Name: Environmental Screening von Aeromonas Hydrophila, Mycobacterium spp. und Pseudocapillaria Tomentosa im Zebrafisch-Systeme (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-12-08T12:30:00.000+00:00
Duration: 9 min 58 s
Description: Erfahren Sie eine Methode zur Umweltscreening von Pathogenen wie Mycobacterium spp. und Aeromonas hydrophila in Zebrafisch-Anlagen mittels Sumpf-Abstrichen und Schlamm-Analyse. Diese Technik verbessert die Biosecurity und reduziert den Einsatz von Sentinel-Fischen erheblich.

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Die Autoren möchten BRF Aquatics-Team des Instituts Francis Crick für ihre technische Hilfe und kritische Beiträge danken. Diese Arbeit wurde von Francis Crick Institut unterstützt die erhält die Grundfinanzierung von Cancer Research UK (FC001999), UK Medical Research Council (FC001999) und des Wellcome Trust (FC001999).

1. Exposition der Vorfiltration Wächter aus einem umlaufenden System
<ol><li>
Setzen Sie einen saubere 8 L Tank aus einem umlaufenden System. Füllen Sie es mit Wasser aus der Ölwannen. Fügen Sie 2 keramische Perlen oder Schwamm Würfel aus Bio-Medien aus den Systemen zum Bildschirm (Abbildung 1). Fügen Sie 1-2 D.Rerio/l (d.h. 12 Fische). Verwenden Sie Wildtyp Fisch von den dominanten genetischen Hintergrund in der Anlage, zum Beispiel AB.
	<ol>
<li>Wählen Sie mindestens 6 Fische wie folgt: mindestens ein Weibchen und ein Männchen unter 6 Monate alt, ein Weibchen und ein Männchen zwischen 6 und 18 Monate und ein Weibchen und ein Männchen über dem Alter von 18 Monaten.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
Einmal am Tag zu füttern. Variieren Sie die Diäten (z.B. trockene Nahrung, Artemia) um sicherzustellen, dass die Wächter alle Diäten verwendet in der Zebrafisch-Anlage ausgesetzt sind. Wechseln Sie Wasser am Montag, Mittwoch und Freitag, d. h., dreimal pro Woche für 4 Monate.
	<ol>
<li>Um den Wasserwechsel durchzuführen, übertragen Sie Wächter und Bio-Medien in eine temporäre Tank. Die Sentinel-Tank vollständig entleeren und reinigen. Füllen Sie den Sentinel-Tank Sumpf nur mit Wasser. Setzen Sie die Wächter und Bio-Medien zurück.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Die Wächter für 4 Monate zu Sumpf Wasser aussetzen. Einschläfern der Fisch von einer anerkannten Methode wie eintauchen in eine Überdosis Lösung des 2-Phenoxyethanol (3 mL/L).</li>
	<li>
Um Tod zu bestätigen, warten Sie 10 Minuten nach Beendigung der Opercula Bewegung.
	<ol>
<li>Die Kadaver mit Zange greifen und ausschließlich auf-80 ° C in einem identifizierten Behälter einfrieren. Dies wird für PCR-12,15verwendet werden.</li>
		<li>Alternativ schneiden Sie die Tailat der kaudalen Blütenstiel, nick der Bauchwand, und inmitten von 4 % Formalin. Achtung: Benutzen Sie Handschuhe und Rauch Schrank für die Histopathologie. Den Probenbehälter zu kennzeichnen.</li>
	</ol>
</li>
</ol>(2) Sumpf Tupfer
<ol><li>Verwenden Sie einen sterilen trockenen Tupfer mit einem Kunststoffschacht. Tragen Sie Handschuhe. Lokalisieren Sie die Oberfläche Tupfer (Sumpf-Wand an der Oberfläche des Wassers) und entfernen Sie alle Elemente einfach Zugriff auf der Oberfläche zu verhindern. Wählen Sie eine Ölwanne Oberfläche mit low-Flow.</li>
	<li>
Ziehe den Tupfer durch Entfernen der äußeren Verpackung und setzen die sterilen Wattetupfer in die Luft. Vermeidung von Kreuzkontamination des Tupfers kümmert sich nicht um ungeprüfte Oberflächen berühren.
	<ol>
<li>Wischen Sie die Ölwanne Wand über 5-10 cm zu absorbieren Wasser und Biofilm an der Ölwanne Oberfläche Wasserstand.</li>
		<li>Den Tupfer wieder Mantel oder die Spitze in einem sterilen Zentrifugenröhrchen brechen. Beschriften Sie die Probe und senden für PCR-Tests oder Einfrieren bei-80 ° C.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. Erkennung p. Tomentosa Eier an der Unterseite des Tanks
<ol><li>
Schlamm-Analyse von Mikroskopie
	<ol>
<li>Verwenden Sie eine 60 mL Spritze9 , um der Schlamm am unteren Rand ein Sumpf oder eines Panzers, der Fisch einschließlich Wächter hält Aspirieren. Teilen Sie die Probe in 15 mL-Tuben. Schließen Sie die Rohre mit ihren Schraubverschlüssen und beschriften Sie die Rohre.</li>
		<li>Vorbereiten die gesättigten Zuckerlösung (spezifisches Gewicht = 1,27) durch das Mischen von 227 g Kristallzucker in 177 mL heißes Wasser mit einem Magnetrührer14.</li>
		<li>Zentrifugieren Sie die 15 mL Röhrchen bei 175-250 X g für 10 min in einer Zentrifuge mit Schaukel Eimer. Dekantieren Sie die Röhrchen und halten Sie das Sediment in ihre Röhre.</li>
		<li>Füllen Sie die Rohre mit der gesättigten Zuckerlösung auf halbem Weg. Schließen Sie die Rohre mit den Schraubverschluss und mischen Sie das Sediment mit der Lösung.</li>
		<li>Legen Sie die Röhren in der Zentrifuge Schaukel Eimer und füllen sie mit gesättigten Zuckerlösung an die Spitze. Legen Sie ein Deckglas vorsichtig am Anfang jedes Rohr und im Kontakt mit der Zuckerlösung gesättigt.</li>
		<li>Zentrifuge bei 175-250 X g für 10 min. beachten Sie, dass einige Deckglas kann fallen und bei der Zentrifugation daher dort brechen sind 4 Röhren für jede 60 mL Probe. Heben Sie das Deckglas und setzen Sie ihn auf einen Objektträger. Beschriften Sie die Folie mit einem Bleistift oder Marker Stift.<ol>
<li>Für den Fall, dass zu viele Deckglas Brüche auftreten, füllen den größten Teil des Rohrs mit der gesättigten Zuckerlösung, Zentrifuge bei 175-250 X g für 10 min, nach oben mit der gesättigten Zuckerlösung auffüllen und dann sanft das Deckglas gesetzt. 30 min. warten.</li>
		</ol>
</li>
		<li>Suchen Sie nach p. Tomentosa Eiern mit dem Mikroskop13 (Abbildung 2 und Video 1). Die zweipolige Stecker bei Vergrößerung 400 X6zu identifizieren. Hinweis: Die Größe der Eier ist 57-78 µm lang und 27-39 µm Durchmesser16,17. Beachten Sie, dass eine positive Folie genug für die 60 mL Probe positiv deklariert werden.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
Screening importierte Tiere in Quarantäne für p. Tomentosa Eiern
	<ol>
<li>Männliche und weibliche D. Rerio in einen Panzer gesetzt. Fügen Sie in den Tank Gerät normalerweise verwendet, um zu ernten und erzeugte Eiern erhalten, sondern können sie hier sammeln Sie Kot (Abbildung 3 hinzu). Hinweis: zum Beispiel ist eine 1 L Zucht Tankfüllung (Außentank und Innenbehälter mit geriebenem unten) vollständig in einem 13 L Tank, ermöglicht freien Zugang für die Fische in die und aus der Zucht-Gerät verschieben getaucht.</li>
		<li>Entfernen Sie die Zucht Gerät nach einer Woche und ernten Sie den gesammelte Schlamm in die Zucht-Gerät zu, wie unter Schritt 3.1 "Schlamm-Analyse von Mikroskopie."</li>
	</ol>
</li>
</ol>(4) PCR auf Schlamm Sediment
<ol><li>Aspirieren Sie den Schlamm am unteren Rand ein Tank oder Sumpf mit einer 60 mL Spritze9 und übertragen Sie die Probe auf eine 60 mL-Tube. Verschließen Sie das Röhrchen mit den Schraubverschluss und beschriften Sie das Rohr. Entsorgen Sie die Spritze.</li>
	<li>Schütteln Sie die 60 mL-Tube und übertragen Sie 15 mL auf eine 15 mL Tube. Verschließen Sie das Röhrchen mit den Schraubverschluss und beschriften Sie das Rohr.</li>
	<li>Zentrifugieren der 15 mL Tube bei 175-250 X g für 10 min in einer Zentrifuge mit Schaukel Eimer. Dekantieren Sie die Röhrchen und halten Sie das Sediment in der Röhre.</li>
	<li>
Ziehe einen Tupfer durch Entfernen der äußeren Verpackung und setzen die sterilen Wattetupfer in die Luft. Vermeidung von Kreuzkontamination des Tupfers kümmert sich nicht um ungeprüfte Oberflächen berühren.
	<ol>
<li>Wischen Sie das Sediment in der Röhre für 15 s.</li>
		<li>Den Tupfer wieder Mantel oder die Spitze in einem sterilen Zentrifugenröhrchen brechen. Beschriften Sie die Probe, bei-80 ° C eingefroren und senden für PCR-Tests. Hinweis: 45 mL bleiben in der 60 mL Tube. Dies kann zur Erkennung von p. Tomentosa Eiern durch Schlamm Analyse von Mikroskopie gehalten werden, wie unter Schritt 3.1, um beispielsweise das PCR-Ergebnis zu bestätigen. Die PCR im Klärschlamm kann versucht werden, für das screening von importierten Tieren nach Schritt 3.2.</li>
	</ol>
</li>
</ol>

