Quelle: Meunier Sylvain1,2,3, Perchet Thibaut1,2,3, Sophie Novault4, Rachel Golub1,2,3
1 Einheit für Lymphopoiese, Institut für Immunologie, Pasteur Institute, Paris, Frankreich
2 INSERM U1223, Paris, Frankreich
3 Université Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, Cellule Pasteur, Paris, Frankreich
4 Flow Cytometry Platfrom, Cytometry and Biomarkers UtechS, Center for Translational Science, Pasteur Institute, Paris, Frankreich
Die Abwehr von Krankheitserregern hängt von der Überwachung durch das Immunsystem ab. Dieses System ist komplex und umfasst viele Zelltypen, von denen jeder spezifische Funktionen hat. Diese komplexe Zusammensetzung ermöglicht Immunreaktionen auf eine große Vielfalt von Krankheitserregern und Verletzungen. Die adaptive Immunität ermöglicht spezifische Reaktionen gegen bestimmte Krankheitserreger. Die Mehrheit der Zellen, die für diese Art der Immunität verantwortlich sind, sind die Lymphozyten (B-Zellen und T-Zellen). In der Regel reagieren B-Zellen auf extrazelluläre Infektionen (z. B. bakterielle Infektionen) und T-Zellen auf intrazelluläre Infektionen (z. B. Virusinfektionen). Die verschiedenen Zelltypen in Lymphozytenpopulationen können durch die Kombination von Zelloberflächenproteinen, die sie exprimieren, und/oder durch eine Gruppe von abgesonderten Zytokinen charakterisiert werden.
Die magnetische Sortierung ermöglicht die Anreicherung von Zielzellpopulationen unter Verwendung magnetischer Eigenschaften und expressionierung eines oder mehrerer Zelloberflächenproteine (1, 2). Diese Technik besteht aus drei Schritten. Zunächst werden die Zellen mit magnetischen Perlen inkubiert, die mit einem oder mehreren monoklonalen Antikörpern gekoppelt sind. Zellen, die Oberflächenproteine ausdrücken, die an diese Antikörper binden, heften sich an die magnetischen Perlen. Dann werden die Zielzellpopulationen mit einem Magneten erfasst. Zum Abschluss werden die Zielzellen vom Magneten eluiert. Am Ende werden zwei Sortierprodukte erhalten, eines mit nicht beschrifteten Zellen und das zweite mit den Zielzellen gekoppelt mit den Magnetperlen. Säulen können verwendet werden, um die Effizienz der magnetischen Sortierung zu verbessern. In der Spalte verlängert ein nichtmagnetisches Element den Pfad der Zelle durch die Spalte. Daher wird der Zellfluss verlangsamt, was die Zellerfassung durch den Magneten erleichtert.
Abbildung 1: Schematische Darstellung der magnetischen Trennung. Thymische Leukozyten sind mit Anti-CD3-biotinylierten Antikörpern gefärbt. Nach dem Waschen fixieren Streptavidin (SAV) gekoppelte Perlen das Biotin gezielt auf Anti-CD3-Antikörper. (1) Zellen werden in eine Spalte übertragen. (2) Der Magnet behält keine unbeschrifteten Zellen, während CD3-positive Zellen in der Spalte verbleiben. Schließlich wird die Säule vom Magneten getrennt und (3) CD3-positive Zellen werden im Medium eluiert. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Es gibt zwei Arten der magnetischen Sortierung (3). Bei der positiven Sortierung werden Von interessede Zellen mit den Magnetperlen erfasst. Bei der negativen Sortierung werden unerwünschte Zellen entfernt, indem sie mit den magnetischen Perlen, die die entsprechenden Antikörper tragen, aufgenommen werden. Diese MACS-Technik ermöglicht eine gute Anreicherung von Zielzellen und verbessert den Anteil der zurückgewonnenen Zellen von 1-20% auf 60-98% in einem Organ. Nach der Sortierung ist es notwendig, die Zellreinheit und die Sortierung nach verschiedenen Methoden (z.B. Durchflusszytometrie) zu überprüfen. Die MACS-Technik ist ideal, um eine Zielpopulation für andere Experimente wie Zellkultur oder Zellzyklusanalyse zu bereichern.
In dieser Übungseinheit zeigen wir, wie thymische Leukozyten isoliert und anschließend thymische CD3-positive Zellen aus dem Mix mit der magnetischen Zellsortierungstechnik angereichert werden können.
