1. VNP (CPMV, BMV, PVX y TMV) Propagación
- Poner la cámara de planta de interior controla a 15 horas del día (100% de luz, 25 º C, 65% de humedad) y 9 h de la noche (0% de luz, 22 ° C, 60% de humedad).
- Se inoculan las plantas de acuerdo a la escala de tiempo en la Tabla 1.
| CPMV | PVX, TMV, y BMV |
| Día 0: Planta 3 caupí semillas / maceta. | Día 0: Plant ~ 30 N. benthamiana semillas / maceta. Fertilizar una vez por semana con un fertilizante cucharada 1/5 l de agua. |
| Día 14: Re-pot N. benthamiana en 1 planta / maceta. |
| Día 10: Infect deja las hojas primarias con CPMV (5 μg/50 l / hoja) por inoculación mecánica con una fina capa de carburo de silicio. | Día 28: Infect tres a five deja con PVX, TMV, o BMV (5 μg/50 l / hoja) por inoculación mecánica con una fina capa de carburo de silicio. |
| Día 20: Hojas de la cosecha y almacenar a -80 ° C. | Día 42: las hojas de la cosecha y almacenar a -80 ° C. |
Tabla 1. Cronograma para el cultivo, infectando, y cosechar las hojas.
Nota: sólo propagación CPMV se demuestra como un ejemplo.
2. VNP (CPMV, BMV, PVX y TMV) Purificación
Nota: Todos los pasos se llevan a cabo en hielo o a 4 º C.
- Homogeneizar 100 g de hojas congeladas en un mezclador estándar utilizando 2 volúmenes de tampón frío (véase la Tabla 2). Filtrar a través de 2-3 capas de estopilla.
- Para PVX, ajustar el pH a 6,5 utilizando 1 M de HCl. Añadir 0,2% (w / v) de ácido ascórbico y 0,2% (w / v) de sodio sulfiTE.
- Centrifugar homogeneizado crudo planta a 5.500 xg durante 20 min. Recoger el sobrenadante.
- Para BMV, capa de 25 ml de sobrenadante sobre 5 ml de 10% (w / v) de solución de sacarosa. Se centrifuga a 9.000 xg durante 3 horas y se resuspende el pellet en solución de CsCl 38,5% (w / v). Mezclar por agitación durante 5 horas, y luego continúe con el paso 2.12.
- Extraer material de la planta mediante la adición de 0,7 volúmenes de 1:1 (v / v) de cloroformo :1-butanol. Revuelva la mezcla durante 30-60 min.
- Centrifugar la solución a 5.500 xg durante 20 min. Recoger la fase acuosa superior.
- Añadir NaCl a 0,2 M y 8% (w / v) PEG (MW 8.000). Para TMV, también añadir 1% (v / v) de Triton X-100. Se agita durante al menos 1 h, después se deja reposar durante al menos 1 h.
- Se centrifuga la solución a 15.000 xg durante 15 min. Resuspender el sedimento en 10 ml de tampón. Para PVX, añadir 0,1% β-mercaptoetanol y urea a 0,5 M.
- Centrifugar a 8.000 xg durante 30 min y recoger el líquido sobrenadante.
- Ultracentrífuga sobrenadante a 160.000 xg durante 3 hr. Resuspender el sedimento en 5 ml de tampón overnight.
- Preparar un gradiente de sacarosa al 10-40% usando volúmenes iguales de 10%, 20%, 30% y 40% de sacarosa en tampón (el más pesado primero). Permitir que el gradiente de equilibrar durante la noche a temperatura ambiente.
- Ultracentrífuga precipitado resuspendido sobre gradiente de sacarosa a 100.000 xg durante 2 horas (24 horas para BMV).
- Recoger banda de dispersión de luz y diálisis frente a tampón.
- Caracterizar los VNPs (abajo) y se almacena a 4 º C. Para almacenamiento a largo plazo, almacenar a -80 ° C.
| CPMV y TMV | 0,1 M de tampón de fosfato de potasio (pH 7,0) 38,5 mM KH 2 PO 4 61,5 mM K 2 HPO 4 |
| PVX | 0,5 M de tampón borato (pH 7,8) 0,5 M de ácido bórico Ajustar el pH con NaOH |
| BMV | SAMA tampón (pH 4,5) 250 mM de acetato de sodio 10 mM MgCl 2 2 mM β-mercaptoetanol (añadir nuevo) |
Tabla 2. Buffers y sus recetas para cada VNP.