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<li>Watts, S. A., Lawrence, C., Powell, M., D'Abramo, L. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Vital+Relationship+Between+Nutrition+and+Health+in+Zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Zebrafish%22%5BJournal%5D)">The Vital Relationship Between Nutrition and Health in Zebrafish.</a> Zebrafish. 13, Suppl 1. 72-76 (2016).</li>
</ol>

Die Autoren haben nichts preisgeben.

Einschränkungen der Techniken, wichtige Schritte und Fehlerbehebung:
Alter, Geschlecht, Belastung und Dauer der Exposition der Wächter sind nicht standardisiert. Dies ist in Tabelle 1dargestellt. Es gibt sehr wenig Screening von Fischen unter 6 Monate alt oder Alter Fisch. Möglicherweise gibt es einige Krankheitserreger, die Jungfische zu beeinflussen, da gibt es einige Krankheitserreger, die häufiger in der älteren Bevölkerung10,18,19,20sind. Ebenso gilt das Geschlecht nicht in der Auswahl einiger Sentinel-Gruppen trotz einige berichten, gibt es eine Gender-Bias für einige Krankheitserreger21. Die vorgeschlagene Technik versucht, diese Probleme anzugehen, obwohl die Wahl der Sorte nach einem spezifischen Erreger erfolgen könnte, um zu überwachen. Z. B. TU ließe sich mit der Erkennung von Mycobacterium spp.12,22, aber besteht die Gefahr, die die Wächter dann als ein Reservoir oder Anzeige klinische Zeichen fungieren würde. Hinsichtlich der Dauer der Exposition erhöht der Ansatz der Zebrafisch International Resource Center10 die Chancen, Krankheitserreger zu erkennen, die mit einer unzureichenden Kontamination entgehen lassen könnte. Die Notwendigkeit einer über längere Zeit impliziert, dass Wächter nicht verfügbar sind. Die Zugabe von der Umweltproben ermöglicht eine gewisse Flexibilität und die Vermehrung von Screening-Veranstaltungen. Zum Beispiel kann Probenahme alle zwei Monate mit einem 4-monatigen Intervall zwischen jeder Screening-Methode erfolgen. Dadurch kann dem Ablauf der Zeit, bis ein neu eingeführten Erreger erkannt wird.
Die Umwelt Screening-Techniken beruhen auf der Nachweis von Krankheitserregern in der Umwelt. Die Erreger sind Schuppen der Fische und daher im System Wasser verdünnt. Die Möglichkeit der Erfassung der Krankheitserreger durch Wasser-Filtration-23 wurde nicht geprüft. Die Methoden, die wir beschreiben, sind nur wirksam, wenn Krankheitserreger genügend Zeit gegeben werden, zu Fisch und Biofilm zur Erreichung einer Schwellenwerts der Kontamination Detektion ermöglicht vermehren. Diese Einschränkung der Techniken wird durch eine kritische Auswahl der Probenahmestellen minimiert: der Schlamm im Tank wird anstatt des Ölwanne Schlamms abgetastet und das Wasser und Biofilm sind an der Oberfläche der Ölwanne und nicht in einem Tank oder Nachfiltrierung probieren. Die Proben aus dem gleichen System sind jedoch unwahrscheinlich, dass die gleichen Ergebnisse. Positive Ergebnisse für p. Tomentosa können bestätigt werden, mithilfe einer anderen Assay (Histopathologie, PCR oder Schlamm-Analyse). Mykobakteriellen PCR-positive Ergebnisse können durch Kultur oder von einem anderen diagnostischen Labor bestätigt werden. Jedoch sind bei der Festlegung einer Gesundheitszustands weiter Proben empfohlen, negative Ergebnisse aus einer ökologischen Siebtechnik bestätigen.
Bedeutung der Technik in Bezug auf bestehende/Alternative Methoden:
Mycobacterium spp. sind häufig in die Umwelt und ihre Anwesenheit im Sumpf nicht vorhersagen, ihre Pathogenität12. Mocho9 zeigte, dass Überwachung Sterblichkeitsraten Schlüssel für die Entwicklungen von gesundheitlichen Problemen zu befragen. Die Verwendung von tierischen Proben bleibt unverzichtbar, eine tierärztliche Untersuchung. Systemüberwachung Erkennung aller gängigen Erreger in einer Einrichtung bedeutet, und dies kann nicht mit die alleinige Nutzung der Umwelt Screening Techniken erreicht werden. Dennoch kann ein Mangel an Sensibilität der Diagnosetools verzögern oder verhindern eine genaue Beschreibung des Gesundheitszustandes. Während der Verwendung der Wächter die Zahl der Fische erforderlich reduziert, eine Mikrobe weit verbreitet in der Bevölkerung zu erkennen, verleiht der Mangel an Sensibilität Gewicht mit einer Kombination von Methoden, einschließlich Umwelt Screening5,23. In der Tat ist der spezifische Erreger freie Status in der Regel als das Fehlen einer Spezies in der Anlage so definiert, dass Umwelt- und Tierschutz Proben negativ24,25testen müssen.
Die Ölwanne Tupfer Ergebnisse Ermittlung Mycobacterium spp. zeigen, dass unter Berufung auf Fische, die Proben zu einem falsch negativen gesundheitlichen Status führen können. Die 6 getesteten mykobakteriellen Arten werden beschrieben als Pathogene oder Potenzial Pathogene im Zebrafisch15 und einige würden nicht behoben werden, indem Ei Flächendesinfektion mit Chlor26 in Quarantäne so routinemäßig durchgeführt. Daher müssen die falsche-negativ einige Konsequenzen für die Mitarbeiter, die Linien zu importieren. Z. B. M. Fortuitum wurde mittels PCR auf Fisch Probe verpasst, aber mehr als die Hälfte der Ölwanne Tupfer PCR es erkannt. Man bedenkt, dass diese Mykobakterien widerstandsfähiger gegenüber Chlor als andere, und ihre Fähigkeit zu wachsen in den Wassersystemen27sind, ist es ein Risiko für die unbelastete einführenden Anlage. Um den Import von Linien zu ermöglichen, müssen Manager Vertrauen und die Gesundheitsberichte der ausführenden Anlage mit den ihrigen zu vergleichen. ICLAS Performance Evaluation Program28 ist der Schlüssel zu diesem Prozess bei Nagetieren. RESAMA Netzwerk meldet den Nachweis von M. Gordonae und M. Mucogenicum in französischen D. Rerio11. Diese Mykobakterien sind nicht in den Feldern der kommerzielle Labors vorgeschlagen, die wir verwenden. Es wäre sinnvoll, das ICLAS-Programm zu erweitern und die diagnostische Assays sowie die Liste der pathogenen Arten29zu harmonisieren.
A. Hydrophila ist auch ein Erreger, die das Potenzial hat, eingeführt werden, bei der Einfuhr von Tieren, obwohl seine Anfälligkeit für Chlor30 ihre Beseitigung während der routinemäßigen Ei Flächendesinfektion wahrscheinlicher macht. Die Ölwanne, Tupfer und Schlamm-Ergebnisse zeigen, dass ökologische Screening verwendet werden kann, um diese Erreger zu erkennen. Andere Bakterien wie Mycobacterium spp. wurden im Klärschlamm durch PCR23festgestellt. Diese Art der Probe ist besonders relevant, da es den Nachweis von Krankheitserregern Schuppen erlaubt. Eine weitere neue Anwendung ist beispielsweise die Schlamm-Analyse, importierte Fische in Quarantäne für p. TomentosaBildschirm. Der Parasit ist eine Bedrohung des Tieres Gesundheit13 und Neoplasie Modelle16. Darüber hinaus sind Chlorkonzentrationen in Routine Zebrafisch Ei Flächendesinfektion verwendet nicht effizient31. Aus diesem Grund scheint die Fähigkeit, die importierte Tiere mit einem einwöchigen Umsatz und ohne irgendwelche Fische Euthanasie Bildschirm sehr attraktiv. Diese Technik kann die Quarantäne und Biosicherheit Regeln beeinflussen, indem Sie erlauben eine Selektierung der Einfuhren. Ein Prozess der Entscheidungsfindung ist dann entsprechend die vorherrschende Erreger in der ausführende Einrichtung, die erkannten Erreger in Proben aus den importierten Fischen und das Risiko einer Beeinträchtigung des Gesundheitszustands des einführenden Anlage10entworfen.
Zukünftige Anwendungen oder Richtungen nach Beherrschung dieser Techniken:
Auch wenn Routine Quarantäne Behandlung der gewählten Variante ist, kann die Wirksamkeit von solchen Medikamenten32,33,34,35,36 mit der Zucht Gerät Schlamm Analyse beurteilt werden. Ganz allgemein könnte die Umwelt Screening verwendet werden, um Verbindungen gegen Bakterien und Parasiten testen zu beseitigen, und namentlich im Fisch Biotop. Eine weitere Nischenanwendung der Umwelt Screening ist zur Überwachung der Erreger Bevölkerung im live feed37,38. Obwohl die Anwendung dieser Techniken als eine wertvolle Ergänzung zu der Diagnose-Toolbox für die Gesundheitsüberwachung im Zebrafisch-Einrichtungen ist. Durch eine genauere, Kosten und Zeit effizient Definition des Gesundheitsstatus, Sumpf-Tupfer und Schlamm Analyse sind komplementär zu der Sentinel-Surveillance und der routinemäßigen Quarantäne-Praxis. In der Tat ist die Zukunft dieser Techniken ein routinemäßiger Bestandteil jeder aquatischen Laborbericht Gesundheit sein.

