Name: Umweltproben von photosynthetischen Mikroben und ihren Viren: Vom Feld ins Labor (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-07-03T14:30:00.000+00:00
Duration: 8 min 1 s
Description: Erfahren Sie Methoden zur Isolierung und Charakterisierung von Cyanophagen und ihren Wirten aus aquatischen Ökosystemen. Diese Techniken ermöglichen präzise Analysen von Virus-Wirt-Dynamiken für die virologische Forschung.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Zhang, D., You, F., He, Y., Te, S. H., Gin, K. Y. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+and+characterization+of+the+first+freshwater+cyanophage+infecting+Pseudanabaena%5BTitle%5D)+AND+%22J+Virol%22%5BJournal%5D)">Isolation and characterization of the first freshwater cyanophage infecting Pseudanabaena.</a> J Virol. 94 (17), 10-1128 (2020).</li>
<li>Dong, Z. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aDong%2C+Z+%22Isolation%2C+Characterization+and+Ecological+Dynamics+of+Tropical+Freshwater+Cyanophages%22">Isolation, Characterization and Ecological Dynamics of Tropical Freshwater Cyanophages</a>. , National University of Singapore. Doctoral dissertation (2022).</li>
<li>Sime-Ngando, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Environmental+bacteriophages%3A+viruses+of+microbes+in+aquatic+ecosystems%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Environmental bacteriophages: viruses of microbes in aquatic ecosystems.</a> Front Microbiol. 5, 355(2014).</li>
<li>Sigee, D. C. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSigee%2C+DC+%22Freshwater+microbiology%3A+biodiversity+and+dynamic+interactions+of+microorganisms+in+the+aquatic+environment%22">Freshwater microbiology: biodiversity and dynamic interactions of microorganisms in the aquatic environment</a>. , John Wiley & Sons. (2005).</li>
<li>Jacquet, S., Miki, T., Noble, R., Peduzzi, P., Wilhelm, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Viruses+in+aquatic+ecosystems%3A+important+advancements+of+the+last+20+years+and+prospects+for+the+future+in+the+field+of+microbial+oceanography+and+limnology%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Oceanography+Limnol%22%5BJournal%5D)">Viruses in aquatic ecosystems: important advancements of the last 20 years and prospects for the future in the field of microbial oceanography and limnology.</a> Adv Oceanography Limnol. 1 (1), 97-141 (2010).</li>
<li>Tucker, S., Pollard, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+cyanophage+Ma-LBP+and+infection+of+the+cyanobacterium+Microcystis+aeruginosa+from+an+Australian+subtropical+lake+by+the+virus%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Identification of cyanophage Ma-LBP and infection of the cyanobacterium Microcystis aeruginosa from an Australian subtropical lake by the virus.</a> Appl Environ Microbiol. 71 (2), 629-635 (2005).</li>
<li>Bhardwaj, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cyanobacteria%3A+a+key+player+in+nutrient+cycling%5BTitle%5D)+AND+%22Cyanobacteria%22%5BJournal%5D)">Cyanobacteria: a key player in nutrient cycling.</a> Cyanobacteria. , 579-596 (2024).</li>
<li>Douterelo, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Methodological+approaches+for+studying+the+microbial+ecology+of+drinking+water+distribution+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Water+Res%22%5BJournal%5D)">Methodological approaches for studying the microbial ecology of drinking water distribution systems.</a> Water Res. 65, 134-156 (2014).</li>
<li>Brandt, J. P., Flannigan, M. D., Maynard, D. G., Thompson, I. D., Volney, W. J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+introduction+to+Canada%27s+boreal+zone%3A+ecosystem+processes%2C+health%2C+sustainability%2C+and+environmental+issues%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Rev%22%5BJournal%5D)">An introduction to Canada's boreal zone: ecosystem processes, health, sustainability, and environmental issues.</a> Environ Rev. 21 (4), 207-226 (2013).</li>
<li>Ramanan, R., Kim, B. H., Cho, D. H., Oh, H. M., Kim, H. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Algae-bacteria+interactions%3A+evolution%2C+ecology+and+emerging+applications%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnol+Adv%22%5BJournal%5D)">Algae-bacteria interactions: evolution, ecology and emerging applications.</a> Biotechnol Adv. 34 (1), 14-29 (2016).</li>
<li>Atkinson, C. L., Capps, K. A., Rugenski, A. T., Vanni, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Consumer-driven+nutrient+dynamics+in+freshwater+ecosystems%3A+From+individuals+to+ecosystems%5BTitle%5D)+AND+%22Biol+Rev%22%5BJournal%5D)">Consumer-driven nutrient dynamics in freshwater ecosystems: From individuals to ecosystems.</a> Biol Rev. 92 (4), 2003-2023 (2017).</li>
<li>Mojica, K. D., Brussaard, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Factors+affecting+virus+dynamics+and+microbial+host-virus+interactions+in+marine+environments%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Microbiol+Ecol%22%5BJournal%5D)">Factors affecting virus dynamics and microbial host-virus interactions in marine environments.</a> FEMS Microbiol Ecol. 89 (3), 495-515 (2014).</li>
