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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Proporcionamos un protocolo detallado para la inducción de la potenciación a largo plazo en la región CA1 del hipocampo y el posterior aislamiento de fracciones enriquecidas nucleares de la zona de tetanized de la rodaja. Este enfoque puede ser utilizado para determinar la actividad de importación nuclear dependiente de proteína en modelos celulares de aprendizaje y memoria.
El estudio de la actividad de la expresión de proteínas dependientes, translocación subcelular, o fosforilación es esencial para entender los mecanismos celulares subyacentes de la plasticidad sináptica. La potenciación a largo plazo (LTP) y depresión a largo plazo (LTD) inducida en cortes de hipocampo agudos son ampliamente aceptados como modelos celulares de aprendizaje y la memoria. Existen numerosos estudios que usan imágenes de células o de inmunohistoquímica enfoques en vivo para visualizar la actividad dinámica de las proteínas dependientes. Sin embargo, estos métodos se basan en la idoneidad de los anticuerpos para inmunocitoquímica o sobreexpresión de proteínas de fluorescencia de etiquetado en las neuronas individuales. La inmunotransferencia de proteínas es un método alternativo que proporciona una confirmación independiente de los resultados. El primer factor limitante en la preparación de fracciones subcelulares de cortes de hipocampo tetanized individuales es la baja cantidad de material. En segundo lugar, el procedimiento de manejo es crucial porque las manipulaciones incluso muy cortos y menores de living rebanadas podría inducir la activación de ciertas cascadas de señalización. Aquí se describe un flujo de trabajo optimizado con el fin de obtener una cantidad suficiente de la fracción nuclear enriquecido de suficiente pureza a partir de la región CA1 de cortes de hipocampo agudos de cerebro de rata. Como ejemplo representativo se muestra que la ERK1 / 2 forma fosforilada de la proteína nuclear mensajero synapto-Jacob activamente transloca al núcleo después de la inducción de la LTP y se puede detectar en una fracción enriquecida nuclear de las neuronas CA1.
Sináptica N-metil-D-aspartato-receptores (NMDAR) juegan un papel crucial en la plasticidad sináptica y la supervivencia celular de señalización mientras que la activación de los NMDAR extrasinápticos puede desencadenar la neurodegeneración y la muerte celular. Estos cambios dependen de / actividad regulada la expresión génica dependiente fuertemente controlada y por lo tanto requieren una comunicación constante entre las sinapsis o dendritas activados y el núcleo 7. El MAP quinasas ERK1 / 2 son los efectores de NMDAR sinápticos de señalización y están involucrados en la expresión génica inducida por NMDAR activación, mientras que la señalización a través de NMDAR extrasynaptic no tiene o tiene un efecto inhibitorio sobre la ERK1 / 2 Actividad 8,11.
Hay una serie de proteínas que han demostrado lanzadera entre dendritas distales y el núcleo. Muchas de estas proteínas contienen una señal de localización nuclear y son transportados activamente a lo largo de los microtúbulos en un dineína y forma importina dependiente al núcleo 6,9. Interestingly, algunos de estos mensajeros sólo de tránsito al núcleo en respuesta a estímulos sinápticos específicos. Por ejemplo, el transporte retrógrado de AMP cíclico elemento de respuesta a la proteína de unión 2 (CREB2) es inducida por LTD química pero no LTP 12. Localizada estimulación sináptica dependiente de NMDAR impulsa coactivador transcripcional CREB reguladas (CRTC1) en el núcleo, un proceso de translocación, que está implicado en la plasticidad del hipocampo a largo plazo 4. Se ha demostrado recientemente que el mensajero de proteínas Jacob se transloca al núcleo después de tanto, la activación NMDAR sinápticos y extrasynaptic y regula la transcripción génica dependiente de CREB 5. El origen sináptica o extrasynaptic de la señal se codifica en una modificación postraduccional de Jacob. La actividad sináptica induce ERK1 / 2 fosforilación dependiente de Jacob en una serina en la posición 180 fundamental (pJacobS 180), que es un requisito para la posterior translocación al núcleo del hipocampo en cultivo primario. Por otra parte, in neuronas CA1 del hipocampo rebanadas agudas pJacobS 180 transloca al núcleo después de Schaffer garantía LTP pero no LTD 1,10. PS180 Jacob lleva a un aumento de la expresión de genes relacionados con la plasticidad y la expresión de los genes se alimenta de nuevo a la función sináptica. En agudo contraste, Jacob que se transloca al núcleo después de la activación NMDAR extrasinápticos no está fosforilada en Ser180 y podría estar asociado con diferente complejo de proteínas en el núcleo causando 'CREB apagado' y una retracción de los contactos sinápticos 10.
