YTHDC1 fördert den zytoplasmatischen Export des m6A-modifizierten Rab27A, während IGF2BP2 Rab27A im Zytoplasma stabilisiert, wodurch die Osteoklastendifferenzierung verbessert und zur Osteoporose beiträgt.
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Forschungsartikel
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YTHDC1 fördert den zytoplasmatischen Export des m6A-modifizierten Rab27A, während IGF2BP2 Rab27A im Zytoplasma stabilisiert, wodurch die Osteoklastendifferenzierung verbessert und zur Osteoporose beiträgt.
Die Entwicklung neuartiger Therapien für Osteoporose hat zunehmend Aufmerksamkeit erregt. Rab27A wird während der Osteoklast-Differenzierung hochreguliert, und die N6-Methyladenosin-(m6A)-Modifikation hat sich als wichtiger epigenetischer Regulator bei orthopädischen Erkrankungen etabliert. Bioinformatische Analysen sagten voraus, dass Rab27A mehrere m6A-Modifikationsstellen enthält und mit mehreren m6A-assoziierten Proteinen interagiert. Knockdown-Experimente wurden durchgeführt, um die Rolle von Rab27A bei der Osteoklast-Differenzierung und Osteoporose mit einem ovariektomierten (OVX) Mausmodell zu bewerten. Der Depletion von Rab27A schwächte die Osteoporose ab und erhöhte den Knochenbildungsprozentsatz von 14,73 % auf 28,13 % (P < 0,05) bei OVX-Mäusen. Western-Blotting und quantitative PCR zeigten, dass Rab27A-Knockdown die Protein- und mRNA-Expression der Osteoklastenmarker TRAP, NFATc1 und c-FOS reduzierte und damit die Osteoklastendifferenzierung von Knochenmark-abgeleiteten Makrophagen (BMMs), die durch den makrophagen-koloniestimulierenden Faktor (M-CSF) und den Rezeptoraktivator des nuklearen Faktor-κB-Ligands (RANKL) induziert wurden, unterdrückte. Die TRAP-Färbung zeigte zudem, dass die Rab27A-Depletion die TRAP-Aktivität nach M-CSF- und RANKL-Induktion signifikant von 24,1 % auf 12,9 % reduzierte (P < 0,01). RNA-Immunpräzipitationstests bestätigten Wechselwirkungen zwischen Rab27A und den m6A-Leserproteinen YTHDC1 und IGF2BP2. Die nukleare und zytoplasmatische Fraktionierung zeigte, dass YTHDC1 den zytoplasmatischen Export von m6A-modifiziertem Rab27A erleichtert. Darüber hinaus zeigten q-PCR- und Western-Blot-Analysen, dass der Knockdown von entweder YTHDC1 oder IGF2BP2 die Rab27A-Expression reduzierte und die Expression von TRAP, NFATc1 und c-FOS verringerte, wodurch die durch M-CSF und RANKL induzierte Osteoklastendifferenzierung unterdrückt wurde. Zusammen deuten diese Ergebnisse darauf hin, dass YTHDC1-vermittelter zytoplasmatischer Export und IGF2BP2-vermittelter Stabilisierung von m6A-modifizierten Rab27A die Osteoklastendifferenzierung fördern und zum Knochenverlust im OVX-Mausmodell beitragen.
Osteoporose (OP) ist eine häufige Skeletterkrankung, die durch eine Verschlechterung der Knochenmikrostruktur und eine verminderte Knochenmineraldichte gekennzeichnet ist, was weltweit zu einem erhöhten Frakturenrisiko führt 1,2,3. Osteoporotische Brüche treten am häufigsten am Unterarm, Oberarm, Hüfte und Wirbelsäule auf und sind besonders häufig bei älteren Erwachsenen. Diese Brüche beeinträchtigen die Lebensqualität erheblich und verursachen erhebliche physische, psychische und sozioökonomische Belastungen für Patienten, ihre Familien und Gesundheitssysteme3. Daher bleiben die Prävention, das Management und die Behandlung der Osteoporose zentrale klinische und öffentliche Gesundheitsprioritäten.
