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1. Inmunofluorescencia
El siguiente protocolo se realiza en secciones criogénicas cerebrales coronales obtenidas de ratones perfundidos transcardialmente (20 ml de PBS, 0,1 moles / litro, pH 7,4, seguido de 50 ml de paraformaldehído al 4% enfriado en PBS). Después de la perfusión, los cerebros se retiran y se transfieren a 30% de sacarosa en PBS a 4 ° C durante la noche para crioprotección cuidadosamente. Los cerebros se congelan rápidamente por inmersión en isopentano a - 45 ° C durante 3 min antes de ser sellado en viales y se almacenaron a -70 ° C hasta su uso. Criosecciones cerebrales coronales (20 m) se cortan en serie y se sometieron a protocolo de inmunofluorescencia 11, 6.
Llevar todos reactivos y muestras a temperatura ambiente antes de su uso. Por favor, tenga en cuenta que los presentados diluciones de trabajo de anticuerpos en suero y el resultado de las pruebas realizadas con el fin de obtener el mejor rendimiento. Cuando se utilizan diferentes anticuerpos y el suero, el protocolo debe ser validado.
Nota que debido a anticuerpos primarios tanto anti-CD11b y anti-CD68 se hacen, en la rata, para evitar la señal de cruce por anti-rata Alexa 546, se utilizó una alta dilución de anticuerpos anti-CD11b seguido de amplificación de la señal fluorescente con kit TSA (Cy5 tiramida). Hemos puesto en marcha la dilución de trabajo óptima para el anti-CD11b realizando el protocolo descrito excepto el paso 1.17 y el uso de por lo menos 7 diferentes diluciones de anti-CD11b como se informa en la Tabla 1. Como resultado, 1:30.000 ha sido elegido ser el único dilución lograr: 1) la señal visible con Cy5 a una excitación de longitud de onda 646 nm; 2) no hay señal con Alexa 546 en la longitud de onda de excitación de 532 nm. De esta manera, Alexa 546 señal fluorescente se asocia selectivamente con la expresión de CD68.
Las diluciones óptimas para los anticuerpos anti-CD68 anti-CD11b y pueden variar dependiendo del tipo de tejido y debe ser definido antes de iniciar el protocolo de co-etiquetado.
- Lave cryosections cerebro dos veces con PBS.
- Encryosections Cubate durante 5 minutos en PBS que contenía 1% de H 2 O 2 (paso necesario ya que la amplificación fluorescente necesita incubación con peroxidasa de rábano picante, estreptavidina-HRP, consulte el paso 1.12).
- Cryosections Lave 2X con PBS.
- Incubar durante 60 min cryosections en PBS que contenía 10% de NGS y 0,3% Tritón.
- Incubar criosecciones a 4 ° C durante la noche en PBS que contenía primaria Ab de rata anti-CD11b [1:30.000], 10% de NGS y 0,3% de Triton.
- Lavado cryosections 2x (5 min) con PBS.
- Incubar durante 60 min cryosections en PBS que contengan biotina secundario anti-Rata Ab [1:200] y 1% de NGS.
- Cryosections Lave 2X con PBS.
- Lavar criosecciones con TNT (Tris-HCl, NaCl, Tween: 0,1 M Tris-HCl, pH 7,4, NaCl 0,15 M, 0,05% de Tween 20).
- Incubar criosecciones durante 1,5 h en TNB (tampón Tris-HCl-NaCl-Bloqueo: 0,1 M Tris-HCl, pH 7,4, NaCl 0,15 M, 0,5% de reactivo de bloqueo del kit apropiado (véase la tabla de reactivos)).
- Lave criosecciones 3x veces con TNT.
- Incubar criosecciones en TNB que contienen estreptavidina-HRP [1:100].
- Cryosections Lave 3x con TNT.
- Incubar cryosections durante 8 minutos en la amplificación de diluyente que contiene Cyanine 5 tiramida [1:300].
- Cryosections Lave 3 veces con PBS.
- Incubar durante 60 min cryosections en PBS que contenía 10% de NGS y 0,1% Tritón.
- Incubar criosecciones a 4 ° C durante la noche en PBS que contenía primaria Ab de rata anti-CD68 [1:200], 3% de NGS y 0,3% de Triton.
