Datensatz GSE60438 wurden 7.633 DEGs gefunden, mit 3.371 hochregulierten und 4.262 herunterregulierten Genen (Abbildung 1C). Die erheblichen Unterschiede in der Anzahl der DEGs zwischen den drei Datensätzen spiegeln wahrscheinlich Unterschiede in der Stichprobengröße, dem Gewebetyp (plazentare Zotten vs. Decidua basalis) und der Klassifizierung der PE-Schwere wider, was weiterhin die Bedeutung unterstreicht, den Durchschnitt der Datensätze zu bilden, um robuste gemeinsame DEGs zu identifizieren.
Funktionelle Anreicherungsanalyse von DEGs
Zur systematischen Identifizierung zentraler DEGs im Zusammenhang mit PE wurde eine Venn-Analyse der DEGs aus den PE-Datensätzen GSE75010, GSE10588 und GSE60438 durchgeführt, wodurch letztendlich 56 gemeinsame DEGs identifiziert wurden (Abbildung 2A). Mithilfe der Online-Plattform STRING (Interaktionsscore ≥0,15) wurde ein PPI-Netzwerk für diese 56 gemeinsamen DEGs erstellt, und basierend auf ihrem Vernetzungsgrad wurden die 20 wichtigsten Hub-Gene ermittelt, die mittels der Software Cytoscape rangiert wurden (Abbildung 2B). Auf Grundlage dieser Gene wurde außerdem eine GO-Enrichment-Analyse durchgeführt, um potenzielle Funktionen in biologischen Prozessen (BP), zellulären Komponenten (CC) und molekularen Funktionen (MF) zu untersuchen (Abbildung 2C). Die DEGs zeigten eine stärkste Anreicherung in der Hormonsekretion sowie in der Regulation der Transmembranrezeptor-Serin/Threonin-Kinase-Signalübertragung. Auf zellulärer Ebene waren die Gene hauptsächlich in fokalen Adhäsionen, Zell-Substrat-Verbindungen und einer Vielzahl von vesikel- und lysosomenbezogenen Genen lokalisiert. In Bezug auf molekulare Funktionen umfassten die angereicherten Terme Prolylhydroxylase-Aktivität, Hormonaktivität und den transmembranen Transport lipidbezogener Moleküle. Diese Ergebnisse deuten darauf hin, dass die DEGs möglicherweise wichtige Rollen bei der Signalübertragung in Plazentazellen, der Interaktion zwischen Zelle und Matrix sowie der Aufrechterhaltung endokrinbezogener Funktionen spielen. Gleichzeitig zeigte die KEGG-Pfad-Anreicherung, dass die DEGs am stärksten in der Interaktion von Zytokinen und Zytokinrezeptoren, der Interaktion von Adhäsionsmolekülen auf Zellen sowie in den Signalwegen von TGF-β und HIF-1 angereichert waren (Abbildung 2D). Die Anreicherung bestimmter virusbezogener Terme (z. B. Hepatitisviren, Ebolavirus) spiegelt vermutlich eine unspezifische Überlappung mit gemeinsamen immunregulatorischen Genen wider und nicht eine direkte biologische Assoziation mit PE; der interpretative Fokus liegt daher auf entzündungs-, adhäsions- und hypoxiebezogenen Wegen. Diese Signalwege sind mit entzündlichen Reaktionen, der adhäsionsvermittelten Zellinteraktion und hypoxiebezogenen Signalvorgängen assoziiert und könnten den Fortschritt von PE beeinflussen, indem sie den immun-entzündlichen Status und die Zell-Zell-Kommunikation im mikrobiologischen Umfeld der Plazenta verändern.
