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Artículo de método

Ensayo híbrido de levadura y uno modificado para detectar interacciones heteroméricas entre el complejo de proteínas y el ADN

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8 de julio de 2025

En este artículo

Resumen

Fuente: Tripathi, P. et al., Un sistema híbrido de levadura modificada para estudios de interacción de ADN complejo de proteínas heteroméricas. J. Vis. Exp. (2017)

En este video, demostramos el ensayo de un híbrido de levadura modificada, que detecta múltiples proteínas que interactúan con el ADN objetivo. Las células de levadura transformadas contienen la secuencia de ADN diana aguas arriba del gen reportero. Además, expresan proteínas factores de transcripción. Cuando las proteínas forman complejos y se unen al ADN diana, el gen reportero se expresa y puede detectarse enzimáticamente.

Protocolo

1. Día 9 (mañana): Iniciar el cultivo para la medición enzimática.

  1. Vuelva a suspender el cultivo y transfiéralo 125 μL utilizando una pipeta multicanal en una placa de espectrofotómetro (medida OD600).
    nota: Precaución: No dispense la última gota para evitar burbujas, si el OD600 es inferior a 0,3 - 0,6, incube las células restantes durante 1 - 2 h más según la lectura. El cultivo de 125 μL utilizado en este paso se puede descartar o transferir de nuevo al bloque de pocillo profundo original a discreción del usuario.
  2. Centrifugar las células restantes en el bloque de pocillos profundos durante 10 min a 3000 x g y 21 °C. Eliminar el sobrenadante invirtiendo.
  3. Añadir 200 μL de tampón Z y vortex.
    nota: Consulte la receta para el tampón Z en la Tabla 1.
  4. Centrifugar durante 5 min a 3000 x g y 21 °C. Eliminar el sobrenadante invirtiéndolo.
  5. Agregue 20 μL de tampón Z y vórtice.
  6. Cubra la placa con papel de sellado que pueda resistir los ciclos de congelación y descongelación. Realizar 4 ciclos de congelación/descongelación con nitrógeno líquido en campana extractora y a 42 ºC en baño maría (2 min cada uno).
  7. Añadir 200 μL de tampón Z/beta-mercaptoetanol (β-ME)/orto-nitrofenil-β-galactósido (ONPG) (12 mL, 21 μL, 8,4 mg respectivamente producirán 20 mL de solución; siempre preparar fresco)
    nota: El ONPG tardará algún tiempo en disolverse correctamente, así que prepare la solución una hora antes de llegar a este paso. El ONPG sirve como sustrato para la medición de la actividad de la β-galactosidasa.
  8. Incubar durante un máximo de 17 a 24 h a 30 °C (compruebe entre medias, si el color se desarrolla antes, proceda al siguiente paso).

>2. Día 10 (mañana): Detén la reacción y mide.

  1. Agregue 110 μL 1M Na2CO3 para detener la reacción y registrar el tiempo.
  2. Vórtice y centrífuga durante 10 min a 3000 x g y 21 °C.
  3. Tome 125 μL de sobrenadante utilizando multicanal y mida OD420.
    nota: Atención, no dispense la última gota para evitar burbujas.

Tabla 1: Receta de las soluciones utilizadas en el protocolo. La tabla proporciona la receta para las soluciones madre y de trabajo de los principales tampones utilizados en el ensayo.

Tampón TE 10X (10 ml)
deseableDe la culata
1000mM Tris-Cl (pH 8.0)1mL de Tris 1M
10mM EDTA (pH 8.0)200uL de EDTA 0.5M
Compensar el volumen con agua
TE/LiAc (10 ml)
deseableDe la culata
1X 1mL TE 10X
0,1 millones de LiAc1mL LiAc 1M
Compensar el volumen con agua
TE/LiAc/PEG (50 mL) 50%
deseableDe la culata
1X5 mL TE 10X
0,1 millones de LiAc5 mL LiAc 1M
40 mL PEG3350
Tampón Z (1L) pH 7.0
Na2HPO4 16,1g de heptahidratado o 8,52g de anhidro
NaH2PO4 5,5 g de hidratado o 4 g de anhidro
KCl 0.75g
MgSO4 0,246g de hidratado o 0,12g de anhidro
Mantener el pH con HCl
Todas las soluciones se esterilizan antes de su uso.
Media y placas de agar utilizadas en el protocolo (YPDA, SD-Ura; Las placas de agar SD-Trp-Ura y SD-Trp-Ura) siguen la misma receta que en Y1H

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Divulgaciones

No se han declarado conflictos de interés.

Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Placa de fondo redondo de 96 pocillosGreiner bio-one650101Artículos de plástico
Bloque de pozos de 96 metros de profundidadCientífico de EE. UU1896-2000Artículos de plástico
Lámina sellableCientífico de EE. UU2923-0110Artículos de plástico
ArasealExcel CientíficoB-100Artículos de plástico
2-mercaptoetanolFisher Científico034461-100Ensayo
ONPGSigma-Aldrich73660Ensayo
Na2CO3Sigma-Aldrich223484Ensayo
Na2HPO4Sigma-AldrichS3264Ensayo
NaH2PO4Sigma-AldrichS3139Ensayo
KclFisher CientíficoBP366-500Ensayo
MgSO4Sigma-Aldrich83266Ensayo
HclFisher CientíficoSA54-4Ensayo
Baño secoTermo Fischerdispositivo
vórticeTermo Fischerdispositivo
centrífugaEppendorfcentrífuga 5810Rdispositivo
Lector de placasDispositivo molecularEspectrofotómetro de microplacas SPECTRAMAX PLUSdispositivo
incubadoraTermo FisherModelo No. 5250-37 grados, 6250-30 gradosdispositivo
Incubadora ShakerNew Brunswickdispositivo
Baño de aguaTermo FisherIsoTemp 205dispositivo
Base TrisFisher CientíficoBP152-1Ensayo
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Etiquetas

Interacci n de complejos proteicos con el ADNensayo de beta galactosidasadominio de activaci n de GAL4uni n de factores de transcripci nexpresi n de genes reporteroslisis por congelaci n y descongelaci nsustrato en tamp n Zmedici n de la densidad pticadetecci n de prote nas heterom ricas