Um Forschung und Tierschutz1,2zu schützen, ist das Vorhandensein von Krankheitserregern in Tierhaltungen überwacht. Im Falle der Zebrafisch,3,4,5,6,7,8,9,10,11 der Gesundheitsüberwachung stützt sich oft auf Tiere analysiert post-mortem durch Histopathologie, Bakteriologie Kultur oder molekularbiologische Methoden. Tests nur Kolonie Tiere ist nicht die empfohlene Methode aufgrund der Anzahl der Fische und damit verbundenen Aufwendungen, die erforderlich wären, um Krankheitserreger der niedrigen Prävalenz zu erkennen. Daher ist die bevorzugte Methode, eine kleine Gruppe von Tieren zu einer höheren Belastung von Schadstoffen aussetzen. Diese Fische werden Vorfiltration Wächter genannt. Diese Ausstellung dauert Monate und es geht um eine Zunahme der Tierpflegerin Arbeitsbelastung und/oder einige speziell entwickelte technische Lösung. Eine weitere Herausforderung ist die Vorführung von importierten Zeilen in Quarantäne, wo die fruchtbare Tiere sind lebendig gehalten werden und dies ist nicht kompatibel mit routinemäßigen Tests am Schlachtkörper.
Hier beschreiben wir einige Methoden um bestimmte Zebrafisch Krankheitserreger (A. Hydrophila, Mycobacterium spp. und p. Tomentosa) durch screening der aquatischen System-Umgebung zu erkennen. Ziel ist es, reduzieren Sie die Anzahl der Fische verwendet für die Systemüberwachung und Umsatz, Kosten und Empfindlichkeit der Erkennung zu optimieren. Solche Methoden sind eine Alternative zu der Verwendung von Tieren und Screening Einfuhren in Quarantäne können einige Techniken angewendet werden. Zum Beispiel Mocho9 war in der Lage, weitere pathogenen mykobakteriellen Arten zu identifizieren, durch die Durchführung der PCR auf Sumpf Tupfer nicht auf Zebrafisch (einschließlich Wächter), und dies wurde mit weniger Proben erhalten. In diesem gleichen Studie, p. Tomentosa Eiern wurden mit mehr Sensibilität von screening des Tank Schlamms mit Flotation und Mikroskopie erkannt anstatt Fisch durch PCR und Histopathologie.
Tabelle 1 fasst die unterschiedlichen Merkmale des Sentinel Programme3,4,5,6,7,8,9,10 durch eine Reihe von Zebrafisch Einrichtungen verwendet. Nachfiltrierung Wächter erhalten Wasser auf die gleiche Weise wie jede Kolonie Fisch während Vorfiltration Wächter Wasser erhalten, sobald es durch Kolonie Aquarien zuerst in Umlauf gebracht hat. Zum Beispiel können Vorfiltration Wächter auf dem umlaufenden System eingerichtet werden durch kontinuierlich Ölwanne Vorfluter. Dies kann keine Option sein, wenn in einem Raum gibt es viele unabhängige Systeme. In diesem Fall kann ein Tank der Vorfiltration Wächter verwendet werden, den ganzen Raum auf den Bildschirm. Die Wächter sind in einem statischen Tank aus dem umlaufenden System und ihr Wasser ist regelmäßig, mit nur Vorfiltration Wasser d.h.Sumpf Wasser aus allen Systemen im Raum verändert. Diese Technik ist beschrieben als Grundlage für den Vergleich mit der Wirksamkeit der Umwelt Screening. Die vorgeschlagene Einrichtung soll Wasser Qualitätsprobleme wie eine Abnahme der pH-Wert oder ein Stickstoff-Verschmutzung zu kontrollieren.
Das Konzept des bakteriellen Umwelt Screenings stützt sich auf die Hypothese, die dass die Bakterien nachweisbar im Biofilm wie gefunden an der Ölwanne Wand an der Wasseroberfläche oder in den Schlamm an der Unterseite des Tanks sind. Die Ölwanne scheint eine ideale Aufnahmepunkt in einem umlaufenden Aquakultur-System da es Abfall (Wasser, Kot, Futter und anderes organisches Material sammelt) aus allen Tanks Vorfiltration. Die Oberfläche der Ölwanne ist oft leicht zu erreichen, rückt das Schrubben und zur Vermeidung von Cross-Kontamination der Probe (von Handschuhen zum Beispiel) aseptisch durchgeführt werden kann. Der Begriff wird verwendet, um verbreiteten pathogenen Mycobacterium spp. im Zebrafisch Systeme9,12zu identifizieren. Die Technik wird im folgenden beschrieben und berichten wir auch Nachweis von A. Hydrophila in Zebrafisch Ölwanne Oberfläche Tupfer und Schlamm.
Das ökologische Screening für die Parasiteneier basiert auf der Erkennung von Murray Et al. 13 und die Flotation-Technik wird routinemäßig für Parasitologie und mikroskopische Screening Parasit Eier im Kot14verwendet. Mocho9 vorgeschlagen, eine Alternative zu der Bemusterung und zeigte, dass die Technik verwendet werden könnte, um andere Arten von Fisch Biotop zu erkennen. Infizierten D. Rerio pass p. Tomentosa Eiern mit ihren Kot und die Parasiteneier bleiben an der Unterseite des Tanks in den Schlamm. Sie können dort aufgrund ihrer Dichte größer als Wasser gesammelt werden. Die Dichte der Eier wird verwendet, um die Umwelt Probe zu verarbeiten. Eine erste Börsengang mit Zentrifugation trennt Wasser und leichten Schmutz von schwerer Materie. Eine zweite Zentrifugation stützt sich auf gesättigten Zuckerlösung (mit einer Dichte größer als die Dichte von p. Tomentosa Eiern) um die Parasiteneier entstehen an der Oberfläche des Rohres zu ermöglichen.
Das Screening für Bakterien im Biofilm und p. Tomentosa aus dem Boden des Tanks kann durch die Durchführung von PCR für diese Erreger auf den Schlamm Probe Sediment erhalten nach der ersten Zentrifugation kombiniert werden. Dies optimiert die Abtastzeit. Das Verfahren wird nachfolgend beschrieben. Wir bieten auch diese Techniken in einem Quarantäne-Kontext zu verwenden. Auf dem Bildschirm importierte Erwachsene Zebrafisch, die am Leben gehalten werden müssen, wird ein Zucht-Gerät das Quarantänebecken eingefügt. Nach einer Woche Kot und andere Abfallstoffe in der Zucht-Gerät gesammelt und abgeschirmt durch Mikroskopie oder PCR. Die Technik wird im folgenden beschrieben und einige p. Tomentosa Eiern wurden von Mikroskopie in diesem Zusammenhang erkannt.

