Name: Ein zweisprachiger computergestützter Workflow zur Identifizierung potenzieller PLK1-Inhibitoren in der amerikanischen Gebärdensprache und im Englischen (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-04-03T15:00:00.000+00:00
Duration: 14 min 34 s
Description: Lernen Sie einen zweisprachigen computergestützten Workflow zur Identifizierung potenzieller PLK1-Inhibitoren mit ADMET-S-Bewertung. Diese Methode unterstützt die computergestützte Arzneimittelforschung durch Protein-Liganden-Docking und Selektivitätsanalyse.

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<table><tbody><tr><td>ADMETLab3</td><td>Simulationen Plus. Inc</td><td>V3.0</td><td>ADMET-Eigenschaften</td></tr><tr><td>Alphafold</td><td>Google DeepMind & Isomorphe Labs (Alphabet-Tochtergesellschaften)</td><td>V3.0.1</td><td>3D-Proteinmodellierung</td></tr><tr><td>Anaconda/Conda</td><td>Anaconda, Inc.</td><td>V24.9.2</td><td>Open-Source-Paketverwaltungssystem&nbsp;</td></tr><tr><td>CB-Dock2</td><td>Yang Cao Labor</td><td>V2.0</td><td>Protein-Ligand-Blindandocking</td></tr><tr><td>CHARMM-GUI</td><td>Lehigh Universität</td><td>V3.8</td><td>Biomolekulare Manipulation und Simulation</td></tr><tr><td>DARWIN AUF ZUGANG</td><td>Universität von Delaware</td><td>N/A</td><td>Hochleistungsrechnen</td></tr><tr><td>ORCA</td><td>FAccTs GmbH</td><td>V6.1.0</td><td>Quantenchemie-Paket</td></tr><tr><td>Proteindatenbank</td><td>Weltweite Proteindatenbank</td><td>RRID:SCR_006555</td><td>Proteindatenbank</td></tr><tr><td>RDKit</td><td>Open Source</td><td>RRID:SCR_014274</td><td>Cheminformatik-Programmierung</td></tr><tr><td>SuperNatural 3.0</td><td>Institut für Physiologie und Science-IT (Berlin)</td><td>V3.0</td><td>Bibliothek natürlicher Moleküle</td></tr><tr><td>SwissADME</td><td>Schweizerisches Institut für Bioinformatik</td><td>RRID:SCR_017865</td><td>ADME-Eigenschaften</td></tr><tr><td>Toxtree</td><td>Ideaconsult Ltd</td><td>V3.1.0</td><td>Toxizitätsklassifikation</td></tr></tbody></table>

ein zweisprachiger computergestützter workflow zur identifizierung potenzieller plk1-inhibitoren in der amerikanischen gebärdensprache und im englischen

A Bilingual Computational Workflow for Identifying Potential PLK1 Inhibitors in American Sign Language and English

Ein zweisprachiger computergestützter Workflow zur Identifizierung potenzieller PLK1-Inhibitoren in der amerikanischen Gebärdensprache und im Englischen

Polo-like Kinase 1 (PLK1) plays essential roles in the S, G2, and M phases of the cell cycle, and its overexpression is frequently observed in multiple ...

a-bilingual-computational-workflow-for-identifying-potential-plk1

Research

Forschung

JoVE Journal

Chemistry

Chemie

Hier zeigen wir, wie Proximity Ligation Assay (PLA), mit einer Kombination von Antikörpern zu verwenden, um Bone Morphogenetic Protein (BMP)-Signalisierung in fixierten Zellen sichtbar zu machen. Diese Technik erlaubt es uns, die nukleare Anreicherung von endogenen BMP aktivierten Effektor-Komplexe folgen und zu quantifizieren, ihre Werte im Laufe der Zeit unter BMP4 Stimulation.

Erkennung von Signaling Effektor-Komplexe Downstream von BMP4 Mit In situ PLA, einem Proximity Ligation Assay

Hier verwenden wir ein menschliches LentiPlex gebündelt Bibliothek und traditionelle Methoden zur Sequenzierung Gen-Targets zu fördern Überleben der Zelle zu identifizieren. Wir zeigen, wie die Einrichtung und Dekonvolution ein LentiPlex Bildschirm und Validierung der Ergebnisse.

MISSION LentiPlex Pooled shRNA Bibliothek Screening in Säugerzellen

Die Kontrolle der Proteinsynthese erfolgt hauptsächlich im Initiationsschritt der Translation, dessen Mängel mit verschiedenen Störungen verbunden sind. Um ihre Ätiologie besser zu verstehen, haben wir hier ein Protokoll mit Xenopus laevis Eizellen beschrieben, das die Translation des mos-Transkripts in Gegenwart einer Mutante des Translationsinitiationsfaktors eIF4G1 bewertet.

