Name: Bewertung von Blattantworten auf mikrobielle Sekundärmetabolite mittels eines Hochdurchsatzformats (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-12-05T13:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 51 s
Description: Erfahren Sie, wie Sie Blattantworten auf mikrobielle Sekundärmetabolite in einem Hochdurchsatzformat bewerten. Diese Methode ermöglicht die gleichzeitige Messung von Ionenleckage, Peroxidaseaktivität und Callose-Produktion.

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<ol><li>Yu, X., Feng, B., He, P., Shan, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((From+chaos+to+harmony%3A+responses+and+signaling+upon+microbial+pattern+recognition%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Phytopathol%22%5BJournal%5D)">From chaos to harmony: responses and signaling upon microbial pattern recognition.</a> Annu Rev Phytopathol. 55 (1), 109-137 (2017).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+cyclic+lipopeptide+from+Fusarium+graminearum+targets+plant+membranes+to+promote+virulence%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Rep%22%5BJournal%5D)">A cyclic lipopeptide from Fusarium graminearum targets plant membranes to promote virulence.</a> Cell Rep. 43 (7), 114384(2024).</li>
<li>Thoms, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Innate+immunity+can+distinguish+beneficial+from+pathogenic+rhizosphere+microbiota%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Innate immunity can distinguish beneficial from pathogenic rhizosphere microbiota.</a> bioRxiv. , (2023).</li>
<li>Nishiuchi, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fusarium+phytotoxin+trichothecenes+have+an+elicitor-like+activity+in+Arabidopsis+thaliana%2C+but+the+activity+differed+significantly+among+their+molecular+species%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Fusarium phytotoxin trichothecenes have an elicitor-like activity in Arabidopsis thaliana, but the activity differed significantly among their molecular species.</a> Mol Plant Microbe Interact. 19 (5), 512-520 (2006).</li>
<li>Schellenberger, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Apoplastic+invasion+patterns+triggering+plant+immunity%3A+plasma+membrane+sensing+at+the+frontline%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">Apoplastic invasion patterns triggering plant immunity: plasma membrane sensing at the frontline.</a> Mol Plant Pathol. 20 (11), 1602-1616 (2019).</li>
<li>Henry, G., Deleu, M., Jourdan, E., Thonart, P., Ongena, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+bacterial+lipopeptide+surfactin+targets+the+lipid+fraction+of+the+plant+plasma+membrane+to+trigger+immune-related+defence+responses%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The bacterial lipopeptide surfactin targets the lipid fraction of the plant plasma membrane to trigger immune-related defence responses.</a> Cell Microbiol. 13 (11), 1824-1837 (2011).</li>
<li>Pršić, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanosensing+and+sphingolipid-docking+mediate+lipopeptide-induced+immunity+in+Arabidopsis%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Mechanosensing and sphingolipid-docking mediate lipopeptide-induced immunity in Arabidopsis.</a> bioRxiv. , (2023).</li>
<li>Crouzet, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biosurfactants+in+plant+protection+against+diseases%3A+rhamnolipids+and+lipopeptides+case+study%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Bioeng+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Biosurfactants in plant protection against diseases: rhamnolipids and lipopeptides case study.</a> Front Bioeng Biotechnol. 8, 1014(2020).</li>
<li>Khan, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Luminol-based+chemiluminescent+signals%3A+clinical+and+non-clinical+application+and+future+uses%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Biochem+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Luminol-based chemiluminescent signals: clinical and non-clinical application and future uses.</a> Appl Biochem Biotechnol. 173, 333-355 (2014).</li>
<li>Schenk, S. T., Schikora, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Staining+of+callose+depositions+in+root+and+leaf+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Bio-protoc%22%5BJournal%5D)">Staining of callose depositions in root and leaf tissues.</a> Bio-protoc. 5 (6), e1429(2015).</li>
<li>Mott, G. A., Desveaux, D., Guttman, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+high-sensitivity%2C+microtiter-based+plate+assay+for+plant+pattern-triggered+immunity%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">A high-sensitivity, microtiter-based plate assay for plant pattern-triggered immunity.</a> Mol Plant Microbe Interact. 31 (5), 499-504 (2018).</li>
<li>Hatsugai, N., Katagiri, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+plant+cell+death+by+electrolyte+leakage+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Bio-protoc%22%5BJournal%5D)">Quantification of plant cell death by electrolyte leakage assay.</a> Bio-protoc. 8 (5), e2758(2018).</li>
<li>Zhang, X. H., Yu, X. Z., Yue, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phytotoxicity+of+dimethyl+sulfoxide+%28DMSO%29+to+rice+seedlings%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Environ+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Phytotoxicity of dimethyl sulfoxide (DMSO) to rice seedlings.</a> Int J Environ Sci Technol. 13, 607-614 (2016).</li>
<li>Mannan, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DMSO+triggers+the+generation+of+ROS+leading+to+an+increase+in+artemisinin+and+dihydroartemisinic+acid+in+Artemisia+annua+shoot+cultures%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Rep%22%5BJournal%5D)">DMSO triggers the generation of ROS leading to an increase in artemisinin and dihydroartemisinic acid in Artemisia annua shoot cultures.</a> Plant Cell Rep. 29, 143-152 (2010).</li>
