Name: Dünnschicht-Chromatographie-(TLC) Trennungen und Bioassays der Pflanzenextrakte antimikrobielle Verbindungen zu identifizieren (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-03-27T22:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 4 s
Description: Erfahren Sie, wie Sie mit Dünnschicht-Chromatographie und Bioautographie antimikrobielle Pflanzenmetabolite aus Rotklee-Extrakten identifizieren. Diese Methode ermöglicht die gezielte Analyse phenolischer Verbindungen gegen anaerobe Bakterien im Wiederkäuermagen.

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Wir danken dem späten Dr. Norm Taylor, Abteilung Pflanzen-und Bodenwissenschaften an der Universität von Kentucky, für die Erlaubnis, seine Proben aus Rotklee Grundstücke für diese Studie zu verwenden. Dieses Projekt wurde von der United States Department of Agriculture finanziert.

1. Herstellung von Pflanzenextrakt <ol><li> Siehe Kagan und Flythe 10 für die Extraktion von phenolischen Verbindungen aus Trifolium pratense cv. Kenland. </li><li> Zum anderen Verbindungen in andere Pflanzen zu extrahieren, überprüfen Sie die phytochemical Analyse Literatur für Pflanzen oder Metaboliten-spezifischen Extraktionsmethoden (viele sind beschrieben), oder schauen Sie für Protokolle wie die von Khurram et al. 7,8, die viele Verbindungen mit einem breiten isolieren Bereich von Polaritäten. </li></ol> 2. Herstellung von Dünnschicht-Platten <ol><li> Saubere DC-Platten durch die Entwicklung in einem oder mehreren polaren, neutralen Lösungsmittel, um adsorbierte Verunreinigungen von der Zone der Entwicklung zu bewegen. <ol><li> In einer Abzugshaube, bereiten genug Reinigungsmittel (zB 15-100 ml Ethylacetat-Methanol 2:1, V / V), um den Boden der TLC-Entwicklungskammer sowie den unteren Rand einer DC-Platte, wenn Satz decken im Inneren der Kammer. </li><li> Verwenden Sie handelsüblichen Glas TLC Entwicklungskammern (verschiedene Größen, mit Deckel) oder Folie abgedeckten Pyrex Bechergläser oder Einmachgläser. </li><li> Mit einer Schere aus Aluminium-oder Kunststoff-Backed (flexibel) Kieselgel-Platten, die in verschiedenen Größen (20 cm x 20 cm und kleiner) zu kommen, um die verfügbare Entwicklungskammer passen geschnitten. (Vorsicht: Kieselsäure kann Lungenschäden verursachen beim Einatmen Arbeiten in einem Abzug, und Griff DC-Platten mit Handschuhen zu vermeiden, Hautöle auf der Kieselsäure.). </li><li> Legen Sie die Platten in die Kammer, mit den Spitzen lehnte sich gegen den Kammerwänden. Die Platten sollten sich nicht berühren. Decken Sie die Kammer und ließ das Lösungsmittel bewegen sich die Platte durch Kapillarwirkung. </li><li> Als Lösungsmittel die obere der Platten erreicht hat, entfernen Platten von Kammer-und arrangieren in einer stehenden Position innerhalb der Abzug bis das Lösungsmittel verdampft ist. </li><li> Prüfen Sie, ob Verunreinigungen in der Nähe der Spitze der DC-Platte durch die Suche nach einem gelben Band unter sichtbarem migriertLicht, oder eine fluoreszierende Bande unter UV-Licht (UV) (siehe die &quot;Verunreinigung vor&quot; oder IF in Abbildung 2B). Wenn die Mehrheit der Platte noch einen Gelbstich, wiederholen Sie den Reinigungsvorgang. </li><li> Nach DC-Platten aus der Kammer zu entfernen, entsorgen Sie die Lösungsmittel. Lassen Restlösemittel vollständig, bevor Sie die Kammer für Protokoll 2 verdampfen. </li><li> So entfernen Restfeuchte, die die Migration von Verbindungen auf Kieselgel 16 beeinflussen können, stütze die Platten aufrecht in einem Trockenofen bei 100 ° C (10-15 min für eine 20 cm x 20 cm Platte, und 5 min für 7 cm x 10 cm-Platten ). </li><li> Wenn eine 100 º C Trockenofen nicht verfügbar ist, Heizplatten für eine längere Zeit bei niedrigeren Temperaturen (z. B. 40 Minuten bei 60 ° C). </li><li> Nachdem die Platten trocken sind, lassen Sie sie auf Umgebungstemperatur vor dem Laden abkühlen. </li></ol></li></ol> 3. Vorbereitung der Entwicklung von Kammern für Extract Trennung <ol&gt; <li> Mit einer Schere ein Stück Filterpapier leicht unter Kammerhöhe, und etwa die Hälfte der Kammer Umfang in der Breite geschnitten. Dieses Papier dient als Docht zu zeichnen Lösungsmittel die Kammerwand und die Sättigung der Kammer mit Lösungsmitteldämpfen und verbessert so die Reproduzierbarkeit der Trennungen ein. </li><li> In einem Abzug, Mischungslösemittel (Ethylacetat-Methanol 4:1 v / v, für diese Studie). Gießen Sie Lösungsmittel-Gemisch in die Kammer und zu decken. Warten Sie, bis die gesamte Docht nass mit Lösungsmittel, was Kammersättigung, um Platten in die Kammer gestellt. </li></ol> 4. Laden und Entwicklung von DC-Platten <ol><li> Leicht markieren den Ursprung mit Bleistift. Wenn die DC-Platte Adsorbens ist weich und leicht beschädigt, stellen Marken Kanten. Verbindungen oberhalb der Oberfläche des Entwicklungsmittel, wenn Platten in der TLC-Kammer eingeführt