<li>Graham, E. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microbes+as+engines+of+ecosystem+function%3A+when+does+community+structure+enhance+predictions+of+ecosystem+processes%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Microbes as engines of ecosystem function: when does community structure enhance predictions of ecosystem processes.</a> Front Microbiol. 7, 214(2016).</li>
<li>Ceballos, R. M., Stacy, C. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantifying+relative+virulence%3A+when+%C2%B5+max+fails+and+AUC+alone+just+is+not+enough%5BTitle%5D)+AND+%22J+General+Virol%22%5BJournal%5D)">Quantifying relative virulence: when µ max fails and AUC alone just is not enough.</a> J General Virol. 102 (1), 001515(2021).</li>
<li>Hour, S., Pierce, A. J., Heng, S. Y., Plymale, R., Ceballos, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantifying+Resilience+in+Single-Host%2FSingle-Virus+Infections%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Quantifying Resilience in Single-Host/Single-Virus Infections.</a> Appl Microbiol. 5 (1), 18(2025).</li>
<li>Ceballos, R. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Differential+virus+host-ranges+of+the+Fuselloviridae+of+hyperthermophilic+Archaea%3A+implications+for+evolution+in+extreme+environments%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Differential virus host-ranges of the Fuselloviridae of hyperthermophilic Archaea: implications for evolution in extreme environments.</a> Front Microbiol. 3, 295(2012).</li>
<li>Ceballos, R. M., Drummond, C. G., Stacy, C. L., Padilla-Crespo, E., Stedman, K. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Host-dependent+differences+in+replication+strategy+of+the+Sulfolobus+spindle-shaped+virus+strain+SSV9+%28aka%2C+SSVK1%29%3A+infection+profiles+in+hosts+of+the+family+Sulfolobaceae%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Host-dependent differences in replication strategy of the Sulfolobus spindle-shaped virus strain SSV9 (aka, SSVK1): infection profiles in hosts of the family Sulfolobaceae.</a> Front Microbiol. 11, 1218(2020).</li>
<li>Rippka, R., Deruelles, J., Waterbury, J. B., Herdman, M., Stanier, R. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generic+assignments%2C+strain+histories+and+properties+of+pure+cultures+of+cyanobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology%22%5BJournal%5D)">Generic assignments, strain histories and properties of pure cultures of cyanobacteria.</a> Microbiology. 111 (1), 1-61 (1979).</li>
<li>Kliphuis, A. M., Janssen, M., van den End, E. J., Martens, D. E., Wijffels, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Light+respiration+in+Chlorella+sorokiniana%5BTitle%5D)+AND+%22J+Appl+Phycol%22%5BJournal%5D)">Light respiration in Chlorella sorokiniana.</a> J Appl Phycol. 23, 935-947 (2011).</li>
<li>Lea-Smith, D. J., Vasudevan, R., Howe, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generation+of+marked+and+markerless+mutants+in+model+cyanobacterial+species%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Generation of marked and markerless mutants in model cyanobacterial species.</a> J Vis Exp. (111), e54001(2016).</li>
<li>Noroozi, M., Amozegar, M. A., Rahimi, R., Shahzadeh Fazeli, S. A., Bakhshi Khaniki, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+isolation+and+preliminary+characterization+of+native+cyanobacterial+and+microalgal+strains+from+lagoons+contaminated+with+petroleum+oil+in+Khark+Island%5BTitle%5D)+AND+%22Biol+J+Microorg%22%5BJournal%5D)">The isolation and preliminary characterization of native cyanobacterial and microalgal strains from lagoons contaminated with petroleum oil in Khark Island.</a> Biol J Microorg. 5 (20), 33-41 (2017).</li>
<li>Nübel, U., Garcia-Pichel, F., Muyzer, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((PCR+primers+to+amplify+16S+rRNA+genes+from+cyanobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">PCR primers to amplify 16S rRNA genes from cyanobacteria.</a> Appl Environ Microbiol. 63 (8), 3327-3332 (1997).</li>
<li>Tragin, M., Lopes dos Santos, A., Christen, R., Vaulot, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diversity+and+ecology+of+green+microalgae+in+marine+systems%3A+an+overview+based+on+18S+rRNA+gene+sequences%5BTitle%5D)+AND+%22Perspect.+Phycol%22%5BJournal%5D)">Diversity and ecology of green microalgae in marine systems: an overview based on 18S rRNA gene sequences.</a> Perspect. Phycol. 3 (3), 141-154 (2016).</li>
<li>Uchida, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+coupled+assay+system+for+the+lysis+of+cyanobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Japanese+J+Water+Treatment+Biol%22%5BJournal%5D)">A coupled assay system for the lysis of cyanobacteria.</a> Japanese J Water Treatment Biol. 34 (1), 67-75 (1998).</li>
<li>Drummond, C. Characterization of Sulfolobus. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aDrummond%2C+C+%22Spindle-shaped+Virus+replication%22">Spindle-shaped Virus replication</a>. , Portland State University. (2010).</li>
