Facilitar el análisis de los datos inmunológicos con Visual técnicas analíticas

Summary

La analítica visual (AV) es un nuevo enfoque de análisis de datos de forma interactiva. En este video, se discute el problema de la sobrecarga de datos causada por experimentos de alto rendimiento biológico y proponer VA como una solución a tal problema. El video muestra el análisis dentro y entre los conjuntos de datos inmunológicos utilizando una herramienta llamada Tableau VA.

Abstract

La analítica visual (VA) ha surgido como una nueva forma de analizar la gran base de datos a través de pantallas de visualización interactiva. Hemos demostrado la utilidad y la flexibilidad de un enfoque de VA en el análisis de conjuntos de datos biológicos. Ejemplos de estos conjuntos de datos en inmunología incluyen la citometría de flujo, los datos de Luminex, y el genotipo (por ejemplo, el polimorfismo de nucleótido único) de datos. A diferencia del enfoque tradicional de visualización de información, VA restaura el poder de análisis en las manos del analista, al permitir que el analista de participar en tiempo real proceso de exploración de datos. Hemos seleccionado el software VA llamado Tableau después de evaluar varias herramientas de VA. Hay dos tipos de tareas de análisis de análisis dentro y entre los conjuntos de datos se demuestra en el video de presentación usando un método llamado análisis de pares. El análisis de pares, tal como se define en el VA, es un método de análisis en el que un experto en la herramienta VA trabaja codo a codo con un experto en el campo durante el análisis. El experto en el campo es el que entiende la importancia de los datos, y hace las preguntas que los datos recogidos podrían abordar. El experto herramienta crea visualizaciones para ayudar a encontrar patrones en los datos que puedan responder a estas preguntas. El corto tiempo de retardo entre la generación de hipótesis y la visualización rápida visual de los datos es la principal ventaja de un enfoque de VA.

Protocol

1. Exploración basada en el análisis de Tableau

1. Usted tiene un conjunto de datos y desea explorar las diversas relaciones entre las columnas de los datos.
   1. (Figura 1) Importar el conjunto de datos, haga clic en "Conectar a los datos. Seleccione el tipo de fuente de datos y siga las instrucciones para importar el conjunto de datos.
   2. (Figura 1) Asegúrese de que la plataforma contiene columnas de dimensiones categóricas a la vez la plataforma de medidas contiene las columnas numéricas del conjunto de datos. En ocasiones una columna de dimensión, tales como identificador de objeto se puede enumerar como medida si es numerado. El cambio a las d....

Discussion

El advenimiento de la tecnología de alto rendimiento en la investigación biomédica moderna llevó a una explosión de datos de investigación que requiere de una forma más eficiente de los análisis. La analítica visual (AV) es la ciencia del razonamiento analítico facilitada por interfaces interactivas visuales (1). El enfoque VA restaura el poder analítico en las manos del analista humano, a diferencia del enfoque tradicional para detectar patrones por ordenador. La analítica visual se ha aplicado a la investigación en di.......