Methylated RNA Immunoprecipitation Assay to Study m<sup>5</sup>C Modification in Arabidopsis

Eleftheria Saplaoura; Valentina Perrera; Vincent Colot; Friedrich Kragler

doi:10.3791/61231

Journal

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Genetik

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Methylierte RNA-Immunpräzipitierung Assay zur Studie m⁵C Modifikation bei Arabidopsis

Methylated RNA Immunoprecipitation Assay to Study m<sup>5</sup>C Modification in Arabidopsis

JoVE Journal
Genetik

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Methylated RNA Immunoprecipitation Assay to Study m⁵C Modification in Arabidopsis

Methylierte RNA-Immunpräzipitierung Assay zur Studie m⁵C Modifikation bei Arabidopsis

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08:50 min

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May 14, 2020

DOI:

10.3791/61231-v

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10.3791/61231-v

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May 14, 2020

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Eleftheria Saplaoura*¹, Valentina Perrera*², Vincent Colot³, Friedrich Kragler¹

¹Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology ²Department of Molecular Medicine, Medical School,University of Padua ³Biologie de l’Ecole Normale Supérieure (IBENS), Paris, France

Summary

Der methylierte RNA-Immunpräzipitationstest ist eine Antikörper-basierte Methode zur Anreicherung für methylierte RNA-Fragmente. Gekoppelt mit einer tiefen Sequenzierung führt dies zur Identifizierung von Transkripten, die die m⁵C-Modifikation tragen.