<li>Flores, E., Wolk, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Production%2C+by+filamentous%2C+nitrogen-fixing+cyanobacteria%2C+of+a+bacteriocin+and+of+other+antibiotics+that+kill+related+strains%5BTitle%5D)+AND+%22Arch+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Production, by filamentous, nitrogen-fixing cyanobacteria, of a bacteriocin and of other antibiotics that kill related strains.</a> Arch Microbiol. 145, 215-219 (1986).</li>
<li>Wick, C., McCubbin, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+purified+MS2+bacteriophage+by+the+physical+counting+methodology+used+in+the+integrated+virus+detection+system+%28IVDS%29%5BTitle%5D)+AND+%22Toxicol+Methods%22%5BJournal%5D)">Characterization of purified MS2 bacteriophage by the physical counting methodology used in the integrated virus detection system (IVDS).</a> Toxicol Methods. 9 (4), 245-252 (1999).</li>
<li>Marei, E. M., Elbaz, R., Hammad, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Induction+of+temperate+cyanophages+using+heavy+metal-copper%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Microbiol+Res+Rev%22%5BJournal%5D)">Induction of temperate cyanophages using heavy metal-copper.</a> Int J Microbiol Res Rev. 5 (5), 472(2013).</li>
<li>Bratchkova, A., Kroumov, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microalgae+as+producers+of+biologically+active+compounds+with+antibacterial%2C+antiviral%2C+antifungal%2C+antialgal%2C+antiprotozoal%2C+antiparasitic+and+anticancer+activity%5BTitle%5D)+AND+%22Acta+Microbiol+Bulgarica%22%5BJournal%5D)">Microalgae as producers of biologically active compounds with antibacterial, antiviral, antifungal, antialgal, antiprotozoal, antiparasitic and anticancer activity.</a> Acta Microbiol Bulgarica. 36 (3), 79-89 (2020).</li>
<li>Storms, Z. J., Teel, M. R., Mercurio, K., Sauvageau, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+virulence+index%3A+a+metric+for+quantitative+analysis+of+phage+virulence%5BTitle%5D)+AND+%22Phage%22%5BJournal%5D)">The virulence index: a metric for quantitative analysis of phage virulence.</a> Phage. 1 (1), 27-36 (2020).</li>
<li>Omata, T., Murata, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+and+characterization+of+three+types+of+membranes+from+the+cyanobacterium+%28blue-green+alga%29+Synechocystis+PCC+6714%5BTitle%5D)+AND+%22Arch+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Isolation and characterization of three types of membranes from the cyanobacterium (blue-green alga) Synechocystis PCC 6714.</a> Arch Microbiol. 139, 113-116 (1984).</li>
<li>Wilson, W. H., Joint, I. R., Carr, N. G., Mann, N. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+and+molecular+characterization+of+five+marine+cyanophages+propagated+on+Synechococcus+sp.+strain+WH7803%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Isolation and molecular characterization of five marine cyanophages propagated on Synechococcus sp. strain WH7803.</a> Appl Environ Microbiol. 59 (11), 3736-3743 (1993).</li>
<li>Grasso, C. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+review+of+cyanophage-host+relationships%3A+Highlighting+cyanophages+as+a+potential+cyanobacteria+control+strategy%5BTitle%5D)+AND+%22Toxins%22%5BJournal%5D)">A review of cyanophage-host relationships: Highlighting cyanophages as a potential cyanobacteria control strategy.</a> Toxins. 14 (6), 385(2022).</li>
<li>Srivastava, A., Gupta, N., Mishra, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cyanophages%3A+interacting+mechanism+and+evolutionary+significance%5BTitle%5D)+AND+%22Cyanobacteria%22%5BJournal%5D)">Cyanophages: interacting mechanism and evolutionary significance.</a> Cyanobacteria. , 255-282 (2024).</li>
<li>Cai, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Abundant+and+cosmopolitan+lineage+of+cyanopodoviruses+lacking+a+DNA+polymerase+gene%5BTitle%5D)+AND+%22ISME+J%22%5BJournal%5D)">Abundant and cosmopolitan lineage of cyanopodoviruses lacking a DNA polymerase gene.</a> ISME J. 17 (2), 252-262 (2023).</li>
<li>Komárek, J., Kaštovský, J., Mareš, J., Johansen, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Taxonomic+classification+of+cyanoprokaryotes+%28cyanobacterial+genera%29+2014%2C+using+a+polyphasic+approach%5BTitle%5D)+AND+%22Preslia%22%5BJournal%5D)">Taxonomic classification of cyanoprokaryotes (cyanobacterial genera) 2014, using a polyphasic approach.</a> Preslia. 86 (4), 295-335 (2014).