Name: Laborprotokoll für genetische Darm Inhaltsanalysen der aquatischen Makroinvertebraten Using gruppenspezifische rDNA Primer (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-10-05T12:55:00.000+00:00
Duration: 10 min 17 s
Description: Lernen Sie genetische Methoden zur Analyse von Darmproben bei aquatischen Makroinvertebraten zur Untersuchung trophischer Interaktionen und Nahrungsnetzökologie. Diese Technik ermöglicht präzisere Beutediagnose als visuelle Verfahren.

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Wir danken Silke Classen vom Forschungsinstitut für Ökosystem Analyse und Bewertung (Gaiac), RWTH Aachen für ihre Hilfe bei der Schaffung der in diesem Protokoll verwendeten gruppenspezifischen Primer-Sets. Wir danken auch Peter Martin und Laura Schynawa von der Universität Kiel für die Zusammenarbeit in der Wasser-Milben-Experimente. Wir danken auch der technische Laboranten zur Aufbewahrung Labor reibungslos läuft und das Register der Unternehmen und Katalognummern vorbereiten. Diese Arbeit wurde von der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG, Projekt GE 2219/3-1) unterstützt.

<ol><li>Carreon-Martinez, L., Heath, D. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Revolution+in+food+web+analysis+and+trophic+ecology%3A+diet+analysis+by+DNA+and+stable+isotope+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Ecol%22%5BJournal%5D)">Revolution in food web analysis and trophic ecology: diet analysis by DNA and stable isotope analysis.</a> Mol Ecol. 9 (1), 25-27 (2010).</li>
<li>Hardy, C. M., Krull, E. S., Hartley, D. M., Oliver, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Carbon+source+accounting+for+fish+using+combined+DNA+and+stable+isotope+analyses+in+a+regulated+lowland+river+weir+pool%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Ecol%22%5BJournal%5D)">Carbon source accounting for fish using combined DNA and stable isotope analyses in a regulated lowland river weir pool.</a> Mol Ecol. 19 (1), 197-212 (2010).</li>
<li>Baxter, C. V., Fausch, K. D., Saunders, W. C. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2427.2004.01328.x/full">Tangled webs: reciprocal flows of invertebrate prey link streams and riparian zones.</a> Freshwater Biol. 50 (2), 201-220 (2005).</li>
<li>Baxter, C. V., Fausch, K. D., Murakami, M., Chapman, P. L. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1890/04-138/abstract">Fish invasion restructures stream and forest food webs by interrupting reciprocal prey subsidies.</a> Ecol. 85 (10), 2656-2663 (2004).</li>
<li>Traugott, M., Kamenova, S., Ruess, L., Seeber, J., Plantegenest, M. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/publication/259188892_Chapter_Three_-_Empirically_characterising_trophic_networks_what_emerging_DNA-based_methods_stable_isotope_and_fatty_acid_analyses_can_offer">Empirically Characterising Trophic Networks: What Emerging DNA-Based Methods, Stable Isotope and Fatty Acid Analyses Can Offer.</a> Adv. Ecol. Res. Vol 49: Ecological Networks in an Agricultural World. 49, Elsevier Academic Press Inc. 177-224 (2013).</li>
<li>Diaz Arredondo, M. A., Guzman del Proo, S. A. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/publication/292536291_Feeding_habits_of_the_spiny_lobster_Panulirus_interruptus_Randall_1840_in_Bahia_Tortugas_Baja_California_Sur">Feeding habits of the spiny lobster (Panulirus interruptus Randall, 1840) in Bahia Tortugas, Baja California Sur.</a> Cienc Mar. 21 (4), 439-462 (1995).</li>
<li>Letourneur, Y., Galzin, R., Harmelin-Vivien, M. <a target="_blank" href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S002209819602730X">Temporal variations in the diet of the damselfish Stegastes nigricans (Lacepède) on a Réunion fringing reef.</a> J Exp Mar Biol Ecol. 217 (1), 1-18 (1997).</li>
<li>Akin, S., Winemiller, K. O. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1007%2FBF02784282?LI=true">Seasonal variation in food web composition and structure in a temperate tidal estuary.</a> Estuar Coast. 29 (4), 552-567 (2006).</li>
<li>Redd, K. S., Jarman, S. N., Frusher, S. D., Johnson, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+molecular+approach+to+identify+prey+of+the+southern+rock+lobster%5BTitle%5D)+AND+%22Bull+Entomol+Res%22%5BJournal%5D)">A molecular approach to identify prey of the southern rock lobster.</a> Bull Entomol Res. 98 (3), 233-238 (2008).</li>
<li>Gergs, R. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/publication/30019761_Dreissena_polymorpha_in_Lake_Constance_An_example_of_a_keystone_engineer">Dreissena polymorpha in Lake Constance: An example of a keystone engineer?</a> Universität Konstanz. , (2009).</li>
<li>Sheppard, S. K., Harwood, J. D. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/profile/Samuel_Sheppard2/publication/227994386_Advances_in_molecular_ecology_Tracking_trophic_links_through_predator-prey_food-webs/links/0deec519bc75aa375c000000.pdf">Advances in molecular ecology: tracking trophic links through predator-prey food-webs.</a> Funct Ecol. 19 (5), 751-762 (2005).</li>
<li>Jarman, S. N., Ward, R. D., Elliott, N. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oligonucleotide+primers+for+PCR+amplification+of+coelomate+introns%5BTitle%5D)+AND+%22Mar+Biotechnol+%28NY%29%22%5BJournal%5D)">Oligonucleotide primers for PCR amplification of coelomate introns.</a> Mar Biotechnol (NY). 4 (4), 347-355 (2002).</li>
<li>Verma, S. K., Singh, L. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1046/j.1471-8286.2003.00340.x/abstract">Novel universal primers establish identity of an enormous number of animal species for forensic application.</a> Mol Ecol Notes. 3 (1), 28-31 (2003).</li>
<li>Deagle, B. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+scatology+as+a+tool+to+study+diet%3A+analysis+of+prey+DNA+in+scats+from+captive+Steller+sea+lions%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Ecol%22%5BJournal%5D)">Molecular scatology as a tool to study diet: analysis of prey DNA in scats from captive Steller sea lions.</a> Mol Ecol. 14 (6), 1831-1842 (2005).</li>
<li>Jarman, S. N., Deagle, B. E., Gales, N. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Group-specific+polymerase+chain+reaction+for+DNA-based+analysis+of+species+diversity+and+identity+in+dietary+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Ecol%22%5BJournal%5D)">Group-specific polymerase chain reaction for DNA-based analysis of species diversity and identity in dietary samples.</a> Mol Ecol. 13 (5), 1313-1322 (2004).</li>