Das maschinelle Lernen identifiziert SASH1 als ein Schlüsselgen bei PE
Zur Identifizierung wichtiger prognostischer Gene wurden vier maschinelle Lernverfahren für die Merkmalsauswahl angewandt. Die LASSO-Regression mit Kreuzvalidierung zeigte, dass das Modell den minimalen Kreuzvalidierungsfehler erreichte, wenn log(λ.min) = -3,8075 betrug. Gene mit nicht-null Koeffizienten bei diesem λ-Wert wurden als Schlüsselmerkmale ausgewählt, die mittels LASSO identifiziert wurden (Abbildung 3A–B). Der Boruta-Algorithmus bewertet die Wichtigkeit von Merkmalen durch Vergleich mit Schattenmerkmalen. Gene mit Wichtigkeitswerten über shadowMax wurden als Bestätigt gekennzeichnet und als wichtige Kandidatengene betrachtet, während jene mit Wichtigkeitswerten unter shadowMin als Abgelehnt markiert und als nicht signifikant beitragend eingestuft wurden. Gene zwischen diesen beiden Schwellenwerten wurden als Vorläufig klassifiziert, was auf eine mögliche, aber unsichere Bedeutung hinweist (Abbildung 3C). Die SVM-RFE-Analyse zeigte, dass bei Beibehaltung von 40–50 Merkmalen die Kreuzvalidierungsgenauigkeit ihr höchstes oder nahezu höchsten Niveau erreichte, was auf eine optimale Vorhersageleistung bei diesem Merkmalsumfang hindeutet (Abbildung 3D). Die moderate Kreuzvalidierungsgenauigkeit (~0,6) zeigt an, dass kein einzelner Algorithmus für diesen Datensatz optimal abschnitt; daher wurde eine Strategie des multiplen Algorithmus-Schnitts angewandt, um die Robustheit der Merkmalsauswahl zu erhöhen. XGBoost quantifizierte die relative Wichtigkeit der Gene anhand von Gain-Werten und identifizierte so Merkmale mit höherem Beitrag zur Modellvorhersage (Abbildung 3E). Die Venn-Schnittmengenanalyse der Ergebnisse der vier Methoden identifizierte SASH1 als einziges überlappendes Gen. Obwohl SASH1 im Boruta-Algorithmus als Vorläufig klassifiziert wurde, stützt die konsistente Auswahl durch alle drei anderen Algorithmen seine Einstufung als konsensbasiertes Kandidatengen (Abbildung 3F).
Einzelzellanalyse
Die zelluläre Heterogenität und die molekularen Prozesse in PE-Plazentageweben wurden untersucht. Die Zellen wurden anhand der Anzahl der nachgewiesenen Gene, der Anzahl der RNA-Zählungen und des Prozentsatzes der mitochondrialen Genexpression qualitätsgefiltert. Niedrigqualitative Zellen (weniger als 200 nachgewiesene Gene oder mehr als 20 % mitochondriale Genexpression) wurden entfernt, um eine hochwertige Einzelzellprobe für die nachgeschaltete Analyse zu erhalten. Die Qualitätskontrollkennzahlen und die Identifizierung hochvariabler Gene sind in Supplementary Figure 1A–B dargestellt. Nach der Normalisierung und Identifizierung hochvariabler Gene wurde eine Hauptkomponentenanalyse (PCA) unter Verwendung der 2.000 am stärksten variablen Gene sowie signifikanter Hauptkomponenten mithilfe der JackStraw-Analyse und der ElbowPlot-Analyse durchgeführt (Supplementary Figure 2A–B).
Basierend auf den Hauptkomponenten wurde die Uniforme Mannigfaltigkeitsapproximation und Projektion (UMAP) zur Dimensionsreduktion und Durchführung einer unbeaufsichtigten Clusterung verwendet, wobei alle Zellen in 22 Cluster klassifiziert wurden, was die hohe zelluläre Heterogenität im Plazentagewebe verdeutlicht (Abbildung 4A). Durch die Untersuchung der cluster-spezifischen Expression von Markergenen und die Visualisierung differentiell exprimierter Gene (DEGs) in einer Heatmap (Abbildung 4B) wurde jeder Cluster anhand eines kanonischen Markers annotiert und anschließend zurück in das UMAP-Embedding projiziert (Abbildung 4C). Basierend auf diesen Hauptpopulationen plazentaler Zellen konnten B-Zellen/Plasmazellen, endotheliale Zellen, Fibroblasten/Stromazellen, Makrophagen/Dendritische Zellen, natürliche Killerzellen, T-Zellen sowie Trophoblastenzellen identifiziert werden. Vergleiche zwischen Kontroll- und PE-Gruppen zeigen, dass mehrere Zelltypen in PE-Plazentas eine erhebliche relative Verteilung aufweisen, was auf eine Umgestaltung des plazentaren Mikromilieus hindeutet (Abbildung 4D).