Es wurden verschiedene therapeutische Strategien für Osteoporose entwickelt und lassen sich im Allgemeinen in zwei Kategorien einteilen: knochenbildende Mittel und antiresorptive Therapien 4,5. Zu den traditionellen Antiresorptiven zählen Bisphosphonate, Ralexifen und Strontiumranelat, während neuere Wirkstoffe Denosumab, Odanacatib und Saracatinib umfassen. Knochenbildende Therapien umfassen das Nebenschilddrüsenhormon (PTH 1–84), während mehrere weitere Kandidaten wie MK-5442, AMG 785 und BHQ 880 sich in klinischer Entwicklungbefinden. Obwohl diese Behandlungen wirksam sein können, sind viele mit erheblichen Nebenwirkungen, begrenzter langfristiger Wirksamkeit oder Einschränkungen bei längerer Anwendung verbunden 4,6,7,8,9. Beispielsweise kann die langfristige Verabreichung von Aminobisphosphonaten und Denosumab die normale Knochenumbildungbeeinträchtigen. Daher bleibt die Identifizierung sicherer und wirksamerer therapeutischer Ziele ein wichtiges Ziel in der Osteoporoseforschung.
Rab-Proteine sind Schlüsselregulatoren des intrazellulären Vesikeltransports und der Zellsignalübertragung und sind an vielfältigen biologischen Prozessen beteiligt, darunter Virusinfektionen, Autophagie und zytoskelettale Organisation10. In den letzten Jahren richtete sich zunehmend die Aufmerksamkeit auf die Rolle der Rab-Familienproteine im Knochenstoffwechsel und bei der Osteoporose. Es wurde berichtet, dass Rab44 die Osteoklastendifferenzierung reguliert, indem es die intrazelluläreCa-2⁺-Signalübertragung moduliert und den nuklearen Faktor aktivierter T-Zellen 1 (NFATc1) im Rezeptoraktivator der mit dem Nuklearfaktor κB-Liganden (RANKL) behandelten Makrophagen11 aktiviert. Osteoklasten sind multinukleäre Zellen, die von Vorläufern der Makrophagenlinie abgeleitet sind, und spielen eine wesentliche Rolle bei der Knochenresorption und der skelettalen Homöostase 12,13,14,15,16,17,18,19. Daher ist das Verständnis der molekularen Mechanismen, die die Osteoklastendifferenzierung steuern, entscheidend für die Entwicklung neuartiger therapeutischer Ansätze für Osteoporose.
Rab27A ist ein wichtiges Mitglied der Rab-GTPase-Familie und wird weit verbreitet in sekretorischen und Immunzellen exprimiert. Sie spielt eine entscheidende Rolle beim Transport von Vesikeln, Exozytose und intrazellulärer Signalübertragung20,21,22,23,24,25,26,27. Frühere Studien haben gezeigt, dass Rab27A die Eosinophil-Degranulation während der Atemwegsentzündung reguliert und die vesikuläre Mobilisation steuert, die mit der NADPH-Oxidase-Aktivität in aktivierten Makrophagen20.23 assoziiert ist. Bemerkenswert ist, dass sich die zunehmenden Belege darauf hindeuten, dass die Rab27A-Expression während der Osteoklastendifferenzierung signifikant hochreguliert wird. Shimada-Sugawara et al. berichteten, dass die Expression von Rab27A während der Differenzierung von Knochenmark-abgeleiteten Makrophagen (BMMs) zu Osteoklasten zunimmt, was auf eine mögliche Rolle bei der Osteoklastogenese28 hindeutet. Zusammenfassend deuten diese Ergebnisse darauf hin, dass Rab27A die Bildung und Funktion von Osteoklasten beeinflussen kann, indem es den vesikularen Transport und intrazelluläre Signalwege reguliert28,29.