werden. </li><li> Auflösen Extrakte genügend organische Lösungsmittel (in diesem Fall Methanol), um eine konzentrierte Lösung anstelle eines trüben habenFederung. </li><li> Laden Sie die Proben und Standards als schmale Bänder mit einer Mikroliter-Spritze oder Kapillare Mikropipetten, so dass eine 1 cm Rand an den Seiten der Platte. Lassen Sie die Bänder, um zu trocknen (schüren die Platte oder Einlegen in einer Abzugshaube hilft). </li><li> Wenn eine größere Konzentration der Probe wird auf einer Platte, &quot;Überdrucken&quot; von dem Laden der Proben wieder auf die getrocknete Bänder nötig. </li><li> Mit einer Pinzette oder einer Zange, setzen Platte (n) in der gesättigten DC-Kammer. Platten sollten nicht den Docht berührt, da dies zu den Platten an Kontaktpunkten bereitzustellen Lösungsmittel unter Änderung der Pfad der Verbindung Migration. Decken Sie Kammer und lassen Platten zu entwickeln. </li></ol> 5. Herstellung von Platten für Bioassay <ol><li> Entfernen Platte (n) von TLC Tank, bevor die Lösungsmittelfront die Oberkante der Platte erreicht, und markieren Sie die Höhe der Mittelfront mit einem Bleistift. Lassen Platte trocken in Abzug. <ol><li> Entwickeln Sie alle restlichen DC-Platten in der gleichen DC-Kammer, die ge istnerally nutzbar für einen ganzen Tag, wenn geschlossen gehalten. Erneuern Lösungsmittelgemisch für DC-Kammer, wenn die Menge des Lösungsmittels in der Kammer abnimmt, insbesondere. </li></ol></li><li> Nach Platten trocken sind, Banden sichtbar unter sichtbarem oder UV-Licht, und abzugrenzen Bands mit einem Bleistift. Ein Sichtkammer mit einem tragbaren UV-Lampe ist bequem, vor allem, wenn die Lampe an beiden Verbindungen 254 nm (kurzwelliges UV) und 365 nm (langwelliges UV) zu erfassen. Hinweis: Zu diesem Zeitpunkt oder nach dem nächsten Schritt können Platten in Kunststofffolie eingewickelt werden, mit Folie abgedeckt und bei -20 ° C gelagert Die maximale Lagerzeit ist abhängig von Verbindung Stabilität. Da Kieselsäure ist nicht neutral, können einige Verbindungen, während auf der DC-Platte abzubauen. </li><li> Fotografieren oder zeichnen Platten. <ol><li> Verwenden Sie eine Fotodokumentation Gel-System, wenn man mit Overhead-UV-und / oder sichtbares Licht ausgestattet zur Verfügung steht. </li><li> Wenn keine kommerzielle Fotodokumentation System verfügbar ist, fotografieren Platten innerhalb einer Box ausgekleidet mit dunklen Papier oder Stoff, with eine Kamera auf ein Stativ und einen tragbaren UV-Licht eingespannt zu einem Ring stehen 17. Beim Fotografieren von Platten, die keine Fluoreszenzindikator, verwenden Sie einen Blaulichtfilter über der Kameralinse zu Band 17 Aussehen zu verbessern. </li></ol></li><li> Um bei der Charakterisierung von Bands zu unterstützen, berechnen Retentionsfaktor (R f)-Werte durch Messen von Entfernungen durch Verbindung und Lösungsmittelfront gereist und Aufteilung der ehemaligen von dieser (Abbildung 2A). </li></ol> 6. Bakterielle Kultur und Assay <ol><li> Vorbereiten und impfen Medien unter anaeroben Bedingungen. Das in diesem Fall verwendete Kultur war Clostridium-Stamm sticklandii SR, die aus der Kultur Sammlung von James B. Russell, Cornell University, Ithaca, NY erhalten. <ol><li> Siehe Flythe Kagan und 13 und die Materialliste für eine Beschreibung der HAB Medien. </li></ol></li><li> Die Kultur exponentielle oder stationären Phase. Verwenden Sie sterile anaeroben techniques bei der Arbeit mit anaeroben Mikroorganismen. </li><li> Inokulieren die Kultur (1% v / v) in geschmolzenem Agar, nachdem die Temperatur des Agar (0,75% w / v) wurde auf unter 60 ° C gesenkt Vorsichtig mischen und sofort in einer anaeroben Kammer zu bringen (95% CO 2 -5% H 2-Atmosphäre für HAB-Medien) zu gießen. </li><li> Gießen Sie in 15 mm x 100 mm Petrischalen aus Kunststoff und lassen sich zu verfestigen. </li><li> Mit Schere, schneiden Sie die DC-Platte in Zonen-Band (en), die von Interesse sind. Legen Bands Gesicht nach unten auf Agar-Platten, Markierungsstreifen auf der Kennzeichenträger zu verfolgen ursprünglichen Ausrichtung auf DC-Platte zu halten. Legen Sie eine unbenutzte TLC Streifen auf einer Agar-Platte als Kontrolle. </li><li> Inkubieren Agar-Platten, Agar Seite nach unten in der anaeroben Kammer (24 h, 39 ° C). </li></ol> 7. Visualisierung von Bioassay-Agar-Platten <ol><li> Mit Pinzette Bands aus Agar-Platten, während sie in der anaeroben Kammer sind. </li><li> 1% (w / v) tetrazolium rot, in Wasser, tropfenweise auf die Oberfläche der Agar-Platten. Lassen Sie die Farbe, die für mindestens 20 min zu entwickeln, oder bis der Steuerplatte schaltet sich komplett rot, vor dem Entfernen aus dem anaeroben Kammer. Die anaeroben Bakterien beginnt Fähigkeit unmittelbar nach der Entnahme aus der anaeroben Kammer zu verlieren, aber die Farbe ist für mehr als 24 h stabil. </li><li> Fotografieren unter sichtbarem Licht. </li></ol>

