1. Cosecha de proteína MOGtag
NOTA: En esta etapa, las bacterias habrán producido grandes cantidades de proteína MOGtag. Para cosechar MOGtag, las bacterias se lisan primero en un tampón Triton X-100, seguido de la sonicación. A continuación, MOGtag se libera de los cuerpos de inclusión y se desnaturaliza con imidazol y guanidina, lo que da lugar a una solución de proteína cruda que contiene la proteína MOGtag.
- Tome una alícuota de 1 ml de uno de los cultivos nocturnos y transfiérala a un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml. Peletizar las células a 16.000 x g durante 1 min y retirar el sobrenadante. Etiquete el tubo TO/N (post-inducción), luego coloque el gránulo bacteriano en un congelador a -20 °C para futuros análisis de páginas SDS (Figura 2).
- Distribuya los cultivos uniformemente entre botellas de 250 ml compatibles con centrifugación de alta velocidad y manténgalas en hielo a partir de este momento. Granular las células bacterianas a 22.000 x g durante 15 min a 4 °C.
- Deseche el sobrenadante. Almacene los gránulos bacterianos a -20 °C o continúe con el paso 1.4.
- Preparar tampón de lisis (0,1 mg/ml de lisozima de huevo de gallina, 0,1% de Triton-X (v/v) en solución salina tamponada con fosfato (PBS)) añadiendo 60 μl de Triton X-100 y 120 μl de solución madre de lisozima de huevo de gallina 50 mg/ml a 60 mL de PBS.
- Vuelva a suspender y combine todos los gránulos bacterianos del paso 1.3 en un total de 30 ml de tampón de lisis. Transfiera este volumen a un tubo de fondo redondo de 50 ml capaz de centrifugar a alta velocidad. Coloque este tubo en un baño de agua a 30 °C durante 30 min. Durante el tiempo de incubación, agite el tubo dos veces para volver a suspender las células.
- Después de la incubación, transfiera el tubo al hielo y sonique la solución a 20 kHz, amplitud 70%, pulso encendido durante 3 segundos, pulso apagado durante 3 segundos y cinco pulsos por ronda. Sonica la solución durante seis rondas en total y deja que la solución se enfríe en hielo entre rondas.
- Centrifugar la solución a 24.000 x g durante 15 min a 4 °C. Desechar el sobrenadante y repetir los pasos 1.5-1.7 una vez. Guarde el pellet a -20 °C o continúe con el paso 1.8.
- Preparar tampón A (500 mM de NaCl (cloruro de sodio), 20 mM de Tris-HCl (clorhidrato de Tris (hidroximetil)aminometano), 5 mM de imidazol, pH 7,9) añadiendo 0,8766 g de NaCl, 0,09456 g de Tris-HCl y 0,01021 g de imidazol a un vaso de precipitados de 100 ml. Agregue agua hasta que el volumen alcance los 28 ml, luego ajuste el pH de la solución a 7.9. Luego, transfiera la solución a un cilindro graduado de 100 ml y agregue agua hasta que el volumen sea de 30 ml.
- Vuelva a suspender el gránulo del paso 1.7 en 30 ml de tampón A e incube esta solución a 4 °C durante 3 horas. Durante este tiempo, pesar 17,2 g de guanidina-HCl.
- Sonicar la solución en hielo con los mismos ajustes que en el paso 1.6. Luego agregue 17,2 g de guanidina-HCl a la solución. Incube esto en hielo durante 1 hora para solubilizar la proteína MOGtag.
- Centrifugar la solución a 24.000 x g durante 30 min a 4 °C. Recoger el sobrenadante y almacenar el sobrenadante a 4 °C hasta la purificación de la proteína.
2. Purificación de proteínas
NOTA: En los siguientes pasos, la proteína MOGtag se purificará a través de 4 rondas de absorción en resina de níquel cargada (a través de la etiqueta His) y la elución.
- Prepare los siguientes tampones:
- prepare el tampón B (500 mM de NaCl, 20 mM de Tris-HCl, 5 mM de imidazol, 6 M de guanidina-HCl, pH 7,9). Agregue 5,844 g de NaCl, 0,6304 g de Tris-HCl, 0,0681 g de imidazol y 114,64 g de guanidina-HCl a un vaso de precipitados de 500 ml. Luego agregue agua hasta que alcance los 190 ml y ajuste el pH a 7,9. Transfiera la solución a un cilindro graduado de 250 ml y agregue agua hasta que el volumen sea de 200 ml.
- Prepare el tampón de elución (500 mM de NaCl, 20 mM de Tris-HCl, 0,5 M de imidazol, 6 M de guanidina-HCl, pH 7,9). Agregue 5,844 g de NaCl, 0,6304 g de Tris-HCl, 6,808 g de imidazol y 114,64 g de guanidina-HCl a un vaso de precipitados de 500 ml. Agrega agua hasta que alcance los 190 ml y ajusta el pH a 7,9. Transfiera la solución a un cilindro graduado de 250 ml y agregue agua hasta que el volumen sea de 200 ml.