N6-Methyladenosin (m6A) ist die am häufigsten vorkommende interne RNA-Modifikation in eukaryotischen und nicht-kodierenden RNAs und dient als entscheidender Regulator des RNA-Stoffwechsels und der Genexpression. Als erste identifizierte mRNA-Modifikation bei Säugetieren wurde m6A an zahlreichen biologischen Prozessen beteiligt, darunter RNA-Stabilität, Spleißen, Transport und Translation. Wang et al. zeigten, dass m6A-Modifikationen, die häufig in konservierten Sequenzmotiven auftreten, von YTH-domänenhaltigen Proteinen erkannt werden und zur Regulation der mRNA-Stabilität und des Stoffwechsels30 beitragen. Darüber hinaus wurde die m6A-Modifikation mit verschiedenen biologischen Funktionen in Verbindung gebracht, darunter Genomstabilität, transkriptionelle Regulation, Chromatinorganisation, Krebsprogression und Immunantworten31. Neuere Studien haben zudem wichtige Rollen der m6A-Signalübertragung bei knochenbedingten Erkrankungen und Osteoporose32 hervorgehoben.
Unter den m6A-Reader-Proteinen fungiert YTHDC1 als Kernleser, der die RNA-Verarbeitung und den Kernexport reguliert, während das insulinähnliche mRNA-bindende Protein 2 (IGF2BP2) m6A-modifizierte Transkripte im Zytoplasma stabilisiert. Chen et al. zeigten, dass YTHDC1 den nuklearen Export von m6A-modifizierten circNSUN2 fördert, die anschließend mit IGF2BP2 interagiert, um HMGA2-mRNA zu stabilisieren und die Kolorektalkrebsmetastase33 zu fördern. Diese Ergebnisse deuten darauf hin, dass die koordinierte Regulation durch YTHDC1 und IGF2BP2 einen allgemeinen Mechanismus darstellen könnte, der das Schicksal von m6A-modifizierten Transkripten steuert.
Die vorliegende Studie untersuchte vorhergesagte m6A-Modifikationsstellen in Rab27A-mRNA und untersuchte deren Wechselwirkungen mit YTHDC1 und IGF2BP2. Es wurde festgestellt, dass YTHDC1 den nuklearen Export von m6A-modifizierten Rab27A-Transkripten erleichtert, während IGF2BP2 mit Rab27A im Zytoplasma interagierte und dessen Stabilität verbesserte. Durch diesen regulatorischen Mechanismus förderte Rab27A die Osteoklastendifferenzierung und trug zum Fortschreiten der Osteoporose bei. Zusammen identifizieren die Ergebnisse einen bisher nicht anerkannten, m6A-abhängigen regulatorischen Weg, der YTHDC1, IGF2BP2 und Rab27A in der Osteoklastendifferenzierung umfasst. Diese Ergebnisse liefern neue Einblicke in die molekulare Pathogenese der Osteoporose und könnten die Entwicklung neuartiger therapeutischer Strategien fördern, die auf die m6A-vermittelte Regulation von Rab27A abzielen.
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Alle Tierverfahren wurden vom Ausschuss für Tierschutz und -nutzung des angeschlossenen Krankenhauses der Southwest Medical University genehmigt (Genehmigungsnummer 2024-Ethics-042). Alle Experimente wurden gemäß den ARRIVE-Leitlinien, dem britischen Animals (Scientific Procedures) Act 1986 und den damit verbundenen Leitlinien, der EU-Richtlinie 2010/63/EU sowie dem Leitfaden der National Institutes of Health für die Pflege und Nutzung von Labortieren (NIH Publication Nr. 8023, überarbeitet 1978) durchgeführt. Die Mäuse wurden zufällig experimentellen Gruppen zugeteilt, und die Zuteilungssequenz wurde vor dem Prüfer verborgen. Alle Datenerhebungen und -analysen, einschließlich histologischer Bewertung, Mikro-Computertomographie (Mikro-CT) Bildanalyse und statistischer Analysen, wurden von Forschern durchgeführt, die für die Gruppenzuweisung blind waren. Keine Tiere oder Proben wurden von den Analysen ausgeschlossen. Alle Reagenzien, Geräte, Software und andere in diesem Protokoll verwendeten Ressourcen sind in der Materialtabelle aufgeführt.
