Name: Mapping Microglial Parameters Software (MMPS): Ein Open-Source-, benutzerfreundliches Werkzeug zur quantitativen Analyse der Mikrogliamorphologie (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-07-24T12:55:00.000+00:00
Duration: 8 min 35 s
Description: Erfahren Sie die quantitative Analyse der Mikrogliamorphologie mit MMPS, einer Open-Source-Software für Einzelzellanalysen ohne Programmierkenntnisse. Validierung erfolgte am Nagetier-Neuroinflammationsmodell.

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<table><tbody><tr><td>12-well plate</td><td>Fisher Scientific</td><td>07-200-82</td><td>Platte zur Inkubation und zum Waschen von Gewebeschnitten.</td></tr><tr><td>Aluminiumfolie</td><td>Fisher Scientific</td><td>01-213-101</td><td>Zum Schutz fluoreszierender Proben vor Lichtexposition.</td></tr><tr><td>Antigen Retrieval Puffer (10&times;)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>00-4955-58</td><td>Zur Verbesserung der Antigenzugänglichkeit bei der Immunfluoreszenzfärbung.</td></tr><tr><td>Anti-Iba1 Primärantikörper</td><td>FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation</td><td>019-19741</td><td>Primärantikörper für die immunfluoreszente Markierung von Mikroglia.</td></tr><tr><td>Kryostat</td><td>Fisher Scientific</td><td>95-710-0L</td><td>Instrument zur Herstellung von Gefrierschnitten aus Hirngewebe in definierten Dicken.</td></tr><tr><td>Donkey anti-Rabbit IgG, Alexa Fluor 555</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>A-21428</td><td>Fluoreszierende Sekundärantikörper zur Visualisierung von Kaninchen-Primärantikörpern.</td></tr><tr><td>Donkey Serum</td><td>Fisher Scientific</td><td>50-413-115</td><td>Blockierungsreagenz zur Reduzierung unspezifischer Antikörperbindungen.</td></tr><tr><td>EVOS FL Auto 2 Imaging System</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMAFD2000</td><td>Fluoreszenzmikroskop zur Bilderfassung.</td></tr><tr><td>Fiji (ImageJ) 2.16.0</td><td>NIH</td><td>fiji.sc</td><td>Bildverarbeitungsplattform zur Analyse der Morphologie und für Plugins.</td></tr><tr><td>Fluoromount-G</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>00-4959-52</td><td>Einbettmedium zur Konservierung von Fluoreszenz und zur Sicherung von Objektträgern.</td></tr><tr><td>Isofluran</td><td>EntirelyPets Pharmacy</td><td>MWI502017</td><td>Inhalationsanästhetikum, das bei Tierversuchen verwendet wird.</td></tr><tr><td>Lipopolysaccharid</td><td>Millipore Sigma</td><td>L2630</td><td>Zur Induktion systemischer Neuroinflammation und mikroglialer Aktivierung bei Nagetieren.</td></tr><tr><td>Matplotlib</td><td>https://pypi.org/project/matplotlib/</td><td></td><td>Python-Plotting-Bibliothek zur Datenvisualisierung und Figurenerstellung.</td></tr><tr><td>MMPS (Mapping Microglial Parameters Software) v1.00</td><td>Diese Arbeit</td><td>https://github.com/NeurodegenerativePharmaceuticalLab/Mapping-Microglia-Parameters-Software/releases/tag/v1.00</td><td>Open-Source-Softwareplattform zur Analyse der Mikroglia-Morphologie.</td></tr><tr><td>Net wells</td><td>Millipore Sigma</td><td>CLS3477</td><td>Einsätze zur Aufnahme von frei schwimmenden Gewebeschnitten während der Färbeverfahren.</td></tr><tr><td>Numpy</td><td>https://pypi.org/project/numpy/</td><td></td><td>Python-Bibliothek für numerische Berechnungen innerhalb von MMPS.</td></tr><tr><td>Objektivlinse (4&times;)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMEP4922</td><td>Objektivlinse mit niedriger Vergrößerung zur anatomischen Orientierung und Regionsidentifikation.</td></tr><tr><td>Objektivlinse (40&times;)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AMEP4625</td><td>Objektivlinse mit hoher Vergrößerung zur Mikroglia-Morphologie-Bildgebung.</td></tr><tr><td>opencv-python</td><td>https://pypi.org/project/opencv-python/</td><td></td><td>Computer-Vision-Bibliothek für Bildverarbeitungsfunktionen innerhalb von MMPS.</td></tr><tr><td>Paraformaldehyd</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>169650025</td><td>Fixiermittel zur Gewebeperfusion und -erhaltung vor der Schnittherstellung.</td></tr><tr><td>Permount</td><td>Fisher Scientific</td><td>SP15-100</td><td>Permanentes Einbettmedium zur Folienerhaltung.</td></tr><tr><td>Phosphat-gepufferte Kochsalzlösung</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP3991</td><td>Pufferlösung zum Waschen von Gewebe und zur Reagenzzubereitung.</td></tr><tr><td>Pillow</td><td>https://pypi.org/project/Pillow/</td><td></td><td>Python-Bildverarbeitungsbibliothek für Bildverarbeitungsoperationen.</td></tr><tr><td>PyQt5</td><td>https://pypi.org/project/PyQt5/</td><td></td><td>Python GUI-Framework zur Generierung der MMPS-grafischen Benutzeroberfläche.</td></tr><tr><td>Python 3.11</td><td>Python Software Foundation</td><td>python.org</td><td>Programmierumgebung, die für die Entwicklung und Ausführung von MMPS verwendet wird.</td></tr><tr><td>R 4.3.2</td><td>R Foundation for Statistical Computing</td><td>r-project.org</td><td>Statistische Software zur Datenanalyse und Grafikerstellung.</td></tr><tr><td>Scikit-image</td><td>https://pypi.org/project/scikit-image/</td><td></td><td>Python-Bildanalysebibliothek zur Bildverarbeitung und Segmentierung.</td></tr><tr><td>Scipy</td><td>https://pypi.org/project/scipy/</td><td></td><td>Python-Wissenschaftspaket zur Filterung und Bildverarbeitungsoperationen.</td></tr><tr><td>Sprague-Dawley-Ratten</td><td>Evingo</td><td>002</td><td>Experimentelle Tiere zur Validierung des Neuroinflammationsmodells.</td></tr><tr><td>Saccharose</td><td>Fisher Scientific</td><td>S5-3</td><td>Kryoprotektor vor dem Einfrieren von Hirngewebe.</td></tr><tr><td>Tifffile</td><td>https://pypi.org/project/tifffile/</td><td></td><td>Python-Paket zum Lesen und Schreiben von TIFF-Bilddateien.</td></tr><tr><td>Tissue-Tek O.C.T. Compound</td><td>Sakura Finetek</td><td>4583</td><td>Einbettmedium für die Kryoschnittherstellung von gefrorenen Gewebeproben.</td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP151-100</td><td>Detersiens zur Membranpermeabilisierung während der Immunfluoreszenz.</td></tr></tbody></table>

