Name: Erfassung häufiger fragiler Stellenbrüche durch natives γH2A. X ChIP (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-01-24T14:20:00.000+00:00
Duration: 9 min 46 s
Description: Erfahren Sie eine optimierte native γH2A.X-ChIP-Methode zur effizienten Detektion häufiger fragiler Stellenbrüche in Krebszellen. Diese Technik reduziert Zeit und Arbeitsaufwand bei hoher Reproduzierbarkeit.

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<ol><li>Glover, T. W., Berger, C., Coyle, J., Echo, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+polymerase+alpha+inhibition+by+aphidicolin+induces+gaps+and+breaks+at+common+fragile+sites+in+human+chromosomes%5BTitle%5D)+AND+%22Hum+Genet%22%5BJournal%5D)">DNA polymerase alpha inhibition by aphidicolin induces gaps and breaks at common fragile sites in human chromosomes.</a> Hum Genet. 67 (2), 136-142 (1984).</li>
<li>Bignell, G. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Signatures+of+mutation+and+selection+in+the+cancer+genome%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Signatures of mutation and selection in the cancer genome.</a> Nature. 463 (7283), 893-898 (2010).</li>
<li>Hellman, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+role+for+common+fragile+site+induction+in+amplification+of+human+oncogenes%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Cell%22%5BJournal%5D)">A role for common fragile site induction in amplification of human oncogenes.</a> Cancer Cell. 1 (1), 89-97 (2002).</li>
<li>Kotzot, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Parental+origin+and+mechanisms+of+formation+of+cytogenetically+recognisable+de+novo+direct+and+inverted+duplications%5BTitle%5D)+AND+%22J+Med+Genet%22%5BJournal%5D)">Parental origin and mechanisms of formation of cytogenetically recognisable de novo direct and inverted duplications.</a> J Med Genet. 37 (4), 281-286 (2000).</li>
<li>Miller, C. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genomic+amplification+of+MET+with+boundaries+within+fragile+site+FRA7G+and+upregulation+of+MET+pathways+in+esophageal+adenocarcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Oncogene%22%5BJournal%5D)">Genomic amplification of MET with boundaries within fragile site FRA7G and upregulation of MET pathways in esophageal adenocarcinoma.</a> Oncogene. 25 (3), 409-418 (2006).</li>
<li>Zack, T. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pan-cancer+patterns+of+somatic+copy+number+alteration%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">Pan-cancer patterns of somatic copy number alteration.</a> Nat Genet. 45 (10), 1134-1140 (2013).</li>
<li>Gao, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Common+fragile+sites+%28CFS%29+and+extremely+large+CFS+genes+are+targets+for+human+papillomavirus+integrations+and+chromosome+rearrangements+in+oropharyngeal+squamous+cell+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Chromosomes+Cancer%22%5BJournal%5D)">Common fragile sites (CFS) and extremely large CFS genes are targets for human papillomavirus integrations and chromosome rearrangements in oropharyngeal squamous cell carcinoma.</a> Genes Chromosomes Cancer. 56 (1), 59-74 (2017).</li>
<li>Thorland, E. C., Myers, S. L., Gostout, B. S., Smith, D. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Common+fragile+sites+are+preferential+targets+for+HPV16+integrations+in+cervical+tumors%5BTitle%5D)+AND+%22Oncogene%22%5BJournal%5D)">Common fragile sites are preferential targets for HPV16 integrations in cervical tumors.</a> Oncogene. 22 (8), 1225-1377 (2003).</li>
<li>Matovina, M., Sabol, I., Grubisić, G., Gasperov, N. M., Grce, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+human+papillomavirus+type+16+integration+sites+in+high-grade+precancerous+cervical+lesions%5BTitle%5D)+AND+%22Gynecol+Oncol%22%5BJournal%5D)">Identification of human papillomavirus type 16 integration sites in high-grade precancerous cervical lesions.</a> Gynecol Oncol. 113 (1), 120-127 (2009).</li>
<li>Yu, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+role+of+viral+integration+in+the+development+of+cervical+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Genet+Cytogenet%22%5BJournal%5D)">The role of viral integration in the development of cervical cancer.</a> Cancer Genet Cytogenet. 158 (1), 27-34 (2005).</li>
<li>Bignell, G. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Signatures+of+mutation+and+selection+in+the+cancer+genome%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Signatures of mutation and selection in the cancer genome.</a> Nature. 463 (7283), 893-898 (2010).</li>