1. Konstruktion des Ovariektomie-(OVX)-Modells
Vierundzwanzig weibliche Wildtyp-C57BL/6 Mäuse im Alter von 8 Wochen wurden verwendet, um ein Osteoporosemodell zu etablieren. Nach einer einwöchigen Akklimatisierungsphase wurden die Mäuse zufällig entweder der Sham- oder OVX-Gruppe zugeordnet. Das OVX-Modell wurde durch eine bilaterale Ovariektomie etabliert, wie zuvorbeschrieben 34,35. Sham-operierte Mäuse unterzogen sich einer operativen Exposition der Eierstöcke ohne Entfernung.
Für die intrafemorale Genabgabe wurden lentivirale Vektoren, die sh-Rab27A oder sh-NC exprimieren, 7 Tage nach der OVX-Operation injiziert, wie zuvor berichtet36,37. Kurz gesagt wurden konzentrierte lentivirale Partikel (1 × 106 Transduziereinheiten/mL) unter Narkose über den Patellarweg mit einer 22-Gauge-Nadel in den Oberschenkelknochen injiziert. Jede Maus erhielt 20 μL lentivirale Suspension. Der Schnitt wurde anschließend genäht und die Tiere während der gesamten Genesung überwacht.
Alle Tierversuche wurden unter spezifischen, pathogenfreien Bedingungen durchgeführt. Oberschenkelproben wurden 8 Wochen nach der Operation entnommen. Mindestens sechs Mäuse pro Gruppe wurden für histologische Analysen und RNA- oder Proteinextraktion verwendet.
2. In-vivo Mikro-CT-Bildgebung
Mikro-Computertomographie (Mikro-CT) wurde durchgeführt, um die Morphologie der Trabekulären Knochen zu untersuchen. Das rechte Schienbein jeder Maus wurde vor der OVX-Operation im Alter von 14 Wochen in vivo gescannt. Folgeuntersuchungen wurden wöchentlich bis zum Alter von 22 Wochen durchgeführt. Mindestens sechs Mäuse pro Gruppe wurden in die Mikro-CT-Analyse einbezogen.
Die Mäuse wurden mit intraperitonealem Natriumpentobarbital (50 mg/kg Körpergewicht) betäubt. Eine adäquate Anästhesie wurde durch das Fehlen des Zehenkneifreflexes und durch kontinuierliche Überwachung der Atemfrequenz bestätigt, die während des gesamten Bildgebenden Verfahrens aufrechterhalten wurde. Alle Euthanasieverfahren wurden gemäß dem genehmigten Tierprotokoll, den institutionellen Tierschutzrichtlinien und den nationalen Vorschriften für die Euthanasie von Labortieren durchgeführt.
Im Alter von 24 Wochen wurden die Mäuse durch eine zervikale Verrenkung nach Tiefanästhesie eingeschläfert, und beide Tibia wurden mit demselben Bildgebungsprotokoll für ex-vivo-Scans entnommen. Zu den Scanningsparametern gehörten eine Voxelgröße von 10,4 μm, eine Spannung von 55 kV, ein Strom von 145 μA, ein Sichtfeld von 32 mm, 1500/750 Proben pro Projektion und eine Integrationszeit von 100 ms.