<table><tbody><tr><td>Aqua-Sed 250 mL</td><td>Vetark</td><td></td><td>2-Phenoxyethanol</td></tr><tr><td>Tubed Sterile Dryswab Spitze</td><td>mwe</td><td>MW100</td><td>Sumpfoberfläche</td></tr><tr><td>BD Plastipak Einwegspritze 50 mL Exzentrischer</td><td>Becton Dickinson 300866</td><td></td><td>Sie sind tatsächlich graduiert auf 60 ml</td></tr><tr><td>Zentrifugenröhrchen 15 mL Corning</td><td>Corning 430766</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Centaur 2 Tischzentrifuge mit 4 x 200 mL Swing&ndash; Rotor (nicht abgedichtet)</td><td>Sanyo</td><td>MSB020. CX1.5</td><td></td></tr><tr><td>Deckglas 22 mm x 22 mm</td><td>Menzel-Glaser</td><td>MNJ-350-020H</td><td></td></tr><tr><td>Plain Swab Steriler Kunststoff-Applikator Rayon Tiped White</td><td>Cap Sterilin Ltd Thermo Fisher Scientific</td><td>F155CA</td><td>Tupfer Sediment aus Schlamm</td></tr><tr><td>50 mL Selbststehendes Zentrifugenröhrchen CentriStar Cap</td><td>Corning</td><td>430921</td><td></td></tr><tr><td>In-Tank Laichschale Set</td><td>MBK Installations Ltd</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

environmental screening von aeromonas hydrophila, mycobacterium spp. und pseudocapillaria tomentosa im zebrafisch-systeme

Environmental Screening of Aeromonas hydrophila, Mycobacterium spp., and Pseudocapillaria tomentosa in Zebrafish Systems

Gesundheit-monitoring-Systeme entwickelt und in Zebrafisch Forschungseinrichtungen eingesetzt, weil Krankheitserreger von Danio Rerio wie Aeromonas Hydrophila, Mycobacterium spp. und Pseudocapillaria Tomentosa das Potenzial haben beeinträchtigen Sie Tierschutz und Forschung. Die Fische sind in der Regel analysiert post-mortem , Mikroben zu erkennen. Die Verwendung der Wächter ist eine vorgeschlagene Möglichkeit, die Empfindlichkeit der Überwachung zu verbessern und die Anzahl der Tiere zu reduzieren. Die Einstellung eines Vorfiltration Sentinel-Tanks aus einem umlaufenden System wird beschrieben. Die Technik ist Verunreinigung des Wassers zu verhindern und die Fischpopulation vertreten durch eine sorgfältige Auswahl von Alter, Geschlecht und Belastungen entwickelt. Um die minimale Anzahl der Tiere zu nutzen, werden Techniken die Umwelt auf den Bildschirm auch detailliert beschrieben. Polymerase Chain Reaction (PCR) auf Oberfläche Ölwanne Tupfer wird verwendet, um die Erkennung einiger weit verbreitet und pathogenen mykobakteriellen Arten wie z. B. Mycobacterium Fortuitum, Mycobacterium Haemophilumund deutlich zu verbessern Mycobacterium Chelonae. Eine weitere ökologische Methode besteht darin, Verarbeitung des Schlamms am unteren Rand einen Fäkalientank oder Sumpf zu p. Tomentosa Eiern suchen. Dies ist eine günstige und schnelle Technik, die in Quarantäne angewendet werden kann, wo ein Zucht-Gerät in den Fäkalientank von importierten Tieren eingetaucht. Zu guter Letzt PCR wird der Schlamm Probe angewendet und A. Hydrophila wird an der Ölwanne Unterseite und Oberfläche erkannt. In der Regel haben diese ökologischen Screening Techniken angewendet, um diese spezifischen Erreger zu einer erhöhten Empfindlichkeit gegenüber der Prüfung der Vorfiltration Wächter geführt.

