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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
En este artículo se presenta un método basado en microfluídica para el confinamiento de partículas basado en el flujo hidrodinámico. Demostramos atrapando partículas estables en un punto de estancamiento de líquido mediante un mecanismo de control de retroalimentación, lo que permite el confinamiento y la micromanipulación de partículas arbitrarias en un microdispositivo integrado.
La capacidad de confinar y manipular las partículas individuales en una solución libre es una tecnología clave para la ciencia fundamental y aplicada. Métodos para la captura de partículas basado en técnicas ópticas, magnéticas, electrocinética y acústicos han conducido a importantes avances en la física y la biología que van desde el molecular a nivel celular. En este artículo, se introduce una nueva técnica basada en microfluidos para atrapar las partículas y la manipulación basada únicamente en el flujo de fluido hidrodinámico. Usando este método, se demuestra la captura de partículas de micro-y nano-escala en soluciones acuosas de las escalas de tiempo. La trampa de la hidrodinámica se compone de un dispositivo integrado de microfluidos con una geometría de canales cruzados ranura en la que dos corrientes opuestas convergen laminar, lo que genera un flujo planar extensional con un punto de estancamiento de líquidos (cero punto la velocidad). En este dispositivo, las partículas están confinadas en el centro de la trampa de control activo del campo de flujo para mantener la posición de la partícula en el punto de estancamiento de líquidos. De esta manera, las partículas se encuentran atrapados en una solución de forma gratuita mediante un algoritmo de control de retroalimentación a cabo con un código personalizado, construido LabVIEW. El algoritmo de control consiste en la adquisición de imágenes de una partícula en el dispositivo de microfluidos, seguido por el rastreo de partículas, la determinación de la posición de la partícula centroide, y el ajuste activo del flujo de fluidos mediante la regulación de la presión aplicada a una válvula neumática en el chip con un regulador de presión. De esta manera, el on-chip las funciones dinámicas de la válvula de medición para regular las tasas de flujo relativo en los canales de salida, lo que permite a escala fina de control de posición de estancamiento punto y la captura de partículas. La trampa de la hidrodinámica de microfluidos basada en exposiciones de varias ventajas como un método para la captura de las partículas. Atrapando hidrodinámico es posible para cualquier partícula arbitraria sin requisitos específicos de las propiedades físicas o químicas del objeto atrapado. Además, la captura hidrodinámico permite el confinamiento de un objeto "único" objetivo de suspensiones de partículas concentradas o lleno de gente, que es difícil de usar la fuerza alternativa basada en el terreno los métodos de captura. La trampa de la hidrodinámica es fácil de usar, fácil de implementar y puede ser añadido a los actuales dispositivos de microfluídica para facilitar la captura y análisis a largo plazo de las partículas. En general, la trampa de la hidrodinámica es una nueva plataforma para el confinamiento, la micromanipulación, y la observación de las partículas sin inmovilización de superficie y elimina la necesidad de campos ópticos, magnéticos y eléctricos potencialmente perturbativa de la captura sin solución de partículas pequeñas.
La trampa de la hidrodinámica se compone de un híbrido de dos capas (polidimetilsiloxano (PDMS) / vidrio) dispositivo de microfluidos para el confinamiento de las partículas. Los pasos 1-2 describe la fabricación de dispositivos de microfluídica, y el proceso de diseño 4.3 dispositivo de discutir y operación.
1. SU-8 de fabricación del molde (no se muestra en el video)
2. Fabricación de dispositivos de microfluídica
Pasos 3-4 describen la aplicación de la trampa de hidrodinámica de utilizar el dispositivo de microfluidos descrito anteriormente.