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>1 PS Edelstahl-Transferpumpe&nbsp;</td><td>Utilitech, Charlotte, NC, USA</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>1,5 ml Röhrchen</td><td>www.eppendorf.com</td><td>30123611</td><td></td></tr><tr><td>10K NMWL Centricon Plus 70 Spin-Konzentrator&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>UFC701008</td><td></td></tr><tr><td>250 mL Erlenmeyerkolben mit Prallwand&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>CLS4450250</td><td></td></tr><tr><td>3800-Watt-Inverter-Generator</td><td>WEN Products, West Dundee, IL, USA</td><td>WEN 56380i</td><td></td></tr><tr><td>3K NMWL Amicon 15 mL&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>UFC800308</td><td></td></tr><tr><td>500 mL Erlenmeyerkolben mit Schwall&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>CLS4450500</td><td></td></tr><tr><td>5-Gallonen-Wasserkrüge&nbsp;</td><td>www.homedepot.com</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>80 Fuß lang, 0,5" Durchmesser, Nylon&nbsp;</td><td>https://facomex.mx/producto/combo/</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>Eine 26 Fuß tiefe V-Mittelkonsole Sailfish 2660 mit zwei Yamaha 150 PS Außenbordmotoren&nbsp;</td><td>https://yamahaoutboards.com/</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>Ammoniumacetat (CH3CO2NH4)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>631618</td><td></td></tr><tr><td>Borsäure (H3BO3)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>10043353</td><td></td></tr><tr><td>Calciumchlorid-Dihydrat (CaCl2. 2H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>10035048</td><td></td></tr><tr><td>Zentrifuge 5920&nbsp; R</td><td>www.eppendorf.com</td><td>5948000107</td><td></td></tr><tr><td>Zitronensäure (C6H8O7)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>77929</td><td></td></tr><tr><td>Kobalt(II)-nitrathexahydrat [Co(NO3)2,6H2O]</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>10026229</td><td></td></tr><tr><td>Zusammenklappbarer Gummi-Flexschlauch&nbsp;</td><td>swanhose.com</td><td>CELTF58050</td><td></td></tr><tr><td>Kupfer(II)-sulfat-Pentahydrat (CuSO4.5H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>7758998</td><td></td></tr><tr><td>Corning 50 mL Zentrifugenröhrchen&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>CLS430291</td><td></td></tr><tr><td>Dikaliumphosphat (K2HPO4)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>7758114</td><td></td></tr><tr><td>Dinatriumethylendiamintetraessigsäure (Na2EDTA)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>6381926</td><td></td></tr><tr><td>DS-11 FX+_Microvolume und Spektralphotometer und Florometer</td><td>www.denovix.com</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>Klebeband&nbsp;</td><td>www.homedepot.com</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>Eppendorf Röhren</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>EP022364120</td><td></td></tr><tr><td>Ethanol</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>64175</td><td></td></tr><tr><td>Ethylendiamintetraessigsäure (EDTA)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>60004</td><td></td></tr><tr><td>Eisenammoniumcitrat (C6H8O7&middot; xFe3+&middot; yNH3)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>1185575</td><td></td></tr><tr><td>Flex-plus blauer PVC-Schlauch</td><td>www.carlonsales.com</td><td>12008-750</td><td></td></tr><tr><td>Innova S44i - Stapelbarer Inkubator-Schüttler</td><td>www.eppendorf.com</td><td>2231001081</td><td></td></tr><tr><td>LVEM5 Tischgerät Elektronen- Microscope_Transmission Elektronenmikroskopie (TEM)</td><td>delongamerica.com</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>Magnesiumsulfat-Heptahydrat (MgSO4,7 H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>10034998</td><td></td></tr><tr><td>Mangan(II)-chlorid-Tetrahydrat (MnCl2.4H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>13446349</td><td></td></tr><tr><td>Pilzanker schwarz Vinyl beschichtet/30 lbs</td><td>www.homedepot.com</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>Petrischale, Polystyrol</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>Nr. P5481</td><td></td></tr><tr><td>Membran-Filterbecher aus Polyethersulfon (PES) mit 0,22 mm</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>Z358193-1CS</td><td></td></tr><tr><td>Membran-Filterbecher aus Polyethersulfon (PES) mit 0,45 mm</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>Z370622-1CS</td><td></td></tr><tr><td>Kaliumethylxanthogenat (C2H5OCSSK)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>140896</td><td></td></tr><tr><td>Natriumcarbonat (Na2CO3)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>497198</td><td></td></tr><tr><td>Natriumdodecylsulfat [CH3(CH2)11OSO3Na]</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>151213</td><td></td></tr><tr><td>Natriummolybdat-Dihydrat (Na2MoO4.2H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>10102406</td><td></td></tr><tr><td>Natriumnitrat (NaNO3)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>7631994</td><td></td></tr><tr><td>Tris(hydroxymethyl)methyl]-2-aminoethansulfonsäure aci (TES) (C6H15NO6S)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>7365448</td><td></td></tr><tr><td>Triton X-100&nbsp;</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>Nr. T8787</td><td></td></tr><tr><td>Trizma-Hydrochlorid (Tris-HCl)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>1185531</td><td></td></tr><tr><td>Vakuum-/Druckpumpe&nbsp;</td><td>Cole-Parmer; Vernon Hills, IL, Vereinigte Staaten von Amerika</td><td>Nr. EW-79204-00</td><td></td></tr><tr><td>Vinyl-Schläuche</td><td>www.homedepot.com</td><td>N/A</td><td></td></tr><tr><td>Zinksulfat-Heptahydrat (ZnSO4.7H2O)</td><td>www.sigmaaldrich.com</td><td>7446200</td><td></td></tr></tbody></table>

