El objetivo de este protocolo es informar sobre un método simple para generar andamios de nanofibras con gradaciones en la organización de las fibras y probar sus posibles aplicaciones en el control de la morfología/orientación celular. La organización de las nanofibras se controla con un nuevo aparato de fabricación que permite la disminución gradual de la organización de las fibras en un andamio. El cambio de la alineación de las fibras se logra mediante la disminución del tiempo de deposición de las fibras electrohiladas aleatorias en una estera de fibra alineada uniaxialmente. Al cubrir el colector con una barrera/máscara móvil, a lo largo del mismo eje que la deposición de fibras, la estructura organizativa se controla fácilmente. Con fines de ingeniería de tejidos, las células madre derivadas del tejido adiposo se pueden sembrar en estos andamios. Las células madre experimentan cambios morfológicos como resultado de su posición en la variada estructura organizacional, y potencialmente pueden diferenciarse en diferentes tipos de células dependiendo de sus ubicaciones. Además, la organización graduada de las fibras mejora la biomímesis de los andamios de nanofibras para que se parezcan más a las orientaciones naturales de las nanofibras de colágeno en el sitio de inserción del tendón al hueso en comparación con los andamios tradicionales. A través de la nanoencapsulación, las fibras graduadas también ofrecen la posibilidad de construir gradientes químicos en andamios de fibra y, por lo tanto, fortalecer aún más sus aplicaciones potenciales en el cribado rápido de la interacción célula-materiales y la regeneración de tejidos interfaciales. Esta técnica permite la producción de andamios de gradiente continuo, pero también puede producir fibras en pasos discretos controlando el movimiento de la barrera/máscara móvil de manera discreta.