Mayoría de los estudios publicados sobre la importación nuclear de synapto-nuclear proteína mensajera se han realizado en cultivos primarios neuronales disociadas. Por lo tanto, sería interesante ver si estos hallazgos pueden ser reproducidos en fisiológicamente más relevante condiciones utilizando rebanadas de hipocampo donde la conectividad neuronal y la función son mucho mejor conservado. Aquí presentamos un protocolo optimizado para la evaluación de LTP-deColgante translocación nuclear de los mensajeros de proteínas por inmunotransferencia. Este método también es adecuado para el análisis de la actividad de fosforilación dependiente de proteínas en una fracción nuclear crudo. En concreto, el actual protocolo implica la preparación de rodajas de hipocampo CA1 agudas, la inducción y la grabación de la LTP. A continuación, la región CA1 se diseccionó microscópicamente para aislar la región estimulada. Hemos combinado y modificado el protocolo para el aislamiento nuclear proporcionada por CellLytic NuCLEAR Extraction Kit con los cambios introducidos por Zhao y sus colegas 17. El procedimiento optimizado incluye la lisis de las regiones CA1 disecados en tampón hipotónico que permite hinchazón celular y liberación de núcleos. La lisis celular y la morfología de los núcleos pueden ser determinadas por examen microscópico. De enriquecimiento nuclear se logra mediante una etapa de centrifugación corta. Análisis de inmunotransferencia con anticuerpos contra NeuN y NSE2, marcadores específicos de fracciones citosólicas o nucleares, indica que este enfoque puede ser utilizado como un rápidoy el protocolo reproducible para aislar estas fracciones subcelulares y estudiar las modificaciones posteriores a la traducción muy lábiles como la fosforilación de proteínas. Además, este método es ventajoso para las pequeñas muestras de tejido que se derivan de regiones CA1 de cortes de hipocampo disecados y se puede utilizar en combinación para inmunohistoquímica de cortes de hipocampo.
1 Preparación de aguda hipocampo rebanadas de cerebro de rata adulta
2. Posicionamiento de Electrodos, grabación de línea de base, y la inducción de la LTP
3. Colección de rebanadas después de la inducción de LTP y Snap Congelación
4. Aislamiento de fracciones nucleares enriquecidos de la región CA1 del hipocampo
5. Inmunoblotting Semicuantitativo para Proteínas Synapto nucleares
Análisis 6. Datos
| Nombre del buffer | Reactivo | Concentración (mM) | Importe | Comentarios / Descripción |
| La solución de Gey (pH: 7,3 ~ 7,4) | NaCl | 130 | 7,6 g | filtración estéril |
| 1000 ml | KCl | 4.9 | 0,37 g | |
| CaCl 2 · 2H 2 O | 1.5 | 0,22 g | ||
| MgSO 4 · 2H 2 O | 0.3 | 0.0739 g | ||
| MgCl2 · 6H 2 O | 11 | 2,24 g | ||
| KH 2 PO 4 | 0.23 | 0,0313 g | ||
| Na 2 HPO 4 · 7H 2 O | 0.8 | 0.2145 g | ||
| Glucosa · H 2 O | 5 | 0.9909 g | ||
| HEPES | 25 | 5,96 g | ||
| NaHCO3 | 22 | 1,85 g | ||
| ACSF (pH: 7,3 ~ 7,4) | NaCl | 110 | 6.428 g | filtración estéril |
| 1000 ml | KCl | 2.5 | 0.1865 g | |
| CaCl 2 · 2H 2 O | 2.5 | 0,368 g | ||
| MgSO 4 · 2H 2 O | 1.5 | 0.370 g | ||
| KH 2 PO 4 | 1.24 | 0,169 g | ||
| Glucosa · H 2 O | 10 | 1,9817 g | ||
| NaHCO3 | 27.4 | 2,3 g | ||
| 1x hipotónica (pH: 7,9) | HEPES | 10 | 0,23 g | |
| 100 ml | MgCl2 · 6H 2 O | 1.5 | 0,0304 g | |
| KCl | 10 | 0,07455 g |
Tabla 1. Tampones.
Hemos demostrado previamente que la proteína nuclear synapto-mensajero Jacob acumula en el núcleo después de la inducción de la LTP pero no LTD 1. Por otra parte, la translocación de Jacob después de la estimulación sináptica requiere la activación de la MAPK ERK1 / 2 y la fosforilación de Ser180 a Jacob (Figura 1). Jacob fosforilado se transloca al núcleo de una manera importin-dependiente y el estado fosforilado se puede conservar durante períodos prolongados de tiempo por la asociación con el filamento intermedio αinternexin 15 (Figura 1). El fosfo-estado de Jacob es importante para la expresión de genes dependientes de la actividad y la supervivencia celular. Curiosamente, la activación de los NMDAR extrasinápticos también impulsa Jacob en el núcleo pero en este caso Jacob no es fosforilada en Ser180 y su acumulación nuclear induce CREB 'apagado' 5,10. Los resultados descritos anteriormente se obtuvieron por protocols establecidas en nuestro estudio reciente (véase Karpova et al. 10 para una descripción detallada del modelo).