Die Bilder wurden mit einem Beam-Hardening-Korrekturalgorithmus dritter Ordnung erstellt, der gegen ein 1200 mg HA/cm 3-Phantom kalibriert wurde. Die Knochenvolumenfraktion (BV/TV), die Trabekulardicke (Tb.Th) und die Trabekularzahl (Tb.N) wurden in der distalen Femurmetaphyse quantifiziert, die sich 1,0 mm proximal zur Wachstumsplatte befindet.
3. Plasmidtransfektion
sh-Rab27A- und sh-NC-Plasmide wurden erzeugt und zur Lentivirusproduktion verwendet. Lentivirale Verpackungsplasmide und shRNA-Konstrukte wurden gemäß den Anweisungen des Herstellers ko-transfiziert in HEK293T Zellen. Virale Titer wurden vor intrafemoraler Verabreichung bestimmt, wie zuvor beschrieben36. Es wurden drei unabhängige biologische Replikate durchgeführt.
4. Färbung von Hämatoxylin und Eosin (HE)
Femurproben wurden 24 Stunden lang in 4 % Paraformaldehyd fixiert, 4 Wochen lang in 10 % EDTA entkalkt, in 30 % Saccharose/PBS kryogeschützt, in Paraffin eingebettet und mit einer Dicke von 5 μm durchschnitten. Gewebeschnitte wurden mit Hämatoxylin und Eosin gefärbt und mit einem Lichtmikroskop untersucht. Mindestens sechs Mäuse pro Gruppe wurden analysiert.
5. Tartratresistente Säurephosphatase (TRAP)-Färbung
Die TRAP-Färbung der Oberschenkelschnitte erfolgte gemäß den Herstelleranweisungen38. Die TRAP-Aktivität in Knochenmark-abgeleiteten Makrophagen (BMMs) wurde mittels eines TRAP-Färbungstests untersucht. Reife Osteoklasten wurden als TRAP-positive multinukleierte Zellen definiert, die mindestens drei Kerne enthalten. Es wurden drei unabhängige biologische Replikate durchgeführt, jeweils mit drei technischen Replikaten.
6. q-PCR
Die Gesamt-RNA wurde gemäß den Anweisungen des Herstellers mit TRIzol-Reagenz isoliert. Komplementäre DNA wurde mittels Reverse-Transkriptase synthetisiert und einer quantitativen Echtzeit-PCR mit SYBR-Green-Chemie unterzogen. Es wurden drei unabhängige biologische Replikate durchgeführt, jeweils mit drei technischen Replikaten.
Die Primer-Sequenzen waren wie folgt:
Rab27A: F, TTCCTGCTTCTGTTCGACCT; R, GGCAGCACTGGTTTTTCAAAAT
FALLE: F, TGTTGACAGCGGTCCATCTA; R, CCTCCTTCTTAACCCGAAGC
NFATc1: F, GGTGCTGTCTGGCCATAACT; R, GCGGAAAGGTGGTATCTCAA
C-FOS: F, TACTACCATTCCCCAGCCGA; R, GCTGTCACCGTGGGGATAAA
YTHDC1: F, GAAGTGGAAGCTCTGCATCAG; R, TTGATCTTTTCGGACAGCACG
IGF2BP2: F, GACTACCCCGACCAGAACTG; R, GAGGCGGGATGTTCCGAATC
β-Aktin: F, GGGAAATCGTGCGTGACATTAAG; R, TGTGTTGGCGTACAGGTCTTTG
7. Western-Blotting
Zellen oder Gewebe wurden mittels RIPA-Puffer, ergänzt mit Protaseinhibitoren, lysiert. Die Proteinkonzentrationen wurden mittels eines Bradford-Tests bestimmt. Gleiche Mengen Protein (20 μg) wurden durch SDS-PAGE getrennt und auf Polyvinylidenfluorid (PVDF) oder Nitrocellulosemembranen übertragen. Die Membranen wurden 1 Stunde lang mit 5 % fettfreier Milch bei Zimmertemperatur blockiert und über Nacht bei 4 °C mit primären Antikörpern gegen TRAP, NFATc1, c-FOS, Rab27A, YTHDC1, IGF2BP2 oder β-Actin inkubiert. Nach dem Waschen wurden die Membranen mit den entsprechenden sekundären Antikörpern für 1 Stunde bei Raumtemperatur inkubiert. Die Proteinbänder wurden mit standardisierten Nachweisverfahren visualisiert. Es wurden drei unabhängige biologische Replikate durchgeführt.
