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Glykan-Protein-Wechselwirkungen entwirren: Kernspinresonanz (NMR) als Rettung
Glykan-Protein-Wechselwirkungen entwirren: Kernspinresonanz (NMR) als Rettung
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JoVE Journal Chemistry
Disentangling Glycan-Protein Interactions: Nuclear Magnetic Resonance (NMR) to the Rescue

Glykan-Protein-Wechselwirkungen entwirren: Kernspinresonanz (NMR) als Rettung

Full Text
2,011 Views
07:40 min
May 17, 2024

DOI: 10.3791/66530-v

Sara Bertuzzi1, Ana Poveda1, Ana Ardá1,2, Ana Gimeno1,2, Jesús Jiménez-Barbero1,2,3

1CIC bioGUNE, Basque Research and Technology Alliance (BRTA), 2lkerbasque, Basque Foundation for Science, 3Centro de Investigacion Biomedica En Red de Enfermedades Respiratorias

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Hier stellen wir ein Protokoll vor, das die Erfassung, Verarbeitung und Analyse einer Reihe von NMR-Experimenten zur Charakterisierung von Protein-Glykan-Wechselwirkungen in Lösung beschreibt. Es werden die gängigsten ligandenbasierten und proteinbasierten Methoden skizziert, die zweifellos zu den Bereichen der strukturellen Glykobiologie und der molekularen Erkennungsstudien beitragen.

Unsere Forschung befasst sich mit der Erforschung verschiedener Glykan-Lektin-Systeme und erforscht ihre Verbindungen zu Gesundheit und Krankheit. Wir haben Methoden aus Chemie, Biologie und Biomedizin zusammengeführt, um die Rolle bei der Immunantwort auf Pathologen von Krebs bis hin zu bakteriellen und viralen Infektionen eingehend zu untersuchen. In jüngster Zeit haben die Glykowissenschaften bahnbrechende Meilensteine gesetzt, indem sie das Glykandesign, die Synthese und die Analyse von Aspekten der strukturellen molekularen Erkennung von der atomaren auf die zelluläre Ebene transformiert haben.

Diese Fortschritte bilden zusammen die Voraussetzungen für fluoreszierende oder neuartige Glykan-basierte Therapien. Dieses Protokoll beschreibt die Verfahren zum Erfassen, Verarbeiten und Analysieren von zwei der leistungsstärksten NMR-Methoden, die im Glykanbereich eingesetzt werden. Diese Methoden, die Sättigungstransferdifferenz und die chemisch sichere Störungsanalyse bieten ergänzend genaue Informationen über die strukturellen und dynamischen Aspekte der molekularen Erkennung von Flechten.

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Schlüsselwörter: Glykan-Protein-Wechselwirkungen Kernspinresonanz (NMR) Sättigungstransferdifferenz (STD) heteronukleare Einzelquantenkohärenz (HSQC) molekulare Erkennung chemische Glykobiologie

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