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</ol>

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Dieses Protokoll beschreibt ein einfaches Verfahren zum Trennen eines Extrakts in Untergruppen von Verbindungen und Testen dieser Untermengen von Kontakt Bioautographie. Die Methode ist ganz ähnlich wie ein von Chomnawang et al. Verwendet werden, um für 15 Pflanzenstoffe hemmend auf Gonorrhoe-Bakterien zu untersuchen. Die Art der Bioautographie zu Bildschirm für die antimikrobielle Pflanzenstoffe verwendet, hängt von vielen Faktoren, einschließlich der Testmikroorganismus, der Laboraufbau und den Vor...

Untersuchung auf antimikrobielle Verbindungen in Pflanzen erfordert die Trennung der Komponenten eines Pflanzenextrakts, Belichten eines Testmikroorganismus zu diesen Komponenten und Bestimmen, ob das Wachstum des Mikroorganismus wird von irgendeiner der Verbindungen gehemmt. Trennungen von Papier-oder Dünnschichtchromatographie (TLC oder PC) sind praktisch, weil viele Verbindungen können auf einer ebenen Oberfläche getrennt werden. Trennung auf Polarität basiert, wobei einige Verbindungen feste Bindung an das Adsorbens (Zellulose im Fall von PC, und eine Vielzahl von Adsorptionsmitteln bei der TLC) und die Migration unter anderem 1. Fig. 1 stellt ein Beispiel für die relativen Positionen der polare und unpolare phenolische Verbindungen nach Trennung auf einer Silica-TLC-Platte. <img alt="Figur 1" fo:content-width="5in" fo:src="/files/ftp_upload/51411/51411fig1highres.jpg" src="/files/ftp_upload/51411/51411fig1.jpg" /> Fig. 1 ist. Schematische Darstellung Verteilungen von Verbindungen unterschiedlicher Polarität nach der Trennung auf einer Silica-Dünnschicht-Chromatographie (DC)-Platte. Phenolverbindungen von Rotklee (Trifolium pratense L.) als Beispiel verwendet. Polare Verbindungen, wie clovamide, haben eine starke Affinität zu einem polaren Adsorbens wie Siliciumdioxid und bleiben in der Nähe des Ursprungs (OR), während weniger polaren Verbindungen, wie die drei Isoflavone in der Nähe der Lösungsmittelfront (SF), Partition leichter in den Lösungsmitteln (es sei denn, das Wasser, Säuren oder Basen enthalten sind weniger polar als Kieselsäure) und wandern weiter bis der Platte. Nach der Abtrennung eines Extrakts auf eine DC-Platte können Testmikroorganismen zu allen Verbindungen auf der Platte freigelegt werden, und beschleunigt somit die Identifizierung der aktiven Komponenten eines Extraktes 2. Wenn ein Pilz-oder Bakterienkultur wird dem Chromatogramm ausgesetzt ist, wird das mikrobielle Wachstum überall, außer in Bereichen mit Wachstums-Inhibitor auftreteny-Verbindungen. Inhibitionszonen dann kann durch die Beobachtung der Kontrast zwischen Mycel-Wachstum und die Wachstumsfreie Bereiche, wenn Pilze angewendet wurden 3 oder durch Besprühen mit Verbindungen, die Farbe ändern, wenn reduziert oder durch lebende Zellen 4 hydrolysiert visualisiert werden. Obwohl die Verwendung von Papier-oder Dünnschicht-Chromatogramme antimikrobiellen Assays wurde zuerst 5 Antibiotika und Fungizide 3,6 aufgebracht, Pflanzenextrakte werden jetzt häufig für antimikrobielle Verbindungen mit diesem Verfahren, das oft als Bioautographie bezeichnet gescreent. Die beschriebenen Protokolle hierin Bioautographie von Dünnschichtchromatogrammen gelten. TLC wird weithin verwendet, weil es relativ schnell und kann auf verschiedene Adsorbentien (z. B. Siliciumdioxid, Stärke, Aluminiumoxid), sowie eine gute Auflösung und Empfindlichkeit 1 durchgeführt werden. Pflanzenextrakte können für TLC auf viele Arten hergestellt werden. Gängige Methoden sind extraPflanzenMaterial in alcohol-Wasser-Gemische, wie 80% Ethanol 7,8, gegebenenfalls unter Zusatz von Säure oder Base 9. Nach einer Extraktion in solchen Lösungsmitteln, die etwas Wasser enthalten und gegebenenfalls sauren oder basischen, müssen Extrakte konzentriert werden, so dass sie auf TLC-Platten in einem minimalen Volumen angewendet werden. Die Konzentration der Alkohol-Wasser-Extrakte können durch Aufteilung mit Wasser nicht mischbaren organischen Lösungsmitteln 8 oder mit einem Gemisch solcher Lösungsmittel, wie Ethylacetat-Ethylether (1:1, v / v) 10,11 erreicht werden. Verschiedenen Pflanzenmetabolite werden in verschiedenen organischen Lösungsmitteln extrahiert werden, in Abhängigkeit von ihrer Polarität. Um sicherzustellen, dass die Pflanze organischen Säuren oder Basen werden bei dieser Stufe in organischen Lösungsmitteln extrahiert werden, kann der pH-Wert einer Alkohol-Wasser-Extrakt erhöht oder mit einer wasserlöslichen Säure oder Base zu dissoziierten Analyten in ihre nondissociated Formen, die dann konvertiert abgesenkt löslich in organischen Lösungsmitteln 9 neutral. Die organische Phase kann dann e seinunter Vakuum oder unter Stickstoff vaporated und auf das gewünschte Volumen für die DC eingestellt. Der pH-Wert des Extrakts ist unwahrscheinlich letal Bioassay Mikroorganismen aufgrund der Partitionierung des Analyten in neutralen Lösungsmittel, kleine Endvolumen und Eindampfen des Extraktes auf der DC-Platte vor der Trennung ist. Beide Pilze und Bakterien werden als Test Mikroorganismen in Bioautographie von Pflanzenextrakten eingesetzt 2. Sporen einiger Pilze wie Cladosporium cucumerinum, keimen auf TLC-Platten (abgesehen von den Bereichen mit Inhibitorverbindungen), wenn auf Platten in einer Nährlösung besprüht und in einer feuchten Umgebung für mehrere Tage 3 inkubiert. Die dunkle Myzel von C. cucumerinum auf nichthemmenden Zonen bietet einen scharfen Kontrast zu den Zonen frei von Myzel-Wachstum. Obwohl Bakterien zu Dünnschicht-Chromatographie (DC)-Platten in der gleichen Weise 4,12 angewendet wurde, werden die Bakterien auch über TLC gegossenPlattenoberflächen in Agar überlagert 13,14. Hefen, wie Candida albicans, in Agar-Overlay sowie 14 aufgebracht werden. Alternativ DC-Platten können dem Gesicht nach unten auf Agar mit Bakterien oder Hefe 10,15 8, ein Verfahren, wie Kontakt Bioautographie 2 bekannt geimpft platziert werden. Wir beschreiben ein Verfahren zur Kontakt Bioautographie für antimikrobielle phenolische Verbindungen aus Rotklee (Trifolium pratense cv. Kenland) zu screenen. Das Testmikroorganismus Clostridium sticklandii eine Pansen hyper Ammoniak-produzierenden Bakterium (HAB) und anaerobe verpflichten. Obwohl die verwendeten Abstände nicht alle Komponenten des Extrakts zu beheben, erleichtern sie die Identifizierung von Bereichen der antimikrobiellen Aktivität, wodurch Verengung der Pool von möglichen antimikrobielle Verbindungen. Das Protokoll nutzt Standardverfahren für die DC ein. Das Protokoll beschreibt auch einige der Techniken zur Kultivierung erforderlichen VerGate Anaerobier für einen solchen Test ein Verwendungskontakt Bioautographie 15 und einer Visualisierungsmethode mit einem Tetrazolium-Salz, das lebende Zellen 2,4 färbt.