<li>Jarman, S. N., Redd, K. S., Gales, N. J. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1471-8286.2005.01172.x/full">Group-specific primers for amplifying DNA sequences that identify Amphipoda, Cephalopoda, Echinodermata, Gastropoda, Isopoda, Ostracoda and Thoracica.</a> Mol Ecol Notes. 6 (1), 268-271 (2006).</li>
<li>Hayashi, K., Yandell, D. W. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8257985">How sensitive is PCR-SSCP?</a> Hum Mutat. 2 (5), 338-346 (1993).</li>
<li>Glavač, D., Dean, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimization+of+the+single-strand+conformation+polymorphism+%28SSCP%29+technique+for+detection+of+point+mutations%5BTitle%5D)+AND+%22Hum+Mutat%22%5BJournal%5D)">Optimization of the single-strand conformation polymorphism (SSCP) technique for detection of point mutations.</a> Hum Mutat. 2 (5), 404-414 (1993).</li>
<li>Mülhardt, C. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aM%C3%BClhardt%2C+C+%22Der+Experimentator+Molekularbiologie+%2F+Genomics%22">Der Experimentator Molekularbiologie / Genomics</a>. , 7th ed, Spektrum Akademischer Verlag. Heidelberg. (2013).</li>
<li>Lee, S. V., Bahaman, A. R. Discriminatory Power of Agarose Gel Electrophoresis in DNA Fragments Analysis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aLee%2C+SV+%22Gel+Electrophoresis+-+Principles+and+Basics%22">Gel Electrophoresis - Principles and Basics</a>. , InTech. (2012).</li>
<li>Wang, X. W., et al. <a target="_blank" href="https://www.ajol.info/index.php/ajb/article/view/60628">A new electrophoresis technique to separate microsatellite alleles.</a> Afr J Biotechnol. 8 (11), 2432-2436 (2009).</li>
<li>Gemmer, I., Gergs, R. <a target="_blank" href="https://pubag.nal.usda.gov/catalog/612063">Characterization of the first twelve microsatellite loci for the amphipod Gammarus roeselii (Crustacea: Amphipoda).</a> Conserv Genet Resour. 5 (4), 955-957 (2013).</li>
<li>Olafsson, K., Hjorleifsdottir, S., Pampoulie, C., Hreggvidsson, G. O., Gudjonsson, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Novel+set+of+multiplex+assays+%28SalPrint15%29+for+efficient+analysis+of+15+microsatellite+loci+of+contemporary+samples+of+the+Atlantic+salmon+%28Salmo+salar%29%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Ecol+Resour%22%5BJournal%5D)">Novel set of multiplex assays (SalPrint15) for efficient analysis of 15 microsatellite loci of contemporary samples of the Atlantic salmon (Salmo salar).</a> Mol Ecol Resour. 10 (3), 533-537 (2010).</li>
<li>Baric, S., Hollrigl, A., Fureder, L., Petutschnig, J., Dalla Via, J. <a target="_blank" href="https://www.kmae-journal.org/articles/kmae/abs/2006/01/kmae2006380-381p977/kmae2006380-381p977.html">First analysis of genetic variability in Carinthian populations of the white-clawed crayfish Austropotamobius pallipes.</a> Bull. Fr. Peche Piscicult. (380-381), 977-990 (2006).</li>
<li>Koester, M., Gergs, R. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/publication/265367886_No_evidence_for_intraguild_predation_of_Dikerogammarus_villosus_Sowinsky_1894_at_an_invasion_front_in_the_Untere_Lorze_Switzerland">No evidence for intraguild predation of Dikerogammarus villosus (Sowinsky, 1894) at an invasion front in the Untere Lorze, Switzerland.</a> Aquat Invasions. 9 (4), 489-497 (2014).</li>
<li>Sonnenberg, R., Nolte, A. W., Tautz, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+evaluation+of+LSU+rDNA+D1-D2+sequences+for+their+use+in+species+identification%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Zool%22%5BJournal%5D)">An evaluation of LSU rDNA D1-D2 sequences for their use in species identification.</a> Front Zool. 4 (6), 6(2007).</li>
<li>Koester, M., Bayer, B., Gergs, R. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1007/s10750-015-2558-9">Is Dikerogammarus villosus (Crustacea, Gammaridae) a 'killer shrimp' in the River Rhine system?</a> Hydrobiologia. 768 (1), 299-313 (2016).</li>
<li>Koester, M., Claßen, S., Gergs, R. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1007/s12686-013-9998-1">Establishment of group-specific PCR primers for the identification of freshwater macroinvertebrates.</a> Conserv Genet Resour. 5 (4), 1091-1093 (2013).</li>
<li>Martin, P., Koester, M., Schynawa, L., Gergs, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((First+detection+of+prey+DNA+in+Hygrobates+fluviatilis+%28Hydrachnidia%2C+Acari%29%3A+a+new+approach+for+determining+predator-prey+relationships+in+water+mites%5BTitle%5D)+AND+%22Exp+Appl+Acarol%22%5BJournal%5D)">First detection of prey DNA in Hygrobates fluviatilis (Hydrachnidia, Acari): a new approach for determining predator-prey relationships in water mites.</a> Exp Appl Acarol. 67 (3), 373-380 (2015).</li>
<li>Deagle, B. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Studying+Seabird+Diet+through+Genetic+Analysis+of+Faeces%3A+A+Case+Study+on+Macaroni+Penguins+%28Eudyptes+chrysolophus%29%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Studying Seabird Diet through Genetic Analysis of Faeces: A Case Study on Macaroni Penguins (Eudyptes chrysolophus).</a> PLoS One. 2 (9), e831(2007).</li>
<li>Sint, D., Niederklapfer, B., Kaufmann, R., Traugott, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Group-Specific+Multiplex+PCR+Detection+Systems+for+the+Identification+of+Flying+Insect+Prey%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Group-Specific Multiplex PCR Detection Systems for the Identification of Flying Insect Prey.</a> PLoS One. 9 (12), e115501(2014).</li>
<li>Zarzoso-Lacoste, D., Corse, E., Vidal, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improving+PCR+detection+of+prey+in+molecular+diet+studies%3A+importance+of+group-specific+primer+set+selection+and+extraction+protocol+performances%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Ecol+Resour%22%5BJournal%5D)">Improving PCR detection of prey in molecular diet studies: importance of group-specific primer set selection and extraction protocol performances.</a> Mol Ecol Resour. 13 (1), 117-127 (2013).</li>
<li>Vestheim, H., Jarman, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Blocking+primers+to+enhance+PCR+amplification+of+rare+sequences+in+mixed+samples+-+a+case+study+on+prey+DNA+in+Antarctic+krill+stomachs%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Zool%22%5BJournal%5D)">Blocking primers to enhance PCR amplification of rare sequences in mixed samples - a case study on prey DNA in Antarctic krill stomachs.</a> Front Zool. 5 (1), 12(2008).</li>
<li>Harper, G. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+screening+of+invertebrate+predators+for+multiple+prey+DNA+targets%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Ecol%22%5BJournal%5D)">Rapid screening of invertebrate predators for multiple prey DNA targets.</a> Mol Ecol. 14 (3), 819-827 (2005).</li>
</ol>

