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Artículo de método

Muestreo de células individuales mediante microdisección por captura láser: una técnica para recolectar células objetivo de una población celular heterogénea

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30 de abril de 2023

En este artículo

Resumen

Fuente: Chen S. et al. Enrichment de células objetivo y amplificación del genoma completo para la caracterización de células individuales aguas abajo. J. Vis. Exp. (2018)

Este video describe la técnica para obtener una sola célula a partir de una población celular heterogénea utilizando microdisección de captura láser. La célula aislada se puede utilizar para estudios genómicos adicionales o investigaciones sobre el cáncer.

Protocolo

1. Muestreo de una sola célula

  1. Microdisección láser
    NOTA: Se agregarán células individuales a 4,5 μL de mezcla maestra de lisis celular (componentes del kit WGA, Tabla de Materiales y Reactivos) para WGA.
    1. Prepare la mezcla maestra de lisis celular de acuerdo con Czyż et al. mezclando 5,0 μL de tampón de reacción, 1,3 μL de octilfenoxipolietoxietanol (solución al 10%), 1,3 μL de 4-(1,1,3,3-tetrametilbutil)fenil-polietilenglicol (solución al 10%), respectivamente, 2,6 μL de una solución de proteinasa K y 34,8 μL de agua sin RNasa/DNasa para obtener una mezcla maestra para 10 muestras (volumen total 45 μL). Coloque la mezcla maestra en hielo.
      nota: Para obtener más muestras, aumente los volúmenes en consecuencia.
    2. Tratamiento UV de los portaobjetos recubiertos de membrana adecuados para la microdisección láser. Coloque los portaobjetos en un dispositivo de reticulación de ADN y expóngalos a los rayos UV más altos durante unos 10 minutos.
    3. Ensamble el portaobjetos recubierto de membrana en una citocentrífuga y centrifuga toda la suspensión celular a 300 x g durante 5 min.
      nota: Cuando se utiliza un sistema en líquido, donde las células se citocentrífugan en el portaobjetos en solución, retire el sobrenadante después de la citocentrifugación y aplique un centrifugado seco a 1140 x g durante 1 min.
    4. Proceda directamente a la microdisección láser o deje que los citospins se sequen al aire durante la noche y congele las muestras a -20 °C para su almacenamiento a largo plazo.
    5. Pipetear 4,5 μL de mezcla maestra de lisis celular en la tapa de un tubo de PCR de 0,2 mL y recolectar células individuales mediante microdisección láser.
    6. Recupere el tubo de PCR del microscopio de microdisección láser y cierre el tubo. Recoja todo el líquido en el fondo del tubo con un giro corto y coloque la muestra en hielo.
    7. Proceda con el WGA de una sola celda o almacene las muestras aisladas a -80 °C durante un máximo de 1 mes antes de continuar con el procesamiento.

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Divulgaciones

No se han declarado conflictos de interés.

Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
McCoy's 5A Medium (1x) supl. con L-GlutaminaThermo Fisher Scientific16600-082Medio de cultivo utilizado para las células HT-29, adapte el medio de cultivo a la línea celular utilizada para los experimentos
Solución tampón HEPES (1 m)PAAS11-001Suplemento para McCoy's 5A Medio
Suero Fetal Bovino OroPAAA15-151Suplemento para el medio modificado 5a de McCoy
Penicilina-estreptomicina (100x)BiooesteL0018-100Suplemento para el medio modificado 5a de McCoy
Solución salina tamponada con fosfato (1x PBS)Thermo Fisher Scientific10010-015
AccutaseBiooesteL0950-100Solución de desprendimiento celular (cultivo celular)
Baño de aguaGFL (en inglés)Tipo 1003Se utiliza para soluciones de precalentamiento
incubadoraThermo Fisher ScientificSe utiliza para incubar células (cultivo celular)
Tubos de reacción de 50 mLVWR525-0403
Mezclador de rodillosStuart CientíficoSRT6DSe utiliza para unir las células al alambre mientras se evita que las células se sedimenten
Kit de proliferación celular CellTrace CFSEThermo Fisher ScientificC34554Se utiliza para etiquetar células vivas (etiqueta citoplasmática)
Hoechst 33342H3570Thermo Fisher ScientificSe utiliza para teñir el ADN (contratinción nucleica)
Centrífuga (equipada para contener tubos de reacción de 15 mL y 50 mL)Thermo Fisher ScientificHeraeus Megafuge 40RSe utiliza para peletizar celdas
Observer Z1 (Microscopio de fluorescencia/microdisección láser)Carl Zeiss MicroimagenMicroscopio invertido (inmunofluorescencia) capaz de microdisección láser; Los microscopios de fluorescencia deben ser capaces de detectar Hoechst 33342 (filtro DAPI) y CFSE (filtro FITC)
Albúmina sérica bovina (BSA)Sigma-AldrichA4503-50GSe utiliza para recubrir superficies de vidrio/plástico
MS1 MiniagitadorSigma-AldrichZ404039Se utiliza para el vórtice
Detektor CANCER03 DC03GilupiGIL003Cable funcionalizado capaz de aislar y separar células EpCAMpositivas (también conocidas como catch&release, C&R)
Agujas de jeringa (G20)VWR613-0554Se utiliza para perforar tapas de goma con el fin de permitir que la parte no funcional del C&R pase a través de ellas
Cámara de NeubauerRothT729.1Se utiliza para contar células
Pipetas Pasteur 150 mmVolacD810Se utiliza para la aplicación de bajo volumen de células al C&R
Bolígrafo de grasaDakoS2002Se utiliza en portaobjetos de vidrio para mantener la suspensión de la celda en su lugar
Agitador de placas DelfiaPerkin Elmer1296-003Se utiliza para la agitación durante el desprendimiento de la célula
Tubos de 1,5 mlEppendorf30.125.150
Kit Ampli1 WGABiosistemas de silicioA pedir a través de Silicon Biosystems
Tubos de PCR de 0,2 mLBiozym710920
Citocentrífuga y equipoHettichUniversal 32Utilice la citocentrífuga a mano
TermocicladorBio-RadDíada del motor de ADNSe pueden utilizar todos los termocicladores con tapa calefactada
MicrocentrífugaRothCX73.1Utilice una centrífuga de sobremesa a mano
Stratalinker UV 1800Estratogén400072Utilice el reticulante de ADN a mano
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Etiquetas

Aislamiento de células individualesTécnica de citocentrifugaciónPreparación de suspensión celularPortaobjetos recubierto de membranaTratamiento con luz UVMezcla maestra de lisis celularRecolección en tubos de PCRCosecha de células diana