<table><tbody><tr><td>Silica F254 DC-Platten, Aluminiumkaschiert, 0,2 mm Dicke, 20 cm x 20 cm</td><td>EMD Chemicals</td><td>5554/7</td><td>Diese Platten sind mit Silica beschichtet, das einen bei 254 nm fluoreszierenden Indikator enthält. Verbindungen, die bei dieser Wellenlänge absorbieren, erscheinen dunkel auf einem fluoreszierenden grünen Hintergrund. Alternative Quellen sind Analtech, Selecto Scientific, Fluka.&nbsp; Andere Adsorbentien als Kieselsäure können erforderlich sein. Je nach den zu verwendenden Lösungsmitteln können Platten mit Kunststoffrücken geeignet sein.</td></tr><tr><td>Scharfe, robuste Schere&nbsp;</td><td>beliebiges Nähzubehör</td><td>ähnlich Fiskars 175800-1002</td><td>Zum Schneiden von DC-Platten. Ein Papierschneider mit einer scharfen Klinge kann ebenfalls verwendet werden. Quarzstaub nicht einatmen.</td></tr><tr><td>Trockenschrank bei 100 °; C (mechanische Konvektion)</td><td>Thermo Scientific</td><td>PR305225M</td><td>Quincy Lab, Inc, Chicago, IL (www.quincylab.com); Cascade Technical Sciences, Hillsboro, OR (www.cascadetek.com)</td></tr><tr><td>TLC-Kammer</td><td>Kimble Chase</td><td>416180-0000</td><td>Alternative Quellen:&nbsp; Aldrich. Für kleine Teller (z.B. 5 cm x 10 cm) können Pyrex-Becher oder Einmachgläser verwendet werden. Mit Alufolie abdecken (Glasdeckel können Material enthalten, das durch Lösungsmitteldämpfe extrahiert werden kann).</td></tr><tr><td>50 & Mikro; l Spritze mit flacher Nadelspitze</td><td>Hamilton</td><td>80965</td><td>Zum Laden von Standard- oder Probenmengen von mehr als 5-10 μl.&nbsp; Alternative Quellen sind gleichwertig.</td></tr><tr><td>Mikropipetten</td><td>Drummond</td><td>2-000-001</td><td>Zum Laden kleiner Mengen von Standards oder Proben. Alternative Quellen:&nbsp; VWR.&nbsp; Außerdem können Pasteur-Pipetten mit einem Butanbrenner auf einen dünneren Durchmesser gedehnt werden. &nbsp;</td></tr><tr><td>Filterpapier (Klasse #1)</td><td>Whatman</td><td>1001 917</td><td>Dient als Kammerdocht.&nbsp; Andere Filterpapiersorten sind in Ordnung. Diese Größe kann für die Kammern mit den Tellern 20 cm x 20 cm zugeschnitten werden. &nbsp; &nbsp; &nbsp;</td></tr><tr><td>Becherzange</td><td>Fisher Scientific</td><td>15-186</td><td>Zum Ein- und Ausschieben von Platten in eine große DC-Kammer. Alternative Quellen: VWR&nbsp;</td></tr><tr><td>Flachpinzette</td><td>Fisher Scientific</td><td>10-275</td><td>Zum Ein- und Ausschieben von Platten in eine kleine Kammer. Alternative Quellen: VWR </td></tr><tr><td>Kleine tragbare UV-Lampe mit 4-W- oder 6-W-Lampen für kurz- und langwellige UV-Lichtbeleuchtung (254 bzw. 365 nm)</td><td>Ultraviolet Products</td><td>95-0271-01</td><td>Alternative Quellen: Spectronics Corporation (www.spectroline.net)</td></tr><tr><td>Sichtschrank zur Verwendung mit einer tragbaren UV-Lampe</td><td>Ultraviolet Products</td><td>Chromato-Vue C-10E</td><td>UV-aktive Bänder lassen sich leichter einkreisen, wenn hier Platten eingesetzt werden können. Alternative Quellen: Spectronics Corporation.&nbsp;</td></tr><tr><td>Fotodokumentationssystem mit UV-Lampe und sichtbarer Lampe</td><td>Kodak</td><td>Gel Logic 200</td>&<td>nbsp; Alternative Quellen: Ultraviolet Products (www.uvp.com).&nbsp; Siehe Protokoll für hausgemachte Alternativen.