Nota: sólo propagación CPMV se demuestra como un ejemplo.
3. VNP (CPMV, BMV, PVX y TMV) Caracterización
- Espectroscopía UV / visible para determinar la concentración de VNPs.
- Medir la absorbancia de 2 l de muestra utilizando un espectrofotómetro NanoDrop.
- Determinar la concentración de partículas y colorantes utilizando la ley de Beer-Lambert (A εcl =, donde A es la absorbancia, ε es el coeficiente de extinción, c es la concentración, y l es la longitud del camino). La longitud del camino es de 0,1 cm para el NanoDrop.
Los coeficientes de extinción VNP-específicos son:
CPMV: 8,1 cm -1 mg -1 ml (a 260 nm)
PVX: 2,97 cm -1 mg -1 ml (a 260 nm)
TMV: 3,0 cm -1 mg -1 ml (a 260 nm)
BMV: 5,15 cm -1 mg -1 ml (a 260 nm)
- Analizar las partículas por exclusión de tamaño rápido cromatografía líquida de proteínas (FPLC).
- El uso de un Superose 6 columna de exclusión por tamaño y el Explorador de ÄKTA, carga de 50-100 g de VNPs en 200 l de 0,1 M tampón fosfato de potasio (pH 7,0).
- Establecer detectores a 260 nm (ácido nucleico), 280 nm (proteína), y la longitud de onda de excitación de los colorantes unidos.
- Ejecute a una velocidad de flujo de 0,5 ml / min durante 72 min.
- El perfil de elución y A260: A280 nm indica si la preparación VNP es puro y si las partículas están intactos y montados.
El siguiente A260: 280 proporciones indican una preparación pura VNP:
CPMV: 1,8 ± 0,1
PVX: 1,2 ± 0,1
TMV:1,1 ± 0,1
BMV: 1,7 ± 0,1
- Realizar desnaturalización (pre-cast NuPAGE) Bis-Tris poliacrilamida 4-12% electroforesis en gel de gradiente para analizar la pureza de la preparación y la conjugación a proteínas de recubrimiento individuales.
- Añadir 3 ml de tampón de muestra LDS 4x a 10 g de las partículas en 9 l de tampón de fosfato de potasio. Añadir un adicional de 1 l de tampón de muestra LDS 4x y 3 l de β-mercaptoetanol a BMV para reducir el elevado número de enlaces disulfuro.
- Incubar en bloque de calor durante 5 minutos a 100 ° C.
- Cargar muestras en un gel de SDS.
- Ejecutar las muestras a 200 V durante 1 h en 1x MOPS funcionamiento de amortiguación.
- Documentar el gel bajo luz UV para visualizar las proteínas fluorescentes abrigo.
- Para no fluorescente de proteínas, tinción con azul de Coomassie (0,25% (w / v) azul brillante de Coomassie R-250, 30% (v / v) de metanol, 10% (v / v) de ácido acético) durante 1 hr.
- Destain con 30% de metanol, 10% de ácido acético durante la noche. Change la solución si se requiere.
- Documentar el gel con luz blanca.
- Analizar la integridad de las partículas por microscopía electrónica de transmisión (TEM).
- Diluir las muestras a 0.1-1 mg / ml en 20 l de agua DI.
- Coloque 20 gotas l de las muestras en Parafilm.
- Cubra gotas con una rejilla TEM y deje reposar durante 2 min. Wick fuera de la solución en exceso en la rejilla con papel de filtro.
- Lave la red mediante la colocación de una gota de agua DI luego mecha seca.
- Mancha de red mediante la colocación de una gota en 20 l de 2% (w / v) de acetato de uranilo durante 2 min. Wick fuera el exceso de tinción con papel de filtro.
- Lavar rejilla una vez más en agua.
- Observe red con un microscopio electrónico de transmisión.