Die Autoren haben nichts preisgeben.

Hier präsentieren wir Ihnen eine einfache und kostengünstige Methode für PCR-basierte Bestimmung der Räuber-Beute-Interaktionen von Feldproben über gruppenspezifischen Primer für rDNA Regionen, die mit anderen nicht-molekulare Analysen der gleichen Proben kombiniert werden können. Allerdings gibt es einige wichtige Schritte im Rahmen des Protokolls. Erstens ist es wichtig, versichert die Spezifität der Primer verwendet. Zweitens ist es wichtig zur Vermeidung von Verschmutzung und Verlust der Darm Inhalt Material bei der ...

Räuber-Beute-Interaktionen, die die Mehrheit der trophischen Interaktionen und Nahrungsnetz Dynamik darstellen, sind wichtige Aspekte charakterisieren die Fluten von Materie und Energie im gesamten Nahrungsnetze innerhalb und zwischen den Ökosystemen, die eines der wichtigsten Ziele der Ökologie ist 1. die Bestimmung der Quelle und Fluss von Kohlenstoff und Nährstoffen fördert das Verständnis der ökologischen Vernetzung zwischen Ökosystemen2. Ökosysteme, wie Flüsse und ihre Einzugsgebiete werden jedoch nicht nur durch Fluten von organischen Stoffen und Nährstoffen, sondern auch durch die Bewegungen der Organismen3verknüpft. So können Lebensraum Änderungen unterbrechen die Ressourcen, die diese Systeme verbinden stark Nahrungsketten der beiden Ökosysteme nicht nur direkt, sondern indirekt auch ändern, indem Änderung der jeweiligen Zusammensetzung der Räuber-Beute-Gemeinschaften. Zum Beispiel wurden Änderungen der Nahrungsnetze gezeigt, um die Bewegungen der einzelnen Raubtier Arten (z.B., Regenbogenforelle)4verknüpft werden. Solche Veränderungen drohen möglicherweise biologische Vielfalt und das funktionieren aquatischer Ökosysteme. Daher ist es wichtig, die Auswirkungen von Menschen verursachten Umweltveränderungen, wie Wasser-Management-Praktiken, auf die Einheimischen Biodiversität aquatischer Ökosysteme, Räuber-Beute-Interaktionen im Bereich Analyse.
Da tracking trophische Beziehungen schwierig in komplexen Systemen, entstanden mehrere Ansätze, die es ermöglichen die Beurteilung der Fütterung Interaktionen in Feld5. Traditionell, Untersuchungen der Fütterung Interaktionen im Bereich basieren auf visuelle Identifizierung der Beute bleibt in seziert Mut und erfordern ein umfangreiches Wissen über die Vielfalt der morphologischen Beute. Visuelle Darm Inhaltsanalysen haben Einblicke in die Nutzung der Ressourcen von mehreren Gruppen von Verbrauchern (z. B. jahreszeitliche Variation in der Ernährung der Hummer6 und Fisch7,8 oder Fütterung Präferenzen von Copepoden) zur Verfügung gestellt. Jedoch der physikalischen Prozess der Verdauung erschwert die visuelle Darm Inhaltsanalysen und in der Regel weichen vollmundigen Beute-Organismen9vermisst. Für die Arten Fütterung durch flüssige Einnahme oder für einige wirbellose Verbraucher, die ihre Nahrung vor der Einnahme, wie Amphipoden, intensiv zerkleinern ist visuelle Identifizierung von Beutetieren im Darminhalt unmöglich10. Aufgrund dieser Einschränkungen bietet die molekulare Analyse eine viel versprechende Alternative.
Molekulare Analysen haben jetzt ein gemeinsames Instrument ermöglicht schnelle und präzise Beute Nachweis im Darminhalt geworden. Solche Techniken sind vielfältig: Strategien basierend auf monoklonalen Antikörpern oder Polymerase-Kettenreaktion (PCR) werden häufig verwendet, wegen ihrer hohen Spezifität und Sensitivität11. Die Entwicklung von neuen monoklonalen Antikörpern ist Zeit- und kostenintensiv, daher die Anwendung der anderen molekularen Techniken ist nützlich, wenn Antikörper11nicht bereits vorhanden sind. Eine andere Möglichkeit ist die Verstärkung der Regionen der Desoxyribonukleinsäure (DNA), wie ribosomale Ribonukleinsäure (RNA) Gene bei den meisten Arten, universelle Grundierung mit12,13. Wenn Sie diese Technik verwenden, ist es oft nicht möglich, das gesamte Spektrum der Beute Organismen in verschiedenen Quellen von DNA-14zu identifizieren. Ein effektiver Ansatz, diesen Nachteil zu vermeiden setzt gruppenspezifischen Primer verwenden für genetische Darm Inhaltsanalysen. Entwickelt, um nur DNA-Abschnitte bestimmter Zielgruppen zu verstärken und schließen alle anderen Arten15,16, ermöglichen gruppenspezifischen Primer Beute Organismen auf der taxonomischen Ebene der angegebenen Gruppen ohne Zeit- und kostenintensive Sekundäranalysen. Wie alle Inhaltsanalyse ausnehmen, bieten solche Analysen jedoch nur eine Momentaufnahme der Fressverhalten. Daher gilt als Kombination von molekularen Darm Inhaltsanalysen mit Analysen von Zeit-Integration von natürliche Tracer (z. B. stabile Isotope) vorteilhaft1,2.
Hier beschreiben wir eine detaillierte Methode für PCR-basierte Untersuchungen der Räuber-Beute-Interaktionen mit gruppenspezifischen Primer-Sets für nukleare ribosomalen DNA (rDNA) Regionen mit stabilen Isotopen-Analysen der gleichen Probe kombiniert werden. Wir beschreiben den Nachweis der DNA des einzigen Beute Gruppen durch Agarose-Gelelektrophorese. Darüber hinaus präsentieren wir eine Gelegenheit für weitere nachgelagerte Analysen der PCR-Produkte von solchen gruppenspezifischen Primer anwendbar, wenn eine höhere taxonomische Auflösung als die Primer Spezifität erforderlich ist. Da einzelne stranded DNA (SsDNA) Form tertiären Konformationen, die durch ihre primäre Sequenz17bestimmt sind Fragmente, führen kleine Variationen in Fragmenten, die durch solche gruppenspezifischen Primer verstärkt zu Konformationsänderungen. Solche Änderungen können durch Einzelstrang Konformation Polymorphismus (SSCP) Analysen mit Polyacrylamid-Gele17,18, ermöglichen eine genauere Identifizierung der Beute Organismen (bis auf Artniveau) erkannt werden.
Während Agarose-Gelelektrophorese ist ein gemeinsamer und preiswerte Werkzeug, um DNA-Fragmente zu visualisieren und bestimmen ihre ungefähre Länge19, die Auflösung hängt von der DNA und der Färbung Farbstoff verwendet20. In der Regel die Visualisierung ist geradlinig beim Arbeiten mit reiner DNA-Proben, aber potenziell geringe Mengen an Beute DNA in den Darminhalt der Verbraucher kann das Punktesystem von Agarose-Gel-Elektrophorese-Ergebnisse erschweren. Dennoch diese Nachweismethode ist möglich, eine geringe Anzahl von Verbraucher-Proben aus dem Bereich für einen Bildschirm oder ein paar Beute Gruppen, aber Komplikation in der Wertung macht das Screening eine hohe Anzahl von Proben für mehrere Beute Taxa sehr Zeit intensiv und damit nicht praktikabel. Ein empfindlicher Nachweisverfahren ist die automatisierte Analyse von Fragmenten über Kapillarelektrophorese, wodurch zusätzlich die Bestimmung der genauen Länge des Fragmente21. Mehreren Mikrosatelliten basierten Studien haben gezeigt, dass mit unterschiedlichen Fluoreszenzfarbstoffen als Etiketten, es möglich ist zu erkennen und zu bestimmen, verschiedene Fragmente von vergleichbarer Länge durch automatisierte Fragment Analyse22,23, 24. Daher stellen wir auch ein detailliertes Protokoll für parallelen Detektion von DNA aus mehreren Beute Gruppen mittels PCR mit beschrifteten gruppenspezifischen Primer und Erkennung über automatisierte Fragment Analyse mit einem automatisierten Sequenzer. Darüber hinaus präsentieren wir die Ergebnisse aus einer Fallstudie demonstriert, dass die Erkennung von Beute DNA über automatisierte Fragment Analyse Ansatz ermöglicht auch eine relative Quantifizierung von angesaugte Beute.