<li>Thavathiru, E., Ludes-Meyers, J. H., MacLeod, M. C., Aldaz, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+of+common+chromosomal+fragile+site+genes%2C+WWOX%2FFRA16D+and+FHIT%2FFRA3B+is+downregulated+by+exposure+to+environmental+carcinogens%2C+UV%2C+and+BPDE+but+not+by+IR%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Carcinog%22%5BJournal%5D)">Expression of common chromosomal fragile site genes, WWOX/FRA16D and FHIT/FRA3B is downregulated by exposure to environmental carcinogens, UV, and BPDE but not by IR.</a> Mol Carcinog. 44 (3), 174-182 (2005).</li>
<li>Sirbu, B. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+protein+dynamics+at+active%2C+stalled%2C+and+collapsed+replication+forks%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Dev%22%5BJournal%5D)">Analysis of protein dynamics at active, stalled, and collapsed replication forks.</a> Genes Dev. 25 (12), 1320-1327 (2011).</li>
<li>Barlow, J. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+early+replicating+fragile+sites+that+contribute+to+genome+instability%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Identification of early replicating fragile sites that contribute to genome instability.</a> Cell. 152 (3), 620-632 (2013).</li>
<li>Petermann, E., Orta, M. L., Issaeva, N., Schultz, N., Helleday, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hydroxyurea-stalled+replication+forks+become+progressively+inactivated+and+require+two+different+RAD51-mediated+pathways+for+restart+and+repair%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">Hydroxyurea-stalled replication forks become progressively inactivated and require two different RAD51-mediated pathways for restart and repair.</a> Mol Cell. 37 (4), 492-502 (2010).</li>
<li>Rogakou, E. P., Pilch, D. R., Orr, A. H., Ivanova, V. S., Bonner, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+double-stranded+breaks+induce+histone+H2AX+phosphorylation+on+serine+139%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">DNA double-stranded breaks induce histone H2AX phosphorylation on serine 139.</a> J Biol Chem. 273 (10), 5858-5868 (1998).</li>
<li>Shanbhag, N. M., Rafalska-Metcalf, I. U., Balane-Bolivar, C., Janicki, S. M., Greenberg, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ATM-dependent+chromatin+changes+silence+transcription+in+cis+to+DNA+double-strand+breaks%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">ATM-dependent chromatin changes silence transcription in cis to DNA double-strand breaks.</a> Cell. 141 (6), 970-981 (2010).</li>
<li>Stiff, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ATR-dependent+phosphorylation+and+activation+of+ATM+in+response+to+UV+treatment+or+replication+fork+stalling%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">ATR-dependent phosphorylation and activation of ATM in response to UV treatment or replication fork stalling.</a> EMBO J. 25 (24), 5775-5782 (2006).</li>
<li>Nelson, J. D., Denisenko, O., Bomsztyk, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fast+chromatin+immunoprecipitation+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Nuc+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Fast chromatin immunoprecipitation assay.</a> Nuc Acids Res. 34 (5), e2(2006).</li>
<li>Dorbic, T., Wittig, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+of+oligonucleosomes+from+active+chromatin+using+HMG17-specific+monoclonal+antibodies%5BTitle%5D)+AND+%22Nuc+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Isolation of oligonucleosomes from active chromatin using HMG17-specific monoclonal antibodies.</a> Nuc Acids Res. 14 (8), 3363-3376 (1986).</li>
<li>Dorbic, T., Wittig, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+from+transcribed+genes+contains+HMG17+only+downstream+from+the+starting+point+of+transcription%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Chromatin from transcribed genes contains HMG17 only downstream from the starting point of transcription.</a> EMBO J. 6 (8), 2393-2399 (1987).</li>
<li>Hebbes, T. R., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+direct+link+between+core+histone+acetylation+and+transcriptionally+active+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">A direct link between core histone acetylation and transcriptionally active chromatin.</a> EMBO J. 7 (5), 1395-1402 (1988).</li>
<li>Hebbes, T. R., Thorne, A. W., Clayton, A. L., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histone+acetylation+and+globin+gene+switching%5BTitle%5D)+AND+%22Nuc+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Histone acetylation and globin gene switching.</a> Nuc Acids Res. 20 (5), 1017-1022 (1992).</li>