</td></tr><tr><td>Anaerobe Kammer, Typ A, Vinyl</td><td>Coy</td><td>7150000</td><td>Diese Kammer ist für anaerobe Bakterien, wie Clostridium sticklandii, wie beschrieben, geeignet. &nbsp; Die Wachstumsbedingungen müssen jedoch auf den im Assay verwendeten Organismus zugeschnitten sein. Eine Biosicherheitswerkbank und andere Vorsichtsmaßnahmen sollten getroffen werden, wenn pathogene Organismen verwendet werden. Alternative Quellen: Anaerobe Systems, BioRad, Plas Labs, andere&nbsp;</td></tr><tr><td>Tetrazolium red</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T8877</td><td>Alternative Quellen: MP Biomedicals, Santa Cruz Biotechnology, Alfa Aesar</td></tr><tr><td colspan="4">Ingredients for HAB media</td></tr><tr><td>Pyridoxamine &middot; 2HCl</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P9380</td><td>Für dieses und für alle anderen Reagenzien in dieser Tabelle sind alternative Quellen gleichwertig.</td></tr><tr><td>Riboflavin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>R4500</td><td></td></tr><tr><td>Thiamin HCl</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T3902</td><td></td></tr><tr><td>Nicotinamid</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>N3376</td><td></td></tr><tr><td>Calcium-D-Pantothenat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C8731</td><td></td></tr><tr><td>Liponsäure</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T5625</td><td></td></tr><tr><td>p-Aminobenzoesäure&nbsp;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A9878</td><td></td></tr><tr><td>Folsäure</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>F8798</td><td></td></tr><tr><td>Biotin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>B4639</td><td></td></tr><tr><td>Cobalamin&nbsp;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C3607</td><td></td></tr><tr><td>Pyridoxal HCl</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P9130</td><td></td></tr><tr><td>Pyridoxin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P5669</td><td></td></tr><tr><td>EDTA</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>E6758</td><td></td></tr><tr><td>Eisensulfat & Middot; 7H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>F8263</td><td></td></tr><tr><td>Zinksulfat & Middot; 7H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Z0251</td><td></td></tr><tr><td>Manganchlorid & Middot; 4H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M8054</td><td></td></tr><tr><td>Borsäure</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>B6768</td><td></td></tr><tr><td>Kobaltchlorid & Middot; 6H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C8661</td><td></td></tr><tr><td>Kupferchlorid & Middot; 2H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td></td><td></td>459097</tr><tr><td>Nickelchlorid & Middot; 6H2</td><td>O Sigma-Aldrich</td><td>203866</td><td></td></tr><tr><td>Natriummolybdat & Middot; 2H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>331058</td><td></td></tr><tr><td>Trypticase (Pankreasaufschluss von Kasein)</td><td>Thermo Fisher</td><td>B11921</td><td></td></tr><tr><td>Kaliumphosphat monobasisch wasserfrei</td><td>Thermo Fisher</td><td>P284</td><td></td></tr><tr><td>Natriumcarbonat & Middot; H2O&nbsp;</td><td>Thermo Fisher</td><td>S636</td><td></td></tr><tr><td>Agar</td><td>Thermo Fisher</td><td>50841063</td><td></td></tr><tr><td>Magnesiumsulfat & Middot; 6H2O</td><td>Thermo Fisher</td><td>7791-18-6</td><td></td></tr><tr><td>Calciumchlorid & Middot; 2H2O</td><td>Thermo Fisher</td><td>BP510</td><td></td></tr><tr><td>Cystein HCl</td><td>Thermo Fisher</td><td>19464780</td><td></td></tr><tr><td>Kalium Phosphat zweibasisch wasserfrei</td><td>Thermo Fisher</td><td>P290</td><td></td></tr><tr><td>Natriumchlorid</td><td>Thermo Fisher</td><td>BP358</td><td></td></tr></tbody></table>