umweltproben von photosynthetischen mikroben und ihren viren: vom feld ins labor

Environmental Sampling of Photosynthetic Microbes and Their Viruses: From Field to Lab

Umweltproben von photosynthetischen Mikroben und ihren Viren: Vom Feld ins Labor

Environmental sampling of photosynthetic microorganisms and their viruses plays a critical role in understanding contemporary marine and freshwater ...

environmental-sampling-photosynthetic-microbes-their-viruses-from

Research

Forschung

JoVE Journal

Biology

Biologie

Die Fluktuationsrate von Viren in Meer-und Süßwasser-Systeme können durch eine Reduktion und Wiederholung Technik geschätzt werden. Die Daten können die Forscher Raten von Virus-vermittelte mikrobielle Sterblichkeit in aquatischen Systemen zu schließen.

Die Schätzung Virus Produktionsraten in aquatischen Systemen

Hier präsentieren wir ein umfassendes Protokoll zur Bewertung der Verfügbarkeit organischer und anorganischer Nährstoffe sowie der Häufigkeit und Struktur von mikrobiellen und viralen Gemeinschaften in abgelegenen Meeresumgebungen.

Entwirren der unsichtbaren Spieler im Ozean - ein Feld Führer zu Wasserchemie und Marine Mikrobiologie

Hier präsentieren wir phänomische Ansätze zur funktionellen Charakterisierung von mutmaßlichen Phagengenen. Zu den Techniken gehören ein entwickelter Assay, der in der Lage ist, den anabolen Metabolismus des Wirts zu überwachen, die Multi-Phenotype Assay Plates (MAPs), zusätzlich zu der etablierten Methode der Metabolomik, die in der Lage ist, Auswirkungen auf den katabolen Metabolismus zu messen.