Die Gewebeherkunft und der Krankheitsstatus wurden verwendet, um Zellen in derselben UMAP-Einbettung basierend auf der Gewebequelle (Decidua vs. Villi) und der Krankheitsgruppierung (Kontrolle vs. PE) zu verfolgen (Abbildung 4E). Die Verteilung der Zellanzahl war teilweise nach Gewebeherkunft getrennt, während Zellen aus unterschiedlichen Krankheitsgruppen stark miteinander verbunden waren. Dies legt nahe, dass PE die gesamte transkriptomische Struktur nicht wesentlich umgestaltet, jedoch möglicherweise Auswirkungen auf einzelne Zellpopulationen oder bestimmte molekulare Merkmale hat. Die Expression von SASH1 wurde auf das UMAP abgebildet, um ihre Verteilung unter den plazentaren Zellpopulationen zu untersuchen (Abbildung 4F–G). SASH1 zeigt eine stark zelltypspezifische Expression mit bemerkenswerten Unterschieden zwischen den decidualen und villösen Zellpopulationen. Der statistische Vergleich der SASH1-Expression zwischen PE- und Kontrollgruppen über verschiedene Zelltypen hinweg (Wilcoxon-Rangsummentest) ergab signifikante Unterschiede in mehreren plazentaren Zellpopulationen, wobei die stärkste Erhöhung in Trophoblastenzellen aus PE-Proben beobachtet wurde (Abbildung 4H). Dieser Befund liefert Einzelzell-Evidenz dafür, dass die Dysregulation von SASH1 im Trophoblasten-Kompartiment besonders ausgeprägt ist, und unterstützt die Verwendung der HTR-8/SVneo-Trophoblastenzelllinie für nachfolgende funktionelle Experimente.
Die Absenkung von SASH1 hemmt die hypoxieinduzierte Apoptose von Trophoblasten und entzündliche Reaktionen
Zur Validierung der bioinformatischen Vorhersagen wurde ein PE-bezogenes Trophoblasten-Zellmodell unter hypoxischen Bedingungen (1 % O2) etabliert. qPCR- und Western-Blot-Analysen wurden durchgeführt, um die SASH1-Expression zu bewerten (Abbildung 5A–B). Im Vergleich zu normoxischen HTR-8/SVneo-Zellen zeigten hypoxiebehandelte Zellen signifikant erhöhte SASH1-mRNA- und Proteinexpressionsniveaus, was eine vorläufige experimentelle Bestätigung der bioinformatischen Ergebnisse darstellt. Um den Effekt der SASH1-Reduktion auf PE-bezogene pathologische Prozesse zu untersuchen, wurde SASH1 in hypoxiebehandelten HTR-8/SVneo-Zellen stillgelegt. Quantitative PCR- und Western-Blot-Analysen (Abbildung 5C–D) zeigten, dass die SASH1-Expression in allen sh-SASH1-Gruppen im Vergleich zur sh-NC-Gruppe signifikant verringert war. Unter diesen erwies sich sh-SASH1#3 als am effizientesten in der Knockdown-Wirkung und wurde daher für nachfolgende Experimente ausgewählt. TUNEL-Färbung und ELISA wurden unter drei Bedingungen durchgeführt: normoxische Kontrolle (Normal), Hypoxie mit negativer Kontroll-shRNA (Hypoxia + sh-NC) und Hypoxie mit SASH1-Knockdown (Hypoxia + sh-SASH1). Im Vergleich zur Normal-Gruppe zeigte die Hypoxia + sh-NC-Gruppe signifikant erhöhte Apoptose sowie erhöhte Sekretion der proinflammatorischen Zytokine IL-1β, IL-6 und TNF-α, was eine hypoxieinduzierte Trophoblastenschädigung bestätigt. Die SASH1-Reduktion verminderte diese Effekte deutlich und senkte die Apoptose (Abbildung 5E) sowie die Zytokinspiegel (Abbildung 5F) auf