4. Conjugación química de VNPs con PEG y fluoróforos, purificación y caracterización
- Para los cálculos para las reacciones siguientes, la masa molar de los VNPs son:
CPMV: 5,6x 10 6 g / mol
PVX: 35 x 10 6 g / mol
TMV: 41 x 10 6 g / mol
BMV: 4,6 x 10 6 g / mol - Conjugar tintes y PEG a las lisinas superficiales de CPMV y PVX utilizando un solo paso N-hidroxi succinimida reacción de acoplamiento: Añadir 2.500 equivalentes molares (todos los excesos molares se refieren a un exceso molar de por VNP) de Alexa Fluor 647 éster de succinimidilo y 4.500 equivalentes de NHS- PEG (PM 5.000) disuelto en DMSO a CPMV en 0,1 M tampón fosfato de potasio. Cuando se trabaja con PVX, añadir un exceso molar de 10.000 NHS-dye y PEG-NHS. Ajustar los volúmenes de tampón y DMSO tales que la concentración final de CPMV y PVX es 2 mg / ml y el contenido de DMSO es 10% del volumen total de reacción. Incubar la mezcla de reacción durante la noche a temperatura ambiente protegido de la luz. CPMV y PVX tiene 300 y 1.270 lisinas direccionables, respectivamente. (El lector puede consultar las siguientes referencias para lecturas adicionales sobremodificación química de CPMV y PVX: 13-15).
- Colorantes conjugado y PEG a tirosinas del TMV mediante un acoplamiento de diazonio seguido por el cobre (I)-catalizada azida-alquino cicloadición.
- Preparar sal de diazonio (alquino) mediante la mezcla de 400 l de 0,3 M de monohidrato de ácido p-toluenosulfónico, 25 l de nitrito de sodio 3,0 M, y 75 l de 0,68 M destilada 3-etinilanilina disolvió en acetonitrilo a 4 º C durante 1 hr.
- Añadir 3,3 ml de tampón borato, pH 8,8, que contiene 100 mM NaCl a 1,25 ml de TMV (20 mg / ml de solución madre).
- Reaccionar el TMV con 450 l de la sal de diazonio (alquino) de solución en un baño de hielo durante 3 horas para añadir una ligadura alquino manejar a TMV por acoplamiento de diazonio. La solución se convertirá en un color marrón claro. TMV tiene 2.140 tirosinas disponibles para la conjugación.
- Se purifica el producto final utilizando un colchón de sacarosa como se describe en el paso 4,4.
- Adjuntar azida-funcional Alexa Fluor 647 y PEG-azida (PM 5.000) using de cobre (I)-catalizada azida-alquino cicloadición (CuAAC). Añadir 2 equivalentes de tinte y PEG-azida por proteína de la cubierta y se incuban con 1 mM CuSO 4, 2 mM AMG, y ascorbato de sodio 2 mM a temperatura ambiente durante 15 min. Ajustar el volumen del tampón de forma que la concentración final de reacción de TMV es 2 mg / ml. (El lector puede consultar las siguientes referencias para la lectura adicional sobre la modificación química de TMV: 16,17).
- Conjugar colorantes a lisinas y PEG a cisteínas de cisteína BMV mutante (cBMV):
- Añadir 2.000 equivalentes molares de Oregon Green 488 succinimidil éster disueltos en DMSO a cBMV en 0,1 M de tampón TNKM (50 mM Tris base, 50 mM NaCl, 10 mM KCl, 5 mM MgCl 2, pH 7,4). Ajustar los volúmenes de tampón y DMSO tales que la concentración final de BMV es 1 mg / ml y el contenido de DMSO es 10% del volumen total de reacción. Incubar la mezcla de reacción durante la noche a 4 º C protegida de la luz.
- Purificar las partículas mediante centrifiltros fugados como se describe en el paso 4.4.
- Añadir 2.000 exceso molar de PEG-maleimida (PM 2.000) usando las mismas condiciones de reacción como antes y se incuba la mezcla de reacción durante 2 horas a 4 ° C. cBMV tiene 180 lisinas reactivas y cisteína. (El lector puede consultar las siguientes referencias para la lectura adicional sobre la modificación química de la BMV, 18).
- Purificación: Pasar la solución a través de un colchón de sacarosa al 40% (w / v) a 160.000 xg durante 2,5 hr. Volver a disolver el precipitado en tampón. Alternativamente, se dializa frente a tampón apropiada, usando 10 kDa de corte filtros spin.
- Caracterización: VNPs PEGilados y marcado fluorescentemente-se analizaron usando los métodos descritos anteriormente: UV / visible de espectroscopia, la electroforesis en gel de SDS, FPLC, y TEM (no se muestra, sin embargo, se refieren a las figuras 6 y 7).
5. Tumor de Metas e imágenes utilizando un modelo de xenoinjertos de ratón
- Cultura HT-29 células humanas de cáncer de colon en medio RPMI suplementado con FBS al 5%, 1% de penicilina-estreptomicina, y 1% de L-glutamina, a 37 ° C en 5% de CO 2 utilizando 175 cm 2 frascos de cultivo celular.