Xenopus laevis als Modell zur Übersetzung Impairment Identifizieren

Drug Resistenz gegen gezielte Therapeutika ist weit verbreitet und die Notwendigkeit, die Mechanismen der Resistenz zu identifizieren - vor oder nach dem klinischen Einsetzen - ist entscheidend für die Führung alternative klinische Management-Strategien. Hier präsentieren wir ein Protokoll zu koppeln, Ableitung von Medikamenten-resistenten Linien in vitro mit Sequenzierung zur Entdeckung dieser Mechanismen zu beschleunigen.

Implementierung von<em&gt; In-vitro-</em&gt; Drug Resistance Assays: Maximierung des Potenzials für die Aufdeckung klinisch relevanter Resistenzmechanismen

Hier ist ein Protokoll für Medium-High Throughput Analyse von Protein-Phosphorylierung-Veranstaltungen auf der zellulären Ebene präsentiert. Phospho-Durchflusszytometrie ist ein leistungsfähiger Ansatz charakterisieren Signalisierung Aberrationen, identifizieren und Biomarker zu validieren und Pharmakodynamik zu beurteilen.

Phospho-Durchflusszytometrie mit fluoreszierenden Zelle Barcoding für einzelne Zelle Signalisierung Analyse und Entdeckung von Biomarkern

Hier stellen wir ein eCLIP-Protokoll vor, um die wichtigsten RNA-Ziele von RBP-Kandidaten in Hoden zu ermitteln.

Verbesserte Vernetzung der Immunoptierungsmethode (eCLIP) zur effizienten Identifizierung der proteingebundenen RNA in Mäusetestis

Ein detailliertes Protokoll zur Erzeugung von selbstzusammengesetzten menschlichen Proteinmikroarrays zum Screening von Kinase-Inhibitoren wird vorgestellt.

Kinase-Inhibitor-Screening in selbstmontierten humanen Protein-Mikroarrays

Diese Studie zielte darauf ab, eine Strategie zur Identifizierung von Wechselwirkungen zwischen Medikamenten und Peptid zu präsentieren. Die Strategie umfasst die Biopanierung von medikamentenerkennenden kurzinomischen Kurzpeptiden auf der Grundlage eines Mikrobilanzsensors (QCM) in Quarzkristall, gefolgt von einer Bioinformatik-Analyse zur quantitativen Bewertung der für die Arzneimittelerkennung und Anmerkung der Arzneimittelbindungsstellen auf Proteinen erhaltenen Informationen.

Biosensor-basierte Hochdurchsatz-Biopanning- und Bioinformatik-Analysestrategie zur globalen Validierung von Wechselwirkungen zwischen Arzneimittel und Proteinen

Wir haben einen speziesübergreifenden vergleichenden Onkogenomik-Ansatz entwickelt, der genomische Analysen und funktionelle genomische Screenings verwendet, um therapeutische Ziele in Tumoren, die in gentechnisch veränderten Mausmodellen auftreten, und den entsprechenden menschlichen Tumortyp zu identifizieren und zu vergleichen.

Genetisches Profiling und Dropout-Screening im Genommaßstab zur Identifizierung therapeutischer Ziele in Mausmodellen für bösartige periphere Nervenscheidentumoren

Untargeted metabolomics stellt eine Hypothese generieren Momentaufnahme eines metabolischen Profils. Dieses Protokoll wird zeigen, die Extraktion und Analyse von Metaboliten von Zellen, Serum oder Gewebe. Eine Reihe von Metaboliten werden mit flüssigem befragten-Flüssigphasenextraktion, Mikroströmungsfühler UltraPerformance Flüssigkeits-Chromatographie / hochauflösende Massenspektrometrie (UPLC-HRMS), gekoppelt mit Differential-Analyse-Software.

Untargeted Metabolomics aus biologischen Quellen Mit UltraPerformance Flüssigkeits-Chromatographie-hochauflösender Massenspektrometrie (UPLC-HRMS)

Lernen Sie einen zweisprachigen computergestützten Workflow zur Identifizierung potenzieller PLK1-Inhibitoren mit ADMET-S-Bewertung. Diese Methode unterstützt die computergestützte Arzneimittelforschung durch Protein-Liganden-Docking und Selektivitätsanalyse.

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Ein zweisprachiger computergestützter Workflow zur Identifizierung potenzieller PLK1-Inhibitoren in der amerikanischen Gebärdensprache und im Englischen

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