Die Vorteile der Ölwanne Tupfer verbreitet Mycobacterium spp. im Vergleich zu Fischproben identifizieren werden durch die Ergebnisse in Abbildung 4unterstützt. 115 Fisch getestet wurden M. Chelonae und M. Haemophilum bei 5 % und 3 % der Proben festgestellt. Keine andere Pathogene mykobakteriellen Spezies identifiziert wurde. Aus den gleichen Systemen ergab 49 Ölwanne Tupfer 5 mykobakteriellen Arten. Odds-Ratio werden berechnet mit der Hypothese, dass M. Chelonae und M. Fortuitum häufiger durch PCR in die Oberfläche Ölwanne Tupfer als in der Fisch-Probe erkannt werden. Dies ist statistisch signifikant mit entsprechenden Odds Ratio von 11 (95 % CI: 4, 29; p < 0,0001) und 306 (95 % CI: 18, 5208; p = 0,0001). Die Ergebnisse zeigen, dass die Oberfläche Sumpf-Tupfer-Technik eine wertvolle Alternative für die alleinige Nutzung der Wächter zum Bildschirm der Zebrafisch-Anlage für Mycobacterium SPP ist. Die Umweltproben dienten auch zum Bildschirm für A. Hydrophila. Diese Bakterien wurden in Fisch, Schlamm und Bodenproben (Abbildung 4) nachgewiesen. Dies unterstützt auch die Möglichkeit der vorgeschlagenen Techniken der Fisch Biotop auf den Bildschirm.
Bezüglich der Schlamm-Analyse, p. Tomentosa Eiern zu erkennen erkannt Mocho9 der Parasit in 27 % der Fischproben von PCR und Histopathologie, während die Eizellen in 93 % der analysierten Schlamm aus dem gleichen System erkannt wurden. Hier wurde die Technik herausgefordert, Quarantäne-Screening zu reproduzieren. In diesem Zusammenhang eingeführte Tiere abgetastet werden können nicht, und der Beurteilung ihres Gesundheitszustandes in einer fristgerechten Weise hilft bei der Biosicherheit-Management. Fisch von unbekannten Gesundheitszustand von einer p. Tomentosa positive Einrichtung wurden in 8 Panzer mit Zucht Geräte eingestellt: max. 16 Fische/13 L Tank, 7 transgenen und 1 Wildtyp-Linie gemischt Geschlecht, im Alter von 4-24 Monate. Der Schlamm wurde von den Geräten nach einer Woche geerntet und von Mikroskopie analysiert. P. Tomentosa Eiern wurden in 7 (88 %) Proben gesehen. Schließlich war der PCR-Nachweis von Parasiten auf Sumpf Tupfer und Schlamm Sedimente erprobt. 4 von 6 Schlamm Proben waren PCR positiv und alle Ergebnisse negativ für die Oberfläche Tupfer. Dies ist nicht verwunderlich, da der Schlamm-Screening stützt sich auf die Fähigkeit der Eier fallen auf den Boden des Tanks. Dies zeigt, dass die Schlamm-Analyse-Techniken verwendet werden, um Bildschirm D. Rerio Aquarien für p. Tomentosa Befall und die Methoden für das Screening von importierten Tieren angepasst werden können.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55306/55306fig1.jpg"> Abbildung 1: Vorfiltration Sentinel Tank aus dem umlaufenden System. Ein 8-L-Tank ist voller Wasser und Bio-Medien aus den Sümpfen der Systeme zum Bildschirm. Die beiden weißen Keramik Bio-Medien-Perlen sitzen an der Unterseite des Tanks (Bildmitte). 12 Fische werden nach ihrem Alter, Stamm und Geschlecht ausgewählt, und sie werden hinzugefügt, um die Sentinel-Tank. <a href="//cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/55306/55306fig1large.jpg" target="_blank">Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55306/55306fig2.jpg"> Abbildung 2: p. Tomentosa Ei während der Schlamm Analyse von Mikroskopie erkannt. Vergrößerung verwendet wurde 400 X. Pfeile zeigen die zweipolige Stecker. Maßstabsleiste = 50 µm. <a href="//cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/55306/55306fig2large.jpg" target="_blank">Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55306/55306fig3.jpg"> Abbildung 3: Zucht Gerät unter Wasser in einem Aquarium halten, Schlamm für die Analyse zu sammeln. Dieser Tank befindet sich auf einer Bank für das Bild. Es ist sonst im umlaufenden System eingestellt. <a href="//cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/55306/55306fig3large.jpg" target="_blank">Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55306/55306fig4.jpg"> Abbildung 4: Anteil der Identifizierung von Mycobacterium spp., A. Hydrophilaund p. Tomentosa mittels PCR auf Fisch, Oberflächen-Sumpf Tupfer und Ölwanne Schlamm. Prozentsatz wird ermittelt, indem die Anzahl der positiven Ergebnisse für jede Art der Erreger durch die Anzahl der untersuchten Proben. Der Anteil der positiven Ergebnisse erhält durch Probentyp