8. Zellkultur
Knochenmark-abgeleitete Makrophagen (BMMs) wurden isoliert, wie zuvor beschrieben39. Knochenmarkzellen, die von Maus-Oberschenkelknochen entnommen wurden, wurden über Nacht in α-minimalem essentiellen Medium kultiviert, ergänzt mit 10 % fetalem Rinderserum, 30 ng/mL makrophagen-koloniestimulierendem Faktor (M-CSF) und 1 % Penicillin/Streptomycin bei 37 °C in einer befeuchteten Atmosphäre mit 5 % CO₂. Nicht-adhärente Zellen wurden gesammelt und in einem stromalzellfreien System mit 30 ng/mL M-CSF kultiviert. Nach 3 Tagen wurden adhärente Zellen als BMMs entnommen und anschließend in Anwesenheit von 30 ng/mL M-CSF und 50 ng/mL Rezeptoraktivator des nuklearen Faktor-κB-Ligands (RANKL) für 72 Stunden kultiviert, um die Osteoklastendifferenzierung zu induzieren.
9. RNA-Interferenz (RNAi)
Kleine interferierende RNAs (siRNAs) wurden synthetisiert und mit einem lipidbasierten Transfektionsreagenz gemäß den Anweisungen des Herstellers transfiziert. Die Zellen wurden mit einer Dichte von 2 × 104 Zellen pro Bohrloch in sechs-Well-Platten vor der Transfektion ausgesaat. Es wurden drei unabhängige biologische Replikate durchgeführt.
Die Zielsequenzen waren wie folgt:
si-Rab27A: GGACUUAAUCAUCTAGAGAAUGGAA
si-YTHDC1: GCAAGGAGUGUUAUCUUAATT
si-IGF2BP2: CCGUUAACCAACAAGCCAATT
10. Immunfluoreszenz
Die Zellen wurden 20 Minuten lang mit 4 % Paraformaldehyd fixiert und 10 Minuten mit 0,1 % Triton X-100 permeabilisiert. Nach 30 Minuten Blockierung mit 5 % Rinderserumalbumin wurden die Zellen über Nacht mit primären Antikörpern bei 4 °C inkubiert.
Nach dem Waschen wurden fluorophor-konjugierte sekundäre Antikörper für 30 Minuten bei Zimmertemperatur aufgetragen. Die Kerne wurden mit DAPI gegenfärbt, und Bilder wurden mittels Konfokalmikroskopie aufgenommen. Es wurden drei unabhängige biologische Replikate durchgeführt.
11. Kern- und zytoplasmatische Trennung
Kern- und zytoplasmatische Fraktionen wurden gemäß den Anweisungen des Herstellers isoliert. Die Zellen wurden 10 Minuten auf Eis lysiert und bei 500 × g für 3 Minuten bei 4 °C zentrifugiert. Der Supernatant mit zytoplasmatischen Komponenten wurde gesammelt, während der Pellet mit den Kernen separat gewaschen und verarbeitet wurde.
12. RNA-bindende Protein-Immunpräzipitation (RIP)
RNA-Immunpräzipitationstests (RIP) wurden gemäß den Anweisungen des Herstellers durchgeführt. Kurzzeitig wurden die Zellen 30 Minuten lang auf Eis gelistet. Nach der Zentrifugation wurden die Supernatanten über Nacht mit Antikörpern und Protein-A/G-Agaroseperlen inkubiert. Nach dem Waschen wurden immunpräzipitierte Proteine mittels Western Blotting analysiert, und co-immunpräzipitierte RNA wurde mittels quantitativer Echtzeit-PCR analysiert. Es wurden drei unabhängige biologische Replikate durchgeführt.
