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1. Ensayo de toxicidad líquida de C. elegans con Aeromonas
NOTA: Para evitar la contaminación, se deben realizar pasos en una campana de flujo laminar.
- Al día siguiente de sembrar los gusanos L1 en la placa ENGM (medio de crecimiento nematodo enriquecido) se extienden con E. coli OP50, se recoge una sola colonia de cada una de las cuatro cepas de Aeromonas y E. coli OP50, y se cultiva con caldo de 5 mL LB cada uno a 37 °C durante 16 horas.
NOTA: En el protocolo, se utilizaron las siguientes cepas bacterianas: E. coli OP50, la fuente normal de alimento de C. elegans. A. dhakensis AAK1, el primer aislado clínico patógeno completamente secuenciado de A. dhakensis . A. hydrophila A2-066, A. veronii A2-007 y A. caviae A2-9307121 son aislados clínicos representativos del Hospital Nacional de la Universidad Cheng Kung.
NOTA: Para preparar NGM enriquecido (ENGM), disuelva 3 g de NaCl, 5 g de peptona bacteriana, 1 g de extracto de levadura y 30 g de agar en 1 L de agua desionizada. Autoclave a 121 °C durante 20 minutos. Espera hasta que se enfríe a 55 °C en baño maria y añade 1 mL de 1 M CaCl2, 1 mL de 1 MMgSO 4, 1 mL de colesterol al 5% en etanol y 25 mL de tampón de fosfato. Haz un giro para mezclar bien. - Mide la absorción OD600 del caldo de bacterias.
- Centrifuga el caldo bacteriano a 3.500 x g durante 15 minutos para eliminar el caldo LB. Resuspende las bacterias y ajusta el caldo bacteriano a un OD600 = 3.0 con medio S. Añade 195 μL de caldo bacteriano en medio S a al menos 8 pozos de una placa de 96 pozos.
NOTA: La composición del medio S: Para preparar el medio S, mezcle 40 mL de basal S, 0,4 mL de citrato de potasio M, 0,4 mL de solución de metales traza, 0,12 mL de 1 MCaCl 2, 0,12 mL de 1 M MgSO4, 40 μL de colesterol al 5% en etanol y 1 mL de 8 mM FudR antes de su uso. - Lava los gusanos L4 de la placa ENGM con E. coli OP5 usando medio M9. Ajustar la solución de gusano a una concentración de 5 gusanos por μL y añadir 5 μL de la solución de gusano a cada pozo de la placa de 96 pozos. Asegúrate de que haya aproximadamente 25 lombrices por pozo.
- Incuba la placa de 96 pozos en un agitador a 200 rpm a 25 °C.
- Cuenta el número de gusanos vivos y muertos después de 24, 48 y 72 horas. Calcula las tasas de supervivencia de cada pozo con la siguiente fórmula: (Gusanos vivos/Total de gusanos) × 100%.
- Dibuja un gráfico de dispersión con el cálculo diario de datos.