<table><tbody><tr><td>flüssiger Stickstoff</td><td>Beliebig</td><td>NA</td><td>Für den Transport von Feldproben von Makroinvertebraten ins Labor.</td></tr><tr><td>1,5 ml Reaktionsgefäße - Safelock</td><td>Any</td><td>NA</td><td>Für die Entnahme von Verbraucherproben im Feld und die anschließende Konservierung in flüssigem Stickstoff müssen Reaktionsröhrchen nicht unbedingt PCR-sauber sein. Um ein Explodieren der Röhrchen zu vermeiden, sollte der Deckel der Röhrchen mit einer Nadel durchstochen werden.</td></tr><tr><td>Stereomikroskop</td><td>Beliebig</td><td>NA</td><td>Stellen Sie sicher, dass die Vergrößerung geeignet ist, um den Magen-Darm-Trakt der Größe des interessierenden Verbrauchers vorzubereiten.</td></tr><tr><td>Petrischalen</td><td>Beliebig</td><td>NA</td><td>Zum Sezieren des Magen-Darm-Trakts von Verbraucherproben unter dem Stereomikroskop.</td></tr><tr><td>Edelstahl-Foceps: Dumont Pinzette Nr. 7</td><td>Bioform</td><td>B40d</td><td>Diese gebogene Pinzette aus Edelstahl kann manchmal sehr leicht sein, um die Probe zwischen dem gebogenen Teil zu halten, ohne den Magen-Darm-Trakt zu durchstechen.</td></tr><tr><td>Edelstahl-Foceps: Dumont Pinzette Electronic Nr. 5</td><td>Bioform</td><td>B40b</td><td>Diese feine Edelstahl-Pinzette eignet sich hervorragend für die Aufbereitung des Magen-Darm-Trakts von Verbraucherproben.</td></tr><tr><td>DNA-ExitusPlus</td><td>AppliChem</td><td>A7409,1000RF</td><td>Dekontaminationslösung zur Entfernung von DNA- und RNA-Kontaminationen</td></tr><tr><td>fusselfreies Papiertuch</td><td>Jede</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>Laborwaage</td><td>Jede</td><td>NA</td><td>Die Genauigkeit muss mindestens 0,01 g betragen.</td></tr><tr><td>Mikroliter-Pipetten (0,5-10/10-100/50-200/100-1000 &mu; L)</td><td>Alle</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>Safe-Lock Röhrchen 2,0 ml</td><td>VWR</td><td>211-2165</td><td>Es ist entscheidend, dass diese Röhrchen frei von DNA, DNase, RNase und PCR-Inhibitoren sind (PCR clean)!</td></tr><tr><td>Safe-Lock Röhrchen 1,5 ml</td><td>VWR</td><td>211-2164</td><td>Es ist entscheidend, dass diese Röhrchen frei von DNA, DNase, RNase und PCR-Inhibitoren sind (PCR clean)!</td></tr><tr><td>Natriumchlorid &ge; 99,5%, p.a., ACS, ISO</td><td>Carlroth</td><td>3957.3</td><td>Für Salzextraktionspuffer (SEB) und 5M NaCl-Lösung, die für die Extraktion von DNA benötigt wird.</td></tr><tr><td>Tris(hydroxymethyl)-aminomethan Tris</td><td>carlroth</td><td>4855.2</td><td>Für Salzextraktionspuffer (SEB) und FSME-Puffer</td></tr><tr><td>Mikroliterpipetten (0,5-10/10-100/50-200/100-1000 &mu; L)</td><td>carlroth</td><td>8043.1</td><td>Für Salzextraktionspuffer (SEB) und FSME-Puffer</td></tr><tr><td>Borsäure &ge; 99,8 %, p.a., ACS, ISO</td><td>Carlroth</td><td>6943.2</td><td>Für TBE-Puffer. Nicht erforderlich, wenn kommerziell verfügbarer FSME-Puffer bezogen wird.</td></tr><tr><td>Natriumdodecylsulfat (SDS)</td><td>carlroth</td><td>4360.1</td><td>Zur Extraktion von DNA,</td></tr><tr><td>Proteinase K, Lyophil.</td><td>Carlroth</td><td>7528.1</td> Eine <td>Arbeitslösung mit einem Inhalt von 10 mg/ml herstellen.</td></tr><tr><td>TissueLyser II</td><td>Quiagen</td><td>85300</td><td>Kugelmühle zur Homogenisierung der Proben.</td></tr><tr><td>Edelstahlperlen, 5 mm</td><td>Quiagen</td><td>69989</td><td>Zum Homogenisieren von Proben.</td></tr><tr><td>Heizung Thermoshaker</td><td>Jeder</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>Vortex-Mischer</td><td>Jeder</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>Kühlzentrifuge: himac CT 15 RE</td><td>Hitachi</td><td>NA</td><td>Kühlzentrifuge für die Zentrifugation während der Extraktion von DNA (Protokoll 1).</td></tr><tr><td>Isopropanol</td><td>Carlroth</td><td>6752,5</td><td></td></tr><tr><td>Ethanol 99,8 %, p.a.</td><td></td><td></td><td>Jedes</td></tr> NA <tr><td>Wasser Molekularbiologisches Wasser (ddH2O)</td><td>AppliChem</td><td>A7398,1000</td><td>nukleasefreies (stromsterilisiertes und DEPC-behandeltes) Wasser, das zur Resuspension von DNA verwendet wird, und wann immer im Manuskript auf ddH2O Bezug genommen</td></tr><tr><td>wird Unmodifizierte Olegonukleotide</td><td>Eurofins MWG Operon</td><td>NA</td><td>Primer unmarkiert</td></tr><tr><td>Modifizierte Olegonukleotide</td><td>Metabion International AG</td><td>NA</td><td>Primer gelabelt</td></tr><tr><td>peqGOLD Taq all inclusive</td><td>VWR Peqlab</td><td>01-1000</td><td>Taq all inclusive für PCR-Reaktionsgemische (Reaktionspuffer Y und S, dNTPs und MgCl2)</td></tr><tr><td>Primus 96 advanced gradient thermocycler oder peqStar96x Universal Gradient</td><td>Peqlab</td><td>NA</td><td>Die Primer-Sets wurden ursprünglich auf einem Primus 96 Advanced Gradient Thermocycler erstellt. Da dieser Cycler schon recht alt war, haben wir dann mit dem peqSta96x (der auch das ältere Modell simulieren konnte) überprüft, ob unsere Primer-Sets unter den gleichen Bedingungen effizient und spezifisch sind. Tests haben jedoch gezeigt, dass unsere Primer gut funktionieren und immer noch spezifisch sind (vgl. Koester et al. 2013), ohne die Simulation der alten Maschine zu verwenden.