mapping microglial parameters software (mmps): ein open-source-, benutzerfreundliches werkzeug zur quantitativen analyse der mikrogliamorphologie

Mapping Microglial Parameters Software (MMPS): An Open-Source, User-Friendly Tool for Quantitative Microglia Morphology Analysis

Mapping Microglial Parameters Software (MMPS): Ein Open-Source-, benutzerfreundliches Werkzeug zur quantitativen Analyse der Mikrogliamorphologie

Microglia are myeloid-derived immune cells of the central nervous system that mediate tissue degradation and remodeling following neurological injury and ...

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Research

Forschung

JoVE Journal

Neuroscience

Neurowissenschaften

Quelle: Etienne, F. et al. Zwei-Photonen-Bildgebung der Anziehungskraft von Mikrogliaprozessen auf ATP oder Serotonin in akuten Hirnschnitten. J. Vis. Exp. (2019)Dieses Video zeigt den Einsatz der Zwei-Photonen-Mikroskopie, um die Anziehungskraft von Mikrogliaprozessen auf eine injizierte Verbindung in Hirnschnitten zu untersuchen. Es bietet einen Überblick über die Präparation von Hirnschnitten von Mäusen, die Injektion eines Chemolockstoff-Testmittels und die Bildgebung fluoreszenzmarkierter...

Zwei-Photonen-Mikroskopie zur Untersuchung der Anziehungskraft des Mikroglia-Prozesses auf eine Verbindung in einem Maushirnschnitt

Ein Schlüssel zur erfolgreichen Untersuchung der Mikroglia-Biologie ist die Erhaltung der Immunfunktion Mikroglia ex vivo bei der Isolierung von ZNS-Gewebe. Trenn Mikroglia über Dreh Schütteln Ergebnisse in hochreiner und immunofunctional Zellkulturen durch Fluoreszenz-Bildgebung, Immunzytochemie, und ELISA folgenden Mikroglia-Aktivierung mit der proinflammatorische Stimuli Lipopolysaccharide (LPS) und Pam 3 4 CSK (Pam) bewertet.