<li>Hebbes, T. R., Clayton, A. L., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Core+histone+hyperacetylation+co-maps+with+generalized+DNase+I+sensitivity+in+the+chicken+beta-globin+chromosomal+domain%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Core histone hyperacetylation co-maps with generalized DNase I sensitivity in the chicken beta-globin chromosomal domain.</a> EMBO J. 13 (8), 1823-1830 (1994).</li>
<li>Orlando, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mapping+chromosomal+proteins+in+vivo+by+formaldehyde-crosslinked-chromatin+immunoprecipitation%5BTitle%5D)+AND+%22Trend+Biochem%2C+Sci%22%5BJournal%5D)">Mapping chromosomal proteins in vivo by formaldehyde-crosslinked-chromatin immunoprecipitation.</a> Trend Biochem, Sci. 25 (3), 99-104 (2000).</li>
<li>Myers, F. A., Evans, D. R., Clayton, A. L., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targeted+and+extended+acetylation+of+histones+H4+and+H3+at+active+and+inactive+genes+in+chicken+embryo+erythrocytes%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Targeted and extended acetylation of histones H4 and H3 at active and inactive genes in chicken embryo erythrocytes.</a> J Biol Chem. 276 (23), 20197-20205 (2001).</li>
<li>Litt, M. D., Simpson, M., Recillas-Targa, F., Prioleau, M. N., Felsenfeld, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transitions+in+histone+acetylation+reveal+boundaries+of+three+separately+regulated+neighboring+loci%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Transitions in histone acetylation reveal boundaries of three separately regulated neighboring loci.</a> EMBO J. 20 (9), 2224-2235 (2001).</li>
<li>Madisen, L., Krumm, A., Hebbes, T. R., Groudine, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+immunoglobulin+heavy+chain+locus+control+region+increases+histone+acetylation+along+linked+c-myc+genes%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">The immunoglobulin heavy chain locus control region increases histone acetylation along linked c-myc genes.</a> Mol Cell Biol. 18 (11), 6281-6292 (1998).</li>
<li>Clayton, A. L., Hebbes, T. R., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histone+acetylation+and+gene+induction+in+human+cells%5BTitle%5D)+AND+%22FEBS+Lett%22%5BJournal%5D)">Histone acetylation and gene induction in human cells.</a> FEBS Lett. 336 (1), 23-26 (1993).</li>
<li>Tseng, Z., Wu, T., Liu, Y., Zhong, M., Xiao, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Using+native+chromatin+immunoprecipitation+to+interrogate+histone+variant+protein+deposition+in+embryonic+stem+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Using native chromatin immunoprecipitation to interrogate histone variant protein deposition in embryonic stem cells.</a> Methods Mol Biol. 1176, 11-22 (2014).</li>
<li>Durkin, S. G., Glover, T. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromosome+fragile+sites%5BTitle%5D)+AND+%22Ann+Rev+Genetics%22%5BJournal%5D)">Chromosome fragile sites.</a> Ann Rev Genetics. 41, 169-192 (2007).</li>
<li>Lee, J. B., Keung, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+immunoprecipitation+in+human+and+yeast+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Chromatin immunoprecipitation in human and yeast cells.</a> Methods Mol Biol. 1767, 257-269 (2018).</li>
<li>Miyamoto, R., Yokoyama, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protocol+for+fractionation-assisted+native+ChIP+%28fanChIP%29+to+capture+protein-protein%2FDNA+interactions+on+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22STAR+Protoc%22%5BJournal%5D)">Protocol for fractionation-assisted native ChIP (fanChIP) to capture protein-protein/DNA interactions on chromatin.</a> STAR Protoc. 2 (2), 100404(2021).</li>
<li>Mendez, J., Stillman, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+association+of+human+origin+recognition+complex%2C+cdc6%2C+and+minichromosome+maintenance+proteins+during+the+cell+cycle%3A+Assembly+of+prereplication+complexes+in+late+mitosis%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Chromatin association of human origin recognition complex, cdc6, and minichromosome maintenance proteins during the cell cycle: Assembly of prereplication complexes in late mitosis.</a> Mol Cell Biol. 20 (22), 8602-8612 (2000).</li>
<li>Nowak, D. E., Tian, B., Brasier, A. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two-step+cross-linking+method+for+identification+of+NF-%CE%BAB+gene+network+by+chromatin+immunoprecipitation%5BTitle%5D)+AND+%22BioTechniques%22%5BJournal%5D)">Two-step cross-linking method for identification of NF-κB gene network by chromatin immunoprecipitation.</a> BioTechniques. 39 (5), 715-725 (2005).</li>
<li>Schmittgen, T. D., Livak, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analyzing+real-time+PCR+data+by+the+comparative+C%28T%29+method%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Analyzing real-time PCR data by the comparative C(T) method.</a> Nat Protoc. 3 (6), 1101-1108 (2008).</li>