<li>Felix, G., Duran, J. D., Volko, S., Boller, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plants+have+a+sensitive+perception+system+for+the+most+conserved+domain+of+bacterial+flagellin%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+J%22%5BJournal%5D)">Plants have a sensitive perception system for the most conserved domain of bacterial flagellin.</a> Plant J. 18 (3), 265-276 (1999).</li>
<li>Jourdan, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Insights+into+the+defense-related+events+occurring+in+plant+cells+following+perception+of+surfactin-type+lipopeptide+from+Bacillus+subtilis%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Insights into the defense-related events occurring in plant cells following perception of surfactin-type lipopeptide from Bacillus subtilis.</a> Mol Plant Microbe Interact. 22 (4), 456-468 (2009).</li>
<li>Raaijmakers, J. M., De Bruijn, I., Nybroe, O., Ongena, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Natural+functions+of+lipopeptides+from+Bacillus+and+Pseudomonas%3A+more+than+surfactants+and+antibiotics%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Microbiol+Rev%22%5BJournal%5D)">Natural functions of lipopeptides from Bacillus and Pseudomonas: more than surfactants and antibiotics.</a> FEMS Microbiol Rev. 34 (6), 1037-1062 (2010).</li>
<li>vábová, L., Lebeda, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+selection+for+improved+plant+resistance+to+toxin-producing+pathogens%5BTitle%5D)+AND+%22J+Phytopathol%22%5BJournal%5D)">In vitro selection for improved plant resistance to toxin-producing pathogens.</a> J Phytopathol. 153 (1), 52-64 (2005).</li>
<li>Mousa, W. K., Raizada, M. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+diversity+of+antimicrobial+secondary+metabolites+produced+by+fungal+endophytes%3A+an+interdisciplinary+perspective%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The diversity of antimicrobial secondary metabolites produced by fungal endophytes: an interdisciplinary perspective.</a> Front Microbiol. 4, 65(2013).</li>
<li>Bektas, Y., Eulgem, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthetic+plant+defense+elicitors%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">Synthetic plant defense elicitors.</a> Front Plant Sci. 5, 804(2015).</li>
<li>Saeed, B., Trujillo, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+immunity-related+oxidative+bursts+by+a+luminol-based+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Responses+Plants%3A+Methods+Protoc%22%5BJournal%5D)">Analysis of immunity-related oxidative bursts by a luminol-based assay.</a> Environ Responses Plants: Methods Protoc. , 339-346 (2022).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+and+hormonal+profiling+of+Fusarium+graminearum-infected+wheat+reveals+an+association+between+auxin+and+susceptibility%5BTitle%5D)+AND+%22Physiol+Mol+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">Transcriptional and hormonal profiling of Fusarium graminearum-infected wheat reveals an association between auxin and susceptibility.</a> Physiol Mol Plant Pathol. 107, 33-39 (2019).</li>
<li>Taylor, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+wetting+of+leaf+surfaces%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Colloid+Interface+Sci%22%5BJournal%5D)">The wetting of leaf surfaces.</a> Curr Opin Colloid Interface Sci. 16 (4), 326-334 (2011).</li>
<li>Mika, A., Boenisch, M. J., Hopff, D., Lüthje, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Membrane-bound+guaiacol+peroxidases+from+maize+%28Zea+mays+L.%29+roots+are+regulated+by+methyl+jasmonate%2C+salicylic+acid%2C+and+pathogen+elicitors%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Bot%22%5BJournal%5D)">Membrane-bound guaiacol peroxidases from maize (Zea mays L.) roots are regulated by methyl jasmonate, salicylic acid, and pathogen elicitors.</a> J Exp Bot. 61 (3), 831-841 (2010).</li>
<li>Brauer, E. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+profiling+and+genetic+mapping+of+barley+responses+to+bacterial+flagellin%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Transcriptional profiling and genetic mapping of barley responses to bacterial flagellin.</a> Mol Plant Microbe Interact. 38 (2), 344-352 (2025).</li>
<li>Takáč, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((TALEN-based+HvMPK3+knock-out+attenuates+proteome+and+root+hair+phenotypic+responses+to+flg22+in+barley%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">TALEN-based HvMPK3 knock-out attenuates proteome and root hair phenotypic responses to flg22 in barley.</a> Front Plant Sci. 12, 666229(2021).</li>
<li>Kim, M. G., Macoy, D. M., Lee, J. Y., Cha, J. Y., Kim, W. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interactions+between+plant+immunity%2C+temperature%2C+light%2C+and+circadian+rhythm%5BTitle%5D)+AND+%22J+Plant+Biochem+Physiol%22%5BJournal%5D)">Interactions between plant immunity, temperature, light, and circadian rhythm.</a> J Plant Biochem Physiol. 9, 260(2021).</li>
<li>Bahadoor, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gramillin+A+and+B%3A+cyclic+lipopeptides+identified+as+the+nonribosomal+biosynthetic+products+of+Fusarium+graminearum%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Chem+Soc%22%5BJournal%5D)">Gramillin A and B: cyclic lipopeptides identified as the nonribosomal biosynthetic products of Fusarium graminearum.</a> J Am Chem Soc. 140 (48), 16783-16791 (2018).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>5-Aminosalicylsäure</td><td>Millipore Sigma&nbsp;</td><td>A79809</td><td></td></tr><tr><td>Barnart-Vakuumpumpe</td><td>Artisan Technology Group</td><td>400-3910</td><td></td></tr><tr><td>COND-905 Mikroleitfähigkeitssonde</td><td>Lazar Research Laboratories Inc.</td><td></td><td></td></tr><tr><td>FLG22-Peptid</td><td>AnaSpec</td><td>AS-62633</td><td></td></tr><tr><td>Infinite 200PRO F</td><td>TeCan Group Ltd.</td><td>30190086</td><td></td></tr><tr><td>Surfakt</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S3523</td><td></td></tr><tr><td>T-2-Toxin</td><td>Cayman Chemical Company Inc</td><td>20433</td><td></td></tr></tbody></table>

