1. Ensayo de Fijación/Endocitosis
NOTA: Asegúrese de preparar todos los reactivos antes de comenzar el ensayo. Para los tres grupos de control presentados en la sección de resultados (células mock-infectadas, células pretratadas con neuraminidasa y células tratadas con azida de sodio), se requieren pequeñas alteraciones en el protocolo.
- Prepare 16 tubos de fondo profundo, cada uno conteniendo 200.000 células A549. Junto al conjunto experimental formado por 4 tubos, hay 3 condiciones de control, cada una requiriendo 4 tubos: células mock-infectadas, células pretratadas con neuraminidasa (NA) y células tratadas con azida de sodio. Cada grupo consta de 4 tubos etiquetados como ‘0 min’, ‘0 min + estreptavidina (STV)’, ‘30 min’, ‘30 min + STV’.
- Centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda el pellet en 200 µl de solución salina tamponada con fosfato (PBS).
- Centrifugue los tubos a 4 °C a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda el pellet en 200 µl de medio de Eagle modificado de Dulbecco (DMEM) que contenga 0,3 % de albúmina sérica bovina (BSA), 20 mM de 4-(2-hidroxietil)-1-piperazinaetanosulfónico (HEPES) y 1 % de penicilina-estreptomicina (medio de incubación). Incube durante 30 min a 37 °C.
NOTA: Para el control con neuraminidasa: utilice neuraminidasa bacteriana (por ejemplo, sialidasa de Vibrio cholera) a una concentración de 200 mU/ml diluida en medio de incubación para resuspender las células. - Centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda el pellet en 200 µl de PBS. Repita este paso una vez más y luego enfríe los tubos en hielo durante 10 min.
- Centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda el pellet en 100 µl de virus biotinilado (utilice la concentración de virus determinada en la sección 2 diluida en PBS de infección). Incube 1 h en hielo.
- Centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda el pellet en 200 µl de PBS. Repita este paso una vez más.
NOTA: Para el control mock-infectado: utilice PBS de infección sin virus. Para el control con azida de sodio: utilice virus diluido en PBS de infección suplementado con 0,1 % de azida de sodio. - Procesamiento de las muestras tras la infección en hielo:
- Para las muestras de ‘0 min’, siga el paso 2.5 y almacene las muestras a 4 °C hasta que el resto de muestras sean fijadas.
- Para las muestras de ‘0 min + STV’, centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda los pellets en 50 µl de STV (utilice la concentración determinada en la sección 3) diluida en PBS que contenga 2 % de BSA y 0,1 % de azida de sodio (para prevenir la internalización durante el manejo de la muestra). Incube 30 min en hielo.
- Centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda el pellet en 200 µl de PBS. Repita este paso una vez más.
- Para la fijación, centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda el pellet en 100 µl de paraformaldehído (PFA) al 3,7 %. Incube durante 10 min a temperatura ambiente (RT). Luego, repita el paso de lavado descrito en 1.6) y almacene las muestras a 4 °C.
- Para las muestras de ’30 min’, centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda el pellet en 200 µl de PBS que contenga 2 % de BSA. Incube 30 min a 37 °C. Siga los pasos 1.7.3-1.7.4 y almacene las muestras a 4 °C.
NOTA: Para el control con azida de sodio: utilice PBS suplementado con 2 % de BSA y 0,1 % de azida de sodio para la incubación de 30 min a 37 °C. - Para las muestras de ’30 min + STV’, centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda el pellet en 200 µl de PBS que contenga 2 % de BSA. Incube 30 min a 37 °C. Luego, centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda los pellets en 50 µl de STV (utilice la concentración determinada en la sección 3) diluida en PBS que contenga 2 % de BSA y 0,1 % de azida de sodio (para prevenir la internalización durante el manejo de la muestra). Incube 30 min en hielo. Siga los pasos 1.7.3-1.7.4 y almacene las muestras a 4 °C.
NOTA: Para el control con azida de sodio: utilice PBS suplementado con 2 % de BSA y 0,1 % de azida de sodio para la incubación de 30 min a 37 °C.
- Para la permeabilización, centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda el pellet en 100 µl de PBS que contenga 0,5 % de Triton X-100. Incube durante 6 min a temperatura ambiente. Luego, repita el paso de lavado descrito en 1.6).
- Centrifugue los tubos a 4 °C durante 3 min a 450 x g. Retire el sobrenadante y resuspenda el pellet en 50 µl de BSA al 2 % diluida en PBS que contenga STV-Cy3. (Tenga en cuenta que la concentración adecuada de STV-Cy3 debe determinarse antes de comenzar el experimento. Comience con una concentración de 1:200 y pruebe diluciones de dos veces hasta 1:2.400. En nuestra experiencia, una dilución de 1:1.000 resultó ser óptima.)
- Incube 1 h a oscuras a temperatura ambiente. Luego, repita el paso de lavado descrito en 1.6, pero resuspenda el pellet en 200 µl de BSA al 2 % diluida en PBS.
- Analice las muestras mediante citometría de flujo. Determine el porcentaje de células positivas para Cy3 en cada muestra.