Todos los procedimientos que involucran muestras de animales han sido revisados y aprobados por el comité de revisión ética animal apropiado.
1. Prepare la mezcla de enzimas 1 y 2 para cada muestra
NOTA: Para volúmenes superiores a 2 mL, utilice una pipeta serológica de 10 mL; para volúmenes, 200 μL-2 mL, utilice una pipeta de 1000 μL; para volúmenes, 21-199 μL, utilice una pipeta de 200 μL; para volúmenes, 2-20 μL, utilice una pipeta de 20 μL; para volúmenes inferiores a 2 μL, utilice una pipeta de 0-2 μL.
- Para cada muestra, descongele una alícuota de enzima P y una enzima A a temperatura ambiente.
- Para la mezcla de enzimas 1, combine 50 μL de enzima P y 1900 μl de tampón Z en un tubo C etiquetado (Tabla de materiales).
- Para la mezcla de enzimas 2, agregue 20 μL de tampón Y a la alícuota descongelada de 10 μL de enzima A.
>2. Protocolo de disociación cerebral en adultos
NOTA: Cuando se trabaja con muestras, los tubos deben colocarse en una gradilla de tubos a temperatura ambiente mientras BSA y D-PBS permanecen en hielo a menos que se indique lo contrario.
- Encienda el disociador.
- Use fórceps para transferir los pedazos de tejido del hipocampo al tubo C.
- Transfiera 30 μL de la mezcla de enzimas 2 al tubo C. Gire la tapa hasta que se sienta tensión, luego apriétela hasta que haga clic.
- Coloque el tubo C boca abajo en una posición del disociador; a la muestra se le asignará el estado Seleccionado (Figura 1). Asegure el calentador sobre el tubo C.
- Presione el icono de la carpeta, seleccione la carpeta Favoritos, desplácese y seleccione el programa 37C_ABDK_02. Haga clic en OK para aplicar el programa a todos los tubos C seleccionados, luego toque Start (Figura 1).
- Etiquete un tubo cónico de 50 mL por muestra.
- Coloque un filtro de células de 70 μm en cada tubo cónico de 50 mL y humedezca con 2 mL de tampón BSA.
- Al finalizar el programa, retire el calentador y el tubo C del disociador.
- Agregue 4 mL de tampón BSA a la muestra y aplique la mezcla al filtro de células en el tubo cónico de 50 mL.
- Agregue 10 ml de D-PBS al tubo C, ciérrelo y agite la solución suavemente. Aplíquelo en el filtro de células en el tubo cónico de 50 mL.
- Deseche el filtro de células y el tubo C. Centrifugar la suspensión a 300 x g durante 10 min a 4 °C. Luego, aspire y deseche el sobrenadante.
>3. Remoción de escombros
- Vuelva a suspender el pellet con 1550 μL de D-PBS frío y transfiera la suspensión a un tubo cónico de 15 mL marcado.
- Agregue 450 μL de solución fría de eliminación de residuos y pipetee hacia arriba y hacia abajo (no haga vórtice).
nota: La solución de eliminación de escombros es un reactivo en el kit comercial de disociación Brian para adultos.
- Superponga suavemente 1 mL de D-PBS frío sobre la suspensión de la celda, manteniendo la punta contra la pared del tubo cónico. Repita hasta que la superposición total sea de 2 mL.
nota: Este paso es fundamental; Actuar con destreza y destreza.
- Centrífuga a 3000 x g durante 10 min a 4 °C con aceleración total y freno completo.
nota: Si las fases no están claramente separadas, repita los pasos 7.2-7.3. Centrifugar por última vez a 1000 x g durante 10 min a 4°C.
- La suspensión ahora debería constar de tres capas distintas (Figura 2). Aspira la capa superior. Pase la punta de la pipeta hacia adelante y hacia atrás para aspirar la capa intermedia blanca. Retire la mayor cantidad posible de la capa intermedia sin alterar la capa inferior.
nota: Este paso es fundamental; Actuar con destreza y destreza.
- Agregue 2 mL de D-PBS frío y pipetee hacia arriba y hacia abajo para mezclar.
- Centrífuga a 1000 x g durante 10 min a 4 °C con aceleración total y freno completo. Aspirar y desechar el sobrenadante. Vuelva a suspender el pellet en 1 mL de tampón BSA.
NOTA: Las células se pueden resuspender en el tampón apropiado y luego marcarse y aislar magnéticamente en preparación para la secuenciación de una sola célula en este punto.