Proteómica

La proteómica puede definirse como el estudio sistemático a gran escala del proteoma, el conjunto completo de proteínas expresadas por un orgánulo, célula, tejido u organismo en un momento determinado.

Dependiendo del tipo de estudio, se podría utilizar el enfoque de proteómica de arriba hacia abajo, que analiza las proteínas intactas de los sistemas biológicos, o el enfoque de abajo hacia arriba, que estudia las proteínas mediante el análisis de los fragmentos de péptidos, para obtener información sobre el conjunto de proteínas objetivo.

En un flujo de trabajo típico, se recogen muestras de proteínas, por ejemplo, de pacientes con COVID-19 y controles sanos, y se digieren en péptidos. Luego, las técnicas de alto rendimiento, como la EM, permiten la identificación y el cribado comparativo de proteínas significativamente reguladas o alteradas entre las poblaciones de estudio, que pueden identificarse utilizando las bases de datos disponibles. Este perfil de proteoma en profundidad permite la detección de biomarcadores de proteínas específicas de la enfermedad y la identificación de posibles dianas terapéuticas.

La proteómica de la expresión estudia las diferencias en la expresión de proteínas entre muestras. La proteómica estructural ayuda a mapear la estructura de la proteína dentro de un orgánulo específico, mientras que la proteómica funcional identifica las funciones biológicas de un individuo o una clase de proteínas.