Phage Phenomics: Physiologische Ansätze zur Charakterisierung Novel virale Proteine

Verständnis der biologischen Zusammensetzung der Umwelt Feinstaub ist wichtig für das Studium der seine erheblichen Auswirkungen auf die Gesundheit und Krankheit zu verbreiten. Hier haben wir drei Arten von Bioaerosol Probenahmeverfahren und eine biologische Analyse der Luft Mikroben um in der Luft mikrobielle Gemeinschaften unter verschiedenen Umweltbedingungen besser zu erkunden.

Zusammensetzung und Verteilungsanalyse Bioaerosole unter verschiedenen Umweltbedingungen

Ein Citizen-Science-Projekt wurde entwickelt, um Einwohner von San Diego zu rekrutieren, um Umweltproben für SARS-CoV-2 zu sammeln. Für die Datenübermittlung über eine benutzerfreundliche Oberfläche für mobile Geräte wurde eine mehrsprachige webbasierte Plattform geschaffen. Ein Laborinformationsmanagementsystem erleichterte die Entnahme von Tausenden von geografisch unterschiedlichen Proben mit Echtzeit-Ergebnisverfolgung.

Swabbing the Urban Environment - Eine Pipeline zur Probenahme und zum Nachweis von SARS-CoV-2 aus Umweltreservoirs

Diese Veröffentlichung beschreibt das Design von Labor-Photobioreaktoren (PBRs) mit anpassbaren Lichtregimen. Das Wachstum von Cyanobakterien oder Mikroalgen, die Bicarbonat als Kohlenstoffquelle verwenden, wird kontinuierlich überwacht, indem die volumetrische Sauerstoffproduktion gemessen wird. Diese PBRs ermöglichen schnelle, replizierte Laborwachstumsvergleiche mit wenig Benutzereingriffen während der Experimente.

Betrieb von Labor-Photobioreaktoren mit Online-Wachstumsmessungen und anpassbaren Lichtregimen

Die Viruskonzentration aus Wasser- und Abwasserproben aus der Umwelt ist eine anspruchsvolle Aufgabe, die vor allem zur Identifizierung und Quantifizierung von Viren durchgeführt wird. Während mehrere Methoden zur Viruskonzentration entwickelt und getestet wurden, demonstrieren wir hier die Wirksamkeit der Ultrafiltration und der Magermilchflockung für RNA-Viren mit verschiedenen Probentypen.

Konzentration von Viruspartikeln aus Wasser- und Abwasserproben aus der Umwelt mittels Magermilchflockung und Ultrafiltration

Zuverlässige und präzise Formen der vor Ort einsetzbaren DNA-Analysen sind für viele Branchen entscheidend. Dieses Papier bietet zwei Methoden für die Umweltmikrobienanalyse im Feld: 1) die Isolierung mikrobieller DNA aus Umweltproben mittels eines biologischen Extraktions-Feldkits und 2) die Analyse der DNA über die Feld-qPCR-Einheit.

Mikrobielle DNA-Analyse im Feld mit einem biologischen Extraktions-Feldkit und einer Feld-qPCR-Einheit

Dieses Video zeigt die Technik zur Gewinnung von DNA aus den Arten von Mikroben mit Wohnsitz in der Termite Enddarm. Die Herstellung eines Nasspräparat Rutsche, die nützlich für die Visualisierung der gut mikrobiellen Gemeinschaft ist, ist auch dargestellt, und eine Tour durch die artenreiche gut Umfeld gegeben ist.

Extrahieren von DNA aus dem Gut Mikroben der Termite (Zootermopsis Angusticollis) und visualisieren Gut Mikroben

Das Video dokumentiert Methoden zur Erhebung Coastal Marine Wasserproben und deren Verarbeitung für verschiedene Downstream-Anwendungen einschließlich Biomasse-Konzentration, Aufreinigung von Nukleinsäuren, Zell-Hülle und Fülle, Nährstoff-und Spurengasen analysiert.

Meerwasser Probenahme und Sammlung

Erfahren Sie Methoden zur Isolierung und Charakterisierung von Cyanophagen und ihren Wirten aus aquatischen Ökosystemen. Diese Techniken ermöglichen präzise Analysen von Virus-Wirt-Dynamiken für die virologische Forschung.

Umweltproben von photosynthetischen Mikroben und ihren Viren: Vom Feld ins Labor

Weitere Videos entdecken