Werte, die jenen der Normal-Gruppe nahekamen, was darauf hindeutet, dass die SASH1-Reduktion die hypoxieinduzierte Trophoblastenapoptose und entzündlichen Reaktionen weitgehend kompensieren kann. Um die kausale Rolle von SASH1 weiter zu belegen, wurden Gain-of-Function-Experimente durchgeführt. qPCR und Western Blot bestätigten eine erfolgreiche Überexpression von SASH1 in HTR-8/SVneo-Zellen (Abbildung 5G–H). Unter normoxischen Bedingungen führte die SASH1-Überexpression (OE-SASH1) im Vergleich zur OE-NC-Gruppe zu einer signifikanten Zunahme der Trophoblastenapoptose und der Sekretion proinflammatorischer Zytokine, wodurch das hypoxieinduzierte Phänotyp nachgeahmt wurde (Abbildung 5I–J). Insgesamt zeigen die Verlust- und Gewinn-an-Funktion-Daten, dass SASH1 sowohl notwendig als auch ausreichend ist, um die Trophoblastenapoptose und entzündlichen Reaktionen anzutreiben, und bestätigen damit seine kausale Rolle in der PE-bezogenen Pathologie.
P-EXOS unterdrückt die Hypoxie-induzierte Apoptose von Trophoblasten und entzündliche Reaktionen durch die Modulation von SASH1
P-EXOS gelten als therapeutisch vielversprechend bei PE. In dieser Studie deutete eine Bioinformatik-Analyse darauf hin, dass SASH1 mit exosomenbezogenen Signalwegen assoziiert ist (wie durch GO- und KEGG-Anreicherung gezeigt, Abbildung 2C–D), was uns zu der Hypothese führte, dass P-EXOS bei PE einen schützenden Effekt über die Regulation von SASH1 entfalten könnten. Vor funktionellen Untersuchungen wurden die isolierten P-EXOS zunächst charakterisiert. Eine Western-Blot-Analyse bestätigte das Vorhandensein der Exosomen-Markerproteine PLAP, CD63 und TSG101, während kein nachweisbarer Ausdruck des Golgi-Markers GM130 festgestellt wurde, was auf eine hohe Reinheit der isolierten Vesikel hindeutet. Die Transmissionselektronenmikroskopie zeigte zudem typische tassenförmige vesikuläre Strukturen (Abbildung 6A–B). Um zu überprüfen, ob P-EXOS effizient von Zielzellen aufgenommen werden können, wurde eine Immunfluoreszenzfärbung durchgeführt, um die zelluläre Aufnahme von P-EXOS zu bewerten. Im Vergleich zur Kontrollgruppe zeigten HTR-8/SVneo-Zellen, die mit P-EXOS behandelt wurden, in den überlagerten Bildern deutliche Kolokalisationssignale, was darauf hindeutet, dass P-EXOS effektiv von HTR-8/SVneo-Zellen internalisiert wurden (Abbildung 6C).
Anschließend wurden HTR-8/SVneo-Zellen unter hypoxischen Bedingungen mit P-EXOS koinkubiert. Sowohl quantitative PCR- als auch Western-Blot-Analysen zeigten eine deutliche Verringerung der SASH1-mRNA- und Proteinspiegel in der mit P-EXOS behandelten Gruppe im Vergleich zu den Kontrollen (Abbildung 6D–E), was erste Hinweise auf eine regulatorische Interaktion zwischen P-EXOS und SASH1 liefert. In Übereinstimmung mit diesen molekularen Veränderungen zeigte die TUNEL-Färbung eine erhebliche Abschwächung der hypoxieinduzierten Apoptose in HTR-8/SVneo-Zellen nach Behandlung mit P-EXOS (Abbildung 6F). Gleichzeitig wiesen ELISA-Analysen eine deutlich verminderte Sekretion proinflammatorischer Zytokine, darunter IL-6, IL-1β und TNF-α, nach (Abbildung 6G).