</td></tr><tr><td>Standard 96-Well-PCR-Platten</td><td>VWR Peqlab</td><td>732-2879</td><td>Wird für PCR-Reaktionen verwendet.</td></tr><tr><td>Low Profile Tube Stripes 0,15 ml mit Flat Cap Stripes</td><td>VWR Peqlab</td><td>732-3223</td><td>Cap Stripes zum Verschließen der PCR-Platten.</td></tr><tr><td>Agarose</td><td>Peqlab</td><td>35-1020</td><td>Wird für die Gelelektrophorese verwendet.</td></tr><tr><td>Mikrowelle</td><td>Beliebig</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>Konuskolben</td><td>Beliebig</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>Messzylinder</td><td>Beliebig</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>Horizontale Elektrophoreseeinheit und entsprechende Kämme mit Zähnen</td><td>Beliebig</td><td>NA</td><td>Für die Agarose-Gelelektrophorese.</td></tr><tr><td>Elektrophorese-Netzteil PS3002</td><td>Life Technologies</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>Ethidiumbromidlösung 1 %</td><td>Carlroth</td><td>2218.1</td><td>Wird zur Herstellung eines Färbebades für Agarosegele verwendet.</td></tr><tr><td>Formamid</td><td>Carlroth</td><td>6749.1</td><td>Wird für den Denaturierungspuffer für SSCP-Analysen benötigt.</td></tr><tr><td>Bromphenolblau</td><td>AppliChem</td><td>A3640.0010</td><td>Wird für den Ladefarbstoff für die Agarose-Gelelektrophorese benötigt.</td></tr><tr><td>Saccharose</td><td>Carlroth</td><td>4621.1</td><td>Wird für den Ladefarbstoff für die Agarose-Gelelektrophorese benötigt.</td></tr><tr><td>100 bp-DNA-Leiter verlängertes</td><td>Carlroth</td><td>T835.1</td><td>Als Größenstandard für die Agarose-Gelelektrophorese.</td></tr><tr><td>UV-Dokumentationssystem</td><td>Beliebig</td><td>NA</td><td>Zur Visualisierung von Gelelektrophorese-Ergebnissen.</td></tr><tr><td>Rotiphorese NF-Acrylamid/Bis-Lösung 40 % (29:1)</td><td>Carlroth</td><td>A121.1</td><td>Zur Herstellung von Polyacrylamid-Gelen.</td></tr><tr><td>Ammoniumperoxydissulfat</td><td>Carlroth</td><td>9592.2</td><td>Zur Herstellung von Polyacrylamid-Gelen.</td></tr><tr><td>Foldback-Clips (32 mm)</td><td>Beliebig</td><td>NA</td><td>Für die Herstellung von Polyacrylamid-Gelen.</td></tr><tr><td>quadratische Kunststoffdose (21 x 6,5 x 5 cm)</td><td>Alle</td><td>NA</td><td>Zur Herstellung von Polyacrylamid-Gelen.</td></tr><tr><td>Tetramethylethylendiamin (TEMED)</td><td>carlroth</td><td>23.67.1</td><td>Zur Herstellung von Polyacrylamid-Gelen.</td></tr><tr><td>Becher</td><td>Any</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>RC 10 Digitaler Kühler</td><td>VWR</td><td>462-0138</td><td>Für SSCP-Analysen mittels Polyacrylamid-Gelelektrophorese.</td></tr><tr><td>Vertikale Elektrophoreseeinheit P10DS (OWL Separation Systems)</td><td>VWR</td><td>700-2361</td><td>Für SSCP-Analysen mittels Polyacrylamid-Gelelektrophorese.</td></tr><tr><td>Gekerbte Glasplatte</td><td>VWR</td><td>730-0261</td><td>Für SSCP-Analysen mittels Polyacrylamid-Gelelektrophorese.</td></tr><tr><td>Blinde Glasplatte</td><td>VWR</td><td>730-0260</td><td>Für SSCP-Analysen mittels Polyacrylamid-Gelelektrophorese.</td></tr><tr><td>Spacer</td><td>VWR</td><td>730-0262</td><td>Für SSCP-Analysen mittels Polyacrylamid-Gelelektrophorese.</td></tr><tr><td>Kamm mit 25 Zähnen</td><td>VWR</td><td>730-0294</td><td>Für SSCP-Analysen mittels Polyacrylamid-Gelelektrophorese.</td></tr><tr><td>Rüttelplattform</td><td>Beliebig</td><td>NA</td><td>Zum ständigen Schütteln des Färbebades.</td></tr><tr><td>GelStar Nukleinsäure-Fleck (Lonza Rockland, Inc.)</td><td>Biozym</td><td>850535 (50535)</td><td>Zum Färben von Polyacrylamid-Gelen.</td></tr><tr><td>GenomeLab DNA Size Standard Kit 400bp</td><td>AB Sciex</td><td>608098</td><td>Für automatisierte Fragmentanalysen. Größenstandard für Charge B.</td></tr><tr><td>GenomeLab DNA Size Standard Kit 600bp</td><td>AB Sciex</td><td>608095</td><td>Für automatisierte Fragmentanalysen. Größenstandard für Charge A.</td></tr><tr><td>Sample Loading Solution (SLS)</td><td>AB Sciex</td><td>608082</td><td>Für automatisierte Fragmentanalysen.</td></tr><tr><td>Sequenzierungsplatte - 96 Well Polypropylen-PCR-Mikroplatte</td><td>Costar</td><td>6551</td><td>Für automatisierte Fragmentanalysen.</td></tr><tr><td>Plattenzentrifuge, PerfectSpin P</td><td>VWR Peqlab</td><td>NA</td><td>Mini-Plattenzentrifuge zum Schleudern von PCR-Produkten.</td></tr><tr><td>Pufferplatte - 96 Well EIA/RIA Durchsichtiges Polystyrol mit flachem Boden, unbehandelte Mikroplatte</td><td>Corning</td><td>9017</td><td>Für automatisierte Fragmentanalysen.</td></tr><tr><td>GenomeLab Trennpuffer</td><td>AB Sciex</td><td>608012</td><td>Für automatisierte Fragmentanalysen.</td></tr><tr><td>Trenngel - LPAI</td><td>AB Sciex</td><td>608010</td><td>Für automatisierte Fragmentanalysen.</td></tr><tr><td>Sequenzer - CEQ8000 genetisches Analysesystem</td><td>Beckman Coulter</td><td>NA</td><td>Für automatisierte Fragmentanalysen.</td></tr><tr><td>GeneMarker V1.95</td><td>Softgenetics</td><td>NA</td><td>Zur Analyse der Ergebnisse automatisierter Fragmentanalysen.</td></tr></tbody></table>

