El verde de metilo se conoce desde hace mucho tiempo como una tinción histológica con una afinidad específica por el ADN, aunque sus propiedades fluorescentes han permanecido inexploradas hasta hace poco. En este artículo, ilustramos el método para preparar una solución madre acuosa de verde metilo, que cuando se diluye se puede usar como una etiqueta nuclear fluorescente muy conveniente para células y tejidos fijos. Se detallan procedimientos sencillos para etiquetar embriones enteros de pez cebra y pollito, y se muestran ejemplos de imágenes obtenidas. El verde de metilo es excitado al máximo por la luz roja, a 633 nm, y emite con un espectro relativamente agudo que alcanza su punto máximo a 677 nm. Es muy barato, no tóxico, muy estable en solución y muy resistente al fotoblanqueo cuando se une al ADN. Su emisión roja permite obtener imágenes confocales de escaneo de alta resolución inalteradas de núcleos en muestras gruesas. Por último, este protocolo de tinción con verde de metilo es compatible con otros procedimientos de tinción celular, como el marcaje de anticuerpos o el marcaje de filamentos de actina con faloidina conjugada con fluoróforos.