Vías de reparación del ADN son esenciales para el mantenimiento de la integridad genómica y la prevención de la mutación y el cáncer. El objetivo de este protocolo es cuantificar la inestabilidad genómica mediante la observación directa de las aberraciones cromosómicas en metafase se propaga a partir de células B de ratón utilizando hibridación in situ fluorescente (FISH) para las repeticiones teloméricas de ADN.
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Artículo de método
Análisis rápido de aberraciones cromosómicas en linfocitos B de ratón por PNA-FISH
En este artículo
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Resumen
Resumen
Reparación del ADN defectuoso provoca un aumento de la inestabilidad genómica, que es la causa raíz de las mutaciones que conducen a la tumorigénesis. Análisis de la frecuencia y tipo de aberraciones cromosómicas en diferentes tipos de células permite defectos en las vías de reparación del ADN no se ha dilucidado. Entender la biología de reparación del ADN de los mamíferos se ha ayudado en gran medida por la producción de ratones con nocauts en genes específicos. El objetivo de este protocolo es cuantificar la inestabilidad genómica en los linfocitos B de ratón. Etiquetado de los telómeros con sondas PNA-FISH (ácido nucleico peptídico - hibridación fluorescente in situ) facilita el análisis rápido de la inestabilidad genómica en las extensiones de cromosomas en metafase. Células B tienen ventajas específicas relativas a los fibroblastos, porque tienen la ploidía normal y un índice mitótico superior. Cultivo a corto plazo de las células B, por tanto, permite la medición precisa de la inestabilidad genómica en una población celular primaria que es probable que tenga mutación genética secundaria menoss de lo que se encuentra típicamente en fibroblastos transformados o líneas de células de pacientes.
Introducción
El cáncer es causado por la acumulación de mutaciones que afectan a genes que regulan el crecimiento celular normal. La mutación es una consecuencia de cambios en la estructura y la secuencia del genoma causado por el daño al ADN. Daño del ADN puede ocurrir a través de una variedad de procesos, incluyendo agentes exógenos tales como la radiación ionizante y, como un subproducto del metabolismo celular normal, tales como desaminación espontánea de bases de nucleótidos o daños que se producen por el contacto con especies reactivas de oxígeno 1.
Aunque las células de mamíferos poseen una gama de actividades de reparación que puede....
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Protocolo
Este procedimiento fue aprobado por el Comité de Cuidado y Uso de Animales institucional en Rutgers, la Universidad Estatal de Nueva Jersey. Los ratones fueron tratados de acuerdo con la Guía del NIH para el Cuidado y Uso de Animales de Laboratorio. Los científicos deberían consultar a sus organizaciones animalistas nacionales e institucionales de las normas establecidas y aprobadas.
Antes de comenzar, preparar las soluciones enumeradas en la Tabla 1.
Aislamiento Celular 1 B y Activación
La eutanasia a un ratón utilizando CO 2 seguido por dislocación cervi....
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Resultados
Los cromosomas en metafase de una célula derivados deben formar un clúster discreta que contiene 40 cromosomas (si usando células de ratón) (Figura 1A). Cada cromosoma tiene un centrómero en un extremo, que es visible como una esfera de color azul claro. En cromosomas normales, dos señales de los telómeros son vistos en el extremo de las cromátidas y dos señales por cada centrómero. Núcleos en interfase estarán presentes en la diapositiva también. Estos serán visibles como esferas azul, con señales de t.......
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Discusión
Mientras que los linfocitos B activados son particularmente adecuados para la preparación de extensiones de cromosomas mitóticos, también se pueden utilizar otros tipos de células. Linfocitos T compartir muchas de las ventajas de las células B, ya que pueden ser purificados a partir de los nodos de bazo o de los ganglios, y tienen un alto índice mitótico cuando son estimuladas por el crecimiento en medio que contiene mitógenos apropiados 8. Las células madre embrionarias (células ES) también son adecuados par.......
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Divulgaciones
Los autores no tienen intereses en conflicto.
Agradecimientos
Este trabajo es apoyado por el NIH subvención R00 CA160574 (SFB) y por una beca del Programa de Entrenamiento de Biotecnología Rutgers (a SMM).