1. Vorbereitung
2. Dissektion
3. Immunzellisolierung
4. Magnetische Kennzeichnung von Immunzellen
mischen | Etikettierungsreagenzien | verdünnung |
1 | Anti-CD3 biotinylierter Antikörper | 1/400 (in HBSS 2% FCS) |
2 | Streptavidin gekoppelte Perlen | 1/5 (in HBSS 2% FCS) |
3 | Anti-CD3 BV421 | 1/200 (in HBSS 2% FCS) |
Tabelle 1: Antikörper mischen Zusammensetzung. Für die magnetische Trennung werden die Mischungen 1 und 2 verwendet. Mix 3 wird zur Bewertung der Zellanreicherung nach magnetischer Trennung verwendet.
5. Magnetische Trennung von CD3-positiven Zellen
6. Bewertung der Target-Cell-Anreicherung durch Durchflusszytometrie
7. Datenanalyse
Die magnetisch aktivierte Zellsortierung (MACS) ist eine Technik, die es Forschern ermöglicht, Zellen auf der Grundlage spezifischer Epitope, die auf ihren Oberflächen exprimiert werden, zu trennen.
Der Prozess beginnt in der Regel mit der Extraktion eines Organs oder Gewebes, wie dem Thymus. Dann werden die Zellen mechanisch getrennt, in der Regel durch Zerkleinern, bis das Gewebe in einzelne Zellen zerlegt wird. Unerwünschte Zellen können in diesem Stadium durch Zugabe von Chemikalien entfernt werden. Zum Beispiel kann Ammoniumchlorid-Kalium oder ACK-Puffer verwendet werden, um unerwünschte Erythrozyten zu lysieren.
Als nächstes wird der Suspension ein Antikörper hinzugefügt, der mit einem Molekül namens Biotin konjugiert wird, und diese Komplexe binden an die Epitope der Oberfläche der Zielzellen. Biotin hat eine hohe Affinität zu einem anderen Molekül namens Streptavidin. Im nächsten Schritt werden den Antikörper-markierten Zellen Streptavidin-Moleküle zu magnetischen Perlen hinzugefügt. Wenn Biotin und Streptavidin in Kontakt kommen, binden sie fest. Das Ergebnis ist, dass die Interessenszellen mit magnetischen Perlen beschichtet sind. Dieser Komplex wird manchmal als Sandwich bezeichnet. In diesem Fall, CD3 auf der Zellmembran auf der Unterseite, dann Anti-CD3 konjugiert zu Biotin, und schließlich, Streptavidin konjugiert zu magnetischen Perlen.
Diese beschrifteten Zellen können nun in eine Spalte mit einer Matrix platziert werden, die, unterstützt durch die Schwerkraft, die Zellen langsam durch einen Magneten passieren lässt. Dabei kleben die magnetischen, mit Perlen beschrifteten Zellen am Rand des Rohres, das dem Magnet am nächsten liegt, während die nicht beschrifteten Zellen in einem Sammelrohr weitergeführt werden. Als nächstes können die beschrifteten Zellen aus der Säule entfernt werden, indem sie einfach den Magneten entfernen, eine Eluentenlösung hinzufügen und sanften Druck mit einem Kolben anwenden, um sie aus der Säule in ein frisches Sammelrohr zu spülen. Letztlich ermöglicht dieser Prozess 60 bis 98% Abruf der Zellen von Interesse.
In diesem Verfahren werden wir thymische Leukozyten von einer Maus isolieren und MACS verwenden, um CD3-positive T-Zellen zu sortieren, bevor wir die Effizienz der Sortierung mit FACS bestätigen.
Zunächst sollten Sie alle geeigneten Schutzausrüstungen einschließlich Labormantel und Handschuhe anziehen. Als nächstes waschen Sie eine Schere und Zange mit 70% Ethanol und trocknen Sie sie mit einem sauberen Papiertuch. Dann bereiten 200 Milliliter HBSS 2% fetale Kalbsserum, oder FCS, durch Mischen von vier Milliliter FCS mit 196 Milliliter HBSS.
Pin eine eingeschläferte Maus in einer Supine-Position auf einer Sezierplatte. Führen Sie mit Schere und Zange eine Längs-Laparotomie durch, um auf die Brusthöhle zuzugreifen. Entfernen Sie zuerst das Herz, um Zugang zum Thymus zu erhalten, der sich über dem Herzen befindet. Identifizieren Sie dann den Thymus, der aus zwei weißen Lappen besteht. Mit Zangen, lösen Sie den Thymus vorsichtig und legen Sie ihn auf eine Petrischale mit fünf MilliliterHBS2% FCS.