- Lavar las células dos veces con PBS estéril y la cosecha mediante la incubación con 5 ml de tripsina-EDTA a 37 º C durante 5 min. Inactivar la tripsina con 5 ml de medio RPMI. Recoger las células por centrifugación a 500 xg durante 5 min. a 4 º C y se resuspende en medio fresco RPMI a 5x10 6 células/50 medio l (determinar recuento total de células usando azul de tripano y un hemocitómetro a). Mezclar con un volumen igual de matrigel antes de la inyección (mantener todas las soluciones y reactivos estériles).
- Adquirir seis semanas de edad NCR nu / nu ratones y los mantienen en una dieta libre de alfalfa durante 2 semanas. [Nota:. Todos los procedimientos con animales debe ser aprobado por el IACUC] Inducir xenoinjertos de tumores mediante inyección subcutánea de 5x10 6 células/100 l / tumor en los flancos (2 tumores / ratón) usando un manómetro 18 1/2 estérilaguja. Monitorear los animales regularmente. Medir el tamaño del tumor usando calibres y permitir que los tumores crezcan a un volumen promedio de 20 mm 3 (dentro de los próximos 12 días). Asignar los ratones en dos grupos al azar: PBS y VNP (n = 3 animales / grupo / hora punta). Uso de un 1 ml jeringa de insulina de calibre 28, administrar por la vena de la cola de inyección intravenosa 100 l de PBS estéril o 10 mg / kg formulación VNP.
Nota: los experimentos de cultivo de tejidos y estudios con animales vivos que no se ha demostrado. Demostración práctica se limitará a procesamiento de tejidos y de adquisición de datos. Para una referencia sobre la HT-29 modelo de xenoinjerto de tumor, se remite al lector a la ref. 19
Tres técnicas se utilizan para evaluar el tumor homing de VNPs:
- Imágenes de fluorescencia mediante Maestro Imaging System: ratones sacrificio en diferentes puntos de tiempo (2, 24, y 72 h) usando CO 2gas. Disecar los animales y especiales todos los órganos principales (cerebro, corazón, pulmones, el bazo, los riñones y el hígado), junto con los tumores en los flancos, colocar los tejidos en parafilm, y analizar con el instrumento de formación de imágenes de fluorescencia utilizando excitación amarillo y filtros de emisión (800 ms exposición) para detectar la presencia de señales fluorescentes en los tejidos (derivadas de A647 etiqueta conjugarse a los VNPs). Guarde las imágenes y analizar la intensidad de fluorescencia utilizando ImageJ software 1.44o ( http://imagej.nih.gov/ij ). Comparar el patrón de absorción de los VNPs en los tumores con otros tejidos importantes con el tiempo.
- Después de la imagen, recortar cada tejido por la mitad e insertar un medio en compuesto OCT para el análisis de la crio-seccionamiento y confocal. Recoge la otra mitad en predosificados crio-viales y congelar inmediatamente utilizando N2 líquido. Almacenar a -80 ° C hasta que esté listo para su posterior procesamiento.
- Fluorescencia de cuantificación: Retejidos de la médula pesos. Descongelar los tejidos congelados a temperatura ambiente y colocarlos en tubos separados Falcon de 50 ml que contienen 1 ml de PBS. El uso de un homogeneizador de tejidos de mano, homogeneizar los tejidos para 2-3 min en PBS a continuación, transferir el homogenado a tubos de microcentrífuga. Se centrifuga el homogeneizado durante 10 min a 13.000 xg para eliminar la no-tejido homogeneizado.
- Pipetear 100 l del sobrenadante de los tejidos de cada grupo (formulaciones PBS y VNP / puntos de tiempo) en una placa de UV 384 y negro. Evaluar la intensidad de fluorescencia (Ex / Em longitudes de onda de 600/665), utilizando un lector de placas. Normalizar los valores obtenidos fluorescentes por los pesos de los tejidos.
- Inmunohistoquímica: Preparar la crio-micrótomo secciones (10 micras) y se almacena a -20 ° C. Mancha de las secciones de tejido para núcleos de las células (DAPI) y marcador de células endoteliales (marcado con FITC anti-ratón CD31 de anticuerpos). Llevar a cabo el análisis por microscopía confocal para mapear la localización intra vascular y tumoral de marcado fluorescentemente VNPs.
Nota: Este procedimiento no se ha demostrado, los datos representativos se muestran en la Figura 8. Para una referencia sobre la inmunohistoquímica y los métodos de tinción descritos, se remite al lector a la ref. 19