dünnschicht-chromatographie-(tlc) trennungen und bioassays der pflanzenextrakte antimikrobielle verbindungen zu identifizieren

Thin-layer Chromatographic (TLC) Separations and Bioassays of Plant Extracts to Identify Antimicrobial Compounds

Ein gemeinsamer Bildschirm für Pflanzen antimikrobielle Verbindungen besteht aus der Trennung von Pflanzenextrakten Papier oder Dünnschichtchromatographie (TLC oder PC), Aussetzen der Chromatogramme mikrobiellen Suspensionen (z. B. Pilze und Bakterien in der Brühe oder Agar), so dass genügend Zeit für die Mikroben wachsen in einer feuchten Umgebung und Visualisieren Zonen ohne mikrobielle Wachstum. Die Wirksamkeit dieser Screening-Methode, wie Bioautographie bekannt, hängt sowohl von der Qualität der chromatographischen Trennung und der Sorgfalt, mit mikrobiellen Kulturbedingungen behandelt. Dieses Papier beschreibt Standardprotokolle für TLC und Kontakt Bioautographie mit einer neuen Anwendung zu Säure-Fermentation von Bakterien Aminosäuren. Der Extrakt wird über flexible (Aluminium-backed) Kieselgel-DC-Platten getrennt, und die Banden werden unter UV-(UV-) Licht sichtbar gemacht. Zonen werden auf Agar mit dem Testmikroorganismus beimpft geschnitten und inkubiert Gesicht nach unten. Hemmende Banden werden durch Anfärben der Agar-Platte sichtbars mit Tetrazolium rot. Das Verfahren wird auf die Trennung von Rotklee (Trifolium pratense cv. Kenland) phenolischen Verbindungen und ihre Screening-Aktivität gegen Clostridium sticklandii, einem hyper Ammoniak-produzierenden Bakterium (HAB), die ursprünglich aus der Rinder-Pansen aufgebracht. Die TLC-Verfahren anzuwenden, um viele Arten von Pflanzenextrakten und anderen Bakterienspezies (aerob oder anaerob), sowie Pilze, können als Testorganismen verwendet werden, wenn Kulturbedingungen verändert werden, um die Wachstumsanforderungen der Art passen.