bewertung von blattantworten auf mikrobielle sekundärmetabolite mittels eines hochdurchsatzformats

Evaluating Leaf Responses to Microbial Secondary Metabolites Using A High-Throughput Format

Bewertung von Blattantworten auf mikrobielle Sekundärmetabolite mittels eines Hochdurchsatzformats

Microbes secrete structurally diverse secondary metabolites during plant infection, some of which are detected by plant cells, which trigger stress ...

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Biology

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Wir haben eine einfache und reproduzierbare Protokoll Stomata Reaktion auf lebende Bakterien Zugang entwickelt. Diese Methode minimiert Verwundung und Manipulation des Blattes über die Nutzung von epidermalen schält Vergleich bereits berichtet.

Die Beurteilung stomatäre Response to Bakterienzellen Live mit Whole Leaf Imaging

Quelle: Ali, I., et al. Hochdurchsatz-Screening mikrobieller Isolate mit Auswirkungen auf die Gesundheit von Caenorhabditis elegans . J. Vis. Exp. (2022)Dieses Video demonstriert einen Hochdurchsatz-Fluoresziertest, um zu bewerten, wie Darmbakterien die Stressresistenz bei Caenorhabditis elegans beeinflussen. Durch die Verfolgung der blauen Fluoreszenz aus geplatzten Darmgranulaten zeigt der Test frühere Todessignale bei Würmern, die Testbakterien ausgesetzt waren.

Hochdurchsatz-Fluoreszenzanalyse zur Untersuchung von Mikrobe-Wurm-Interaktionen

Die Zellwandstruktur und die chemischen Eigenschaften von Pflanzen werden bewertet, um ideale Rohstoffe für Biokraftstoffe und Biomaterialien zu identifizieren. Standardmethoden haben Einschränkungen, wenn sie auf große Datensätze angewendet werden. Diese Methoden der Hochdurchsatz-Vorbehandlung, der Enzymverzuckerung und der Pyrolyse-Molekularstrahl-Massenspektrometrie vergleichen eine große Anzahl von Biomasseproben mit geringerem Zeit- und Kostenaufwand.