3. Instalación de trampas Experimental hidrodinámico
4. Procedimiento de captura hidrodinámico
Código de LabVIEW: Nota sobre el uso para el controlador de Comentarios
Atrapando las partículas automatizado se logra utilizando un algoritmo de control de retroalimentación lineal implementado mediante un código personalizado de LabVIEW. El código de LabVIEW captura imágenes de una cámara CCD y transmite un potencial eléctrico (voltaje) de un regulador de presión, que modula activamente la posición (estado parcialmente abierto / cerrado) de una válvula neumática en el chip dinámico. A medida que cambia la posición de la válvula, la tasa de flujo hidrodinámico en la línea de salida de un is ajustada, con lo que el cambio de posición del punto de estancamiento y que permite atrapar hidrodinámica. Los pasos en el circuito de retroalimentación de forma secuencial e iterativa ejecutado en la tasa de captura de imágenes (10-60 Hz). El código de LabVIEW ejecuta los siguientes pasos durante cada ciclo de retroalimentación:
El código de LabVIEW registros de los siguientes datos para cada imagen capturada durante la captura de partículas: 1) el tiempo transcurrido, 2) centroide (x, y) la posición de la partícula atrapada, 3) la posición del centro de la trampa, 4) la distancia de la partícula de la presión trampa centro, 5) aplicada a la válvula en el chip. Además, el código también se graba una película de la partícula atrapada en formato AVI.
5. Resultados representante
Estamos atrapados perlas fluorescentes de poliestireno de varios tamaños (100, 540, 830 nm y 2,2 m de diámetro) con una trampa hidrodinámica. Figura 1 (a) muestra una imagen de una partícula atrapada en el cruce transversal de la ranura de un dispositivo de microfluidos. La trayectoria de una partícula atrapada se puede determinar directamente a partir de los datos de posición registrados por el centro de gravedad código de LabVIEW en un evento de captura o mediante el seguimiento y la localización de la partícula atrapada en el archivo de película. Figura 1 (b) muestra la trayectoria de una partícula atrapada (2,2 micras fluorescentes de poliestireno de cuentas) a lo largo de la dirección del canal de salida. El grano es inicialmente atrapado (cuadrados) durante 3 min y se libera de la trampa y se escapa a lo largo de uno de los canales de salida (los círculos). Trayectorias de las partículas a lo largo del eje del flujo de compresión (dirección del canal de entrada, los datos no mostrados) son similares a las trayectorias de las partículas a lo largo del eje del flujo extensional (dirección salida) como se muestra en la Figura 1 (b). Un histograma de desplazamiento de partículas desde el centro de captura para una atrapada de bolas (2,2 m de diámetro) a lo largo de las direcciones de salida del canal se muestra en la Figura 1 (c). Utilizando el algoritmo de control de retroalimentación se describe en este trabajo, las partículas atrapadas se limitan a un margen de ± 1 m del centro de la trampa a lo largo de la entrada y salida de las direcciones de canal.
Un esquema del dispositivo de microfluidos utilizados para la captura de hidrodinámica se muestra en la Figura 2. El dispositivo de microfluidos integrado consiste en una capa de fluido y una capa de control y se fabrica utilizando la litografía blanda estándar de múltiples capas como se describe en este artículo. La capa de fluido contiene los canales de amortiguación y de la muestra, así como la geometría de canales cruzados ranura para facilitar la captura de hidrodinámica. La capa de control consta de una válvula neumática situado sobre uno de los canales de salida en la capa de fluido, y el control de fluidos y capas están separadas por una delgada membrana elastomérica. Durante el funcionamiento del dispositivo, la válvula en la capa de control se presuriza con gas nitrógeno, que las fuerzas de la fina membrana en la capa de fluido, lo que induce una constricción en el canal de salida. La válvula neumática dinámica constriñe el canal de salida de cantidades variables, cambiando la presión aplicada a la capa de control, que ajusta las tasas de flujo relativo en los canales de salida y permite a escala fina de control del punto de estancamiento.

Figura 1: Captura de partículas. (A) Imagen de una sola cuenta confinado en la trampa de la hidrodinámica. Además de la perla en el centro de la trampa, varias cuentas interceptadas se muestran en la región de captura. (B) la trayectoria de una partícula atrapada a lo largo de los canales de salida (cuadrados). Cuando la partícula se libera de la trampa (flecha), que escapa a lo largo de uno de los canales de salida (los círculos). (C) histograma de los desplazamientos de una atrapada de cuentas (2,2 m de diámetro) del centro de la trampa a lo largo de los canales de salida.