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Materiales
| Nombre | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
|---|---|---|---|
| 50% Sulfato de dextrano | Intergen | S4030 | |
| Formamida desionizada | Ambion | 9342 | |
| Pepsina (5 g) | Sigma | P 6887 | |
| FCS | Gemini | 100-106 | |
| LPS (100 mg) | Sigma | L2630 | |
| IL-4 (5 μ g) | Sigma | I1020 | |
| PNA Sonda de telómeros | PNA Bio Inc | F1002 | (CCCTAACCCTAACCCTAA) |
| Colcemid | Roche | 295892 | |
| Mowiol 4-88 | Sigma | 81381-50g | |
| CD43 (ly-48_) micro-perlas | Miltenyl Biotec. | 130-049-801 | |
| DAPI | Sigma | 32670-5MG | |
| Eclipse E800 | Nikon | ||
| AxioImager.Z2 | Zeiss | ||
| CDS-5 Cámara de secado citogenético | Thermotron |
Referencias
- Sancar, A., Lindsey-Boltz, L. A., Unsal-Kacmaz, K., Linn, S. Molecular mechanisms of mammalian DNA repair and the DNA damage checkpoints. Ann Rev Biochem. 73, 39-85 (2004).
- Sperka, T., Wang, J., Rudolph, K. L. DNA damage checkpoints in stem cells, ageing and cancer.....
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Reimpresiones y permisos
Erratum
Formal Correction: Erratum: Rapid Analysis of Chromosome Aberrations in Mouse B Lymphocytes by PNA-FISH
Posted by JoVE Editors on 1/01/1970. Citeable Link.
A correction was made to: Rapid Analysis of Chromosome Aberrations in Mouse B Lymphocytes by PNA-FISH. Table 1 (the list of solutions to prepare) was omitted from the Protocol section. The contents of Table 1 are as follows:
| Solution | Reagents | Comments | Storage |
| B Cell Wash Buffer | 500 ml 1x Hanks Balanced Salt Solution | Filter through 0.22 μm stericup filtration unit | 4 °C |
| 5 ml 50 °C heat inactivated FCS | |||
| 5 ml 100x Pen/Strep | |||
| B Cell Medium | 418.5 ml RPMI-1640 | Filter through 0.22 μm stericup filtration unit | 4 °C |
| 50 ml 50 °C heat inactivated FCS | |||
| 5 ml 100x Pen/Strep | |||
| 5 ml glutamine | |||
| 5 ml nonessential amino acids | |||
| 5 ml sodium pyruvate | |||
| 1.8 ml 14.2 M 2-mercaptoethanol | |||
| 5 ml 1M HEPES | |||
| Fixative | 3:1 v/v methanol/glacial acetic acid | Make fresh | |
| 0.075 M KCl | 1.395 g KCl | Room Temperature | |
| 250 ml distilled H2O | |||
| FISH Master Mix | 40 ml 50% Dextran sulfate | Vortex the solution and leave in a shaking platform overnight | Aliquot and store at -20 °C |
| 20 ml 20x SSC | |||
| 40 ml sterile distilled H2O | |||
| 70% Formamide/2x SSC | 10 ml 20x SSC | Adjust to pH 7 with 1M HCl | Aliquot and store at -20 °C |
| 20 ml distilled H2O | |||
| 70 ml deionized formamide | |||
| 0.01 M HCl | 1 ml 1M HCl | Adjust to pH 2.0 | Room Temperature |
| 99 ml distilled H2O | |||
| 1x PBS/MgCl2 | 50 ml 1M MgCl2 | Room Temperature | |
| 950 ml 1x PBS | |||
| 50% Formamide/2x SSC | 20 ml 20x SSC | Adjust to pH 7.25 Formamide used in this step does not have to be deionized. | Make fresh |
| 80 ml distilled H2O | |||
| 100 ml formamide | |||
| 4x SSC/0.1% Tween20 | 50 ml 20x SSC | Room Temperature | |
| 200 ml distilled H2O | |||
| 250 μl Tween20 | |||
| DAPI staining solution (80 ng/ml) | 40 μl 0.2mg/ml DAPI stock | 4 °C in light protected staining jar | |
| 100 ml 2x SSC | |||
| Mowiol Mounting Medium | 6 g glycerol | Incubate at 50 °C with stirring for 2hrs | Aliquot and store at 4 °C |
| 2.4 g Mowiol 4-88 | |||
| 6 ml distilled H2O | |||
| 12 ml 0.2 M TrisCl pH 8.5 | |||
| 230 μl 1% Thimerosal (w/v in water) |
Table 1. List of solutions.
