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<ol>
	<li>Barret M, et al. Emergence shapes the structure of the seed microbiota. Appl Environ Microbiol. 2015;81(4):1257-66.</li>
	<li>Nelson EB. The seed microbiome: Origins, interactions, and impacts. Plant Soil. 2018;422(1):7-34.</li>
	<li>Shade A, Jacques MA, Barret M. Ecological patterns of seed microbiome diversity, transmission, and assembly. Curr Opin Microbiol. 2017;37:15-22.</li>
	<li>Truyens S, Weyens N, Cuypers A, Vangronsveld J. Bacterial seed endophytes: Genera, vertical transmission and interaction with plants. Environ Microbiol Rep. 2015;7(1):40-50.</li>
	<li>Torres-Cort&#233;s G, et al. Differences in resource use lead to coexistence of seed-transmitted microbial populations. Sci Rep. 2019;9(1):6648.</li>
	<li>Vilchez JI, Yang Y, Yi D, Zhang H. Measurements of root colonized bacteria species. Bio-protocol. 2021;11(7):e3976.</li>
	<li>Wassermann B, Cernava T, M&#252;ller H, Berg C, Berg G. Seeds of native alpine plants host unique microbial communities embedded in cross-kingdom networks. Microbiome. 2019;7(1):108.</li>
	<li>Ding JYM, Ho LS, Ibrahim J, Teh CK, Goh KM. Impact of sterilization and chemical fertilizer on the microbiota of oil palm seedlings. Front Microbiol. 2023;14:1091755.</li>
	<li>Lagier JC, et al. The rebirth of culture in microbiology through the example of culturomics to study human gut microbiota. Clin Microbiol Rev. 2015;28(1):237-64.</li>
	<li>Links MG, et al. Simultaneous profiling of seed-associated bacteria and fungi reveals antagonistic interactions between microorganisms within a shared epiphytic microbiome on Triticum and Brassica seeds. New Phytol. 2014;202(2):542-53.</li>
	<li>Compant S, et al. The plant endosphere world&#8212;bacterial life within plants. Environ Microbiol. 2021;23(4):1812-29.</li>
	<li>Wegner CE, Liesack W. Microbial community dynamics during the early stages of plant polymer breakdown in paddy soil. Environ Microbiol. 2016;18(9):2825-42.</li>
	<li>Xu XY, et al. Seed-microbiome interactions: Mechanistic insights and utilization toward seed performance for sustainable agriculture. Plant Commun. 2026;7(3):101716.</li>
	<li>Rom&#227;o I, do Carmo-Gomes J, Silva D, Vilchez JI. The seed microbiota from an application perspective: An underexplored frontier in plant-microbe interactions. Crop Health. 2025;3(1):12.</li>
	<li>Amann RI, Ludwig W, Schleifer KH. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation. Microbiol Rev. 1995;59(1):143-69.</li>
	<li>Yu Y, Chen Z, Xie H, Feng X, Wang Y, Xu P. Overhauling the effect of surface sterilization on analysis of endophytes in tea plants. Front Plant Sci. 2022;13:849658.</li>
	<li>Berg G, Raaijmakers JM. Saving seed microbiomes. ISME J. 2018;12(5):1167-70.</li>
	<li>Bewley JD. Seed germination and dormancy. Plant Cell. 1997;9(7):1055-66.</li>
	<li>Niza-Costa M, et al. Geographically disperse, culturable seed-associated microbiota in forage plants of alfalfa (Medicago sativa L.) and pitch clover (Bituminaria bituminosa L.): Characterization of beneficial inherited strains as plant stress-tolerance enhancers. Biology. 2022;11(12):1838.</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Agar</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>01916-500G</td><td>Komponente des LB-Agarmediums; 15 g/l.</td></tr><tr><td>Autoklav</td><td>Lab1st&nbsp;</td><td>SV120H</td><td>Zum Sterilisieren von Instrumenten/Materialien oder zur Validierung aseptischer Behandlung.</td></tr><tr><td>Bakterien-DNA-Extraktionskit</td><td>Promocell</td><td>PK-MB708-206-100</td><td>DNA-Extraktion&nbsp;</td></tr><tr><td>Kolonienzähl-/Aufzeichnungseinrichtung</td><td>OCS</td><td>B079Y5W57N</td><td>Zum Aufzeichnen von KBE, Morphotypen und Plattenunterschieden erforderlich; im Manuskript wird kein Zähler/Modell angegeben.