<li>Lu, X., Parvathaneni, S., Hara, T., Lal, A., Sharma, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Replication+stress+induces+specific+enrichment+of+RECQ1+at+common+fragile+sites+FRA3B+and+FRA16D%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cancer%22%5BJournal%5D)">Replication stress induces specific enrichment of RECQ1 at common fragile sites FRA3B and FRA16D.</a> Mol Cancer. 12, 29(2013).</li>
<li>Ruijter, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Amplification+efficiency%3A+linking+baseline+and+bias+in+the+analysis+of+quantitative+PCR+data%5BTitle%5D)+AND+%22Nucl+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Amplification efficiency: linking baseline and bias in the analysis of quantitative PCR data.</a> Nucl Acids Res. 37 (6), e45(2009).</li>
<li>Lyu, X., Chastain, M., Chai, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+mapping+and+profiling+of+%CE%B3H2AX+binding+hotspots+in+response+to+different+replication+stress+inducers%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Genome-wide mapping and profiling of γH2AX binding hotspots in response to different replication stress inducers.</a> BMC Genomics. 20, 579(2019).</li>
<li>Farmer, P. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+epidemiology+studies+of+carcinogenic+environmental+pollutants.+Effects+of+polycyclic+aromatic+hydrocarbons+%28PAHs%29+in+environmental+pollution+on+exogenous+and+oxidative+DNA+damage%5BTitle%5D)+AND+%22Mutat+Res%22%5BJournal%5D)">Molecular epidemiology studies of carcinogenic environmental pollutants. Effects of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) in environmental pollution on exogenous and oxidative DNA damage.</a> Mutat Res. 544 (2-3), 397-402 (2003).</li>
<li>Phillips, D. H., Arlt, V. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genotoxicity%3A+damage+to+DNA+and+its+consequences%5BTitle%5D)+AND+%22EXS%22%5BJournal%5D)">Genotoxicity: damage to DNA and its consequences.</a> EXS. 99, 87-110 (2009).</li>
<li>Nitsch, S., Schneider, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Native+ChIP%3A+Studying+the+genome-wide+distribution+of+histone+modifications+in+cells+and+tissue%5BTitle%5D)+AND+%22Meth+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Native ChIP: Studying the genome-wide distribution of histone modifications in cells and tissue.</a> Meth Mol Biol. 2846, (2024).</li>
<li>Nikitina, T., Wang, D., Gomberg, M., Grigoryev, S. A., Zhurkin, V. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Combined+micrococcal+nuclease+and+exonuclease+III+digestion+reveals+precise+positions+of+the+nucleosome+core%2Flinker+junctions%3A+implications+for+high-resolution+nucleosome+mapping%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Combined micrococcal nuclease and exonuclease III digestion reveals precise positions of the nucleosome core/linker junctions: implications for high-resolution nucleosome mapping.</a> J Mol Biol. 425 (11), 1946-1960 (2013).</li>
<li>Teves, S. S., Henikoff, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Salt+fractionation+of+nucleosomes+for+genome-wide+profiling%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Salt fractionation of nucleosomes for genome-wide profiling.</a> Methods Mol Biol. 833, 421-432 (2012).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>0,2 &Mikro; M Nitrozellulose-Membran</td><td>Amersham</td><td>10600011</td><td></td></tr><tr><td>Aktin B</td><td>Proteintech</td><td>Artikel-Nr.: 20536-1-AP</td><td></td></tr><tr><td>Aphidicolin</td><td>MedChemExpress</td><td>HY-N6733</td><td></td></tr><tr><td>Magnetische Protein A/G-Kügelchen in ChIP-Qualität</td><td>ThermoFisher</td><td>26162</td><td></td></tr><tr><td>Clarity Western ECL-Substrat</td><td>Bio-Rad</td><td>#1705061</td><td></td></tr><tr><td>Glykogen, molekularbiologische Qualität</td><td>ThermoFisher</td><td>Katze. Nr.&nbsp; Nr. R0561</td><td></td></tr><tr><td>HRP-konjugierter Sekundärantikörper&nbsp;</td><td>Proteintech</td><td>SA00001-2</td><td></td></tr><tr><td>Hydroxyharnstoff&nbsp;</td><td>MedChemExpress</td><td>HY-B0313</td><td></td></tr><tr><td>Mikrokokken-Nuklease&nbsp;</td><td>SCHNABEL</td><td>M0247S</td><td></td></tr><tr><td>normales IgG&nbsp;</td><td>Santa Cruz</td><td>SC-2025</td><td></td></tr><tr><td>Taq Universal SYBR Grün Supermix&nbsp;</td><td>BioRad</td><td>1725120</td><td></td></tr><tr><td>&Gamma; H2A. X Antikörper&nbsp; (für ChIP)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>05-636</td><td></td></tr><tr><td>&Gamma; H2A. X-Antikörper (für WB)</td><td>Zelluläre Signalübertragung</td><td>#25955</td><td></td></tr></tbody></table>