Um die Immunzellen zu isolieren, legen Sie den Thymus zunächst auf ein 40 Mikrometer Zellsieb in der Petrischale. Zerkleinern Sie das Gewebe mit einem Kolben, um es in die Schale zu dissoziieren. Danach spülen Sie den Kolben und das Sieb mit HBSS 2% FCS, um alle haftenden Zellen wiederherzustellen. Dann pipette die dissoziierten Thymuszellen und Flüssigkeit aus der Petrischale in ein 15 Milliliter Zentrifugenrohr. Waschen Sie die Petrischale mit fünf Millilitern HBSS 2% FCS und übertragen Sie diese Waschlösung auch auf das 15 Milliliter Zentrifugenrohr.
Als nächstes zentrifugieren Sie das Rohr bei 370 mal g für sieben Minuten bei 20 Grad Celsius. Entsorgen Sie den Überstand und setzen Sie das Pellet in zwei MilliliterACK-Lysingpuffer wieder auf, um die Erythrozyten zu lyse. Zwei Minuten bei Raumtemperatur auf der Bankplatte inkubieren. Dann bringen Sie das Volumen auf 14 Milliliter mit HBSS 2% FCS. Zentrifugieren Sie das Rohr bei 370 mal g für sieben Minuten bei 20 Grad Celsius. Entsorgen Sie dann den Überstand und setzen Sie die Zellen in fünf Millilitern HBSS 2% FCS wieder aus.
Schätzen Sie die Zellkonzentration anhand eines Malassez-Dias, wie im Protokoll zur FACS-Isolierung von B-Lymphozyten gezeigt, und passen Sie die Zellkonzentration auf 10 auf die siebten Zellen pro Milliliter mit HBSS 2% FCS an.
Übertragen Sie 500 Mikroliter Zelllösung in zwei FACS-Röhren. Beschriften Sie eine Röhre nicht angereicherte T-Zellen und die anderen röhrenangereicherten T-Zellen, die durch magnetische Beschriftung getrennt werden.
Zentrifugieren Sie das angereicherte T-Zellen-Rohr bei 370 mal g für drei Minuten bei 20 Grad Celsius. Entsorgen Sie den Überstand und setzen Sie das Pellet in 250 Mikroliter Biotin gekoppelten Anti-CD3-Antikörper verdünnt ein s.in 400 in HBSS 2% FCS. Inkubieren Sie die Zellen für 20 Minuten auf Eis und im Dunkeln. Fügen Sie drei Milliliter HBSS 2% FCS in die Rohre und zentrifugieren Sie sie wieder bei 370 mal g für drei Minuten bei 20 Grad Celsius. Entsorgen Sie den Überstand und setzen Sie das Pellet in 250 MikroliterStreptavidin-gekoppelten Perlen in HBSS 2% FCS verdünnt. Die Mischung aus Zellen und Perlen 20 Minuten lang auf Eis bebrüten. Als nächstes fügen Sie drei Milliliter HBSS 2% FCS in das Rohr, Pipette nach oben und unten zu mischen, und Zentrifuge wieder bei 370 mal g für drei Minuten bei 20 Grad Celsius. Setzen Sie das Pellet in zwei Milliliter HBSS 2% FCS aus.
Legen Sie die Säule auf den Magneten und fügen Sie drei Milliliter HBSS 2% FCS hinzu, um das System zu befeuchten. Dann pipette die gefärbten Zellen in die Spalte. Nachdem die Zellsuspension durch die Säule geht, waschen Sie die Säule dreimal mit drei Millilitern HBSS 2% FCS. Entfernen Sie als Nächstes die Säule vom Magneten und legen Sie sie in ein 15-Milliliter-Rohr. Um die Zielzellen zu löschen, fügen Sie der Spalte fünf Milliliter HBSS 2% FCS hinzu und spülen Sie die Spalte mit einem Kolben. Wiederholen Sie diesen Schritt mit weiteren fünf Millilitern HBSS 2% FCS.
