Ein standardisiertes Verfahren zur Überwachung schädlicher Algenblüten in Chile durch Metabarcoding-Analyse

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26. August 2021

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Kyoko Yarimizu¹ , So Fujiyoshi¹ , Mikihiko Kawai² , Jacquelinne J. Acuña³ , Joaquin-Ignacio Rilling³ , Marco Campos³ , Jonnathan Vilugrón⁴ , Henry Cameron⁵ , Karen Vergara⁶ , Gonzalo Gajardo⁶ , Oscar Espinoza-González⁴ , Leonardo Guzmán⁴ , Satoshi Nagai⁷ , Carlos Riquelme⁵ , Milko A. Jorquera³ , Fumito Maruyama¹

¹Office of Research and Academia-Government-Community Collaboration, Hiroshima University, ²Graduate School of Human and Environmental Studies, Kyoto University, ³Scientific and Biotechnological Bioresource Nucleus, Universidad de La Frontera, ⁴Centro de Estudios de Algas Nocivas, Instituto de Fomento Pesquero, ⁵Ciencias del Mar y Recursos Biologicos, Universidad de Antofagasta, ⁶Departamento de Ciencias Biológicas y Biodiversidad, Universidad de Los Lagos, ⁷Japan Fisheries Research and Education Agency, Fisheries Resources Institute

Dieses Protokoll führt Schritte der Metabarcoding-Analyse ein, die auf 16S rRNA- und 18S rRNA-Gene abzielen, um schädliche Algenblüten und ihr assoziiertes Mikrobiom in Meerwasserproben zu überwachen. Es ist ein leistungsfähiges molekulares Werkzeug, erfordert aber mehrere Verfahren, die hier Schritt für Schritt visuell erklärt werden.