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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Fuente: Chen S. et al. Enrichment de células objetivo y amplificación del genoma completo para la caracterización de células individuales aguas abajo. J. Vis. Exp. (2018)
Este video describe la técnica para obtener una sola célula a partir de una población celular heterogénea utilizando microdisección de captura láser. La célula aislada se puede utilizar para estudios genómicos adicionales o investigaciones sobre el cáncer.
1. Muestreo de una sola célula
| McCoy's 5A Medium (1x) supl. con L-Glutamina | Thermo Fisher Scientific | 16600-082 | Medio de cultivo utilizado para las células HT-29, adapte el medio de cultivo a la línea celular utilizada para los experimentos |
| Solución tampón HEPES (1 m) | PAA | S11-001 | Suplemento para McCoy's 5A Medio |
| Suero Fetal Bovino Oro | PAA | A15-151 | Suplemento para el medio modificado 5a de McCoy |
| Penicilina-estreptomicina (100x) | Biooeste | L0018-100 | Suplemento para el medio modificado 5a de McCoy |
| Solución salina tamponada con fosfato (1x PBS) | Thermo Fisher Scientific | 10010-015 | |
| Accutase | Biooeste | L0950-100 | Solución de desprendimiento celular (cultivo celular) |
| Baño de agua | GFL (en inglés) | Tipo 1003 | Se utiliza para soluciones de precalentamiento |
| incubadora | Thermo Fisher Scientific | Se utiliza para incubar células (cultivo celular) | |
| Tubos de reacción de 50 mL | VWR | 525-0403 | |
| Mezclador de rodillos | Stuart Científico | SRT6D | Se utiliza para unir las células al alambre mientras se evita que las células se sedimenten | .
| Kit de proliferación celular CellTrace CFSE | Thermo Fisher Scientific | C34554 | Se utiliza para etiquetar células vivas (etiqueta citoplasmática) |
| Hoechst 33342 | H3570 | Thermo Fisher Scientific | Se utiliza para teñir el ADN (contratinción nucleica) |
| Centrífuga (equipada para contener tubos de reacción de 15 mL y 50 mL) | Thermo Fisher Scientific | Heraeus Megafuge 40R | Se utiliza para peletizar celdas |
| Observer Z1 (Microscopio de fluorescencia/microdisección láser) | Carl Zeiss Microimagen | Microscopio invertido (inmunofluorescencia) capaz de microdisección láser; Los microscopios de fluorescencia deben ser capaces de detectar Hoechst 33342 (filtro DAPI) y CFSE (filtro FITC) | |
| Albúmina sérica bovina (BSA) | Sigma-Aldrich | A4503-50G | Se utiliza para recubrir superficies de vidrio/plástico |
| MS1 Miniagitador | Sigma-Aldrich | Z404039 | Se utiliza para el vórtice |
| Detektor CANCER03 DC03 | Gilupi | GIL003 | Cable funcionalizado capaz de aislar y separar células EpCAMpositivas (también conocidas como catch&release, C&R) |
| Agujas de jeringa (G20) | VWR | 613-0554 | Se utiliza para perforar tapas de goma con el fin de permitir que la parte no funcional del C&R pase a través de ellas |
| Cámara de Neubauer | Roth | T729.1 | Se utiliza para contar células |
| Pipetas Pasteur 150 mm | Volac | D810 | Se utiliza para la aplicación de bajo volumen de células al C&R |
| Bolígrafo de grasa | Dako | S2002 | Se utiliza en portaobjetos de vidrio para mantener la suspensión de la celda en su lugar |
| Agitador de placas Delfia | Perkin Elmer | 1296-003 | Se utiliza para la agitación durante el desprendimiento de la célula |
| Tubos de 1,5 ml | Eppendorf | 30.125.150 | |
| Kit Ampli1 WGA | Biosistemas de silicio | A pedir a través de Silicon Biosystems | |
| Tubos de PCR de 0,2 mL | Biozym | 710920 | |
| Citocentrífuga y equipo | Hettich | Universal 32 | Utilice la citocentrífuga a mano |
| Termociclador | Bio-Rad | Díada del motor de ADN | Se pueden utilizar todos los termocicladores con tapa calefactada |
| Microcentrífuga | Roth | CX73.1 | Utilice una centrífuga de sobremesa a mano |
| Stratalinker UV 1800 | Estratogén | 400072 | Utilice el reticulante de ADN a mano |