Um die Wirksamkeit der Zielzellisolierung zu bewerten, übertragen Sie zunächst 500 Mikroliter eluierte Zellsuspension in ein FACS-Rohr und beschriften Sie sie angereicherte T-Zellen. Dann zentrifugieren Sie sowohl die angereicherten als auch die nicht angereicherten Rohre bei 370 mal g für sieben Minuten bei 20 Grad Celsius. Entsorgen Sie den Überstand, und fügen Sie dann 100 Mikroliter fluoreszierender Antikörper, der in 200 in HBSS 2% FCS verdünnt wird, in beide Röhren. Inkubieren Sie die Zellen für 20 Minuten auf Eis und im Dunkeln. Als nächstes fügen Sie drei Milliliter HBSS 2% FCS in die Rohre und zentrifugieren Sie sie bei 370 mal g für drei Minuten bei 20 Grad Celsius. Entsorgen Sie den Überstand, und setzen Sie die Pellets in 250 Mikroliter HBSS 2% FCS wieder aus. Bewerten Sie nun die CD3-positive Zellanreicherungsrate mithilfe der Durchflusszytometrie, wie im FACS-Protokoll gezeigt.
Nun werden wir die Häufigkeit von CD3-positiven Lymphozyten unter allen Thymosyten bestimmen, die vom Mausthymus isoliert wurden. Um zu starten, doppelklicken Sie auf das FlowJo-Symbol und ziehen Sie die Dateien für jede Röhre im gesamten Beispielfenster. Doppelklicken Sie dann auf die angereicherte T-Zellen-Datei, um die zellen, die von dieser Probe aufgezeichnet wurden, auf einem Punktdiagramm anzuzeigen, das Vorwärtsstreuung, FSCA auf der x-Achse und Seitenstreuung, SSCA, auf der y-Achse anzeigt.
Klicken Sie auf Polygon, um die Lymphozytenpopulationen zu umkreisen. Doppelklicken Sie anschließend auf die eingekreiste Grundgesamtheit, um ein neues Fenster zu erstellen. Wählen Sie FSC-W auf der y-Achse und FSC-A auf der x-Achse und kreisen Sie die FSA-W-Negativzellen. Benennen Sie im Identifikationsfenster für die Untergrundgesamtheit die Zellenpopulation Als Einzelzellen. Klicken Sie als Nächstes im Identifikationsfenster der Untergrundbevölkerung auf OK und doppelklicken Sie dann auf die eingekreiste Grundgesamtheit, um ein neues Fenster zu erstellen. Wählen Sie CD3 auf der y-Achse aus, und kreisen Sie die CD3-positiven Zellen. Benennen Sie im Identifikationsfenster für die Untergrundgesamtheit Die T-Zellen Der Zellenderpopulation. Wiederholen Sie dies mit der nicht angereicherten T-Zellen-Datei. Um die Zellenpopulation zu visualisieren, klicken Sie auf Layout-Editor, und ziehen Sie die T-Zellen-Population aus angereicherten T-Zellen und nicht angereicherten T-Zellen-Dateien auf die Registerkarte.
Punktdiagramme, die CD3-positive Lymphozyten darstellen, werden angezeigt. CD3-positive Zellen sollten nur in der Population von Interesse in der CD3-positiven angereicherten Röhre erscheinen. Um die Anreicherung von CD3-positiven Lymphozyten in den sortierten Zellen auszuwerten, klicken Sie auf den Tabelleneditor, und ziehen Sie dann die T-Zellen-Population aus angereicherten T-Zellen und nicht angereicherten T-Zellen-Dateien in die Tabelle. Wählen Sie im Statistikmenü Frequenz der Lymphozytenzellen aus, um den Prozentsatz der CD3-positiven Zellen in allen Lymphozyten zu überprüfen. Klicken Sie dann auf Tabelle erstellen. Parameterwerte werden in einer neuen Tabelle angezeigt. Bei den angereicherten T-Zellen sollte die Frequenz von CD3-positiven Zellen bei etwa 80% oder höher liegen.
In diesem Protokoll wurden CD3-positive Zellen mit Hilfe der magnetischen Zellsortierung aus thymischen Leukozyten angereichert (Abbildung 1). Vor der magnetischen Zellanreicherung machten CD3-positive Zellen 53,6 % der gesamten thymischen Zellen aus (Abbildung 2, obere Panels). Nach der anreicherung der magnetischen Zellen stieg der Anteil der CD3-positiven Zellen auf 95 % (Abbildung 2, untere Panels). Somit ist MACS eine einfache, schnelle und effiziente Zellanreicherungstechnik, um gewünschte Zellpopulationen aus einem Zellsuspensionsgemisch zu bereichern.
