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Artículo de método

Hibridación de sonda y amplificación de señal en ARN Hibridación in situ: una técnica para detectar secuencias específicas de ARN en secciones de tejido

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30 de abril de 2023

En este artículo

Resumen

Fuente: Outh-Gauer, S. et al. Hibridación cromogénica in situ como herramienta para el diagnóstico del cáncer de cabeza y cuello relacionado con el VPH. J. Vis. Exp. (2019)

Este video describe una estrategia de hibridación secuencial que implica la hibridación de sondas de ARNm con ARNm objetivo específico. Después de la hibridación de la sonda, se realiza una amplificación de la señal para mejorar la resolución a través de la reducción de la relación señal-ruido durante el ARN-CISH de las muestras histológicas.

Protocolo

Todos los procedimientos que involucran participantes humanos se han realizado de acuerdo con las directrices institucionales, nacionales e internacionales para el bienestar humano y han sido revisados por la junta de revisión institucional local.

1. Ejecución del ensayo

NOTA: No permita que las secciones se sequen entre los pasos de incubación.

  1. Hibridación de la sonda HPV
    NOTA: Asegúrese de que las sondas estén precalentadas para disolver cualquier precipitación antes de usarlas. Para este paso, en lugar de la sonda de VPH, también se puede utilizar la peptidil-prolil isomerasa B (PPIB) para el control positivo o la dihidrodipicolinato reductasa (DAPB) para el control negativo (ver la Tabla de Materiales).
    1. Golpee y/o deslice los portaobjetos para eliminar el exceso de líquido y colóquelos en la rejilla de portaobjetos. Agregue ~ 4 gotas de sonda de VPH para cubrir completamente cada sección.
    2. Cubra la bandeja con una tapa e insértela en el horno durante 2 h a 40 °C.
      NOTA: Para evitar la evaporación, asegúrese de que la perilla giratoria esté completamente girada a la posición de bloqueo.
    3. Retire la bandeja del horno y retire la rejilla deslizante.
    4. Un portaobjetos a la vez, elimine rápidamente cualquier exceso de líquido y coloque el portaobjetos en una rejilla de portaobjetos sumergida en un plato de tinción lleno de 1x tampón de lavado.
    5. Lave los portaobjetos en 1x tampón de lavado durante 2 minutos a temperatura ambiente con agitación constante. Repita esto con tampón de lavado nuevo 1x.
  2. Hibridación de AMP1, AMP2, AMP3 y AMP4
    NOTA: Estos pasos incluyen la hibridación en el horno de hibridación y AMP1–AMP4 del kit comprado (consulte la Tabla de materiales).
    1. Toque y/o deslice para eliminar el exceso de líquido de los portaobjetos y colóquelos en la rejilla de portaobjetos. Agregue ~ 4 gotas de AMP1 para cubrir completamente cada sección.
    2. Cubra la bandeja con una tapa e insértela en el horno durante 30 minutos a 40 °C.
    3. Retire la bandeja del horno y retire la rejilla deslizante.
    4. Un portaobjetos a la vez, elimine rápidamente cualquier exceso de líquido y coloque el portaobjetos en una rejilla de portaobjetos sumergida en un plato de tinción lleno de 1x tampón de lavado.
    5. Lave los portaobjetos en 1x tampón de lavado durante 2 minutos a temperatura ambiente con agitación constante. Repita esto con tampón de lavado nuevo 1x.
    6. Repita los pasos 1.2.1–1.2.5, pero use ~4 gotas de AMP2 en lugar de AMP1 e incube durante 15 minutos a 40 °C. Lave los portaobjetos 2 veces durante 2 minutos, ambas veces en tampón de lavado nuevo.
    7. Repita los pasos 1.2.1 a 1.2.5, pero use ~ 4 gotas de AMP3 en lugar de AMP1 e incube durante 30 minutos a 40 ° C. Lave los portaobjetos 2 veces durante 2 minutos, ambas veces en un tampón de lavado nuevo.
    8. Repita los pasos 1.2.1 a 1.2.5, pero use ~ 4 gotas de AMP4 en lugar de AMP1 e incube durante 15 minutos a 40 ° C. Lave los portaobjetos 2 veces durante 2 minutos, ambas veces en un tampón de lavado nuevo.
  3. Hibridación de AMP5 y AMP6
    NOTA: Estos pasos no incluyen la hibridación en el horno, sino la hibridación a temperatura ambiente. AMP5 y AMP6 provienen del kit comprado (consulte la Tabla de materiales).
    1. Golpee y/o deslice los portaobjetos para eliminar el exceso de líquido y colóquelos en la rejilla de portaobjetos. Agregue ~ 4 gotas de AMP5 para cubrir completamente cada sección.
    2. Cubra la bandeja con una tapa e incube durante 30 minutos a temperatura ambiente.
    3. Un portaobjetos a la vez, elimine rápidamente el exceso de líquido y colóquelo en una rejilla de portaobjetos sumergida en un plato para tinturas lleno de 1x tampón de lavado.
    4. Lave los portaobjetos en 1x tampón de lavado durante 2 minutos a temperatura ambiente con agitación constante. Repita esto con tampón de lavado nuevo 1x.
    5. Repita los pasos 1.3.1 a 1.3.4, pero use ~ 4 gotas de AMP6 en lugar de AMP5 e incube durante 15 minutos a temperatura ambiente. Lave los portaobjetos 2 veces durante 2 minutos, ambas veces en un tampón de lavado nuevo.

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Divulgaciones

No se han declarado conflictos de interés.

Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Horno HybEZ (110v) Diagnóstico Celular Avanzado Inc. 321710
Bastidor deslizante HybEZ Diagnóstico Celular Avanzado Inc. 300104
Reactivos de detección RNAscope 2.5 HD-BROWNDiagnóstico Celular Avanzado Inc.322310Este kit incluye los reactivos de amplificación AMP1, AMP2, AMP3, AMP4, AMP5 y AMP6, y los reactivos de detección DAB-A y DAB-B
Sonda de control negativo RNAscope 3-plex Diagnóstico Celular Avanzado Inc.320871DAPB
Sonda de control positivo RNAscope 3-plex Diagnóstico Celular Avanzado Inc.320861PPIB
Sonda de ARNsonda HPV16/18 Diagnóstico Celular Avanzado Inc.311121
Reactivos tampón de lavado RNAscopeDiagnóstico Celular Avanzado Inc.310091Tampón de lavado 50X x4

Etiquetas

Sondas de ARN en forma de Zsoluci n preamplificadoramezcla de reactivos amplificadorestamp n de hibridaci nsoluci n de lavadoan lisis de secciones de tejidodetecci n de sondas de VPH