</td></tr><tr><td>Kryo-Vorratsfläschchen</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Z359033</td><td>Impliziert für die Lagerung von Glyzerolvorräten bei -80 °C; nicht explizit benannt, aber für den Konservierungsschritt erforderlich.</td></tr><tr><td>Digitales Isolat-Aufzeichnungssystem</td><td>Im Manuskript nicht angegeben</td><td>Nicht zutreffend</td><td>Zum Aufzeichnen von Isolat-Metadaten verwendet: Herkunft, Replikat, Zustand, Sterilisationsbehandlung, Isolationsdatum, Plattenmedium, Morphologie, Identifikationsstatus.</td></tr><tr><td>Ethanol</td><td>VWR</td><td>83813440</td><td>Zur Herstellung einer 70%igen v/v-Ethanollösung für die Samenoberflächensterilisation verwendet.</td></tr><tr><td>Filterpapier</td><td>Fisher Scientific</td><td>11718772</td><td>Optionale alternative Keimungsunterstützung.</td></tr><tr><td>Pinzette/Zange</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>930229</td><td>Zum Übertragen von Samen und Sammeln gekeimter Sämlinge.</td></tr><tr><td>Genomisches DNA-Extraktionskit</td><td>PromoCell</td><td>PK-MB708-206-100</td><td>Zur Extraktion genomischer DNA aus gereinigten Bakterienkulturen verwendet; genaues Kit/Verfahren nicht angegeben.</td></tr><tr><td>Glycerol, steril 80%</td><td>VWR</td><td>24388364</td><td>1:1 v/v mit flüssiger Kultur zur Kryostock-Vorbereitung gemischt.</td></tr><tr><td>Laminar-Flow-Hauben Bio48</td><td>Faster</td><td>LAB-CAP-22</td><td>Erforderlich für aseptische Samenhandhabung, Sterilisationsübertragungen und Vorbereitung steriler Materialien.</td></tr><tr><td>LB-Agarmedium</td><td>VWR</td><td>846495000</td><td>Standardmedium für vergleichende Kultivierung; pro Liter: 10 g Trypton, 5 g Hefeextrakt, 10 g NaCl, 15 g Agar.</td></tr><tr><td>Mikrozentrifugenröhrchen</td><td>Ratiolab</td><td>RATI5615000</td><td>Zur Samensterilisation und Probenverarbeitung verwendet.</td></tr><tr><td>MS-Medium</td><td>Sigma</td><td>M0404-10L</td><td>Als steriles Keimungsunterstützungsmittel für axenische Keimung erwähnt.</td></tr><tr><td>NZYTaq II 2&times; Mastermix</td><td>Nzytech</td><td>MB35803</td><td>PCR-Mix zur Amplifikation</td></tr><tr><td>Parafilm</td><td>Parafilm/Merck</td><td>HS234526A</td><td>Zum Versiegeln von Keimungsplatten bei gleichzeitiger Reduzierung der Kontamination verwendet.</td></tr><tr><td>Petrischalen</td><td>Labbox</td><td>PDIP-E9N-500</td><td>Zum Keimungsaufbau, Platten und Handhaben sterilisierter Samen verwendet.</td></tr><tr><td>Phytoagar</td><td>Duchefa Biochemie</td><td>9002-18-0</td><td>Als optionale alternative sterile Keimungsunterstützung erwähnt.</td></tr><tr><td>Pipetten-Set und Spitzen</td><td>Merck</td><td>EP3123000918-1EA</td><td>Zum Entfernen von Sterilisationslösungen, Waschen, Verdünnen und Platten verwendet.</td></tr><tr><td>R2A-Agarmedium</td><td>HI-MEDIA</td><td>M1743-500G</td><td>Optionales zusätzliches Medium für erweiterte Kulturomics-Workflows.</td></tr><tr><td>Natriumchlorid, NaCl</td><td>Fisher Chemical</td><td>10040460</td><td>Zur Herstellung steriler 0,45%iger NaCl für Homogenisierung und serielle Verdünnungen verwendet; auch Bestandteil des LB-Mediums.</td></tr><tr><td>Natriumhypochlorit</td><td>Carlo Erba</td><td>370323</td><td>Zur Herstellung einer 20%igen v/v-Natriumhypochloritlösung für die Samenoberflächensterilisation verwendet. Korrosiv; erfordert PSA.</td></tr><tr><td>Sterile Einweg-Stössel</td><td>Eppendorf</td><td>EP0030120973</td><td>Zur Homogenisierung trockener Samen und gekeimter Sämlinge verwendet.</td></tr><tr><td>Vortex-Mixer</td><td>Fisher Scientific</td><td>15901137</td><td>Zum Resuspendieren mikrobielle Zellen aus Homogenaten verwendet.</td></tr></tbody></table>