13. Rab27A mRNA-Stabilitätstest
Nach IGF2BP2 Knockdown wurde die gesamte RNA zu den angegebenen Zeitpunkten extrahiert. Anschließend wurden Reverse-Transkription und quantitative Echtzeit-PCR durchgeführt. Die Rab27A-mRNA-Spiegel wurden bei 0 H auf die entsprechende si-NC-Gruppe normalisiert. Es wurden drei unabhängige biologische Replikate durchgeführt.
14. Statistische Analyse
Alle Experimente wurden unabhängig voneinander mit mindestens drei biologischen Replikaten durchgeführt. Für q-PCR, RNA-Interferenz, TRAP-Färbung, Western Blotting und andere zellbasierte Tests umfasste jede biologische Replikat drei technische Replikate, sofern nicht anders angegeben. Die Daten werden als Mittelwert ± Standardabweichung (SD) präsentiert.
Statistische Analysen wurden mit GraphPad Prism Version 9.0 und SPSS-Software durchgeführt. Vergleiche zwischen zwei Gruppen wurden mit einem zweiseitigen Schüler-t-Test durchgeführt. Vergleiche zwischen mehreren Gruppen wurden mittels zweiseitiger Varianzanalyse (ANOVA) analysiert, gefolgt von Tukeys Mehrfachvergleichs-Post-hoc-Test zur Anpassung an mehrere Vergleiche. Ein P-Wert < 0,05 galt als statistisch signifikant.
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Knockdown von Rab27A reduzierte die Osteoporose in vivo.
Um die Rolle von Rab27A bei Osteoporose zu untersuchen, wurde Rab27A Knockdown in einem ovariektomierten (OVX) Mausmodell durchgeführt, das mit zuvor berichteten Methoden34,40 erstellt wurde. Das Gesamtstudiendesign ist in Abbildung 1 zusammengefasst. Die Mikro-Computertomographie zeigte, da...
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Die Osteoklast-Differenzierung spielt eine wesentliche Rolle bei der Knochenremodellierung, Knochenresorption, Frakturreparatur und der skelettalen Homöostase12˒15˒17˒18˒42˒43. Übermäßige Osteoklastenaktivität ist ein wesentlicher Faktor für die Osteoporose, weshalb die Identifizierung regulatorischer Signalwege, die die Osteoklastendifferenzieru...
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Die Autoren erklären keine konkurrierenden finanziellen Interessen oder Interessenkonflikte.
Diese Arbeit wurde finanziell durch das Scientific and Technological Strategic Cooperation Project zwischen dem Pengzhou People's Hospital und der Southwest Medical University (Zuschussnummer 2023PZXNYD01) an Lian Tang unterstützt.