laborprotokoll für genetische darm inhaltsanalysen der aquatischen makroinvertebraten using gruppenspezifische rdna primer

Laboratory Protocol for Genetic Gut Content Analyses of Aquatic Macroinvertebrates Using Group-specific rDNA Primers

Analyse von Nahrungsketten ist essentiell für ein besseres Verständnis von Ökosystemen. Nahrungsnetz-Interaktionen können zum Beispiel schwere Veränderungen verursacht durch die Invasion der nicht heimischer Arten unterziehen. Eine genaue Identifizierung der Feld-Räuber-Beute-Interaktionen ist jedoch in vielen Fällen schwierig. Diese Analysen basieren häufig auf eine visuelle Beurteilung der Darm Inhalt oder die Analyse der stabile Isotopenverhältnisse (δ15N und δ-13C). Solche Methoden erfordern umfassende Kenntnisse über, bzw. morphologische Vielfalt oder isotopische Unterzeichnung von einzelnen Beute Organismen, zu Hindernissen bei der genauen Identifizierung von Beute Organismen. Visuelle Darm Inhaltsanalysen unterschätzen besonders weichen vollmundigen Beute Organismen, weil Mazeration, Nahrungsaufnahme und Verdauung der Beute Organismen Identifizierung von spezifischen Arten erschweren. Daher Polymerase-Kettenreaktion (PCR) basierte Strategien, zum Beispiel die Verwendung von gruppenspezifischen Primer setzt, bieten ein leistungsfähiges Werkzeug für die Untersuchung von Nahrungsnetz-Interaktionen. Hier beschreiben wir ausführliche Protokolle zur Untersuchung der Darminhalt der Verbraucher denkt vom Feld mit gruppenspezifischen Primer-Sets für nukleare ribosomale Desoxyribonukleinsäure (rDNA). DNA kann entweder vom ganzen Exemplare (bei kleinen Taxa) extrahiert oder aus Darminhalt im Feld gesammelten Exemplare. Präsenz und Funktionstüchtigkeit der DNA Vorlagen direkt von der getesteten Person bestätigt werden müssen mit universal Primer setzt gezielt die jeweiligen Untereinheit der DNA. Wir zeigen auch, dass verbrauchte Beute bestimmt werden kann, weiter bis auf Artniveau über PCR mit unveränderten gruppenspezifischen Primer, verbunden mit nachfolgenden Einzelstrang Konformation Polymorphismus (SSCP) Analysen mittels Polyacrylamid-Gele. Darüber hinaus zeigen wir, dass die Verwendung von unterschiedlichen Fluoreszenzfarbstoffen als Etiketten parallel Screening für DNA-Fragmente unterschiedlicher Beute Gruppen aus mehreren Darm Inhalt Proben über automatisierte Fragment Analyse ermöglicht.

Wir haben erfolgreich in diesem Protokoll für Diät-Analysen im Rahmen verschiedener Studien beschriebenen Schritte. In diesem Abschnitt zeigen wir Beispiele beschreiben die Anwendbarkeit der einzelnen Abschnitte des Protokolls.
Als Beispiel um die Wirksamkeit von gruppenspezifischen Primer-Sets von der Autoren-28 und das Potenzial der nachgeschalteten Analysen der PCR-Produkte von SSCP Analysen, gegründet...

Am häufigsten Darm Inhaltsanalysen der Makroinvertebraten sind visuell. Intensive Kenntnisse über morphologische Vielfalt der Beute Organismen erfordern, sie vermissen weichen vollmundigen Beute und durch starke Zerkleinerung von Beute, sind fast unmöglich für einige Organismen, einschließlich Amphipoden. Wir bieten detaillierte, neuartigen gentechnische Ansätze für Soisgrabenbaches Identifikation in der Ernährung der Amphipoden Beute.

Laborprotokoll für genetische Darm Inhaltsanalysen der aquatischen Makroinvertebraten Using gruppenspezifische rDNA Primer

Analyzing food webs is essential for a better understanding of ecosystems. For example, food web interactions can undergo severe changes caused by the ...

Das übergeordnete Ziel dieses Protokolls besteht darin, Untersuchungen der trophischen Ökologie, insbesondere an Feldproben, zu verbessern. Diese Methode kann helfen, zentrale Fragen im Bereich der Nahrungsnetzökologie zu beantworten, beispielsweise den Einfluss invasiver Arten auf trophische Interaktionen. Der Hauptvorteil liegt in der zusätzlichen Anwendbarkeit für zeitlich integrierende trophische Analysen an exakt denselben Proben und darin, dass sie praktisch von jedem Ökologen angewendet werden kann.Obwohl wir diesen Ansatz entwickelt haben, um Einblicke in die Beuteaufnahme aquatischer Konsumenten zu erhalten, kann er auch für andere Zwecke angewendet werden, beispielsweise um die Artzusammensetzung in Proben benthischer makroskopischer Wirbelloser zu bestimmen. Den Ablauf wird Christian Sodemann, ein Techniker aus unserem Labor, demonstrieren. Um dieses Experiment zu beginnen, überführen Sie den zuvor dissezierten gastrointestinalen Trakt des Räubers in eine zwei-Milliliter-Safe-Lock-Reaktionsröhre, die 440 Mikroliter Salz-Extraktionspuffer enthält.Gefrieren Sie die Proben sofort bei minus 20 Grad Celsius ein, bis die DNA-Extraktion erfolgt. Nach dem Entnehmen der Proben au

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Research

Forschung

JoVE Journal

Biology

Biologie

Diese Publikation beschreibt, wie die Agilent Fischarten Identification System verwenden, um die Arten der Fische durch Extraktion von DNA und Durchführung von PCR und RFLP-Analyse zu identifizieren.