Repräsentative Kieselgel-DC-Trennungen von Rotklee (Trifolium pratense cv. Kenland) Extrakte, mit phenolischen Verbindungen, sind in Abbildung 2 dargestellt. Trennung von Rotklee-Extrakt in Ethylacetat-Hexan (9:1, v / v), mehr als 8,5 cm, ergab fünf Bänder, eines unvollständig vom Ursprung gelöst (Fig. 2A). Allerdings zeigt, 2B, dass etwa doppelt so viele Bands offenbart wurden, wenn eine andere Probe von Rotklee-Extrakt (aus der gleichen Sorte, aber in einem s...

Methoden werden für die Dünnschicht-Chromatographie (DC) Trennung von Pflanzenextrakten und Kontakt Bioautographie antibakterielle Metaboliten zu identifizieren beschrieben. Die Methoden sind für das Screening von Rotklee phenolischen Verbindungen Hemmung hyper Ammoniak-produzierende Bakterien (HAB) stammt aus dem Rinder-Pansen aufgebracht.

Dünnschicht-Chromatographie-(TLC) Trennungen und Bioassays der Pflanzenextrakte antimikrobielle Verbindungen zu identifizieren

A common screen for plant antimicrobial compounds consists of separating plant extracts by paper or thin-layer chromatography (PC or TLC), exposing the ...

Das übergeordnete Ziel dieses Verfahrens besteht darin, pflanzliche Metaboliten zu identifizieren, die antimikrobiell gegen anaerobe Bakterien wirken. Dies wird erreicht, indem ein Pflanzenextrakt zunächst mittels Dünnschichtchromatographie oder TLC getrennt wird. Anschließend wird das Chromatogramm in Zonen geschnitten, die jeweils eine oder mehrere Verbindungen enthalten.Die Zonen werden anschließend auf mit anaeroben Bakterien inoculierte Agarplatten gelegt und inkubiert. Nach der Inkubation werden die Zonen entfernt und die Platten angefärbt, um Verbindungen nachzuweisen, die das bakterielle Wachstum hemmen. Die erhaltenen Daten zeigen das Vorhandensein oder Fehlen antimikrobieller Pflanzenmetabolite an.Mit dieser Methode lassen sich zentrale Fragen im Bereich der Wiederkäuerernährung beantworten, beispielsweise welche Auswirkungen pflanzliche sekundäre Metaboliten auf die Nährstoffnutzung durch bestimmte Mikroorganismen haben. Obwohl diese Methode pflanzliche Verbindungen aufdeckt, die hemmend auf Pansenbakterien wirken, kann sie ebenfalls dazu verwendet werden, Substanzen zu identifizieren, die hemmend auf andere Bakterien oder Pilze wirken.In diesem Protokoll werden phenolis

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Research

Forschung

JoVE Journal

Chemistry

Chemie

Zusammensetzung der polaren Lipid-Extrakte und der Fettsäure-Zusammensetzung der einzelnen Glycerolipide sind in einem einfachen und robusten Lipid-Profiling Experiment bestimmt. Zu diesem Zweck sind Glycerolipide durch Dünnschicht-Chromatographie isoliert und Transmethylierung ihrer Acylgruppen. Fatty Acyl Methylester durch Gas-Flüssigkeits-Chromatographie quantifiziert.

Arabidopsis thaliana Polar Glycerolipid Profiling durch Dünnschichtchromatographie (TLC) mit Gas-Flüssigkeits-Chromatographie (GLC) Coupled

Natürliche Produkte sind vielversprechende Ausgangspunkte für die Entwicklung neuer Medikamente und therapeutischer Mittel. Aufgrund der hohen chemischen Vielfalt ist es jedoch eine anspruchsvolle und zeitaufwändige Aufgabe, neue therapeutische Verbindungen aus Pflanzen zu finden. Wir beschreiben einen vereinfachten Ansatz zur Identifizierung von antimikrobiellen und antibiofilmen Molekülen aus Pflanzenextrakten und -fraktionen.

Systematischer Ansatz zur Identifizierung neuartiger antimikrobieller und Antibiofilmmoleküle aus Pflanzenextrakten und -fraktionen zur Vorbeugung von Zahnkaries

Das vorliegende Protokoll entwickelte eine Methode zur Abschätzung der Ausbeute von Verbindungen auf der TLC-Platte unter Verwendung der Blau-LED-Beleuchtungstechnik. Die Vorteile dieses Ansatzes sind, dass er sicher, effektiv und kostengünstig ist und es dem Forscher ermöglicht, mehrere Proben gleichzeitig zu messen.