- Cryosections Lave 3 veces con PBS.
- Incubar cryosections durante 60 minutos en PBS que contenía fluorconjugated secundaria Ab Alexa 546 anti-rata [1:500] y 1% de NGS.
- Cryosections Lave 3 veces con PBS.
- Incubar criosecciones durante 10 min en PBS que contiene Hoechst 1 g / ml.
- Cryosections Lave 3 veces con PBS.
- Montar cryosections en Prolong oro.
2. La adquisición de imágenes tridimensionales por microscopía confocal
El microscopio usado aquí fue un microscopio IX81 equipado con una unidad de digitalización FV500 confocal con 3 líneas de láser: Ar-Kr (488nm), rojo de He-Ne (646nm) y He-Ne verde (532 nm) y un diodo UV.
- Seleccione los láseres de excitación en función de las longitudes de onda de los tintes fluorescentes para ser excitados (rojo He-Ne para Cy5, CD11b, He-Ne verde para Alexa546, CD68 y el diodo UV para Hoechst, núcleos).
- Seleccione la mejor combinación espejo dicroico para la recolección de señal luminosa.
- Configure la resolución de imagen en un mínimo de 800 x 600 píxeles.
- Identifique un área de interés mediante el uso de epi-fluorescencia y aumentar progresivamente la ampliación con el objetivo de 40X.
- Cambie a Láser Scanning Microscopy (LSM) modalidad.
- Ejecutar exploraciones repetitivas para ajustar el fotomultiplicador (PMT) y la ganancia para cada canal. Los láseres pueden ser activados individualmente para facilitar la puesta en marcha. Mantener el aumento de lo más bajo posible para evitar señales no específicas no deseadas.
- Con repetitive ejecución del análisis, mover el control de enfoque para definir los extremos inferior y superior de el eje z (longitud total del eje z = 10 micras).
- Detener exploración repetitiva.
- Definir el tamaño de paso. Debe ser lo más cerca posible de tamaño de píxel (0,225 m) para obtener una relación de tamaño 1:01 estándar sobre el eje z.
- Activar filtro de Kalman por lo menos 2 veces.
- Activar el modo de exploración secuencial para evitar efectos sangrar a través.
- Ir a mitad de camino a lo largo del eje z y ejecutar un análisis secuencial xy. Compruebe la configuración de PMT y la ganancia (buena relación señal / ruido). Si no es satisfactoria, repita el paso 2.6.
- Ejecute adquisición xyz.
- Exportar datos como archivo multitiff. Cada archivo multitiff normalmente contiene 3 canales de color (azul, verde y rojo) y 44 planos focales.
3. Vista tridimensional de Adquisiciones confocal y de representación tridimensional
Subir archivos multitiff al software Imaris y procesarlos como sigue:
- El software libre.
- Seleccione la vista de superar.
- Cargue el archivo multitiff.
- Seleccione el color deseado para cada canal.
- Eliminar el ruido de fondo, aumentando el valor mínimo en el panel de ajuste de pantalla. Ajuste cada canal individualmente.
- Vaya a la vista de sección. Mover a lo largo del eje z en busca de co-localización (píxeles amarillos).
- Haga clic en un área amarilla para ver si la colocalización está presente a lo largo del eje z (es decir, pertenece a un objeto sólido). Proyecciones del eje Z son visibles en la parte derecha y la parte inferior de la figura.
- Tomar una instantánea.
- Volver a superar la vista.
- Recortar 3D para aislar una célula o un grupo de células.
- Seleccione un canal en el panel de ajuste de pantalla.
- Seleccione la superarán / superficies algoritmo constructor. Pasos del algoritmo:
- Seleccione el canal.
- Definir umbral (utilizar el mismo valor mínimo de tse muestra el panel de ajuste).
- Definir el cambio de tamaño.
- Definir suavizado (mejor = 0,200).
- Definir la apariencia del color.
- Fin algoritmo.
- Repita paso 3,12 para cada canal.
- Anule la selección de canales de fluorescencia en el panel de ajuste de la pantalla y seleccionar todas las tres superficies.
- Mueva el volumen para encontrar la mejor vista.
- Tomar una instantánea.