Abbildung 2: Gating-Strategie und Reinheitstestsortierung. Zellen werden zuerst basierend auf ihrer Morphologie (links: FSC-A, SSC-A) und dann Zellen gegen CD3 (rechts: CD3, SSC-A) geplottet. Die obere Platte stellt die Thymuszellsuspension vor der Zellanreicherung dar. Die untere Platte stellt die Thymuszellsuspension nach der magnetischen Zellsortierung dar. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Die Magnetische Trenntechnologie ist eine gängige Methode, um eine Zielzellpopulation einfach und schnell zu sortieren. Mit T-Zellen spezifische Antikörper und magnetische Perlen haben wir T-Zellen Frequenz in unserer Probe angereichert. Die Reinheitsrate am Ende des Experiments hängt vom Prozentsatz der Zielzellen in der anfänglichen Zellsuspension ab. Zellen, die nach der magnetischen Zellsortierung gewonnen werden, können für verschiedene Zwecke wie zellübertragung oder Zellzyklusanalyse verwendet werden. Eine andere Sortiermethode, die die Durchflusszytometrie verwendet, kann verwendet werden, um Zellen anzureichern. Diese Technik liefert eine sehr hohe Reinheitsrate nach der Zellsortierung, erfordert jedoch mehr Schritte und nimmt mehr Zeit in Anspruch.
Magnetic-activated cell sorting, or MACS, is a technique that allows researchers to separate cells based on specific epitopes expressed on their surfaces.
The process typically begins with extraction of an organ or tissue, such as the thymus. Then, the cells are mechanically separated, usually by crushing, until the tissue is dissociated into single cells. Unwanted cells can be removed at this stage via the addition of chemicals. For example, ammonium-chloride-potassium, or ACK buffer, can be used to lyse unwanted erythrocytes.
Next, an antibody conjugated to a molecule called biotin is added to the suspension, and these complexes bind to the epitopes of the surface of the target cells. Biotin has a high affinity for another molecule called streptavidin. In the next step, streptavidin molecules fused to magnetic beads are added to the antibody labeled cells. When the biotin and streptavidin come into contact, they tightly bind. The result is that the cells of interest are coated with magnetic beads. This complex is sometimes referred to as a sandwich. In this case, CD3 on the cell membrane on the bottom, then anti-CD3 conjugated to biotin, and finally, streptavidin conjugated to magnetic beads.
These labeled cells can now be placed into a column containing a matrix which, assisted by gravity, allows the cells to pass slowly by a magnet. As they do so, the magnetic bead-labeled cells will stick to the edge of the tube nearest the magnet, while the non-labeled cells will continue on into a collection tube below. Next, the labeled cells can be removed from the column by simply removing the magnet, adding an eluent solution, and applying gentle pressure with a plunger to flush them out of the column and into a fresh collection tube. Ultimately, this process allows for 60 to 98% retrieval of the cells of interest.
In this procedure, we will isolate thymic leukocytes from a mouse and use MACS to sort out CD3-positive T-cells before confirming the efficiency of sorting using FACS.
To begin, put on any appropriate protective equipment including a lab coat and gloves. Next, wash a pair of dissecting scissors and forceps with 70% ethanol and dry them with a clean paper towel. Then prepare 200 milliliters of HBSS 2% fetal calf serum, or FCS, by mixing four milliliters of FCS with 196 milliliters of HBSS.
Pin a euthanized mouse in a supine position on a dissection plate. Using scissors and forceps, perform a longitudinal laparotomy to access the chest cavity. First, remove the heart to gain access to the thymus, which is located above the heart. Then identify the thymus, which is composed of two white lobes. Using forceps, carefully detach the thymus and place it on a Petri dish with five milliliters of HBSS 2% FCS.
To isolate the immune cells, first place the thymus on a 40 micrometer cell strainer in the Petri dish. Crush the tissue with a plunger to dissociate it into the dish. After this, rinse the plunger and strainer with HBSS 2% FCS to recover any adhered cells. Then, pipette the dissociated thymus cells and fluid from the Petri dish into a 15 milliliter centrifuge tube. Wash the Petri dish with five milliliters of HBSS 2% FCS and transfer this wash solution to the 15 milliliter centrifuge tube also.