Para probar que Jacob se transloca en el núcleo después de la inducción de la LTP, se indujo y se midió la inducción de la potenciación a colateral de Schaffer fEPSP en cortes de hipocampo agudos y posteriormente aislados núcleos neuronales de las neuronas CA1 (figuras 2 y 3). Se han comparado dos momentos diferentes después de la aplicación de la estimulación de alta frecuencia (2 min y 30 min) y grabamos la inducción de LTP para cada sector que fue procesada posteriormente para el aislamiento nuclear y el Western Blot (Figuras 2 y 3). Enriquecimiento del marcador neuronal NeuN nuclear se puede ver en la fracción enriquecida nuclear preparado a partir de la región CA1 diseccionado, mientras que la neurona marcador citosólico enolase2 específica (NSE) es en su mayoría presentes en la fracción sobrenadante obtenido después de la centrifugación de c lisaronells (Figura 4A). La especificidad del anticuerpo PS180 Jacob se ha caracterizado previamente (para más detalles véase Karpova et al. 10). niveles PS180 Jacob permanecieron inalterados en el total de los homogeneizados de proteínas CA1 y en la nuclear enriquecido fracción 2 min después tetanización (Figura 4B), pero encontramos un aumento significativo en pJacobS 180 inmunorreactividad 30 min después de la inducción de la LTP (Figura 4 C), lo que confirma que Jacob translocación al núcleo en este modelo de plasticidad celular es fosforilada en Ser180.

Figura 1. Jacob fosforilados en S180 codifica el origen sináptica de las señales de NMDAR. Estimulación tetánica de fibras colaterales de Schaffer de hipocampo resultados en la activación de los NMDAR sinápticos y la posterior activación de MAPKERK1 / 2 cascada de señalización. Activado ERK1 / 2 se une y fosforila en la serina 180 Jacob y Jacob-ERK1 / 2 complejo se transloca al núcleo y esto se correlaciona con una mayor actividad de CREB y la activación de la plasticidad relacionada con la expresión génica.

Figura 2 Equipos y herramientas utilizadas para la inducción de LTP y la disección de la región CA1 de cortes de hipocampo. A) Vibratome utiliza para la preparación de cortes de hipocampo agudas (1 - Vibratome) B1-2) Electrofisiología y configuración de imagen (2 - Microscopio; 3 - Micromanipulador y sistema de perfusión; 4 - electrodo recodificación; 5 - electrodo de estimulación; 6 - El agua de la lente objetivo ; 7 - titular de la rebanada con la rebanada del hipocampo) C) El equipo utilizado para la disección de la región CA1 de cortes de hipocampo (8 Stereomicroscope; 9 - jeringa de insulina con agujas; 10 - Pequeñas tijeras quirúrgicas; 11 - Escalpelo; 12 - pipeta Pasteur de plástico; 13 - fina espátula; 14-100 mm de plato de cultivo de plástico lleno de agua con hielo, y 40 mm de plato de cultivo de plástico utilizado para la disección de las rebanadas.

Figura 3. historieta que muestre el procedimiento experimental. Los números indican los pasos del protocolo. 2.1 a 2.8) Un corte de hipocampo agudo en la cámara sumergido con electrodos de vidrio colocados en el estrato radiado para la potenciación de colateral de Schaffer-CA1 sinapsis. La inserción representa las huellas analógicas muestra fEPSP, la barra horizontal indica 5 ms y la barra vertical indica 0,5 mV. 3.3) Las rodajas se recogieron en tubos de 1,5 ml después deGrabación de LTP y se congeló. 4.3) La disección de la región CA1 del hipocampo de rata adulta rodajas. 4.4 a 4.5) regiones CA1 homogeneizaron en tampón de lisis hipotónica, lo que provoca la hinchazón osmótica de las células y la liberación de los núcleos. 4.8) La centrifugación de los lisados a 11.000 rpm durante 1 min. 4,10) Colección de las fracciones enriquecidas citoplásmicos y nucleares para inmunotransferencia. 5.3) La carga de fracciones enriquecidas citoplásmicos y nucleares en SDS-PAGE y posterior-Western Blot estándar.