als Fisch, Oberfläche oder Schlamm und nach der Bakterien Name angegeben wird. 115 Fisch- und 49 Oberfläche Ölwanne Tupfer wurden mittels PCR zur Identifizierung von Mycobacterium SPP getestet. Die Daten werden mit Mocho9 Ergebnisse zusammengestellt, da es eine Erweiterung dieser Studie ist. Die Fische sind vor allem Vorfiltration Wächter gemäß Protokoll Abschnitt 1. Selten, wenn Wächter nicht zur Verfügung standen, Flüchtlinge und alte Kolonie Fisch (> 18 Monate) gesampelt wurden. Alle getesteten Systeme für Mycobacterium SPP wurden auf Fisch und Ölwanne Tupfer getestet. Odds-Ratio werden berechnet mit der Hypothese, dass M. Chelonae und M. Fortuitum häufiger durch PCR in die Oberfläche Ölwanne Tupfer als in der Fisch-Probe erkannt werden. Dies ist statistisch signifikant mit entsprechenden Odds Ratio von 11 (95 % CI: 4, 29; p < 0,0001) und 306 (95 % CI: 18, 5208; p = 0,0001). Mycobacterium marinum PCR für alle Proben negativ war und ist daher als abwesend aus diesen Einrichtungen und nicht in die Analyse einbezogen. 12 Fisch, 14 Oberfläche Ölwanne Tupfer und 6 Ölwanne Schlamm wurden mittels PCR auf das Vorhandensein von A. Hydrophilagetestet. 6 Ölwannen wurden auf das Vorhandensein von p. Tomentosa an der Oberfläche und im Klärschlamm untersucht. PCR = Polymerase-Kettenreaktion. CI = Konfidenzintervall. * und ** zeigen statistischen Signifikanz; andere Vergleiche waren statistisch nicht signifikant. <a href="//cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/55306/55306fig4large.jpg" target="_blank">Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.</a>
<img alt="Video 1" src="/files/ftp_upload/55306/55306vid1.jpg"> Video 1: Scannen für ein Ei der P. Tomentosa mit dem Mikroskop. Die Folie wird aus Klärschlamm Analyse gewonnen, wie unter Punkt 3.1 beschrieben. Das Feld wird gescannt, um ein Ei von p. Tomentosazu erkennen. Sobald eine Struktur zu erkennen ist, wird es vergrößert, um die Identifikation mit einer höheren Auflösung zu bestätigen. <a href="http://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/55306/video_scan_for_egg.avi" target="_blank">Bitte klicken Sie hier, um dieses Video anzusehen. (Rechtsklick zum download)</a>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td>Autoren</td>
			<td>Alter bei Beginn der Exposition</td>
			<td>Dauer der Exposition</td>
			<td>Probenahme-Alter</td>
			<td>Pre oder Post Filtration</td>
			<td>Geschlecht</td>
			<td>Angabe</td>
		</tr>
<tr>
<td>Barton Et al. 3
</td>
			<td>4 Monate</td>
			<td>6 Monate</td>
			<td>10 Monate</td>
			<td>Vorfiltration</td>
			<td>N/A</td>
			<td>N/A</td>
		</tr>
<tr>
<td>Borges Et al. 4
</td>
			<td>6 Monate</td>
			<td>6 Monate</td>
			<td>12 Monate</td>
			<td>Vorfiltration</td>
			<td>N/A</td>
			<td>AB Wildtyp</td>
		</tr>
<tr>
<td>Collymore Et al. 5
</td>
			<td>So jung wie möglich</td>
			<td>3 Monate</td>
			<td>< 6 Monate</td>
			<td>Vorfiltration</td>
			<td>N/A</td>
			<td>N/A</td>
		</tr>
<tr>
<td>Geisler Et al. 6
</td>
			<td>4 Monate</td>
			<td>4 Monate</td>
			<td>8 Monate</td>
			<td>Pre- und post Filtration</td>
			<td>N/A</td>
			<td>AB Wildtyp</td>
		</tr>
<tr>
<td>Liu Et al. 7
</td>
			<td>3 Monate</td>
			<td>1-6 Monate</td>
			<td>4-9 Monate</td>
			<td>Pre- und post Filtration</td>
			<td>N/A</td>
			<td>Wildtyp</td>
		</tr>
<tr>
<td>Martins Et al. 8
</td>
			<td>3 Monate</td>
			<td>3 Monate</td>
			<td>6 Monate</td>
			<td>Vorfiltration</td>
			<td>N/A</td>
			<td>Wildtyp</td>
		</tr>
<tr>
<td>Mocho9
</td>
			<td>< 6 Monate 6 - 12 Monate > 18 Monate</td>
			<td>4 Monate</td>
			<td>7 - 24 Monate</td>
			<td>Vorfiltration</td>
			<td>1 Hündin und 1 Rüde von jede Altersgruppe</td>
			<td>AB Wildtyp</td>
		</tr>
<tr>
<td>Murray Et al. 10
</td>
			<td>3-4 Monate</td>
			<td>3 Monate, 6 Monate, 1 Jahr</td>
			<td>7, 10 und 16 Monate</td>
			<td>Pre- und post Filtration</td>
			<td>N/A</td>
			<td>AB Wildtyp</td>
		</tr>
</tbody></table>Tabelle 1: Vergleich der Sentinel-Einstellungen im Zebrafisch Einrichtungen. Die Sentinel-Fische können je nach Alter, Geschlecht oder Belastung ausgewählt werden. Sie sind für einen bestimmten Zeitraum ausgesetzt und Pre- oder Post-Filtration System Wasser erhalten. Die Daten sind zusammengestellt aus 2016 Themenheft Gesundheit der Zebrafisch Journal3,4,5,6,7,8,9, 10.