isolierung der mit tomatensamen assoziierten mikrobiota durch kontrollierte keimung und vergleichende kultivierung

Isolation of Tomato Seed-Associated Microbiota Through Controlled Germination and Comparative Culturing

Isolierung der mit Tomatensamen assoziierten Mikrobiota durch kontrollierte Keimung und vergleichende Kultivierung

Surface sterilization is a critical yet frequently under-optimized step in studies aiming to isolate seed-associated microorganisms, as excessively harsh ...

isolation-tomato-seed-associated-microbiota-through-controlled

Research

Forschung

JoVE Journal

Biology

Biologie

Quelle: Hassan, J. A., et al. Hochdurchsatz-Identifizierung von Resistenzen gegen Pseudomonas syringae pv. Tomate in Tomate mit dem Seedling Flood Assay. J. Vis. Exp. (2020).Dieses Video zeigt eine Methode zum Screening auf bakterielle Resistenz bei verschiedenen Tomatenstämmen mit zehn Tage alten Sämlingen, die mit einer bakteriellen Suspension geimpft wurden. Es wird erklärt, wie Bakterien durch Spaltöffnungen eindringen, Effektorproteine liefern, um die pflanzliche Immunität zu unterdrücken,...

Sämlingsflut-Assay zum Screening der bakteriellen Resistenz bei Tomaten

Quelle: Nathoo, N., et al. Ein hydroponisches Co-Kultivierungssystem zur gleichzeitigen und systematischen Analyse der molekularen Interaktionen und Signalwege von Pflanzen und Mikroben. J. Vis. Exp. (2017).Dieses Video zeigt ein hydroponisches Co-Kultivierungssystem zur Untersuchung von Pflanzen-Bakterien-Interaktionen unter sterilen Bedingungen. Die Pflanzensämlinge werden in ein steriles, saures Wachstumsmedium überführt, inkubiert und auf Kontamination untersucht, bevor sie mit...

Ein Co-Kultivierungssystem zur Untersuchung der molekularen Reaktionen von pflanzlichen Wirten und interagierenden Bakterien

Endophytische Bakterien besiedeln Pflanzengewebe und fördern das Pflanzenwachstum.Um ihre Auswirkungen auf das Wachstum von Tomatenpflanzen unter Salzstress zu untersuchen, beginnen Sie mit sterilen Sämlingen, die sich entwickelnde Blätter und Wurzeln zeigen.Tauchen Sie die Wurzeln des experimentellen Sämlings in eine Suspension endophytischer Bakterien; Lassen Sie die Kontrolle ungeimpft.Übertragen Sie beide Gruppen in sterilisierte Erde, um eine äußere mikrobielle Interferenz zu verhindern,...

Verbesserung der Salzstresstoleranz bei Tomatenpflanzen durch endophytische Bakterienbesiedlung

Quelle: Matthysse, A. G. Die Haftung von Bakterien an Pflanzenoberflächen, gemessen im Labor. J. Vis. Exp., (2018)Dieses Video demonstriert ein Protokoll zur Messung der Wurzelbesiedlung von Tomatensämlingen durch Wildtyp- und cellulosearme pathogene Bakterien. Lebensfähige Zählungen eng haftender Bakterien zeigen eine stärkere Haftung und Mikrokoloniebildung durch den Wildtyp-Stamm, was die Rolle von Cellulose bei der stabilen Wurzelbesiedlung unterstreicht.

Bewertung der Wurzelbesiedlung von Tomatensetzlingen durch ein pathogenes Bakterium anhand lebensfähiger Zellzählungen

Eine einfache Methode zur Messung und Charakterisierung von bakteriellen Adhäsion zu Pflanzen, besonders Wurzeln und Sprossen, wird in diesem Artikel beschrieben.