erfassung häufiger fragiler stellenbrüche durch natives γh2a. x chip

Capturing Common Fragile Site Breaks by Native &#947;H2A.X ChIP

Die Größe der Chromatinfragmente ist entscheidend für den Erfolg von nativem ChIP, da sie sich direkt auf die Zugänglichkeit von DNA-Regionen für die Antikörperbindung auswirkt. Um die optimale MNase-Konzentration für die Chromatinfragmentierung zu bestimmen, haben wir eine Reihe von Mikrozentrifugenröhrchen mit unterschiedlichen Konzentrationen von MNase (d.h. 0,0625 U, 0,125 U, 0,25 U, 0,5 U, 1 U, 2 U, 4 U, 8 U pro Reaktion) und 40 μL isolierter Zellkerne hergestellt. Jede Reaktion wurde 5 Minuten lang bei 37 °C inkubi...

Erfassung häufiger fragiler Stellenbrüche durch natives γH2A. X ChIP

Replication stress induced by exposure to extrinsic agents can lead to DNA breaks at common fragile sites, which are regions in the genome known to be ...

capturing-common-fragile-site-breaks-by-native-h2ax-chip

Research

Forschung

JoVE Journal

Biochemistry

Biochemie

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Kontinuierliche Hochauflösende mikroskopische Beobachtung Replikative Aging in Bäckerhefe

In diesem Artikel präsentieren wir ein Mikrofluidik-Chip für Einzelzellanalyse. Es ermöglicht die Quantifizierung der intrazellulären Proteine, Enzyme, Cofaktoren und zweiten Boten mittels Fluoreszenzassays oder Immunoassays.