Hochdurchsatz-Screening von Widerspenstigkeit Variationen in Lignocellulose-reicher Biomasse: Gesamt Lignin, Lignin-Monomeren und enzymatische Zuckerfreisetzung

Dieses Manuskript beschreibt, wie die Herbizidstoffwechselraten effektiv mit herausgeschnittenen Blättern eines Dikotyledonenkrauts quantifiziert werden können, wodurch die Variabilität reduziert und mögliche verwirrende Effekte der Herbizidaufnahme oder -translokation beseitigt werden, die typischerweise in Ganzpflanzentests beobachtet werden.

Messraten von Herbizid Metabolism in DICOT Weeds mit einem herausgeschnittenen Blatt Assay

Hier beschreiben wir ein Protokoll für die Extraktion von Metaboliten von Staphylococcus aureus und deren anschließenden Analyse mittels Flüssigchromatographie und Massenspektrometrie.

Ein Tandem-Flüssigchromatographie-Massenspektrometrie-basierter Ansatz zur Analyse von Metabolit<em&gt; Staphylococcus aureus</em

Eine einfache, vielseitige und preisgünstige in-vitro- Hydrokultur-System wurde erfolgreich optimiert und ermöglichen umfangreiche Experimente unter sterilen Bedingungen. Dieses System erleichtert die Anwendung von Chemikalien in einer Lösung und deren effiziente Absorption von Wurzeln für molekularen, biochemischen und physiologischen Studien.

Eine Flexible Low-Cost-Hydrokultur-System für die Bewertung der Pflanze Antworten auf kleine Moleküle unter sterilen Bedingungen

Blatt-Spray-Massenspektrometrie ist eine direkte chemische Analyse-Technik, die minimiert die Probenvorbereitung und beseitigt Chromatographie, so dass für die schnelle Erkennung von kleinen Molekülen von Pflanzengewebe.

Blatt-Spray-Massenspektrometrie: Eine schnelle Ambient Ionisation Technik direkt Metaboliten von Pflanzengewebe bewerten

Dieses Protokoll beschreibt einen einzigen Durchsatz für ergänzende analytische und Omics Techniken, die ihren Höhepunkt in einer voll gepaart Charakterisierung von natürlichen organischen Stoffen und mikrobielle Proteomics in verschiedenen Ökosystemen. Dieser Ansatz ermöglicht die robuste Vergleiche zur Identifizierung von Stoffwechselwegen und Transformationen für Treibhausgasproduktion Beschreibung und Vorhersage Reaktionen auf Veränderungen der Umwelt wichtig.

Single-Durchsatz ergänzende hochauflösende Analysetechniken für die Charakterisierung von komplexen natürlichen organischen Substanz Mischungen

Die vorgestellte Methode schafft natürliches Pflanzenfresser schädigendes Pflanzengewebe durch die Anwendung von Manduca sexta Larven auf abgetrennte Blätter von Kartoffeln. Das Pflanzengewebe wird auf die Expression von sechs Transkriptionsfaktor-Homologen geprüft, die an frühen Reaktionen auf Insektenkraut beteiligt sind.

Freistehende Leaf Assays zur Vereinfachung der Genexpressionsstudien in Kartoffeln während des Befalls durch Kauen Voninsekt Manduca sexta

Die in diesem Protokoll vorgestellten Co-Kultur-Interaktions-Assays sind kostengünstig, hochdurchstöbet und einfach. Diese Assays können verwendet werden, um mikrobielle Wechselwirkungen in der Kokultur zu beobachten, Interaktionsmuster zu identifizieren und das hemmende Potenzial eines mikrobiellen Stammes von Interesse gegen menschliche und ökologische Krankheitserreger zu charakterisieren.

High Throughput Co-Culture Assays für die Untersuchung mikrobieller Wechselwirkungen

Hier wird ein Massenspektrometrie-geführtes Genom-Mining-Protokoll erstellt und beschrieben. Es basiert auf Genomsequenzinformationen und LC-MS/MS-Analysen und zielt darauf ab, die Identifizierung von Molekülen aus komplexen mikrobiellen und pflanzlichen Extrakten zu erleichtern.

Mass Spectrometrie-Guided Genome Mining als Werkzeug zur Aufdeckung neuartiger Naturprodukte

Erfahren Sie, wie Sie Blattantworten auf mikrobielle Sekundärmetabolite in einem Hochdurchsatzformat bewerten. Diese Methode ermöglicht die gleichzeitige Messung von Ionenleckage, Peroxidaseaktivität und Callose-Produktion.

Bewertung von Blattantworten auf mikrobielle Sekundärmetabolite mittels eines Hochdurchsatzformats

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