Dieses Protokoll beschreibt die Verwendung von Sumpf Tupfer und Schlamm Analyse der Zebrafisch Systeme führt zu erhöhten Erkennung im Vergleich zu den alleinigen Einsatz von Wächter, Krankheitserreger wie Aeromonas Hydrophila, Mycobacterium spp. und zu erkennen Pseudocapillaria Tomentosa. Außerdem wird ein System zur Überwachung von p. Tomentosa Eiern in Quarantäne vorgeschlagen.

Environmental Screening von Aeromonas Hydrophila, Mycobacterium spp. und Pseudocapillaria Tomentosa im Zebrafisch-Systeme

Health monitoring systems are developed and used in zebrafish research facilities because pathogens of Danio rerio such as Aeromonas hydrophila, ...

Das übergeordnete Ziel dieser Probenahmetechnik besteht darin, die Anzahl der zur Gesundheitsüberwachung verwendeten Fische zu verringern und die Durchlaufzeit, die Kosten sowie die Empfindlichkeit der Pathogendetektion zu optimieren, auch bei der Untersuchung von Importen in der Quarantäne. Diese Technik hilft dabei, den Gesundheitsstatus der Schutzkolonien festzulegen. Diese Methode ist ein nützliches Werkzeug beim Auswerten oder Beurteilen der Behandlungseffizienz.Ein wesentlicher Vorteil dieser Technik liegt in der Untersuchung und Vorsortierung von Importen in der Quarantäne. Sie stärkt das Biosicherheitskonzept der aquatischen Einrichtung. Um die Anleitung zu beginnen, stellen Sie einen sauberen acht Liter fassenden Tank außerhalb eines Recirculationssystems bereit.Füllen Sie den Behälter mit etwa acht Litern Wasser, das aus Sammelgruben stammt. Geben Sie zwei Keramikperlen oder Schwammmatrices aus Biomaterial aus den Systemen zum Abschirmen hinzu. Fügen Sie anschließend ein bis zwei Danio rerio pro Liter hinzu, wobei Wildtyp-Fische mit dem dominanten genetischen Hintergrund der Einrichtung verwendet werden sollen, beispielsweise AB. Wählen Sie mindestens sechs Fische aus.Füttern Sie die Fische einmal täglich. Variieren Sie die Futterrationen, um sicherzustellen, dass die Wachposten allen im Zebrafisch-Bereich verwendeten Futtertypen ausgesetzt sind. Um den Wasserwechsel durchzuführen, überführen Sie die Wachposten zusammen mit dem Biomaterial in ein provisorisches Becken.Leeren Sie den Wächterbehälter vollständig und reinigen Sie ihn. Füllen Sie den Wächterbehälter ausschließlich mit Sumpfwasser wieder auf und setzen Sie die Wächterfische und das Biomedia zurück. Nach einer viermonatigen Exposition der Wächterfische gegenüber Sumpfwasser werden diese durch eine genehmigte Methode, beispielsweise durch Eintauchen in eine Überdosis-Lösung von 2-Phenoxyethanol, euthanasiert.Um den Tod zu bestätigen, warten Sie zehn Minuten nach dem Stillstand der Operculumbewegung. Greifen Sie die Leiche mit einer Pinzette und frieren Sie sie vollständig bei minus 80 Grad Celsius in einem gekennzeichneten Behälter ein. Bereiten Sie einen sterilen, trockenen Abstrich mit Kunststoffstiel vor und ziehen Sie Handschuhe an.Bestimmen Sie die zu abstrichende Oberfläche. Wählen Sie eine Sumpfoberfläche mit geringer Strömung, nämlich die Sumpfwand auf Höhe der Wasseroberfläche, und entfernen Sie alle Gegenstände, die den Zugang zur Oberfläche erschweren. Ziehen Sie danach den Abstrichstab aus der äußeren Verpackung, um die sterile Watteoberfläche der Luft auszusetzen.Beproben Sie die Schachtwand über fünf bis 10 Zentimeter, um das Wasser und den Biofilm auf Höhe der Wasseroberfläche im Schacht aufzunehmen. Danach stecken Sie den Tupfer wieder in die Hülle oder brechen die Spitze in ein steriles Zentrifgenröhrchen ab. Kennzeichnen Sie die Probe und senden Sie sie zur PCR-Analyse oder frieren Sie sie bei minus 80 Grad Celsius ein.Um eine Schlammanalyse mittels Mikroskopie durchzuführen, den Schlamm am Boden eines Sammelbeckens mit einer 60-Milliliter-Spritze aufziehen. Die Probe auf 15-Milliliter-Röhrchen verteilen. Die Verschlüsse aufschrauben und die Röhrchen beschriften.Zentrifugieren Sie die 15-Milliliter-Röhrchen für zehn Minuten bei 175 bis 250 ×g in einer Zentrifuge mit Schwenkköpfen. Gießen Sie die Flüssigkeit vorsichtig ab. Behalten Sie nach dem Abgießen die Sedimente.Bereiten Sie als Nächstes die zuckerhaltige gesättigte Lösung vor, indem Sie 227 Gramm Kristallzucker und 177 