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In Situ Zeitabhängige Dielectric Breakdown im Transmissionselektronenmikroskop: eine Möglichkeit, die Fehlermechanismus in mikroelektronischen Bauelementen Verstehen

Wir berichten über ein Protokoll zur Kombination der atomaren Messtechnik des Rastertunnelmikroskops für die Oberflächenstrukturierung mit der selektiven Atomlagenabscheidung und dem reaktiven Ionenätzen. In einem robusten Prozess, der zahlreiche atmosphärische Expositionen und Transporte umfasst, werden 3D-Nanostrukturen mit atomarer Messtechnik hergestellt.

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Skalierbare Fertigung von dehnbar, Dual Channel, mikrofluidischen Orgel Chips

Dieser Beitrag beschreibt ein Protokoll zusammen mit einer vergleichenden Untersuchung von zwei mikrofluidischen Fertigungstechniken, nämlich Photolithographie/Nassätzung/thermische Bindung und Selektive Laser-induzierte Ätzung (SLE), die für Hochdruckbedingungen geeignet sind. Diese Techniken sind Förderplattformen für die direkte Beobachtung des Flüssigkeitsflusses in ersatzdurchlässigen Medien und gebrochenen Systemen unter Reservoirbedingungen.

Mikrofluidische Fertigungstechniken zur Hochdruckprüfung von mikroskaligen superkritischenCO2-Schaumtransporten in gebrochenen unkonventionellen Reservoirs

Hier stellen wir ein Protokoll für die Durchführung von in situ TEM-Gasreaktionsexperimenten mit geschlossenen Zellen vor und beschreiben dabei mehrere häufig verwendete Probenvorbereitungsmethoden.

Durchführung von geschlossenzelligen In-situ-Gasreaktionen im Transmissionselektronenmikroskop

Ein Protokoll für die Kultur und Manipulation von embryonalem Gewebe der Maus auf einem mikrofluidischen Chip wird bereitgestellt. Durch die Anwendung von Impulsen von Signalwegmodulatoren kann dieses System verwendet werden, um Signalschwingungen für die funktionelle Untersuchung der Maussomitogenese extern zu steuern.

Ein mikrofluidischer Ansatz zur funktionellen Untersuchung von Signalschwingungen, die die Somitogenese steuern

Dieser Artikel zeichnet den Lebenszyklus eines Siliziumnitrid-Membranresonators nach, vom Design über die Herstellung bis hin zur Charakterisierung.

Herstellung und Charakterisierung von Siliziumnitrid-Membranresonatoren mit hoher Güte

Ein neuartiges Dichtungsprotokoll zur Herstellung wasserdichter, silikonbasierter Dichtungen für Membranen von Polydimethylsiloxan-(PDMS)-Chip-Bauelementen. Vorgesehen für Labore zur Einrichtung von Chipmodellen und der Entwicklung von Chip-Plattformen im kleinen Maßstab. Wir demonstrieren das Protokoll mit Kunststoff- und nativen Gewebemembranen. Dieses Verfahren erfordert nur PDMS, Toluol, Schimmel, Membran und eine Vakuumkammer.

Zugängliches Silikonchip-zu-Membran-Abdichtungsverfahren für flexible, zuverlässige Bindungen

Erfahren Sie eine optimierte native γH2A.X-ChIP-Methode zur effizienten Detektion häufiger fragiler Stellenbrüche in Krebszellen. Diese Technik reduziert Zeit und Arbeitsaufwand bei hoher Reproduzierbarkeit.

Erfassung häufiger fragiler Stellenbrüche durch natives γH2A. X ChIP

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