Zellzyklusanalyse: Ein Ansatz zur Untersuchung der Zellzyklusregulation von miRNA-transfizierten Lungenkrebszellen

0 Ansichten3:34 Min. • April 30th, 2023

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- Eine microRNA oder miRNA ist eine kleine, nicht-kodierende RNA. Nach der mRNA-Transfektion oder der Einführung in eine Zelle bildet es einen miRNA-Proteinkomplex. Der Komplex zielt auf spezifische mRNA ab, bindet an sie und reguliert deren Expression negativ, wodurch das Fortschreiten des Zellzyklus gestoppt wird.

Um die Analyse zu beginnen, fügen Sie einer geernteten Kultur von miRNA-transfizierten Lungenkrebszellen ein geeignetes dehydratisierendes Fixiermittel hinzu. Das Fixiermittel konserviert die Zellen und permeablisiert auch die Zellmembran. Behandeln Sie die Zellen mit einer Mischung aus Propidiumiodid, einem fluoreszierenden Nukleinsäurefarbstoff, und Ribonuklease-Enzym.

Der Farbstoff dringt in die Zellen ein und färbt sowohl DNA als auch RNA. Die Enzyme bauen die RNA spezifisch ab und ermöglichen so eine optimale DNA-Quantifizierung. Verwenden Sie ein Durchflusszytometer, um den Anteil der Zellen zu bestimmen, die in verschiedenen Zellzyklusphasen angehalten wurden, basierend auf der Fluoreszenzintensität der einzelnen Zellen.

Die Zellen in der Ruhe- und Wachstumsphase haben einen geringeren DNA-Gehalt und damit eine geringere Fluoreszenzintensität. Die Zellen in der Gap-2-Phase mit der doppelten Menge an DNA produzieren die doppelte Fluoreszenzintensität. Die Zellen in der DNA-Synthesephase induzieren einen Fluoreszenzwert zwischen den beiden anderen Populationen. Das folgende Protokoll analysiert die Zellzyklusregulation von miRNA-behandelten Lungenkrebszellen, indem ihr DNA-Gehalt mittels PI-Färbung und Durchflusszytometrie gemessen wird.

- Transfizieren Sie die Zellen, wie im vorherigen Abschnitt dieses Videos beschrieben. Ernten Sie Zellen aus jeder Probe in separaten sterilen 15-Milliliter-Röhrchen durch Trypsinisierung. Waschen Sie die Zellen anschließend zweimal mit 1X PBS durch Zentrifugation bei 751 g für 5 Minuten und entfernen Sie dann den Überstand. Resuspendieren und brechen Sie das Pellet, indem Sie 200 Mikroliter eiskaltes 1X PBS durch Pipettieren hinzufügen.

Geben Sie 2 Milliliter 70% eiskaltes Ethanol tropfenweise in die Tube, während Sie die Tube vorsichtig vortexen, um die Zellen zu fixieren. Inkubieren Sie die Röhrchen 30 Minuten lang bei Raumtemperatur und legen Sie sie 1 Stunde lang in 4 Grad Celsius. Die Röhrchen bei 4 Grad Celsius herausnehmen und zentrifugieren.

Fügen Sie 2 mL eiskaltes PBS und einen Vortex hinzu und entfernen Sie dann den Überstand durch Zentrifugation. Geben Sie 500 Mikroliter 1X PBS mit Propidiumiodid und Ribonuklease A in Konzentrationen von 50 bzw. 200 Mikrogramm pro Milliliter in jede Probe und inkubieren Sie sie 30 Minuten lang bei Raumtemperatur. Füllen Sie die Proben in geeignete Röhrchen um, die vor Licht geschützt sind, und lassen Sie sie mit einem Durchflusszytometer laufen.

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Zeitliche Verfolgung von Zellzyklus mittels Durchflusszytometrie, ohne die Notwendigkeit für die Synchronisation

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Zuletzt aktualisiert: 22 August 2026