Abschätzung der Ausbeute von Compounds auf der TLC-Platte mittels Blue-LED-Beleuchtungstechnik

Wir beschreiben den Einsatz der Dünnschichtchromatographie, des direkten Bioautographie-Assays und der Flüssigchromatographie-Massenspektrometrie zur Identifizierung von mikrobiellen Naturstoffen, die einen Antagonismus gegenüber pilzlichen Krankheitserregern aufweisen, wobei der Erreger Sclerotinia sclerotiorum und biopestizide Bacillus-Isolate als Modellsystem verwendet werden.

Bioassay-gesteuerte Identifizierung von Naturstoffen für die biologische Kontrolle durch Dünnschichtchromatographie-Direkte Bioautographie

Diese Studie entwickelte eine Hochleistungs-Flüssigkeitschromatographie in Kombination mit der Triple-Quadrupol-Massenspektrometrie (HPLC-QQQ-MS) zur Identifizierung und Quantifizierung von Tropanalkaloiden (Hyoscyamin, Anisodamin, Scopolamin) in Anisodus tanguticus. Die Methode erwies sich als schnell, präzise und zuverlässig für Hochdurchsatzanalysen von Heilpflanzen.

Eine effiziente und schnelle HPLC-QQQ-MS-Methode zur Quantifizierung von Tropanalkaloiden in Heilpflanzen

Säugetier-Hülle enthält Lösungsmittel extrahierbaren Lipide, die chemischen Zusammensetzungen der einzelnen Arten charakteristisch bieten kann. Dieser Beitrag stellt eine Routinemethode zur Trennung breiten Lipidklassen aus Integumentary Geweben isoliert mit Dünnschicht-Chromatographie und Bestimmung der Triacylglycerid Profil von Matrix-Assisted Laser Desorption / Ionisation Time-of-Flight-Massenspektrometrie.

Profilierung der Triacylglycerid Inhalt in Bat Integumentary Lipide durch präparative Dünnschicht-Chromatographie und MALDI-TOF-Massenspektrometrie

Es werden zwei Verfahren zur Zuordnung der α- und ε-Dimethylamin-Kernspinresonanzsignale eines reduktiv 13C-methylierten N-terminalen Lysins beschrieben. Eine Methode nutzt die pH-induzierte Selektivität der reduktiven Methylierungsreaktion, und die andere verwendet Aminopeptidase, um das N-terminale Lysin selektiv zu entfernen.

Methoden, um die NMR-Resonanzen von Identify<sup&gt; 13</sup&gt; C-Dimethyl-N-terminalen Amins auf reduktiv methylierte Proteine

Dieses Video stellt ein Protokoll für die massenspektrometrische Analyse von flüchtigen und oxidationsempfindlichen Verbindungen mit Elektronenstoß-Ionisation. Das vorgestellte Verfahren ist insbesondere von Interesse für anorganische Chemie, die Arbeit mit Metallorganylen, Silane oder Phosphane, die mit inerten Bedingungen, wie der Schlenk-Technik behandelt werden müssen.

Analyse flüchtiger und oxidationsempfindlichen Verbindungen mit einem kalten Einlasssystem und Elektronenstoß-Massenspektrometrie

Dieses Protokoll beschreibt die spezifischen Techniken, die für die strukturelle Charakterisierung von Glykosylsequenz(en) im reduzierenden Endbereich (RE) und Glykosylsequenz(en) im internen Bereich von Heteroxylanen verwendet werden, indem das RE vor der enzymatischen Hydrolyse (Endoxylanase) mit 2 Aminobenzamid markiert und dann die resultierenden Oligosaccharide mittels Massenspektrometrie (MS) und Kernspinresonanz (NMR)  analysiert werden.

Sequenzierung von Pflanzenwand Heteroxylane Mit Enzymatische, Chemical (Methylierungs) und Physical (Mass Spectrometry, Nuclear Magnetic Resonance) Techniques

Verfahren umfassende zweidimensionale Gaschromatographie mit Stickstoff Chemolumineszenznachweise kombiniert wurde on-line-Analyse von stickstoffhaltigen Verbindungen, die in einer komplexen Kohlenwasserstoffmatrix entwickelt und angewendet.

On-line-Analyse von stickstoffhaltige Verbindungen in komplexen Kohlenwasserstoff Matrixes

Erfahren Sie, wie Sie mit Dünnschicht-Chromatographie und Bioautographie antimikrobielle Pflanzenmetabolite aus Rotklee-Extrakten identifizieren. Diese Methode ermöglicht die gezielte Analyse phenolischer Verbindungen gegen anaerobe Bakterien im Wiederkäuermagen.

Dünnschicht-Chromatographie-(TLC) Trennungen und Bioassays der Pflanzenextrakte antimikrobielle Verbindungen zu identifizieren

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