Einhaltung von Bakterien auf Flächen, die im Labor ermittelten Pflanzen

Hier präsentieren wir eine vielseitige Methode zur Tomatenwurzeltransformation, gefolgt von der Impfung mit Ralstonia solanacearum, um eine einfache genetische Analyse für die Untersuchung von bakteriellen Wilt-Erkrankungen durchzuführen.

Tomatenwurzeltransformation gefolgt von Impfung mit Ralstonia Solanacearum für einfache genetische Analyse der bakteriellen Wilt-Krankheit

Der Sämlingsfluttest erleichtert die schnelle Überprüfung von Wildtomaten-Beitritten auf die Resistenz gegen das Pseudomonas syringae Bakterium. Dieser Assay, der in Verbindung mit dem bakteriellen Wachstumstest verwendet wird, kann bei der weiteren Charakterisierung der zugrunde liegenden Resistenz gegen das Bakterium helfen und kann verwendet werden, um Kartierungspopulationen zu untersuchen, um die genetische Grundlage des Widerstands zu bestimmen.

High-Throughput Identifikation der Resistenz gegen Pseudomonas syringae pv. Tomate in Tomaten mit Seedling Flood Assay

Um ein axenisches Insekt zu erhalten, wird seine Eioberfläche sterilisiert, und die geschlüpfte Larve wird anschließend mit axenischen Blättern aufgezogen. Diese Methode bietet eine effiziente Möglichkeit für die axenische Insektenvorbereitung, ohne Antibiotika zu verabreichen oder eine künstliche Diät zu entwickeln, die auch auf andere blattfressende Insekten angewendet werden kann.

Vorbereitung und Aufzucht axenischer Insekten mit gewebekultivierten Sämlingen für Wirt-Darm-Mikrobiota-Interaktionsstudien des Blattkäfers

Dieses Protokoll enthält eine detaillierte Zusammenfassung der Strategien zur Beimpfung von Pflanzenwurzeln mit bodenbürtigen Mikroben. Am Beispiel der Pilze Verticillium longisporum und Verticillium dahliae werden drei verschiedene Wurzelinfektionssysteme beschrieben. Mögliche Anwendungen und mögliche nachgelagerte Analysen werden aufgezeigt und Vor- oder Nachteile für jedes System diskutiert.

Impfungsstrategien zur Infektion von Pflanzenwurzeln mit bodenbürtigen Mikroorganismen

Dieses Protokoll zielt darauf ab, detaillierte Verfahren zum Sammeln, Fixieren und Pflegen mykoheterotropher Pflanzenproben bereitzustellen, wobei verschiedene Mikroskopietechniken wie Raster- und Transmissionselektronenmikroskopie, Licht-, Konfokal- und Fluoreszenzmikroskopie angewendet werden, um die Pilzbesiedlung in Pflanzengeweben und Samen zu untersuchen, die mit Mykorrhizapilzen gekeimt sind.

Mikroskopische Techniken zur Interpretation der Pilzbesiedlung in mykoheterotrophen Pflanzengeweben und der symbiotischen Keimung von Samen

Der Tomatensamen ist ein wichtiges Modell für das Studium der Genetik und Entwicklungsbiologie während der Pflanzenvermehrung. Dieses Protokoll ist nützlich, um Tomatensamen in verschiedenen Entwicklungsstadien zu entfernen, um die feinere embryonale Struktur zu beobachten.

Ein effizientes Clearing-Protokoll zur Untersuchung der Saatgutentwicklung bei Tomaten (Solanum lycopersicum L.)

iPlantMicro Lab..  Dieses Protokoll kombiniert standardisierte Samenoberflächensterilisation mit kontrollierter Keimung, um die reproduzierbare Isolierung der mit Tomatensamen assoziierten Mikrobiota während des Übergangs vom Samen zum Sämling zu ermöglichen. Der Ansatz verbessert die Rückgewinnung kultivierbarer Mikroorganismen, die in Trockensamen unterrepräsentiert sind, und unterstützt vergleichende kulturomatische Studien während der frühen K...

Isolierung der mit Tomatensamen assoziierten Mikrobiota durch kontrollierte Keimung und vergleichende Kultivierung

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