Um zu bestimmen, ob die schützenden Wirkungen von P-EXOS mechanistisch von der Unterdrückung von SASH1 abhängen, wurde ein Rescue-Experiment unter hypoxischen Bedingungen durchgeführt. Zellen mit Überexpression von SASH1 (OE-SASH1 + P-EXOS) wurden mit negativen Kontrollzellen (OE-NC + P-EXOS) verglichen. Die Überexpression von SASH1 beseitigte die schützenden Effekte von P-EXOS signifikant, wie durch erhöhte Apoptose (Abbildung 6H) und gesteigerte Sekretion proinflammatorischer Zytokine (Abbildung 6I) im Vergleich zur OE-NC + P-EXOS-Gruppe belegt wurde. Diese Ergebnisse zeigen, dass die schützende Wirkung von P-EXOS spezifisch über die Unterdrückung von SASH1 vermittelt wird und nicht über parallele Signalwege, was das therapeutische Potenzial von P-EXOS bei PE unterstreicht.
VERFÜGBARKEIT VON DATEN:
Die Datensätze, die die Ergebnisse dieser Studie unterstützen, sind öffentlich zugänglich und wurden aus der Gene Expression Omnibus (GEO)-Datenbank (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/) mit den Zugangsnummern GSE75010, GSE10588, GSE60438 und GSE183338 bezogen. Die Zelltyp-Annotation wurde unter Bezugnahme auf die Cell Classification Database (https://ngdc.cncb.ac.cn/celltaxonomy/) durchgeführt. Ungeschwärzte Western Blot-Bilder und alle weiteren rohen experimentellen Daten, die die Ergebnisse dieser Studie unterstützen, sind im Ordner Supplementary Raw Data enthalten.

Abbildung 1: Identifizierung differentiell exprimierter Gene (DEGs) in Plazenta- und Dezidualgeweben bei Präeklampsie (PE) anhand von drei unabhängigen Datensätzen. (A) Volcano-Plot der DEGs zwischen 157 Plazentaproben von Präeklampsiefällen und 173 Plazentaproben ohne Präeklampsie aus dem kombinierten Datensatz GSE75010. (B) Volcano-Plot der DEGs zwischen schweren Präeklampsie-Proben der Plazenta (n = 17) und normalen Plazentaproben (n = 26) aus dem Datensatz GSE10588. (C) Volcano-Plot der DEGs zwischen Dezidualproben bei Präeklampsie und normotensiven Kontrolldezidualproben aus dem Datensatz GSE60438. Die DEGs wurden anhand eines p-Werts < 0,05 und eines |log2FC| > 0,5 identifiziert. Bitte klicken Sie hier, um eine vergrößerte Version dieser Abbildung anzusehen.

Abbildung 2: Funktionsanreicherung und PPI-Analyse gemeinsamer DEGs im Zusammenhang mit Präeklampsie. (A) Mengendiagramm der aus den präeklampsiebezogenen Datensätzen GSE75010, GSE10588 und GSE60438 identifizierten DEGs. (B) PPI-Netzwerk der 20 wichtigsten Hub-Gene, ausgewählt aus den 56 gemeinsamen DEGs basierend auf dem Grad der Vernetzung, sortiert mithilfe der Cytoscape-Software (STRING-Interaktionsscore ≥0,15). (C) GO- und KEGG-Anreicherungsanalysen der gemeinsamen DEGs, dargestellt als Balkendiagramme. (D) GO- und KEGG-Anreicherungsanalysen der gemeinsamen DEGs, dargestellt als Sehnendiagramme. Bitte klicken Sie hier, um eine vergrößerte Version dieser Abbildung anzusehen.