Figura 2. Esquema del dispositivo de microfluidos para la captura de hidrodinámica La trampa de la hidrodinámica se construye utilizando un dispositivo de microfluidos de dos capas. La capa de fluido se compone de una entrada de la muestra, fnuestras entradas de buffer, y dos salidas de residuos. La capa de control consta de una válvula neumática de membrana situada en la parte superior de uno de los canales de salida en la capa de fluido. Una constricción en el canal de salida opuestos proporciona una presión de desplazamiento de la válvula neumática. Las dimensiones típicas de canales oscila entre 100-500 micras. En la región (A), es el flujo de entrada de la muestra se centró en dos entradas de búfer. En la región (B), oponiéndose a las corrientes de entrada convergen en el cruce transversal de la ranura donde se produce atrapamiento. La válvula neumática (C) se coloca en la parte superior de uno de los canales de salida. La posición del punto de estancamiento es modulada por la regulación de la presión de esta válvula.
En este artículo se presenta un método basado en microfluídica para el confinamiento de partículas basado en el flujo hidrodinámico. Demostramos atrapando partículas estables en un punto de estancamiento de líquido mediante un mecanismo de control de retroalimentación, lo que permite el confinamiento y la micromanipulación de partículas arbitrarias en un microdispositivo integrado.
Damos las gracias al grupo Kenis en la Universidad de Illinois en Urbana-Champaign útil para los debates y ofrecer generosamente el uso de las instalaciones de sala blanca.
Este trabajo fue financiado por el NIH Camino a la Independencia Premio de PI, la subvención No. 4R00HG004183-03 (Charles M. Schroeder y Tanyeri Melikhan).
Este trabajo fue apoyado por la Fundación Científica Nacional a través de una Beca de Investigación de Postgrado de Eric M. Johnson-Chavarría.
| aguja roma de calibre 21 | Zephyrtronics | ZT-5-021-1-L | Para perforar orificios de puerto en PDMS |
| Jeringa de plástico de 3 ml | BD Biosciences | 309585 | Para llenar la válvula con aceite |
| Obleas de Si | University Wafer | 3” P(100) pulido a una cara 380 μ m grado de prueba | |
| Cubierta de vidrio | VWR international | 48404-428 | 24 x 40 mm #1.5 |
| Tarjeta DAQ | National Instruments | PCI 6229 | |
| Perlas fluorescentes | Spherotech, Inc. | FP-2056-2 | 2.2 #x03BC; m Rojo del Nilo |
| Fluorinert | 3M | FC 40 | Aceite portador fluorado |
| Microscopio invertido | Olympus Corporation | IX-71 | |
| LabVIEW | National Instruments | Versión 9.0f3 (32bit) | |
| Microscopio estereoscópico | Leica Microsystems | MZ6 | Para alinear la capa de control PDMS con la capa fluida. |
| Horno mecánico de convección | VWR international | 1300U | Para dispositivos de horneado para crear losas monolíticas de PDMS con dos capas. |
| Tubos y conectores microfluídicos | Upchurch Scientific | 1/16 x .020 Tubos de PFA y accesorios supersin brida | |
| PDMS | GE Healthcare | RTV 615 A& B | |
| Cámara de plasma | Harrick Scientific Products, Inc. | PDC-001 | |
| Transductor de presión | Proporción de aire | DQPV1 | |
| Recubrimiento | giratorioSistemas de recubrimiento especiales | G3P-8 Recubrimiento | |
| giratorio fotorresistente | MicroChem Corp. | SU 8 2050 | |
| Bomba de jeringa | Harvard Apparatus PHD | 2000 Bloque de terminales programable | |
| National Instruments | BNC 2110 | Para salida analógica al regulador de presión y lectura. | |
| Fuente de luz colimada UV y sistema de exposición | OAI | modelo 30 Fuente | de luz mejorada |