Hochdurchsatz-Identifizierung des Gens regulatorischen Sequenzen mit Next-Generation Sequenzierung der kreisförmigen Chromosom Konformation erfassen (4C-Seq)

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5. Oktober 2018

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Die Kennung der physikalischen Wechselwirkungen zwischen Genen und regulatorische Elemente ist anspruchsvoll aber erfassen Bezahlungsmethode Chromosom Konformation erleichtert worden. Diese Modifikation des 4C-Seq-Protokolls mildert PCR Bias durch Minimierung der Überverstärkung PCR-Vorlagen und maximiert die Mappability von Lesevorgängen durch den Einbau eines Zusatz Restriktionsenzym verdauen Schritt.

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4C-seq-Protokoll

Chapters in this video

0:04

Titel

0:45

Formaldehyd-Quervernetzung und Zelllyse

1:59

Erste Restriktionsverdauung und erste Ligation

5:07

Umkehrung der Quervernetzung, Chromatin-Isolierung und weitere Analysen

7:42

Ergebnisse: Repräsentativer genomischer Track der 4C-seq-Read-Abdeckung

8:29

Fazit

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