Milliliter heißes Wasser mit einem Magnetrührer vermischen. Füllen Sie die Röhrchen zur Hälfte mit der zuckerhaltigen gesättigten Lösung. Schrauben Sie die Verschlüsse auf und mischen Sie das Sediment gründlich mit der Lösung. Stellen Sie die Röhrchen in die Schwenkbuckets der Zentrifuge und füllen Sie sie bis zum Rand mit der zuckerübersättigten Lösung auf. Legen Sie vorsichtig ein Deckglas auf jedes Röhrchen, sodass es die zuckerübersättigte Lösung berührt. Beachten Sie, dass vier Röhrchen für jede 60-Milliliter-Probe vorgesehen sind, falls ein Deckglas während der Zentrifugation herunterfällt und zerbricht.Nach Abschluss des Schleudervorgangs heben Sie das Deckglas an und legen es auf einen Objektträger. Beschriften Sie den Objektträger anschließend mit einem Bleistift oder einem Markierstift. Falls zu viele Deckgläser zerbrechen, füllen Sie den größten Teil des Röhrchens mit der zuckerübersättigten Lösung und zentrifugieren Sie das Röhrchen. Füllen Sie das Röhrchen bis zum Rand mit der zuckerübersättigten Lösung, setzen Sie das Deckglas vorsichtig auf und warten Sie 30 Minuten.Suchen Sie mit dem Mikroskop nach den Eiern von Pseudocapillaria tomentosa. Identifizieren Sie die bipolaren Verschlüsse bei einer Vergrößerung von 400×. Um eingeführte Tiere in der Quarantäne auf P. tomentosa-Eier zu untersuchen, stellen Sie männliche und weibliche Danio rerio in ein Becken und fügen Sie ein Laichtablett im Becken hinzu, das hier jedoch zur Sammlung des Kot verwendet wird.Nach einer Woche entfernen Sie die Brutvorrichtung und sammeln Sie den darin gesammelten Schlamm gemäß der zuvor beschriebenen Methode ein. Saugen Sie den Schlamm am Boden eines Tanks oder Sumpfes mit einer 60-Milliliter-Spritze ab und überführen Sie die Probe in ein 60-Milliliter-Röhrchen. Verschließen Sie das Röhrchen mit dem Schraubverschluss und beschriften Sie es.Entsorgen Sie die Spritze. Schütteln Sie das 60-Milliliter-Röhrchen und überführen Sie 15 Milliliter in ein 15-Milliliter-Röhrchen. Verschließen Sie das Röhrchen mit dem Schraubverschluss und beschriften Sie es.Zentrifugieren Sie die 15-Milliliter-Röhrchen bei 175 bis 250 × g für zehn Minuten in einer Zentrifuge mit Schwenkbügeln. Gießen Sie die Flüssigkeit ab und bewahren Sie das Sediment im Röhrchen auf. Entfernen Sie die Umverpackung des Abstrichstabs, um den sterilen Wattetupfer freizulegen, und setzen Sie ihn der Luft aus.Beprobene das Sediment im Reagenzglas 15 Sekunden lang mit dem Tupfer. Stecke den Tupfer wieder in die Hülle oder breche die Spitze in ein steriles Zentrifugenröhrchen ab. Beschrifte die Probe.Einfrieren bei minus 80 Grad Celsius und zur PCR-Testung senden. Mit der Sumpf-Abstrich-Methode wurden insgesamt 115 Fische untersucht; dabei wurde Mycobaterium chelonae in fünf Prozent und Mycobaterium haemophilum in drei Prozent der Proben nachgewiesen, und diese waren die einzigen identifizierten pathogenen Arten. Aus denselben Anlagen ergaben 49 Sumpf-Abstriche das Vorhandensein von fünf Mycobakterien-Arten.Die Odds Ratios zeigen, dass die Oberflächen-Sumpf-Abstrich-Technik eine wertvolle Alternative zur alleinigen Verwendung von Sentinel-Tieren zur Untersuchung der Zebrafischanlage auf Mycobacterium darstellt. Die Umweltproben wurden außerdem auf Aeromonas hydrophila untersucht, das sowohl in Fischen als auch in Schlamm- und Oberflächenproben nachgewiesen wurde, was die Eignung der vorgeschlagenen Methoden zur Untersuchung des Fisch-Biotops untermauert. Mycobacterium chelonae und Mycobacterium fortuitum wurden mittels PCR in den Oberflächen-Sumpf-Abstrichen häufiger nachgewiesen als in den Fischproben.Wenn man die Probenahme einmal beherrscht, dauert sie nur wenige Minuten, und der Nachweis von Pseudocapillaria tomentosa-Eiern kann innerhalb einer Stunde erfolgen. Diese Technik macht die Umweltüberwachung zu einem zentralen Bestandteil des routinemäßigen Gesundheitsmonitorings. Diese Methoden können helfen, wichtige Fragen im Bereich der Fischpathologie zu beantworten, beispielsweise den Zusammenhang zwischen bakteriellem Biofilm und bakterieller Infektion.

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Biologie

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