Next, centrifuge the tube at 370 times g for seven minutes at 20 degrees Celsius. Discard the supernatant and resuspend the pellet in two milliliters of ACK lysing buffer to lyse the erythrocytes. Incubate for two minutes at room temperature on the bench top. Then, bring the volume to 14 milliliters with HBSS 2% FCS. Centrifuge the tube at 370 times g for seven minutes at 20 degrees Celsius. Then, discard the supernatant and resuspend the cells in five milliliters of HBSS 2% FCS.
Estimate the cell concentration using a Malassez slide as shown in the protocol for FACS isolation of B lymphocytes and adjust the cell concentration to 10 to the seventh cells per milliliter with HBSS 2% FCS.
Transfer 500 microliters of cell solution into two FACS tubes. Label one tube non-enriched T-cells and the other tube enriched T-cells, which will be separated using magnetic labeling.
Centrifuge the enriched T-cells tube at 370 times g for three minutes at 20 degrees Celsius. Discard the supernatant and resuspend the pellet in 250 microliters of biotin coupled anti CD3 antibody diluted one in 400 in HBSS 2% FCS. Incubate the cells for 20 minutes on ice and in the dark. Add three milliliters of HBSS 2% FCS to the tubes and centrifuge them again at 370 times g for three minutes at 20 degrees Celsius. Discard the supernatant and resuspend the pellet in 250 microliters of streptavidin-coupled beads diluted one in five in HBSS 2% FCS. Incubate the mixture of cells and beads for 20 minutes on ice. Next, add three milliliters of HBSS 2% FCS to the tube, pipette up and down to mix, and centrifuge again at 370 times g for three minutes at 20 degrees Celsius. Resuspend the pellet in two milliliters of HBSS 2% FCS.
Place the column on the magnet and add three milliliters of HBSS 2% FCS to humidify the system. Then, pipette the stained cells into the column. After the cell suspension passes through the column, wash the column three times with three milliliters of HBSS 2% FCS. Next, remove the column from the magnet and place it in a 15 milliliter tube. To elute the target cells, add five milliliters of HBSS 2% FCS to the column and flush the column with a plunger. Repeat this step with another five milliliters of HBSS 2% FCS.
To evaluate the effectiveness of target cell isolation, first transfer 500 microliters of eluted cell suspension to a FACS tube and label it enriched T-cells. Then, centrifuge both the enriched and non-enriched tubes at 370 times g for seven minutes at 20 degrees Celsius. Discard the supernatant, then add 100 microliters of fluorescent antibody diluted one in 200 in HBSS 2% FCS to both tubes. Incubate the cells for 20 minutes on ice and in the dark. Next, add three milliliters of HBSS 2% FCS to the tubes and centrifuge them at 370 times g for three minutes at 20 degrees Celsius. Discard the supernatant, then resuspend the pellets in 250 microliters of HBSS 2% FCS. Now, evaluate the CD3-positive cell enrichment rate using flow cytometry as shown in the FACS protocol.
Now, we will determine the frequency of CD3-positive lymphocytes among all thymocytes that were isolated from the mouse thymus. To start, double click on the FlowJo icon and drag the files for each tube in the all sample window. Then, double click on the enriched T-cells file to display the cells recorded from that sample on a dot plot that displays forward scatter, FSCA, on the x-axis, and side scatter, SSCA, on the y-axis.
Click on polygon to circle the lymphocyte populations. Next, double click on the circled population to create a new window. Select FSC-W on the y-axis, and FSC-A on the x-axis and circle the FSA-W negative cells. In the sub population identification window, name your cell population Single Cells. Next, click on OK on the sub population identification window, then double click on the circled population to create a new window. Select CD3 on the y-axis, and circle the CD3-positive cells. In the sub population identification window, name your cell population T-cells. Repeat with the non-enriched T-cells file. To visualize your cell population, click Layout Editor and drag the T-cell population from enriched T-cells and non-enriched T-cells files into the tab.
Dot plots representing CD3-positive lymphocytes will appear. CD3-positive cells should only appear in the population of interest in the CD3-positive enriched tube. To evaluate the enrichment of CD3-positive lymphocytes in the sorted cells, click on Table Editor and then drag the T-cells population from enriched T-cells and non-enriched T-cells files into the table. On the statistic menu, select Frequency of Lymphocyte Cells to check the percentage of CD3-positive cells in all lymphocytes. Then, click on Create Table. Parameter values will appear in a new table. For the enriched T-cells, the frequency of CD3-positive cells should be around 80% or above.
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