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DOI: 10.3791/54256-v
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In diesem Manuskript beschreiben wir ein Protokoll zur funktionellen Untersuchung der Transkription und der inhibitorischen Aktivität von antibakteriellen Wirkstoffen, die auf die bakterielle Transkription abzielen.
Das übergeordnete Ziel dieses In-vitro-Transkriptionsassays ist es, die komplexen regulatorischen Schritte während der Transkription zu untersuchen, indem eine Plattform zum Testen der Wirkung von Transkriptionsfaktoren, kleinen Molekülen und Transkriptionsinhibitoren bereitgestellt wird. Diese Methode kann helfen, Schlüsselfragen der Molekularbiologie zu beantworten, wie z.B. die genauen Mechanismen der Transkriptionsregulation, die Funktion von Transkriptionsfaktoren mit unbekannten Mechanismen und die Wirkung normaler Transkriptionsinhibitoren. Der Hauptvorteil dieser Technik besteht darin, dass sie die direkte Visualisierung aller Transkriptionsprodukte entlang einer Zeitachse von einem einzigen RNA-Sequenzierungsgel aus ermöglicht.
Beginnen Sie diesen Vorgang, indem Sie die Platten zweimal mit 70 % Ethanol und gereinigtem Wasser von einem Sequenziergelgerät reinigen. Bauen Sie die Zelle mit einem Kamm und zwei Abstandshaltern zusammen. 33,6 Gramm Harnstoff in 22 Millilitern Wasser und 16,4 Millilitern fünffachem FSME-Puffer mit einem Magnetrührer auflösen.
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