Figura 4. Inducción de CA1 LTP conduce a la acumulación de pJacS180 en el núcleo. A) Inmunotransferencia de homogenado, citosólicas y nucleares fracciones enriquecidas de lisado CA1 probaron con citosólicas y marcadores nucleares. B) El análisis por inmunotransferencia de nivel pJAC-S180 en homogeneizado de 2 min y 30 min después de inducción de tetanización. C) El análisis por inmunotransferencia de nivel pJacS180 en nuclear enriquecido fracción 2 minutos y minutos después tetanización. Estos resultados son parte de gráfico de cuantificación publicado en Karpova et al 10. Estos inmunoblots representativos no están incluidos en la publicación original.
Los autores no tienen nada que revelar.
Proporcionamos un protocolo detallado para la inducción de la potenciación a largo plazo en la región CA1 del hipocampo y el posterior aislamiento de fracciones enriquecidas nucleares de la zona de tetanized de la rodaja. Este enfoque puede ser utilizado para determinar la actividad de importación nuclear dependiente de proteína en modelos celulares de aprendizaje y memoria.
Este trabajo fue financiado por la DFG (SFB 779 TPB8, Kr1879/3-1 MRK), la subvención DIP (MRK), el EU FP7 MC-ITN NPlast (MRK), el Centro de Ciencias del Cerebro del Comportamiento (CBBS, Sahsen-Anhalt), (AK y SB), MM es beneficiario de la beca a largo plazo de la Organización Europea de Biología Molecular (EMBO) (EMBO ALTF 884-2011) y Marie-Curie IEF.
| Equipment | |||
| CED 1401 AD/DA convertidor Cambridge | Electronics Design, UK | ||
| a href="http://www.iciba.com/stereomicroscope">Microscopio estereoscópico | Leica S4E, Alemania | ||
| Vibrotomo | Leica VT1000S, Alemania | ||
| Estimulador de impulsos aislado | A-M Systems, EE. UU. | Centrífuga modelo 2100 | |
| Sistema Thermo Scientific | |||
| SDS-PAGE | Biorad | ||
| Cooler | Julabo | ||
| Microscopio de campo claro | Nikon Eclipse TS100 | ||
| Incubadora de cultivos celulares | Micromanipulador | Thermo Electron Corporation||
| Luigs & Neumann, SM-5, Alemania | |||
| Cámara de transferencia y proveedor de energía eléctrica | Hoefer Scientific Instruments, San Francisco, CA | ||
| Cámara de registro de tipo sumergido | hecha | a medida | |
| forma de U e incubadora de tipo sumergido | hecho | a medida | |
| Tijeras quirúrgicas pequeñas | Bisturí Espátula fina Pipeta Pasteur de plástico Plato de|||
| cultivo de plástico | |||
| Vaso de precipitados | Bunsen | ||
| Jeringa | |||
| NaCl | Roth Art.-Nr.3957.1 | ≥ 99.5%, p.a., ACS, ISO | |
| KCl | Roth | Art.-Nr.6781.1& | ge; 99.5%, p.a., ACS, ISO |
| CaCl2· 2H2O | Merck | 1.02382.0500 | pro analysis |
| MgSO4· 2H2O | Merck | 5886.05 | pro analysis |
| MgCl2· 6H2O | AppliChem | CAS-NO: 7791-18-6; EC-NO:2320946 | para biología molecular |
| KH2PO4 | Merck | 12034.025 | para biología molecular |
| Na2HPO4· 2H2O | Merck | 1.06574.1000 | Glucosaextra pura |
| · H2O Roth | Art.-Nr.6887.1 | para biología molecular | |
| HEPES | Roth | Art.-Nr.9105.4 | PUFFERAN, ≥ 99.5%, p.a. |
| NaHCO3 | Merck | 1.06329.1000 | pro análisis |
| Cóctel de inhibidores de la proteasa | Roche | ||
| Phosphostop | Roche | ||
| Bicuculline | Tocris Bioscience | ||
| Isoflurano | Baxter | ||
| Anticuerpos primarios | Número de catálogo | dela empresa | Especie |
| pJac-s180 | Biogenes | conejo (diluido 1:100) | |
| NeuN | Milipore | MAB377 | ratón (diluido 1:1.000) |
| NSE | Cell Signaling | D20H2 | conejo (diluido 1:1.000) |
| Beta-actina | Sigma | A-5441 | ratón (diluido 1:5.000) |
| Anticuerpos secundarios | Número de catálogo | dela empresa | Especie |
| IgG HRP conjugada | DAKO | cabra anti-ratón (1:5.000) | |
| IgG HRP conjugada | NEB | cabra anti-conejo (1:5.000) | |