Analyse der transgenerationalen epigenetischen Vererbung in C. elegans mittels Fluoreszenzreporter und Chromatin-Immunpräzipitation (ChIP)

Die Forschung in unserem Labor untersucht, wie Chromatin-assoziierte Proteine, Histonmodifikationen und kleine RNA-Signalwegfaktoren im Zusammenhang mit der Entwicklung und der transgenerationalen epigenetischen Vererbung zusammenarbeiten. Der RNA-Vererbungsassay mit einem GFP-Reporter hat sich zu einem sehr leistungsfähigen Werkzeug entwickelt. Dieses Protokoll beschreibt, wie die Vorbereitung, Bewertung und Passage von Würmern sowie die Vorbereitung von ChIP-Proben standardisiert werden können, was dazu beitragen kann, reproduzierbare Ergebnisse zu erzielen.

Eine der experimentellen Herausforderungen bei der Untersuchung von Keimbahn-exprimierten Transgenen ist die Isolierung der Effekte in der Keimbahn des Tieres. Wir verwenden derzeit ganze Tiere für ChIP, aber in Zukunft möchten wir Assays entwickeln, um Chromatin, insbesondere in der Keimbahn, zu untersuchen. Unser Labor interessiert sich für die Histonmethylierung und Proteine, die diese Markierungen erkennen.

In Zukunft möchten wir das Zusammenspiel zwischen diesen Chromatin-Readern und kleinen RNA-Signalwegen im Zusammenhang mit der RNAi-Vererbung an Transgenen und der Regulation endogener Sequenzen untersuchen.