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| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| 4% Paraformaldehyde | Thermo Fisher Scientific | A5818101 | Tissue and cell fixation |
| Alexa Fluor 488 secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-11001 | Fluorescent secondary antibody for immunofluorescence; RRID: AB_2534069 |
| Alexa Fluor 546 secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-11035 | Fluorescent secondary antibody for immunofluorescence; RRID: AB_2534093 |
| Bovine serum albumin (BSA) | Merck | A2153 | Blocking reagent |
| Bradford Protein Assay | Merck | B6916 | Protein quantification |
| C57BL/6JSlac mice | Shanghai SLAC Laboratory Animal Co., Ltd. | — | Female, 8 weeks old; RRID: MGI:2159769 |
| c-FOS antibody | Abcam | ab222699 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_2891049 |
| Confocal laser scanning microscope (SP8) | Leica Microsystems | SP8 | Immunofluorescence image acquisition; RRID: SCR_018169 |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 | Nuclear counterstain for immunofluorescence; RRID: AB_2307445 |
| EDTA | Merck | V900081-500G | Tissue decalcification reagent |
| Eosin | Solarbio | G1100 | Histological cytoplasmic stain |
| Fetal bovine serum (FBS) | Thermo Fisher Scientific | A5669701 | Cell culture supplement |
| GraphPad Prism | GraphPad Software | Version 9.0 | Statistical analysis software; RRID: SCR_002798 |
| Hematoxylin | Cell Signaling Technology | #14166 | Histological nuclear stain |
| IBM SPSS Statistics | IBM | Windows version | Statistical analysis software; RRID: SCR_016479 |
| IGF2BP2 antibody | Proteintech | 11601-1-AP | Primary antibody for western blotting and immunofluorescence; RRID: AB_2122672 |
| Inverted light microscope (DMi8) | Leica Microsystems | DMi8 | Histological image acquisition; RRID: SCR_026672 |
| Lentiviral titer quantification kit | Takara Bio | 631235 | Lentiviral titer determination |
| Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | L3000015 | Plasmid transfection reagent |
| Lipofectamine RNAiMAX | Thermo Fisher Scientific | 13778150 | siRNA transfection reagent |
| M-CSF | MedChemExpress | HY-P7085 | Osteoclast differentiation factor |
| Micro-computed tomography system | Scanco Medical | VivaCT80 | Bone morphometric analysis |
| M-MLV Reverse Transcriptase | Promega | M1701 | cDNA synthesis |
| NFATc1 antibody | Santa Cruz Biotechnology | sc-7294 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_2152503 |
| PARIS Kit | Thermo Fisher Scientific | AM1556 | Nuclear and cytoplasmic fractionation |
| Penicillin/Streptomycin | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | Antibiotic supplement for cell culture |
| Power SYBR Green Master Mix | Thermo Fisher Scientific | 4367659 | Quantitative real-time PCR |
| Protease inhibitor cocktail | Thermo Fisher Scientific | 78429 | Prevention of protein degradation |
| Protein A/G agarose beads | Merck | IP05 | Immunoprecipitation |
| PVDF membrane | Thermo Fisher Scientific | 88520 | Protein transfer membrane for western blotting |
| Rab27A antibody | Abcam | ab55667 | Primary antibody for western blotting and immunofluorescence; RRID: AB_945112 |
| RANKL | MedChemExpress | HY-P7425 | Osteoclast differentiation factor |
| Real-time PCR system | Applied Biosystems | ABI7900HT | Quantitative real-time PCR instrument |
| RIPA buffer | Thermo Fisher Scientific | 78501 | Protein extraction buffer |
| RNA Immunoprecipitation (RIP) Kit | Millipore | RIP-12RXN | RNA immunoprecipitation assay |
| SDS-PAGE reagents | Thermo Fisher Scientific | BT041210BOX | Protein electrophoresis |
| shRNA plasmids | RiboBio | — | Gene silencing by RNA interference |
| Small interfering RNAs (siRNAs) | GenePharma | — | Gene silencing by RNA interference |
| SRAMP | Online resource | — | Prediction of m6A modification sites; RRID: SCR_024500 |
| StarBase (ENCORI) | Online resource | — | RNA interaction prediction database; RRID: SCR_016303 |
| TRAP antibody | Abcam | ab2391 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_303034 |
| TRAP staining kit | Merck | 387A | Detection of osteoclast activity |
| Triton X-100 | Thermo Fisher Scientific | 85111 | Cell permeabilization reagent |
| TRIzol Reagent | Thermo Fisher Scientific | 15596026CN | Total RNA isolation |
| YTHDC1 antibody | Abcam | ab122340 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_11128253 |
| α-MEM | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 139-15651 | Cell culture medium |
| β-Actin antibody | Merck | A5441 | Loading control for western blotting; RRID: AB_476744 |
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