Abbildung 3: Maschinelle Lernbasierte Screening-Untersuchung von Kandidaten-Hub-Genen, die mit Präeklampsie assoziiert sind. (A) LASSO-Regressionsanalyse, die die Koeffizientenprofile der Kandidatengene zeigt. (B) Auswahl des optimalen Regularisierungsparameters (λ) mittels LASSO-Regression mit Kreuzvalidierung. (C) Boruta-Algorithmus. (D) SVM-RFE-Analyse. (E) XGBoost-Algorithmus. (F) Venn-Diagramm, das den Durchschnitt der von den Algorithmen LASSO, Boruta, SVM-RFE und XGBoost identifizierten Kandidatengene zeigt. Abkürzungen: LASSO = least absolute shrinkage and selection operator; SVM-RFE = support vector machine recursive feature elimination. Bitte klicken Sie hier, um eine vergrößerte Version dieser Abbildung anzusehen.

Abbildung 4: Die Einzelzell-Transkriptom-Analyse zeigt zelltypspezifische SASH1-Expressionsmuster bei Präeklampsie. (A) UMAP-Clustering des Einzelzell-Datensatzes. (B) Analyse der fünf stärksten Marker zur Annotation des Einzelzell-Transkriptom-Datensatzes GSE183338 aus Präeklampsie-Proben. (C) Annotation der Zellsubpopulationen. (D) Balkendiagramm zur Darstellung der Verteilung der Zellanteile in Kontroll- und Präeklampsie-Proben. (E) UMAP-Diagramm, eingefärbt nach Gewebekompartiment (Decidua und Villi) und Krankheitsstatus (Kontrolle und Präeklampsie). (F) UMAP-Diagramm zur Darstellung der SASH1-Expression in plazentaren Zellpopulationen, gruppiert nach Gewebekompartiment (Decidua und Villi). (G) UMAP-Diagramm zur Darstellung der SASH1-Expression in plazentaren Zellpopulationen, gruppiert nach Krankheitsstatus (Kontrolle und Präeklampsie). (H) Violindiagramm zur Darstellung der Expressionsverteilung von SASH1 über verschiedene plazentare Zelltypen hinweg. ns p > 0,05; *p < 0,05; **p < 0,01; ***p < 0,001. Abkürzungen: UMAP = uniform manifold approximation and projection; ns = nicht signifikant. Bitte klicken Sie hier, um eine vergrößerte Version dieser Abbildung anzusehen.

Abbildung 5SASH1 reguliert die hypoxieinduzierte Apoptose und Entzündungsreaktion in Trophoblasten. (AqPCR-Analyse der SASH1-mRNA-Expression und dichtometrische Quantifizierung der SASH1-Proteinspiegel in HTR-8/SVneo-Zellen unter normalen und hypoxischen Bedingungen.B) Repräsentative Western-Blot-Bilder, die den in (A) gezeigten dichtometrischen Daten entsprechen. (CqPCR-Analyse der SASH1-mRNA-Expression und dichtometrische Quantifizierung der SASH1-Proteinspiegel in unter Hypoxie behandelten HTR-8/SVneo-Zellen, die mit sh-NC- oder sh-SASH1-Konstrukten (sh-SASH1#1, sh-SASH1#2 und sh-SASH1#3) transfiziert wurden. (D) Repräsentative Western-Blot-Bilder, die den in (C) gezeigten dichtometrischen Daten entsprechen. (E) TUNEL-Färbung von HTR-8/SVneo-Zellen in den Gruppen Normal, Hypoxie + sh-NC und Hypoxie + sh-SASH1(#3). Maßstabsbalken = 20 µm. (FELISA-Analyse entzündungsfördernder Zytokine (IL-1β, IL-6 und TNF-α) in den Gruppen Normal, Hypoxie + sh-NC und Hypoxie + sh-SASH1(#3). (GqPCR-Analyse der SASH1-mRNA-Expression und dichtometrische Quantifizierung der SASH1-Proteinspiegel in HTR-8/SVneo-Zellen, die mit OE-NC- oder OE-SASH1-Konstrukten transfiziert wurden.H) Repräsentative Western-Blot-Bilder, die den in (G) gezeigten dichtometrischen Daten entsprechen. (I) TUNEL-Färbung von HTR-8/SVneo-Zellen in den Gruppen Normal + OE-NC und Normal + OE-SASH1. Maßstabsbalken = 20 µm. (J) ELISA-Analyse entzündungsfördernder Zytokine (IL-1β, IL-6 und TNF-α) in den Gruppen Normal + OE-NC und Normal + OE-SASH1. *p < 0.05; **p < 0.01; ***p < 0,001. Die Daten sind als Mittelwert dargestellt ± SD aus drei unabhängigen biologischen Wiederholungen (n = 3). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.

