Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)

Sandra Deliard; Jianhua Zhao; Qianghua Xia; Struan F.A. Grant

doi:10.3791/50286

Generierung von High Quality Chromatin Immunpräzipitation DNA Vorlage für Hochdurchsatz-Sequenzie...

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Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)

Generierung von High Quality Chromatin Immunpräzipitation DNA Vorlage für Hochdurchsatz-Sequenzierung (ChIP-seq)

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09:52 min

April 19, 2013

DOI: 10.3791/50286-v

Sandra Deliard¹, Jianhua Zhao¹, Qianghua Xia¹, Struan F.A. Grant^1,2

¹Division of Human Genetics,Children's Hospital of Philadelphia Research Institute, ²Department of Pediatrics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Die Kombination von Chromatinimmunpräzipitation und ultra-Sequenzierung mit hohem Durchsatz (Chip-seq) zu identifizieren und abzubilden Protein-DNA-Wechselwirkungen in einem bestimmten Gewebe oder Zelllinie. Skizziert ist, wie man eine hohe Qualität ChIP Vorlage für anschließende Sequenzierung mit Erfahrung mit dem Transkriptionsfaktor TCF7L2 als Beispiel zu generieren.

Das übergeordnete Ziel dieses Verfahrens ist es, Proteinbindungsregionen über Chromatin zu identifizieren. Dies wird erreicht, indem zunächst das Protein mit der DNA vernetzt wird. Der zweite Schritt besteht darin, die DNA zu scheren.

Als nächstes wird das DNA-gebundene Zielprotein immunpräzipitiert und dann angedeutet. Der letzte Schritt besteht darin, die Vernetzung umzukehren und die DNA zu isolieren. Letztendlich wird die Chromatin-Immunpräzipitation verwendet, um die Lokalisierung der Proteinbindung im gesamten Genom zu zeigen.

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