- Prepare el tampón de tiras (500 mM de NaCl, 20 mM de Tris-HCl, 100 mM de EDTA (ácido etilendiaminotetraacético), pH 7,9). Añadir 5,844 g de NaCl, 0,6304 g de Tris-HCl, 40 ml de EDTA 500 mM a un vaso de precipitados de 500 mL. Agrega agua hasta que alcance los 190 mL y ajusta el pH a 7.9. Transfiera la solución a un cilindro graduado de 250 ml y agregue agua hasta que el volumen sea de 200 ml.
- Prepare el tampón de carga (sulfato de níquel 0,1 M). Añadir 5,257 g de sulfato de níquel a un vaso de precipitados de 500 ml y añadir agua hasta alcanzar los 190 ml (PRECAUCIÓN, no manipular el sulfato de níquel fuera de una campana extractora hasta que el sulfato de níquel se haya disuelto en agua). Una vez que el sulfato de níquel se haya disuelto, transfiera la solución a un cilindro graduado de 250 ml y agregue agua hasta que el volumen alcance los 200 ml.
- Divida 10 ml de resina de níquel en dos tubos de centrífuga cónicos de 50 ml capaces de soportar fuerzas centrífugas de más de 4.500 x g (5 ml en cada tubo).
- Cargue y equilibre la resina de níquel:
- Lave la resina añadiendo 40 ml de agua a cada tubo que contenga la resina. Coloque los tubos horizontalmente sobre un balancín y déjelos agitar durante 5 min a 4 °C. Una vez terminado, centrifugar los tubos a 4.500 x g durante 8 min a 4 °C.
- Deseche el sobrenadante pipeteando para evitar alterar el sedimento. Agregue 40 ml de tampón de carga a cada tubo. Transfiera los tubos a un balancín y déjelos agitar durante 15 min a 4 °C. Una vez terminado, centrifugar los tubos a 4.500 x g durante 8 min a 4 °C.
- Deseche el sobrenadante, luego agregue 40 ml de tampón B a los tubos. Transfiera los tubos a un balancín y déjelos agitar durante 5 minutos a 4 °C. Una vez terminado, centrifugar los tubos a 4.500 x g durante 8 min a 4 °C, luego desechar los sobrenadantes.
- Opcional: Tome 150 μl de la proteína solubilizada recogida en el paso 1.11 y transfiérala a un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml. Etiquete el tubo como preincubación y congélelo a -20 ° C para un futuro análisis de página SDS (dodecil sulfato de sodio) (Figura 2, MOGtag crudo).
- Purifique la proteína MOGtag:
- Transfiera todo el volumen de proteína solubilizada del paso 1.11 (~40 ml, menos la pequeña muestra extraída en el paso 2.4) al primer tubo (Figura 1, tubo 1) que contiene resina de níquel del paso 2.3, mezcle y coloque horizontalmente en un balancín a 4 °C durante 1 hora.
- Centrifugar el tubo a 4.500 x g durante 8 min a 4 °C. Una vez terminado, transfiera el sobrenadante al segundo tubo (Figura 1, tubo 2) de resina de níquel e incube como se describe en el paso anterior. Mientras tanto, continúe con los pasos 3 a 6 a continuación con el tubo 1.
- Vuelva a suspender la resina de níquel en el tubo 1 en 40 ml de tampón de elución y coloque el tubo horizontalmente sobre un balancín a 4 °C durante 5 min. A continuación, centrifugar el tubo a 4.500 x g durante 8 min a 4 °C.
- Transfiera el sobrenadante que contiene la proteína MOGtag eluida a un frasco de 250 ml etiquetado como "proteína MOGtag purificada" y mantenga este frasco a 4 °C. Con cada paso de elución, agrupe el sobrenadante resultante en esta botella.
- Añadir 40 ml de tampón de tiras a la resina de níquel y colocar horizontalmente sobre un balancín durante 5 min a 4 °C.
- Centrifugar el tubo a 4.500 x g durante 8 min a 4 °C. Desechar el sobrenadante y, a continuación, recargar la resina de níquel como se indica en el paso 2.3.
- Una vez terminado, avance con el segundo tubo como se indica en el paso 2.5. Un total de 4 rondas de absorción de la proteína solubilizada desde el paso 1.11 sobre la resina de níquel cargada y la elución recuperarán la mayor parte de la proteína, aunque, si se desea, se podría recuperar proteína adicional en rondas adicionales de absorción y elución.
- Una vez completadas cuatro (o más) rondas de absorción y elución, almacene la proteína purificada combinada a 4 °C durante la noche. La resina de níquel se puede almacenar en 40 ml de una solución de etanol al 20% a 4 °C hasta que se necesite nuevamente.