Abbildung 6: P-EXOS lindern hypoxieinduzierte Trophoblastenschäden durch Hemmung von SASH1. (A) Western-Blot-Analyse der P-EXOS-Markerproteine PLAP, CD63 und TSG101, wobei GM130 als negativer Kontrollmarker diente. (B) Analyse der P-EXOS-Morphologie mittels Transmissionselektronenmikroskopie (TEM). Maßstab = 1,0 µm. (C) Konfokale Laser-Scanning-Mikroskopiebilder, die die Aufnahme von PKH67-markierten P-EXOS (grün) in HTR-8/SVneo-Zellen (rot) zeigen. Die Kerne wurden mit DAPI (blau) kontragefärbt. Maßstab = 20 µm. (D) qPCR-Analyse der SASH1-mRNA-Expression sowie dichtometrische Quantifizierung der SASH1-Proteinmengen in HTR-8/SVneo-Zellen der Kontroll- und P-EXOS-Gruppen. (E) Repräsentative Western-Blot-Bilder, die den dichtometrischen Daten aus (D) entsprechen. (F) TUNEL-Färbung von HTR-8/SVneo-Zellen in der Kontroll- und P-EXOS-Gruppe. Maßstab = 20 µm. (G) ELISA-Analyse entzündungsfördernder Zytokine (IL-1β, IL-6 und TNF-α) in hypoxiebehandelten HTR-8/SVneo-Zellen der Kontroll- und P-EXOS-Gruppen. (H) TUNEL-Färbung von HTR-8/SVneo-Zellen in den Gruppen OE-NC + P-EXOS und OE-SASH1 + P-EXOS. Maßstab = 20 µm. (I) ELISA-Analyse entzündungsfördernder Zytokine (IL-1β, IL-6 und TNF-α) in hypoxiebehandelten HTR-8/SVneo-Zellen der Gruppen OE-NC + P-EXOS und OE-SASH1 + P-EXOS. Abkürzungen: P-EXOS = plazentabasierte Exosome; TEM = Transmissionselektronenmikroskopie; PLAP = plazentares alkalines Phosphatase; TSG101 = Tumorsuszeptibilitätsgen 101. *p < 0,05; **p < 0,01. Die Daten sind als Mittelwert ± SD aus drei unabhängigen biologischen Wiederholungen dargestellt (n = 3). Bitte klicken Sie hier, um eine vergrößerte Version dieser Abbildung anzusehen.
Abbildung 1, Ergänzendes Material: Qualitätskontrolle der Einzelzell-RNA-Seq-Daten. (A) Violin-Plot der Genexpressionsniveaus nach der Qualitätskontrolle. (B) Plot der variablen Merkmale, der die nach der Qualitätskontrolle identifizierten hochvariablen Gene zeigt.Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Erweiterte Abbildung 2: Bestimmung statistisch signifikanter Hauptkomponenten für die Einzelzell-Clustering-Analyse. (A) JackStraw-Punktdiagramm zur Identifizierung statistisch signifikanter Hauptkomponenten. (B) Ellbogen-Punktdiagramm, das die von den Hauptkomponenten erklärte Varianz zeigt.Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Erweiterte Tabelle 1: shRNA-Zielsequenzen zur SASH1-Abschaltung. shRNA-Zielsequenzen (5′–3′) für die negative Kontrolle (sh-NC) und drei SASH1-gerichtete Konstrukte (sh-SASH1#1, sh-SASH1#2 und sh-SASH1#3), die für die Genstilllegung verwendet wurden.Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.
Erweiterte Tabelle 2: Primersequenzen für die quantitative PCR. Vorwärts- und Rückwärts-Primersequenzen (5′–3′) für SASH1 und β-Aktin (interne Referenzkontrolle), die in der qPCR-Analyse verwendet wurden.Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.