DNA-basierte Fischarten Identification Protocol

Die aktive Bakteriengemeinschaft mit dem Darm von Spodoptera littoralis verbunden sind, wurde von stabilen Isotopen-Probing (SIP) zu Pyrosequenzierung gekoppelt bestimmt. Mit dieser Methode wurde die Identifizierung der metabolisch aktiven Bakterienarten innerhalb der Gemeinde mit hoher Auflösung und Genauigkeit durchgeführt.

Bezeichnung des metabolisch aktiven Bakterien im Darm der Generalist<em&gt; Spodoptera littoralis</em&gt; Über DNA Stable Isotope Probing Mit<sup&gt; 13</sup&gt; C-Glucose

PCR in Kombination mit hochauflösenden Schmelzanalyse (HRMA) als schnelle und effiziente Methode, um Zebrafisch-Genotyp nachgewiesen.

Schnelle und effiziente Verwendung von Zebrafisch-Genotypisierung PCR mit Hochauflösende Schmelzanalyse

Ein Protokoll zur Quantifizierung von bakteriellen 16S rRNA-Genen und Transkripten aus Küstensedimenten mittels Echtzeit-PCR wird bereitgestellt. Die Methodik umfasst die Co-Extraktion von DNA und RNA; Herstellung von DNA-freier RNA; und Quantifizierung von 16S rRNA-Genen und -Transkripten mittels RT-q-PCR, einschließlich Standardkurvenkonstruktion.

Gleichzeitige DNA-RNA-Extraktion aus Küstensedimenten und Quantifizierung von 16S rRNA-Gene und Transkripte von Real-time PCR

Wir stellen ein Protokoll für die funktionelle Bewertung umfassender single-site Sättigungsmutagenese Bibliotheken von Proteinen Hochdurchsatz-Sequenzierung verwendet. Wichtig ist, nutzt dieser Ansatz orthogonalen Primerpaare Bibliothek Konstruktion und Sequenzierung zu multiplexen. Repräsentative Ergebnisse unter Verwendung von TEM-1 β-Lactamase in klinisch relevanter Dosierung von Ampicillin ausgewählt werden bereitgestellt.

Ein Protokoll für Functional Assessment of Whole-Protein Sättigungsmutagenese-Bibliotheken mit Hilfe von High-Throughput Sequencing

Dieses Manuskript beschreibt ein detaillierte standardisierte Protokoll von Hochdurchsatz-16 s rRNA-Amplifikate Sequenzierung. Das Protokoll stellt eine integrierte, uniformierte Machbare und preiswerte Protokoll Kotprobe Sammlung durch Datenanalysen ab. Dieses Protokoll ermöglicht die Analyse einer großen Anzahl von Proben mit strengen Standards und mehrere Steuerelemente.

Geführte Protokoll für fäkale mikrobielle Charakterisierung von 16 s rRNA-Amplifikate Sequenzierung

Hier beschreiben wir ein Protokoll zur Amplikons Sequenzdaten von Boden, Rhizosphäre und Wurzel Endosphere mikrobiome zu erhalten. Diese Informationen kann verwendet werden, um die Zusammensetzung und Vielfalt der Anlage verbundenen mikrobieller Gemeinschaften zu untersuchen, und eignet sich für den Einsatz mit einer Vielzahl von Pflanzenarten.

Die Wurzel Mikrobiom zu erkunden: Extrahieren von Bakteriengemeinschaft Daten aus dem Boden, die Rhizosphäre und die Wurzel Endosphere

Zebrafisch wurden als zuverlässige genetische Modellorganismen in der biomedizinischen Forschung, vor allem mit dem Aufkommen von Gen-Bearbeitung Technologien verwendet. Wenn Larven Phänotypen zu erwarten sind, kann DNA-Extraktion und Genotyp Identifizierung schwierig sein. Hier beschreiben wir eine effiziente Genotypisierung Verfahren für zebrafischlarven durch Rute zuschneiden, so früh wie 72 h nach Befruchtung.

Hochdurchsatz-DNA-Extraktion und Genotypisierung von 3dpf Zebrafischlarven durch Fin Clipping

Dieses Protokoll beschreibt einen effektiven In-situ-Hybridisierungsansatz, um die mRNA-Expressionsniveaus und räumlichen Muster von Zielgenen in Sipunculus nudus coelomic Fluid zu erkennen.

In situ Hybridisierung für Sipunculus nudus Coelomic Fluid

Umwelt-DNA-Assays erfordern eine strenge Konzeption, Prüfung, Optimierung und Validierung, bevor mit der Erfassung von Felddaten begonnen werden kann. Hier stellen wir ein Protokoll vor, um Benutzer durch jeden Schritt der Entwicklung eines artspezifischen, sonsonenbasierten qPCR-Tests zum Nachweis und zur Quantifizierung einer Zielart-DNA aus Umweltproben zu führen.

Entwicklung und Prüfung artspezifischer quantitativer PCR-Assays für Umwelt-DNA-Anwendungen

Das Protokoll erkennt wichtige Gene für den Methankreislauf in den Feuchtgebieten der südtexanischen Küste und visualisiert ihre räumliche Verteilung, um das Verständnis der Methanregulierung und ihrer Umweltauswirkungen in diesen dynamischen Ökosystemen zu verbessern.

Wir danken den C-REAL-Mitgliedern für ihre Unterstützung bei der Feldbeobachtung und bei Laboranalysen.Visualisierung der mikrobiellen Dynamik des Methankreislaufs in Küstenfeuchtgebieten

Lernen Sie genetische Methoden zur Analyse von Darmproben bei aquatischen Makroinvertebraten zur Untersuchung trophischer Interaktionen und Nahrungsnetzökologie. Diese Technik ermöglicht präzisere Beutediagnose als visuelle Verfahren.

Laborprotokoll für genetische Darm Inhaltsanalysen der aquatischen Makroinvertebraten Using gruppenspezifische rDNA Primer

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