Isolation kortikaler Mikroglia mit bewahrten Immunophänotyp und Funktionalität aus Murine Neugeborene

Mikrogliazellen sind die residenten Immunzellen des zentralen Nervensystems (ZNS) mit hoher Kapazität, in ihren extrazellulären Umgebung phagozytieren oder verschlingen Material. Hier ist eine breit anwendbare, zuverlässige und hoch quantitativen Assay für die Visualisierung und Messung Mikroglia-vermittelte Phagozytose von synaptischen Komponenten beschrieben.

Ein Engulfment Assay: Ein Protokoll, um Interaktionen zwischen Fresszellen und Neuronen CNS bewerten

Mikroglia-Aktivierung und Mikrogliose sind zentrale Antworten auf chronische Neurodegeneration. Hier stellen wir Verfahren zur in-vivo-Langzeit-Visualisierung der Netzhaut CX3CR1-GFP + Mikroglia-Zellen durch konfokale Ophthalmoskopie und zum Schwellenwert und morphometrische Analysen zur Identifizierung und Quantifizierung von deren Aktivierung. Wir überwachen Mikroglia Veränderungen während der frühen Stadien der altersbedingten Glaukom.

In Vivo Dynamics of Retinal Mikrogliaaktivierung Während Neurodegeneration: Confocal Ophthalmoskopische Imaging and Cell Morphometrie in Maus Glaucoma

Dieses Protokoll liefert eine Analyse der Makrophagen-Subpopulationen in das erwachsene Maus-Zentralnervensystem durch Durchflusszytometrie und ist hilfreich für die Untersuchung von mehreren Markern, die von diesen Zellen exprimiert werden.

Analyse von Mikroglia und Monozyten-abgeleiteten Makrophagen aus dem Zentralnervensystem durch Durchflusszytometrie

Mikroglia sind immun Gehirnzellen, die Umfrage und reagieren auf veränderte Gehirnphysiologie durch morphologische Veränderungen, die quantitativ ausgewertet werden kann. Dieses Protokoll beschreibt eine ImageJ basierte Analyse Protokoll, Mikroglia Morphologie als kontinuierliche Daten nach Metriken wie Zelle Verzweigung, Komplexität und Form darzustellen.

Quantifizierung der Mikroglia Morphologie von Mikrofotos von Immunohistochemistry vorbereitet Gewebe mit ImageJ

Dieses Protokoll beschreibt einen schrittweisen Workflow für die immunfluoreszierende Costainierung von IBA1 und TMEM119, zusätzlich zur Analyse der mikrogliaalen Dichte, Verteilung und Morphologie sowie der peripheren myeloischen Zellinfiltration im Gehirngewebe der Maus.

Immunfluoreszenzfärbung mit IBA1 und TMEM119 für Mikroglia-Dichte, Morphologie und periphere Myeloid-Zellinfiltrationsanalyse im Maushirn

In dieser Arbeit beschreiben wir ein Protokoll, das die Adeno-assoziierte Virusinjektion mit der Implantation eines Schädelfensters kombiniert, um die Dynamik der Mikroglia und die neuronale Aktivität in wachen Mäusen simultan abzubilden.

Simultane Bildgebung von Mikrogliadynamik und neuronaler Aktivität in wachen Mäusen

Hier stellen wir zwei Protokolle zur Quantifizierung des mikroglialen Engulfments von vGLUT1-positiven Synapsen und pHRodo Red markierten rohen Synaptosomen mittels Durchflusszytometrie vor.

Quantifizierung des mikroglialen Engulfments von synaptischem Material mittels Durchflusszytometrie

Diese Arbeit demonstriert eine Methode zur Visualisierung und Quantifizierung der Mikroglia-Motilität und des Kontakts mit postsynaptischen Puncta in der Netzhaut mittels rotierender Scheiben-Konfokalmikroskopie.

Live-Bildgebung und Charakterisierung der Mikroglia-Dynamik und Wechselwirkungen mit Synapsen in erkrankter Maus-Netzhaut

Dieses Protokoll kombiniert Durchflusszytometrie und Einzelzell-RNA-Sequenzierung, um Mikrogliazellzustände im Kleinhirn von frühen postnatalen Mäusegehirnen zu isolieren und zu charakterisieren. Es verwendet enzymatische Dissoziation, Percoll-Zentrifugation und Immunfärbung, um die Heterogenität der Mikroglia aufzudecken und das Verständnis ihrer Rolle bei der Kleinhirnentwicklung und -erkrankung zu verbessern.

Durchflusszytometrie und Einzelzellanalyse zur Charakterisierung der Mikroglia-Aktivierung in der frühen postnatalen Entwicklung des Gehirns von Mäusen

Erfahren Sie die quantitative Analyse der Mikrogliamorphologie mit MMPS, einer Open-Source-Software für Einzelzellanalysen ohne Programmierkenntnisse. Validierung erfolgte am Nagetier-Neuroinflammationsmodell.

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